MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 11843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016010	GATG	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	346722941
2	NC_016010	CCCG	2	8	86	93	0 %	0 %	25 %	75 %	346722941
3	NC_016010	CGGT	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	346722941
4	NC_016010	CGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	50 %	50 %	346722941
5	NC_016010	CGCT	2	8	1167	1174	0 %	25 %	25 %	50 %	346722941
6	NC_016010	GCCG	2	8	1254	1261	0 %	0 %	50 %	50 %	346722941
7	NC_016010	TGCC	2	8	1283	1290	0 %	25 %	25 %	50 %	346722941
8	NC_016010	GGAC	2	8	1760	1767	25 %	0 %	50 %	25 %	346722942
9	NC_016010	CCGT	2	8	1992	1999	0 %	25 %	25 %	50 %	346722942
10	NC_016010	CGAT	2	8	3793	3800	25 %	25 %	25 %	25 %	346722944
11	NC_016010	GCCT	2	8	4654	4661	0 %	25 %	25 %	50 %	346722944
12	NC_016010	CCGT	2	8	5560	5567	0 %	25 %	25 %	50 %	346722945
13	NC_016010	TCCT	2	8	5629	5636	0 %	50 %	0 %	50 %	346722945
14	NC_016010	CACC	2	8	5886	5893	25 %	0 %	0 %	75 %	346722945
15	NC_016010	CGAA	2	8	6143	6150	50 %	0 %	25 %	25 %	346722945
16	NC_016010	GCAG	2	8	6948	6955	25 %	0 %	50 %	25 %	346722945
17	NC_016010	GCCG	2	8	8127	8134	0 %	0 %	50 %	50 %	346722946
18	NC_016010	ACCC	2	8	9249	9256	25 %	0 %	0 %	75 %	346722947
19	NC_016010	GCAA	2	8	9653	9660	50 %	0 %	25 %	25 %	346722948
20	NC_016010	TGGG	2	8	9692	9699	0 %	25 %	75 %	0 %	346722948
21	NC_016010	GTCG	2	8	11510	11517	0 %	25 %	50 %	25 %	346722949
22	NC_016010	GAAG	2	8	12706	12713	50 %	0 %	50 %	0 %	346722951
23	NC_016010	GATC	2	8	15158	15165	25 %	25 %	25 %	25 %	346722955
24	NC_016010	AACC	2	8	15208	15215	50 %	0 %	0 %	50 %	346722955
25	NC_016010	ATGG	2	8	15879	15886	25 %	25 %	50 %	0 %	346722956
26	NC_016010	GTTC	2	8	16130	16137	0 %	50 %	25 %	25 %	346722956
27	NC_016010	GGTG	2	8	16202	16209	0 %	25 %	75 %	0 %	346722956
28	NC_016010	CATC	2	8	16334	16341	25 %	25 %	0 %	50 %	346722956
29	NC_016010	GATG	2	8	17278	17285	25 %	25 %	50 %	0 %	346722957
30	NC_016010	GTCG	2	8	17681	17688	0 %	25 %	50 %	25 %	346722957
31	NC_016010	GCCG	2	8	18835	18842	0 %	0 %	50 %	50 %	346722959
32	NC_016010	GGTG	2	8	19960	19967	0 %	25 %	75 %	0 %	346722960
33	NC_016010	GCAG	2	8	20200	20207	25 %	0 %	50 %	25 %	346722960
34	NC_016010	GTGC	2	8	20208	20215	0 %	25 %	50 %	25 %	346722960
35	NC_016010	GGTG	2	8	20965	20972	0 %	25 %	75 %	0 %	346722961
36	NC_016010	GACG	2	8	21000	21007	25 %	0 %	50 %	25 %	346722961
37	NC_016010	TGCC	2	8	22000	22007	0 %	25 %	25 %	50 %	346722961
38	NC_016010	TTCC	2	8	22424	22431	0 %	50 %	0 %	50 %	346722962
39	NC_016010	ACCC	2	8	22440	22447	25 %	0 %	0 %	75 %	346722962
40	NC_016010	TGGC	2	8	22483	22490	0 %	25 %	50 %	25 %	346722962
41	NC_016010	GCCG	2	8	22508	22515	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
42	NC_016010	GCCG	2	8	22698	22705	0 %	0 %	50 %	50 %	346722962
43	NC_016010	ATTC	2	8	22911	22918	25 %	50 %	0 %	25 %	346722962
44	NC_016010	ACGC	2	8	23696	23703	25 %	0 %	25 %	50 %	346722964
45	NC_016010	GCCG	2	8	23843	23850	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
