MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 14305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016010	CGGC	2	8	15	22	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016010	GATG	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	346722941
3	NC_016010	CCCG	2	8	86	93	0 %	0 %	25 %	75 %	346722941
4	NC_016010	CGGT	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	346722941
5	NC_016010	CGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	50 %	50 %	346722941
6	NC_016010	CGCT	2	8	1167	1174	0 %	25 %	25 %	50 %	346722941
7	NC_016010	GCCG	2	8	1254	1261	0 %	0 %	50 %	50 %	346722941
8	NC_016010	TGCC	2	8	1283	1290	0 %	25 %	25 %	50 %	346722941
9	NC_016010	GGAC	2	8	1760	1767	25 %	0 %	50 %	25 %	346722942
10	NC_016010	CCGT	2	8	1992	1999	0 %	25 %	25 %	50 %	346722942
11	NC_016010	TTTG	2	8	2796	2803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016010	GCAG	2	8	3314	3321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016010	CGAT	2	8	3793	3800	25 %	25 %	25 %	25 %	346722944
14	NC_016010	GCCT	2	8	4654	4661	0 %	25 %	25 %	50 %	346722944
15	NC_016010	CGGC	2	8	4913	4920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016010	CCGT	2	8	5560	5567	0 %	25 %	25 %	50 %	346722945
17	NC_016010	TCCT	2	8	5629	5636	0 %	50 %	0 %	50 %	346722945
18	NC_016010	CACC	2	8	5886	5893	25 %	0 %	0 %	75 %	346722945
19	NC_016010	CGAA	2	8	6143	6150	50 %	0 %	25 %	25 %	346722945
20	NC_016010	GCAG	2	8	6948	6955	25 %	0 %	50 %	25 %	346722945
21	NC_016010	GCCG	2	8	8127	8134	0 %	0 %	50 %	50 %	346722946
22	NC_016010	CCGG	2	8	8460	8467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016010	ACCC	2	8	9249	9256	25 %	0 %	0 %	75 %	346722947
24	NC_016010	GCTT	2	8	9420	9427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016010	GCAA	2	8	9653	9660	50 %	0 %	25 %	25 %	346722948
26	NC_016010	TGGG	2	8	9692	9699	0 %	25 %	75 %	0 %	346722948
27	NC_016010	GTCG	2	8	11510	11517	0 %	25 %	50 %	25 %	346722949
28	NC_016010	GGCC	2	8	11662	11669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016010	GAAG	2	8	12706	12713	50 %	0 %	50 %	0 %	346722951
30	NC_016010	GATC	2	8	15158	15165	25 %	25 %	25 %	25 %	346722955
31	NC_016010	AACC	2	8	15208	15215	50 %	0 %	0 %	50 %	346722955
32	NC_016010	ATGG	2	8	15879	15886	25 %	25 %	50 %	0 %	346722956
33	NC_016010	GTTC	2	8	16130	16137	0 %	50 %	25 %	25 %	346722956
34	NC_016010	GGTG	2	8	16202	16209	0 %	25 %	75 %	0 %	346722956
35	NC_016010	CATC	2	8	16334	16341	25 %	25 %	0 %	50 %	346722956
36	NC_016010	GTCG	2	8	17025	17032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016010	GATG	2	8	17278	17285	25 %	25 %	50 %	0 %	346722957
38	NC_016010	GTCG	2	8	17681	17688	0 %	25 %	50 %	25 %	346722957
39	NC_016010	GCAG	2	8	18517	18524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016010	GCCG	2	8	18835	18842	0 %	0 %	50 %	50 %	346722959
41	NC_016010	GGTG	2	8	19960	19967	0 %	25 %	75 %	0 %	346722960
42	NC_016010	GCAG	2	8	20200	20207	25 %	0 %	50 %	25 %	346722960
43	NC_016010	GTGC	2	8	20208	20215	0 %	25 %	50 %	25 %	346722960
44	NC_016010	GTGC	2	8	20622	20629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016010	CGTG	2	8	20664	20671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016010	CCTG	2	8	20725	20732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016010	GGTG	2	8	20965	20972	0 %	25 %	75 %	0 %	346722961
