MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 3729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016010	GCCTG	2	10	820	829	0 %	20 %	40 %	40 %	346722941
2	NC_016010	ACCAC	2	10	1264	1273	40 %	0 %	0 %	60 %	346722941
3	NC_016010	GCTTT	2	10	3489	3498	0 %	60 %	20 %	20 %	346722943
4	NC_016010	TGGAA	2	10	4013	4022	40 %	20 %	40 %	0 %	346722944
5	NC_016010	GGACG	2	10	4088	4097	20 %	0 %	60 %	20 %	346722944
6	NC_016010	TGCGC	2	10	4135	4144	0 %	20 %	40 %	40 %	346722944
7	NC_016010	GGACG	2	10	4609	4618	20 %	0 %	60 %	20 %	346722944
8	NC_016010	GGCGC	2	10	5607	5616	0 %	0 %	60 %	40 %	346722945
9	NC_016010	CGGCC	2	10	8207	8216	0 %	0 %	40 %	60 %	346722946
10	NC_016010	CACTG	2	10	11087	11096	20 %	20 %	20 %	40 %	346722949
11	NC_016010	CCGGT	2	10	12329	12338	0 %	20 %	40 %	40 %	346722950
12	NC_016010	CGCGC	2	10	12725	12734	0 %	0 %	40 %	60 %	346722951
13	NC_016010	CACCG	2	10	13732	13741	20 %	0 %	20 %	60 %	346722953
14	NC_016010	TCCAG	2	10	13887	13896	20 %	20 %	20 %	40 %	346722953
15	NC_016010	AGCGC	2	10	14014	14023	20 %	0 %	40 %	40 %	346722953
16	NC_016010	GGCAC	2	10	14780	14789	20 %	0 %	40 %	40 %	346722954
17	NC_016010	CAGCG	2	10	16380	16389	20 %	0 %	40 %	40 %	346722956
18	NC_016010	GGTCG	2	10	20945	20954	0 %	20 %	60 %	20 %	346722961
19	NC_016010	CTGCC	2	10	23577	23586	0 %	20 %	20 %	60 %	346722964
20	NC_016010	CGCTG	2	10	24355	24364	0 %	20 %	40 %	40 %	346722964
21	NC_016010	GGGGT	2	10	28152	28161	0 %	20 %	80 %	0 %	346722967
22	NC_016010	GCAAG	2	10	31050	31059	40 %	0 %	40 %	20 %	346722969
23	NC_016010	CCAGC	2	10	31598	31607	20 %	0 %	20 %	60 %	346722970
24	NC_016010	CTGCG	2	10	31985	31994	0 %	20 %	40 %	40 %	346722970
25	NC_016010	CGGCG	2	10	34981	34990	0 %	0 %	60 %	40 %	346722972
26	NC_016010	CCAGC	2	10	35099	35108	20 %	0 %	20 %	60 %	346722972
27	NC_016010	CGGGC	2	10	35942	35951	0 %	0 %	60 %	40 %	346722972
28	NC_016010	CGATG	2	10	36994	37003	20 %	20 %	40 %	20 %	346722973
29	NC_016010	GCCGC	2	10	37094	37103	0 %	0 %	40 %	60 %	346722973
30	NC_016010	CTGGT	2	10	38508	38517	0 %	40 %	40 %	20 %	346722974
31	NC_016010	CCAGC	2	10	39364	39373	20 %	0 %	20 %	60 %	346722974
32	NC_016010	AGGCC	2	10	40298	40307	20 %	0 %	40 %	40 %	346722975
33	NC_016010	CGCAG	2	10	42548	42557	20 %	0 %	40 %	40 %	346722975
34	NC_016010	CGCTG	2	10	43856	43865	0 %	20 %	40 %	40 %	346722975
35	NC_016010	ACACC	2	10	44213	44222	40 %	0 %	0 %	60 %	346722975
36	NC_016010	CGGCG	2	10	48441	48450	0 %	0 %	60 %	40 %	346722979
37	NC_016010	CGCTA	2	10	48464	48473	20 %	20 %	20 %	40 %	346722979
38	NC_016010	GCGCA	2	10	48757	48766	20 %	0 %	40 %	40 %	346722979
39	NC_016010	GCGCT	2	10	49930	49939	0 %	20 %	40 %	40 %	346722980
40	NC_016010	CGTGG	2	10	52102	52111	0 %	20 %	60 %	20 %	346722982
41	NC_016010	GCGCC	2	10	53048	53057	0 %	0 %	40 %	60 %	346722983
42	NC_016010	GTGGC	2	10	53064	53073	0 %	20 %	60 %	20 %	346722983
43	NC_016010	GCCAT	2	10	55061	55070	20 %	20 %	20 %	40 %	346722984
44	NC_016010	GCACG	2	10	55131	55140	20 %	0 %	40 %	40 %	346722984
45	NC_016010	GCCGC	2	10	55369	55378	0 %	0 %	40 %	60 %	346722984
46	NC_016010	TCTGC	2	10	57094	57103	0 %	40 %	20 %	40 %	346722986