46	NC_016010	GCAT	2	8	23903	23910	25 %	25 %	25 %	25 %	346722964
47	NC_016010	GGGC	2	8	24056	24063	0 %	0 %	75 %	25 %	346722964
48	NC_016010	GCAG	2	8	24077	24084	25 %	0 %	50 %	25 %	346722964
49	NC_016010	GCCG	2	8	24292	24299	0 %	0 %	50 %	50 %	346722964
50	NC_016010	TGCC	2	8	24791	24798	0 %	25 %	25 %	50 %	346722965
51	NC_016010	TGGC	2	8	24869	24876	0 %	25 %	50 %	25 %	346722965
52	NC_016010	ATCG	2	8	25761	25768	25 %	25 %	25 %	25 %	346722965
53	NC_016010	GGCC	2	8	26150	26157	0 %	0 %	50 %	50 %	346722965
54	NC_016010	CAGC	2	8	26342	26349	25 %	0 %	25 %	50 %	346722966
55	NC_016010	GCCC	2	8	26410	26417	0 %	0 %	25 %	75 %	346722966
56	NC_016010	TGCG	2	8	27249	27256	0 %	25 %	50 %	25 %	346722966
57	NC_016010	GAGC	2	8	27586	27593	25 %	0 %	50 %	25 %	346722966
58	NC_016010	CCGA	2	8	28643	28650	25 %	0 %	25 %	50 %	346722968
59	NC_016010	CGCA	2	8	29194	29201	25 %	0 %	25 %	50 %	346722968
60	NC_016010	GGTC	2	8	29457	29464	0 %	25 %	50 %	25 %	346722968
61	NC_016010	GCCG	2	8	30283	30290	0 %	0 %	50 %	50 %	346722968
62	NC_016010	CGTG	2	8	31400	31407	0 %	25 %	50 %	25 %	346722970
63	NC_016010	TCAT	2	8	32028	32035	25 %	50 %	0 %	25 %	346722970
64	NC_016010	ATAC	2	8	32177	32184	50 %	25 %	0 %	25 %	346722970
65	NC_016010	TCGA	2	8	33652	33659	25 %	25 %	25 %	25 %	346722971
66	NC_016010	GCAA	2	8	34141	34148	50 %	0 %	25 %	25 %	346722971
67	NC_016010	CGGC	2	8	34173	34180	0 %	0 %	50 %	50 %	346722971
68	NC_016010	GCCG	2	8	35603	35610	0 %	0 %	50 %	50 %	346722972
69	NC_016010	CGCA	2	8	36496	36503	25 %	0 %	25 %	50 %	346722973
70	NC_016010	CGCA	2	8	38472	38479	25 %	0 %	25 %	50 %	346722974
71	NC_016010	TCGA	2	8	38763	38770	25 %	25 %	25 %	25 %	346722974
72	NC_016010	CGGC	2	8	39002	39009	0 %	0 %	50 %	50 %	346722974
73	NC_016010	CCGC	2	8	39551	39558	0 %	0 %	25 %	75 %	346722974
74	NC_016010	CGGC	2	8	39702	39709	0 %	0 %	50 %	50 %	346722974
75	NC_016010	CCAG	2	8	40097	40104	25 %	0 %	25 %	50 %	346722975
76	NC_016010	CGCC	3	12	40445	40456	0 %	0 %	25 %	75 %	346722975
77	NC_016010	CAGG	2	8	40491	40498	25 %	0 %	50 %	25 %	346722975
78	NC_016010	CGCC	2	8	40564	40571	0 %	0 %	25 %	75 %	346722975
79	NC_016010	CGGT	2	8	40756	40763	0 %	25 %	50 %	25 %	346722975
80	NC_016010	CCAT	2	8	40825	40832	25 %	25 %	0 %	50 %	346722975
81	NC_016010	AGCG	2	8	40996	41003	25 %	0 %	50 %	25 %	346722975
82	NC_016010	GCCC	2	8	41816	41823	0 %	0 %	25 %	75 %	346722975
83	NC_016010	GCAG	2	8	42488	42495	25 %	0 %	50 %	25 %	346722975
84	NC_016010	GCTG	2	8	42803	42810	0 %	25 %	50 %	25 %	346722975
85	NC_016010	AGGT	2	8	43177	43184	25 %	25 %	50 %	0 %	346722975
86	NC_016010	CGGC	2	8	43328	43335	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
87	NC_016010	GCCG	2	8	43461	43468	0 %	0 %	50 %	50 %	346722975
88	NC_016010	GCAG	2	8	45025	45032	25 %	0 %	50 %	25 %	346722976
89	NC_016010	CAGC	2	8	45039	45046	25 %	0 %	25 %	50 %	346722976
90	NC_016010	CGGC	2	8	45286	45293	0 %	0 %	50 %	50 %	346722977
91	NC_016010	CAAG	2	8	46181	46188	50 %	0 %	25 %	25 %	346722977
92	NC_016010	GCTG	2	8	46783	46790	0 %	25 %	50 %	25 %	346722978
93	NC_016010	CGGC	2	8	47338	47345	0 %	0 %	50 %	50 %	346722979
