MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 36052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016011	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547511
2	NC_016011	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
3	NC_016011	AAG	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
4	NC_016011	TGA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
5	NC_016011	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547511
6	NC_016011	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347547511
7	NC_016011	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547511
8	NC_016011	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
9	NC_016011	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
10	NC_016011	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
11	NC_016011	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
12	NC_016011	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
13	NC_016011	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
14	NC_016011	TTA	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
15	NC_016011	CCA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547511
16	NC_016011	TAA	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
17	NC_016011	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547511
18	NC_016011	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547511
19	NC_016011	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
20	NC_016011	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
21	NC_016011	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
22	NC_016011	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547511
23	NC_016011	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547511
24	NC_016011	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
25	NC_016011	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
26	NC_016011	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
27	NC_016011	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547512
28	NC_016011	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547512
29	NC_016011	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547512
30	NC_016011	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547512
31	NC_016011	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
32	NC_016011	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
33	NC_016011	AAC	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
34	NC_016011	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
35	NC_016011	TTA	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
36	NC_016011	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547512
37	NC_016011	TCT	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547512
38	NC_016011	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547512
39	NC_016011	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
40	NC_016011	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
41	NC_016011	CAA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
42	NC_016011	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
43	NC_016011	TGG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547513
44	NC_016011	CCG	2	6	4779	4784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347547513
45	NC_016011	TAT	2	6	5043	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547514
46	NC_016011	AGA	2	6	5058	5063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
47	NC_016011	AGA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
48	NC_016011	GCA	2	6	5334	5339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547514
49	NC_016011	GTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547514
50	NC_016011	GAT	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547514
51	NC_016011	ACA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547514
52	NC_016011	GAA	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
53	NC_016011	GAT	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547514
54	NC_016011	AAC	3	9	5886	5894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547514
55	NC_016011	ACT	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547514
56	NC_016011	AGA	2	6	6030	6035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
57	NC_016011	TTG	2	6	6182	6187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547515
58	NC_016011	ATA	2	6	6251	6256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547515
59	NC_016011	GTC	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547515
60	NC_016011	TGG	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
61	NC_016011	AGG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347547515
62	NC_016011	GTG	2	6	6494	6499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
63	NC_016011	GTA	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547515
64	NC_016011	GAA	2	6	6517	6522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
65	NC_016011	AAC	2	6	6588	6593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
66	NC_016011	GAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
67	NC_016011	CCA	2	6	6775	6780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547515
68	NC_016011	GAT	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547515
69	NC_016011	TTA	2	6	6935	6940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
70	NC_016011	CAA	2	6	6957	6962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
71	NC_016011	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
72	NC_016011	ATG	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547515
73	NC_016011	GTG	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
74	NC_016011	GCT	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547515
75	NC_016011	TGG	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
76	NC_016011	TGG	2	6	7494	7499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547515
77	NC_016011	ATT	2	6	7537	7542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
78	NC_016011	CTT	2	6	7585	7590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547515
79	NC_016011	CTT	2	6	7618	7623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547515
80	NC_016011	CCG	2	6	7651	7656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347547515
81	NC_016011	AGA	2	6	7713	7718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
82	NC_016011	AAC	2	6	7793	7798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
83	NC_016011	ACA	2	6	7807	7812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547515
84	NC_016011	ACT	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547515
85	NC_016011	CGT	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547515
86	NC_016011	GAA	2	6	7927	7932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
87	NC_016011	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547515
88	NC_016011	CAT	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547516
89	NC_016011	TTG	2	6	8149	8154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547516
90	NC_016011	CGT	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547516
91	NC_016011	TTG	2	6	8269	8274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547516
92	NC_016011	CAG	2	6	8311	8316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547516
93	NC_016011	GGC	2	6	8411	8416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347547516
94	NC_016011	ACT	2	6	8462	8467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547516
95	NC_016011	ATG	2	6	8509	8514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
96	NC_016011	CCA	2	6	8615	8620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547516
97	NC_016011	GAT	2	6	8726	8731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
98	NC_016011	TCG	2	6	8750	8755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547516
99	NC_016011	GAA	2	6	8808	8813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
100	NC_016011	TTA	2	6	8839	8844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547516
101	NC_016011	ATG	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
102	NC_016011	TCG	2	6	8981	8986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547516
103	NC_016011	AAT	2	6	9012	9017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547516
104	NC_016011	ATC	2	6	9079	9084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547516
105	NC_016011	ATT	2	6	9118	9123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547516
106	NC_016011	AGT	2	6	9137	9142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
107	NC_016011	TCG	2	6	9146	9151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547516
108	NC_016011	ATA	2	6	9223	9228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547516
109	NC_016011	ATT	2	6	9237	9242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547516
110	NC_016011	AAG	2	6	9280	9285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
111	NC_016011	TGA	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
112	NC_016011	GAA	3	9	9381	9389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
113	NC_016011	TAG	2	6	9400	9405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
114	NC_016011	TGA	3	9	9437	9445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
115	NC_016011	GAA	2	6	9468	9473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
116	NC_016011	AGA	2	6	9476	9481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
117	NC_016011	CGT	2	6	9507	9512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547516
118	NC_016011	AGA	3	9	9566	9574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
119	NC_016011	CGT	2	6	9642	9647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547516
120	NC_016011	GGT	2	6	9648	9653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547516
121	NC_016011	GAT	2	6	9684	9689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
122	NC_016011	ACT	2	6	9728	9733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547516
123	NC_016011	ATC	2	6	9816	9821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547516
124	NC_016011	TAC	2	6	9932	9937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547516
125	NC_016011	AGA	2	6	10082	10087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
126	NC_016011	GCT	2	6	10113	10118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547516
127	NC_016011	GTG	2	6	10258	10263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547516
128	NC_016011	GAA	2	6	10335	10340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
129	NC_016011	TGA	2	6	10442	10447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547516
130	NC_016011	AGA	3	9	10484	10492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547516
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257	NC_016011	TGC	2	6	20460	20465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547526
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263	NC_016011	TTC	2	6	20969	20974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547526
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