47	NC_016010	CCAGG	2	10	58026	58035	20 %	0 %	40 %	40 %	346722987
48	NC_016010	CGGGT	2	10	59119	59128	0 %	20 %	60 %	20 %	346722987
49	NC_016010	CGGGC	2	10	59846	59855	0 %	0 %	60 %	40 %	346722987
50	NC_016010	GCGCA	2	10	60114	60123	20 %	0 %	40 %	40 %	346722987
51	NC_016010	GCAGG	2	10	60625	60634	20 %	0 %	60 %	20 %	346722988
52	NC_016010	GGCGT	2	10	61573	61582	0 %	20 %	60 %	20 %	346722988
53	NC_016010	CAAGC	2	10	62146	62155	40 %	0 %	20 %	40 %	346722989
54	NC_016010	GCGCC	3	15	63196	63210	0 %	0 %	40 %	60 %	346722989
55	NC_016010	CAGGC	2	10	63985	63994	20 %	0 %	40 %	40 %	346722989
56	NC_016010	GGCGT	2	10	69156	69165	0 %	20 %	60 %	20 %	346722993
57	NC_016010	GGCCG	2	10	70680	70689	0 %	0 %	60 %	40 %	346722996
58	NC_016010	CGTGG	2	10	72151	72160	0 %	20 %	60 %	20 %	346722998
59	NC_016010	CGTTC	2	10	73945	73954	0 %	40 %	20 %	40 %	346722999
60	NC_016010	GCCCA	2	10	75730	75739	20 %	0 %	20 %	60 %	346723001
61	NC_016010	CCAGC	2	10	75974	75983	20 %	0 %	20 %	60 %	346723001
62	NC_016010	CACGC	2	10	78907	78916	20 %	0 %	20 %	60 %	346723006
63	NC_016010	AAGTC	2	10	80902	80911	40 %	20 %	20 %	20 %	346723009
64	NC_016010	CGGCG	2	10	86984	86993	0 %	0 %	60 %	40 %	346723016
65	NC_016010	GTCCA	2	10	87332	87341	20 %	20 %	20 %	40 %	346723017
66	NC_016010	ACCAC	2	10	87561	87570	40 %	0 %	0 %	60 %	346723017
67	NC_016010	TGCCC	2	10	88401	88410	0 %	20 %	20 %	60 %	346723018
68	NC_016010	GGGCT	2	10	89156	89165	0 %	20 %	60 %	20 %	346723019
69	NC_016010	GCGTG	2	10	89349	89358	0 %	20 %	60 %	20 %	346723019
70	NC_016010	CGGCG	2	10	91147	91156	0 %	0 %	60 %	40 %	346723019
71	NC_016010	TGCGT	2	10	92242	92251	0 %	40 %	40 %	20 %	346723019
72	NC_016010	GGCCT	2	10	92378	92387	0 %	20 %	40 %	40 %	346723019
73	NC_016010	CCGAC	2	10	93143	93152	20 %	0 %	20 %	60 %	346723020
74	NC_016010	CGCAG	2	10	93330	93339	20 %	0 %	40 %	40 %	346723021
75	NC_016010	TGGCC	2	10	95253	95262	0 %	20 %	40 %	40 %	346723022
76	NC_016010	TCCAG	2	10	96319	96328	20 %	20 %	20 %	40 %	346723023
77	NC_016010	CGCAG	2	10	96398	96407	20 %	0 %	40 %	40 %	346723023
78	NC_016010	TGCGG	2	10	97383	97392	0 %	20 %	60 %	20 %	346723024
79	NC_016010	TGCGG	2	10	99240	99249	0 %	20 %	60 %	20 %	346723026
80	NC_016010	CAGCG	2	10	99299	99308	20 %	0 %	40 %	40 %	346723026
81	NC_016010	CAGCG	2	10	99464	99473	20 %	0 %	40 %	40 %	346723026
82	NC_016010	GGGGC	2	10	99882	99891	0 %	0 %	80 %	20 %	346723026
83	NC_016010	GCGCG	2	10	100532	100541	0 %	0 %	60 %	40 %	346723027
84	NC_016010	GCGCG	2	10	101009	101018	0 %	0 %	60 %	40 %	346723027
85	NC_016010	CGGGC	2	10	101610	101619	0 %	0 %	60 %	40 %	346723027
86	NC_016010	GCCGG	2	10	101714	101723	0 %	0 %	60 %	40 %	346723027
87	NC_016010	GGCGC	2	10	102354	102363	0 %	0 %	60 %	40 %	346723027
88	NC_016010	GCCAC	2	10	103171	103180	20 %	0 %	20 %	60 %	346723028
89	NC_016010	CGGCG	2	10	103289	103298	0 %	0 %	60 %	40 %	346723028
90	NC_016010	ACTGC	2	10	104036	104045	20 %	20 %	20 %	40 %	346723029
91	NC_016010	GCGCA	2	10	104691	104700	20 %	0 %	40 %	40 %	346723029
92	NC_016010	TCCAG	2	10	104734	104743	20 %	20 %	20 %	40 %	346723029