94	NC_016010	GTTT	2	8	47441	47448	0 %	75 %	25 %	0 %	346722979
95	NC_016010	GCTG	2	8	47802	47809	0 %	25 %	50 %	25 %	346722979
96	NC_016010	CGGT	2	8	48421	48428	0 %	25 %	50 %	25 %	346722979
97	NC_016010	AGCC	2	8	48433	48440	25 %	0 %	25 %	50 %	346722979
98	NC_016010	GCCG	2	8	49155	49162	0 %	0 %	50 %	50 %	346722979
99	NC_016010	GCCA	2	8	49848	49855	25 %	0 %	25 %	50 %	346722980
100	NC_016010	GCCG	2	8	50169	50176	0 %	0 %	50 %	50 %	346722980
101	NC_016010	CGGC	2	8	52569	52576	0 %	0 %	50 %	50 %	346722983
102	NC_016010	CGCC	2	8	52709	52716	0 %	0 %	25 %	75 %	346722983
103	NC_016010	GGCT	2	8	53145	53152	0 %	25 %	50 %	25 %	346722983
104	NC_016010	CACG	2	8	53383	53390	25 %	0 %	25 %	50 %	346722983
105	NC_016010	ACGC	2	8	53598	53605	25 %	0 %	25 %	50 %	346722983
106	NC_016010	AGCA	2	8	55513	55520	50 %	0 %	25 %	25 %	346722984
107	NC_016010	CGTG	2	8	55751	55758	0 %	25 %	50 %	25 %	346722985
108	NC_016010	GATG	2	8	56048	56055	25 %	25 %	50 %	0 %	346722985
109	NC_016010	GTGC	2	8	56217	56224	0 %	25 %	50 %	25 %	346722985
110	NC_016010	GCCG	2	8	56265	56272	0 %	0 %	50 %	50 %	346722985
111	NC_016010	ACGG	2	8	56598	56605	25 %	0 %	50 %	25 %	346722985
112	NC_016010	AGCC	2	8	57063	57070	25 %	0 %	25 %	50 %	346722986
113	NC_016010	CGGC	2	8	57235	57242	0 %	0 %	50 %	50 %	346722986
114	NC_016010	CGAT	2	8	57420	57427	25 %	25 %	25 %	25 %	346722986
115	NC_016010	GGTG	2	8	57792	57799	0 %	25 %	75 %	0 %	346722987
116	NC_016010	ACCG	2	8	58176	58183	25 %	0 %	25 %	50 %	346722987
117	NC_016010	CCGG	2	8	58256	58263	0 %	0 %	50 %	50 %	346722987
118	NC_016010	GCGA	2	8	58424	58431	25 %	0 %	50 %	25 %	346722987
119	NC_016010	GGCC	2	8	58586	58593	0 %	0 %	50 %	50 %	346722987
120	NC_016010	TGCG	2	8	58978	58985	0 %	25 %	50 %	25 %	346722987
121	NC_016010	CATC	2	8	59966	59973	25 %	25 %	0 %	50 %	346722987
122	NC_016010	GAAG	2	8	60307	60314	50 %	0 %	50 %	0 %	346722987
123	NC_016010	TTCG	2	8	60550	60557	0 %	50 %	25 %	25 %	346722988
124	NC_016010	AGCG	2	8	60597	60604	25 %	0 %	50 %	25 %	346722988
125	NC_016010	TGGA	2	8	61119	61126	25 %	25 %	50 %	0 %	346722988
126	NC_016010	CGGC	2	8	61237	61244	0 %	0 %	50 %	50 %	346722988
127	NC_016010	GATC	2	8	61481	61488	25 %	25 %	25 %	25 %	346722988
128	NC_016010	GCAA	2	8	62588	62595	50 %	0 %	25 %	25 %	346722989
129	NC_016010	GACC	2	8	62946	62953	25 %	0 %	25 %	50 %	346722989
130	NC_016010	GCCG	2	8	63071	63078	0 %	0 %	50 %	50 %	346722989
131	NC_016010	GCAA	2	8	63851	63858	50 %	0 %	25 %	25 %	346722989
132	NC_016010	TGGC	2	8	64349	64356	0 %	25 %	50 %	25 %	346722990
133	NC_016010	AATG	2	8	64381	64388	50 %	25 %	25 %	0 %	346722990
134	NC_016010	ACGC	2	8	64963	64970	25 %	0 %	25 %	50 %	346722991
135	NC_016010	TCGG	2	8	65209	65216	0 %	25 %	50 %	25 %	346722991
136	NC_016010	CAGC	2	8	66112	66119	25 %	0 %	25 %	50 %	346722992
137	NC_016010	GCTC	2	8	66188	66195	0 %	25 %	25 %	50 %	346722992
138	NC_016010	ATCC	2	8	66431	66438	25 %	25 %	0 %	50 %	346722992
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140	NC_016010	CGGC	2	8	66634	66641	0 %	0 %	50 %	50 %	346722992
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