48	NC_016010	GACG	2	8	21000	21007	25 %	0 %	50 %	25 %	346722961
49	NC_016010	TGCC	2	8	22000	22007	0 %	25 %	25 %	50 %	346722961
50	NC_016010	TTCC	2	8	22424	22431	0 %	50 %	0 %	50 %	346722962
51	NC_016010	ACCC	2	8	22440	22447	25 %	0 %	0 %	75 %	346722962
52	NC_016010	TGGC	2	8	22483	22490	0 %	25 %	50 %	25 %	346722962
53	NC_016010	GCCG	2	8	22508	22515	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
54	NC_016010	GCCG	2	8	22698	22705	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
55	NC_016010	ATTC	2	8	22911	22918	25 %	50 %	0 %	25 %	346722962
56	NC_016010	ACGC	2	8	23696	23703	25 %	0 %	25 %	50 %	346722964
57	NC_016010	GCCG	2	8	23843	23850	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
58	NC_016010	GCAT	2	8	23903	23910	25 %	25 %	25 %	25 %	346722964
59	NC_016010	GGGC	2	8	24056	24063	0 %	0 %	75 %	25 %	346722964
60	NC_016010	GCAG	2	8	24077	24084	25 %	0 %	50 %	25 %	346722964
61	NC_016010	GCCG	2	8	24292	24299	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
62	NC_016010	TGCC	2	8	24791	24798	0 %	25 %	25 %	50 %	346722965
63	NC_016010	TGGC	2	8	24869	24876	0 %	25 %	50 %	25 %	346722965
64	NC_016010	ATCG	2	8	25761	25768	25 %	25 %	25 %	25 %	346722965
65	NC_016010	GGCC	2	8	26150	26157	0 %	0 %	50 %	50 %	346722965
66	NC_016010	CAGC	2	8	26342	26349	25 %	0 %	25 %	50 %	346722966
67	NC_016010	GCCC	2	8	26410	26417	0 %	0 %	25 %	75 %	346722966
68	NC_016010	TGCG	2	8	27249	27256	0 %	25 %	50 %	25 %	346722966
69	NC_016010	GAGC	2	8	27586	27593	25 %	0 %	50 %	25 %	346722966
70	NC_016010	CAGG	2	8	27647	27654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016010	GTGC	2	8	28405	28412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016010	CCGA	2	8	28643	28650	25 %	0 %	25 %	50 %	346722968
73	NC_016010	CGCA	2	8	29194	29201	25 %	0 %	25 %	50 %	346722968
74	NC_016010	GGTC	2	8	29457	29464	0 %	25 %	50 %	25 %	346722968
75	NC_016010	GCCG	2	8	30283	30290	0 %	0 %	50 %	50 %	346722968
76	NC_016010	ATGG	2	8	30562	30569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016010	TGCT	2	8	31209	31216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016010	CGTG	2	8	31304	31311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016010	TGCG	2	8	31348	31355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016010	CGTG	2	8	31400	31407	0 %	25 %	50 %	25 %	346722970
81	NC_016010	TCAT	2	8	32028	32035	25 %	50 %	0 %	25 %	346722970
82	NC_016010	ATAC	2	8	32177	32184	50 %	25 %	0 %	25 %	346722970
83	NC_016010	GGCG	2	8	33055	33062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016010	TCGA	2	8	33652	33659	25 %	25 %	25 %	25 %	346722971
85	NC_016010	GCAA	2	8	34141	34148	50 %	0 %	25 %	25 %	346722971
86	NC_016010	CGGC	2	8	34173	34180	0 %	0 %	50 %	50 %	346722971
87	NC_016010	TGCG	2	8	34226	34233	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016010	GCCA	2	8	34584	34591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016010	TCGC	2	8	34654	34661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016010	GCCG	2	8	35603	35610	0 %	0 %	50 %	50 %	346722972
91	NC_016010	GTGG	2	8	36069	36076	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016010	CGCA	2	8	36496	36503	25 %	0 %	25 %	50 %	346722973
93	NC_016010	AGGC	2	8	37871	37878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016010	CGCA	2	8	38472	38479	25 %	0 %	25 %	50 %	346722974
95	NC_016010	TCGA	2	8	38763	38770	25 %	25 %	25 %	25 %	346722974