93	NC_016010	CACCG	2	10	108702	108711	20 %	0 %	20 %	60 %	346723033
94	NC_016010	AGCCC	2	10	109067	109076	20 %	0 %	20 %	60 %	346723033
95	NC_016010	GGCAC	2	10	112679	112688	20 %	0 %	40 %	40 %	346723035
96	NC_016010	GGTGC	2	10	117830	117839	0 %	20 %	60 %	20 %	346723041
97	NC_016010	CAGCG	2	10	118160	118169	20 %	0 %	40 %	40 %	346723041
98	NC_016010	CACCG	2	10	118346	118355	20 %	0 %	20 %	60 %	346723041
99	NC_016010	GCCCG	2	10	119320	119329	0 %	0 %	40 %	60 %	346723041
100	NC_016010	CGGCA	2	10	120440	120449	20 %	0 %	40 %	40 %	346723043
101	NC_016010	GCAGA	2	10	121448	121457	40 %	0 %	40 %	20 %	346723044
102	NC_016010	TGGCG	2	10	123510	123519	0 %	20 %	60 %	20 %	346723047
103	NC_016010	GACTG	2	10	123710	123719	20 %	20 %	40 %	20 %	346723047
104	NC_016010	CGGCG	2	10	128872	128881	0 %	0 %	60 %	40 %	346723051
105	NC_016010	CCAGA	2	10	128912	128921	40 %	0 %	20 %	40 %	346723051
106	NC_016010	CGCTG	2	10	134280	134289	0 %	20 %	40 %	40 %	346723056
107	NC_016010	CACCG	2	10	135163	135172	20 %	0 %	20 %	60 %	346723056
108	NC_016010	TGGCC	2	10	135423	135432	0 %	20 %	40 %	40 %	346723056
109	NC_016010	GGCCT	2	10	135973	135982	0 %	20 %	40 %	40 %	346723057
110	NC_016010	GGCCA	2	10	143212	143221	20 %	0 %	40 %	40 %	346723061
111	NC_016010	AATTC	2	10	146740	146749	40 %	40 %	0 %	20 %	346723063
112	NC_016010	ACTTA	2	10	148416	148425	40 %	40 %	0 %	20 %	346723066
113	NC_016010	CAACG	2	10	148455	148464	40 %	0 %	20 %	40 %	346723066
114	NC_016010	CGCTG	2	10	149348	149357	0 %	20 %	40 %	40 %	346723067
115	NC_016010	ATCCC	2	10	150836	150845	20 %	20 %	0 %	60 %	346723068
116	NC_016010	CTCTT	2	10	151204	151213	0 %	60 %	0 %	40 %	346723068
117	NC_016010	GCCCC	2	10	152007	152016	0 %	0 %	20 %	80 %	346723069
118	NC_016010	GCCGC	2	10	152028	152037	0 %	0 %	40 %	60 %	346723069
119	NC_016010	GCGTG	2	10	153975	153984	0 %	20 %	60 %	20 %	346723071
120	NC_016010	CGAGC	2	10	156121	156130	20 %	0 %	40 %	40 %	346723075
121	NC_016010	CCGCG	2	10	161401	161410	0 %	0 %	40 %	60 %	346723078
122	NC_016010	TGCGC	2	10	164037	164046	0 %	20 %	40 %	40 %	346723079
123	NC_016010	GTGGC	2	10	168420	168429	0 %	20 %	60 %	20 %	346723082
124	NC_016010	GGGCT	2	10	168533	168542	0 %	20 %	60 %	20 %	346723082
125	NC_016010	TGCGC	2	10	169627	169636	0 %	20 %	40 %	40 %	346723083
126	NC_016010	GCGCC	2	10	169809	169818	0 %	0 %	40 %	60 %	346723083
127	NC_016010	CGGCC	2	10	170264	170273	0 %	0 %	40 %	60 %	346723083
128	NC_016010	TTCGC	2	10	173024	173033	0 %	40 %	20 %	40 %	346723085
129	NC_016010	TCCAG	2	10	173775	173784	20 %	20 %	20 %	40 %	346723086
130	NC_016010	CGCTG	2	10	175066	175075	0 %	20 %	40 %	40 %	346723088
131	NC_016010	CGGCG	3	15	176488	176502	0 %	0 %	60 %	40 %	346723089
132	NC_016010	GCCAC	2	10	176950	176959	20 %	0 %	20 %	60 %	346723089
133	NC_016010	GGGCG	2	10	177365	177374	0 %	0 %	80 %	20 %	346723089
134	NC_016010	GCCTG	2	10	177878	177887	0 %	20 %	40 %	40 %	346723090
135	NC_016010	GGGTC	2	10	177893	177902	0 %	20 %	60 %	20 %	346723090
136	NC_016010	GCGCC	2	10	179481	179490	0 %	0 %	40 %	60 %	346723092
137	NC_016010	GCGTC	2	10	182200	182209	0 %	20 %	40 %	40 %	346723095
