MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 1715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016011	TAAT	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016011	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016011	TGAT	2	8	3214	3221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016011	TTAT	2	8	3739	3746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016011	CTTC	2	8	3836	3843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016011	ATTT	2	8	3859	3866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016011	GTTA	2	8	4178	4185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016011	AATA	2	8	4507	4514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016011	AAAG	2	8	6001	6008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016011	ATAA	2	8	22871	22878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016011	AGGA	2	8	23125	23132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016011	TTAT	2	8	32609	32616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016011	AGTG	2	8	45439	45446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016011	GTTA	2	8	47538	47545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016011	GCTC	2	8	47593	47600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016011	CATA	2	8	58941	58948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016011	ATGG	2	8	63110	63117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016011	GAAA	2	8	63679	63686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016011	AGTT	2	8	63792	63799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016011	ACTT	2	8	64031	64038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016011	TGAA	2	8	64235	64242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016011	GAAT	2	8	64292	64299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016011	CGAT	2	8	64611	64618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016011	ACGG	2	8	64757	64764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016011	CAAG	2	8	64947	64954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016011	TTTA	2	8	65172	65179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016011	GTTG	2	8	65633	65640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016011	AAAC	2	8	65743	65750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016011	AATT	2	8	65825	65832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016011	TGCG	2	8	66476	66483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016011	ACAA	2	8	66572	66579	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016011	CGTA	2	8	66681	66688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016011	GCGA	2	8	66802	66809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016011	AAGA	2	8	67036	67043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016011	GATT	2	8	67284	67291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016011	TGAT	2	8	67628	67635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016011	AATT	2	8	67682	67689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016011	ACAA	2	8	68066	68073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016011	GAAC	2	8	68200	68207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016011	GATG	2	8	68383	68390	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016011	GAAA	2	8	68391	68398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016011	ATTT	2	8	68560	68567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016011	CTAT	2	8	68696	68703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016011	AAAG	2	8	72883	72890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016011	TAGA	2	8	72907	72914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016011	ACAA	2	8	73126	73133	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016011	AAGC	2	8	73138	73145	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016011	AGGA	2	8	79977	79984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016011	ATAC	2	8	80168	80175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016011	TAAA	2	8	81195	81202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016011	TAAT	2	8	81219	81226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016011	CTAG	2	8	81344	81351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016011	ATTT	2	8	82327	82334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016011	TGGA	2	8	87533	87540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016011	AAAG	2	8	95934	95941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016011	ACTA	2	8	96322	96329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016011	ATTT	2	8	96379	96386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016011	TATT	2	8	96596	96603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016011	AAAG	2	8	96666	96673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016011	ACTA	2	8	97809	97816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016011	AAAT	2	8	97918	97925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016011	ACTT	2	8	106073	106080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016011	ATAA	2	8	107112	107119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016011	TAAC	2	8	107641	107648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016011	CTTT	2	8	107699	107706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016011	GAAT	2	8	107740	107747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016011	AGAA	2	8	114794	114801	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016011	GCTG	2	8	120150	120157	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016011	ATTT	2	8	120278	120285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016011	GAAC	2	8	120352	120359	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016011	GAAA	2	8	120579	120586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016011	AATT	2	8	120720	120727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016011	CTAT	2	8	123236	123243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016011	TAAA	2	8	123330	123337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016011	TTGG	2	8	124137	124144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016011	ACCA	2	8	124173	124180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016011	TGAT	2	8	125776	125783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016011	TAAA	2	8	128296	128303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016011	CAAA	2	8	130372	130379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016011	TAAA	2	8	136415	136422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016011	AACG	2	8	136497	136504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016011	TTTA	2	8	139800	139807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016011	AAAT	2	8	145324	145331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016011	TCAT	2	8	154431	154438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016011	TACT	2	8	159897	159904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016011	AAGT	2	8	159919	159926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016011	AAGG	2	8	164294	164301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016011	TATT	2	8	175608	175615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016011	TCAC	2	8	178709	178716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016011	TTGC	2	8	182003	182010	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016011	TTAA	2	8	182479	182486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016011	CAAA	2	8	183109	183116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016011	TCAT	2	8	183205	183212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016011	TAAT	2	8	185631	185638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016011	AGTT	2	8	186731	186738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016011	ATTA	2	8	187198	187205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016011	ATAG	2	8	187342	187349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016011	CAGG	2	8	187539	187546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016011	CCCA	2	8	189733	189740	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_016011	AAAC	2	8	190171	190178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016011	AGCT	2	8	190374	190381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016011	AAAT	2	8	194498	194505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016011	CAAG	2	8	194728	194735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016011	CATT	2	8	195018	195025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016011	CCAA	2	8	195042	195049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016011	TGCA	2	8	195050	195057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016011	GAAT	2	8	201236	201243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016011	GGGA	2	8	206941	206948	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016011	AATT	2	8	207930	207937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016011	GAAG	2	8	208014	208021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016011	CTTT	2	8	208276	208283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016011	TGAA	2	8	208300	208307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016011	GAAA	2	8	208385	208392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016011	TTGG	2	8	208477	208484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016011	CGAA	2	8	208753	208760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016011	GCAT	2	8	209437	209444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016011	AACA	2	8	209987	209994	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016011	GCCA	2	8	210059	210066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016011	AATA	2	8	210138	210145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016011	AATT	2	8	214249	214256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016011	AAAT	2	8	215287	215294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016011	CTTT	2	8	215334	215341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016011	CGAA	2	8	221616	221623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016011	CCTG	2	8	221683	221690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016011	ATGG	2	8	222799	222806	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016011	AGCC	2	8	223017	223024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016011	TGTT	2	8	223141	223148	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016011	TGTT	2	8	223179	223186	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016011	AGAA	2	8	223571	223578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016011	AAAG	2	8	223674	223681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016011	TACT	2	8	224113	224120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016011	CACG	2	8	224134	224141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016011	GGAA	2	8	224928	224935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016011	TAGG	2	8	225502	225509	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016011	ATGG	2	8	225685	225692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016011	ATCG	2	8	226263	226270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016011	TTTG	2	8	227201	227208	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016011	ATTT	2	8	227300	227307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016011	CGAA	2	8	227636	227643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016011	CCTG	2	8	227703	227710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016011	ATGG	2	8	228819	228826	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016011	AGCC	2	8	229037	229044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016011	TGTT	2	8	229161	229168	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016011	TGTT	2	8	229199	229206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016011	AGAA	2	8	229591	229598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016011	AAAG	2	8	229694	229701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016011	TACT	2	8	230133	230140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016011	CACG	2	8	230154	230161	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016011	GGAA	2	8	230948	230955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016011	TAGG	2	8	231522	231529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016011	ATGG	2	8	231705	231712	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016011	ATCG	2	8	232283	232290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016011	ATAA	2	8	232542	232549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016011	TTAA	2	8	237218	237225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016011	AAAT	2	8	238663	238670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016011	GAAT	2	8	242242	242249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016011	AAAT	2	8	243159	243166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016011	TACT	2	8	243246	243253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_016011	ATTT	2	8	244009	244016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016011	AAAT	2	8	244122	244129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016011	TAGT	2	8	244132	244139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_016011	ATTT	2	8	247214	247221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_016011	ACTT	2	8	247225	247232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_016011	AAGT	2	8	249981	249988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_016011	TAAA	2	8	300813	300820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_016011	TAAT	2	8	791792	791799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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