96	NC_016010	CGGC	2	8	39002	39009	0 %	0 %	50 %	50 %	346722974
97	NC_016010	CCGC	2	8	39551	39558	0 %	0 %	25 %	75 %	346722974
98	NC_016010	CGGC	2	8	39702	39709	0 %	0 %	50 %	50 %	346722974
99	NC_016010	CCAG	2	8	40097	40104	25 %	0 %	25 %	50 %	346722975
100	NC_016010	CGCC	3	12	40445	40456	0 %	0 %	25 %	75 %	346722975
101	NC_016010	CAGG	2	8	40491	40498	25 %	0 %	50 %	25 %	346722975
102	NC_016010	CGCC	2	8	40564	40571	0 %	0 %	25 %	75 %	346722975
103	NC_016010	CGGT	2	8	40756	40763	0 %	25 %	50 %	25 %	346722975
104	NC_016010	CCAT	2	8	40825	40832	25 %	25 %	0 %	50 %	346722975
105	NC_016010	AGCG	2	8	40996	41003	25 %	0 %	50 %	25 %	346722975
106	NC_016010	GCCC	2	8	41816	41823	0 %	0 %	25 %	75 %	346722975
107	NC_016010	GCAG	2	8	42488	42495	25 %	0 %	50 %	25 %	346722975
108	NC_016010	GCTG	2	8	42803	42810	0 %	25 %	50 %	25 %	346722975
109	NC_016010	AGGT	2	8	43177	43184	25 %	25 %	50 %	0 %	346722975
110	NC_016010	CGGC	2	8	43328	43335	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
111	NC_016010	GCCG	2	8	43461	43468	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
112	NC_016010	GCAG	2	8	45025	45032	25 %	0 %	50 %	25 %	346722976
113	NC_016010	CAGC	2	8	45039	45046	25 %	0 %	25 %	50 %	346722976
114	NC_016010	CGGC	2	8	45286	45293	0 %	0 %	50 %	50 %	346722977
115	NC_016010	CAAG	2	8	46181	46188	50 %	0 %	25 %	25 %	346722977
116	NC_016010	GCTG	2	8	46783	46790	0 %	25 %	50 %	25 %	346722978
117	NC_016010	CGGC	2	8	47338	47345	0 %	0 %	50 %	50 %	346722979
118	NC_016010	GTTT	2	8	47441	47448	0 %	75 %	25 %	0 %	346722979
119	NC_016010	GCTG	2	8	47802	47809	0 %	25 %	50 %	25 %	346722979
120	NC_016010	CGGT	2	8	48421	48428	0 %	25 %	50 %	25 %	346722979
121	NC_016010	AGCC	2	8	48433	48440	25 %	0 %	25 %	50 %	346722979
122	NC_016010	GCCG	2	8	49155	49162	0 %	0 %	50 %	50 %	346722979
123	NC_016010	ACCG	2	8	49635	49642	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016010	GCCA	2	8	49848	49855	25 %	0 %	25 %	50 %	346722980
125	NC_016010	GCCG	2	8	50169	50176	0 %	0 %	50 %	50 %	346722980
126	NC_016010	TGGA	2	8	50589	50596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016010	CCAC	2	8	51727	51734	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_016010	CGGC	2	8	52569	52576	0 %	0 %	50 %	50 %	346722983
129	NC_016010	CGCC	2	8	52709	52716	0 %	0 %	25 %	75 %	346722983
130	NC_016010	GGCT	2	8	53145	53152	0 %	25 %	50 %	25 %	346722983
131	NC_016010	CACG	2	8	53383	53390	25 %	0 %	25 %	50 %	346722983
132	NC_016010	ACGC	2	8	53598	53605	25 %	0 %	25 %	50 %	346722983
133	NC_016010	CGGC	2	8	54233	54240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016010	CACC	2	8	54363	54370	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_016010	GCCG	2	8	54933	54940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016010	AGCA	2	8	55513	55520	50 %	0 %	25 %	25 %	346722984
137	NC_016010	CGTG	2	8	55751	55758	0 %	25 %	50 %	25 %	346722985
138	NC_016010	GATG	2	8	56048	56055	25 %	25 %	50 %	0 %	346722985
139	NC_016010	GTGC	2	8	56217	56224	0 %	25 %	50 %	25 %	346722985
140	NC_016010	GCCG	2	8	56265	56272	0 %	0 %	50 %	50 %	346722985
141	NC_016010	ACGG	2	8	56598	56605	25 %	0 %	50 %	25 %	346722985
142	NC_016010	AGCC	2	8	57063	57070	25 %	0 %	25 %	50 %	346722986
143	NC_016010	CGGC	2	8	57235	57242	0 %	0 %	50 %	50 %	346722986
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