138	NC_016010	CGCGC	2	10	182985	182994	0 %	0 %	40 %	60 %	346723095
139	NC_016010	GCCCG	2	10	183044	183053	0 %	0 %	40 %	60 %	346723095
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141	NC_016010	GGTCT	2	10	187617	187626	0 %	40 %	40 %	20 %	346723099
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143	NC_016010	CTGGT	2	10	189457	189466	0 %	40 %	40 %	20 %	346723100
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146	NC_016010	CCGAT	2	10	193579	193588	20 %	20 %	20 %	40 %	346723104
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149	NC_016010	GGCCA	2	10	195244	195253	20 %	0 %	40 %	40 %	346723106
150	NC_016010	GCTGG	2	10	195516	195525	0 %	20 %	60 %	20 %	346723106
151	NC_016010	CGCAG	2	10	198300	198309	20 %	0 %	40 %	40 %	346723108
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167	NC_016010	CGCTG	2	10	217830	217839	0 %	20 %	40 %	40 %	346723124
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170	NC_016010	CGGCG	2	10	226818	226827	0 %	0 %	60 %	40 %	346723132
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176	NC_016010	CTGCA	2	10	233910	233919	20 %	20 %	20 %	40 %	346723139
177	NC_016010	CGCTG	2	10	234362	234371	0 %	20 %	40 %	40 %	346723139
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203	NC_016010	ACGCC	2	10	273402	273411	20 %	0 %	20 %	60 %	346723179
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242	NC_016010	GCGCA	2	10	324000	324009	20 %	0 %	40 %	40 %	346723225
243	NC_016010	AGCGC	2	10	324472	324481	20 %	0 %	40 %	40 %	346723225
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245	NC_016010	GCCAC	2	10	328235	328244	20 %	0 %	20 %	60 %	346723228
246	NC_016010	GGCGA	2	10	329275	329284	20 %	0 %	60 %	20 %	346723229
247	NC_016010	ATCGC	2	10	330038	330047	20 %	20 %	20 %	40 %	346723229
248	NC_016010	TCGCG	2	10	332826	332835	0 %	20 %	40 %	40 %	346723231
249	NC_016010	GTTGC	2	10	332879	332888	0 %	40 %	40 %	20 %	346723231
250	NC_016010	GCGCG	2	10	333125	333134	0 %	0 %	60 %	40 %	346723231
251	NC_016010	CCGGG	2	10	333250	333259	0 %	0 %	60 %	40 %	346723231
252	NC_016010	GCGCC	2	10	335996	336005	0 %	0 %	40 %	60 %	346723233
253	NC_016010	GTGCA	2	10	338966	338975	20 %	20 %	40 %	20 %	346723235
254	NC_016010	CAGCC	2	10	339083	339092	20 %	0 %	20 %	60 %	346723236
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256	NC_016010	GCGCC	2	10	340566	340575	0 %	0 %	40 %	60 %	346723238
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258	NC_016010	CGGCA	2	10	344994	345003	20 %	0 %	40 %	40 %	346723242
259	NC_016010	CGTGC	2	10	346863	346872	0 %	20 %	40 %	40 %	346723244
260	NC_016010	CAGCG	2	10	348919	348928	20 %	0 %	40 %	40 %	346723246
261	NC_016010	AGGCC	2	10	349281	349290	20 %	0 %	40 %	40 %	346723246
262	NC_016010	CGTGG	2	10	349793	349802	0 %	20 %	60 %	20 %	346723247
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264	NC_016010	GGCAG	2	10	350329	350338	20 %	0 %	60 %	20 %	346723247
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389	NC_016010	CGCGG	2	10	525675	525684	0 %	0 %	60 %	40 %	346723396
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