MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 83359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016010	GAT	2	6	27	32	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016010	TCG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
3	NC_016010	GCG	3	9	300	308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722941
4	NC_016010	TCG	2	6	385	390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
5	NC_016010	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
6	NC_016010	GCC	2	6	417	422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722941
7	NC_016010	GGC	2	6	431	436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722941
8	NC_016010	TGC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
9	NC_016010	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
10	NC_016010	GCC	2	6	549	554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722941
11	NC_016010	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722941
12	NC_016010	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722941
13	NC_016010	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
14	NC_016010	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
15	NC_016010	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
16	NC_016010	TTC	2	6	681	686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722941
17	NC_016010	TTC	2	6	714	719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722941
18	NC_016010	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722941
19	NC_016010	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722941
20	NC_016010	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722941
21	NC_016010	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722941
22	NC_016010	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
23	NC_016010	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722941
24	NC_016010	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722941
25	NC_016010	TGC	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
26	NC_016010	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722941
27	NC_016010	TAC	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722941
28	NC_016010	CTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
29	NC_016010	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722941
30	NC_016010	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
31	NC_016010	GGT	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016010	CAC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016010	TGG	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722942
34	NC_016010	CGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722942
35	NC_016010	CAG	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722942
36	NC_016010	CTA	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722942
37	NC_016010	TGT	2	6	2116	2121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722942
38	NC_016010	TGC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722942
39	NC_016010	CGG	2	6	2204	2209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722942
40	NC_016010	ATC	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722942
41	NC_016010	GCC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722942
42	NC_016010	CGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722942
43	NC_016010	CGA	2	6	2642	2647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722942
44	NC_016010	GTG	2	6	2652	2657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722942
45	NC_016010	CAG	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722942
46	NC_016010	TTG	2	6	2818	2823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016010	GTC	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016010	CAG	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016010	TCT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016010	GTT	2	6	3705	3710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016010	CTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722944
52	NC_016010	CAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722944
53	NC_016010	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722944
54	NC_016010	CGC	3	9	4204	4212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722944
55	NC_016010	CTG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722944
56	NC_016010	GGA	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346722944
57	NC_016010	GAT	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722944
58	NC_016010	TGC	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722944
59	NC_016010	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722944
60	NC_016010	GCA	2	6	4851	4856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722944
61	NC_016010	CGC	2	6	4981	4986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016010	CGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
63	NC_016010	TGC	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
64	NC_016010	GGT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722945
65	NC_016010	CGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
66	NC_016010	GAC	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
67	NC_016010	GTG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722945
68	NC_016010	GCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
69	NC_016010	GAA	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722945
70	NC_016010	CGG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
71	NC_016010	TGC	2	6	5339	5344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
72	NC_016010	CGG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
73	NC_016010	CGA	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
74	NC_016010	CGG	2	6	5385	5390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
75	NC_016010	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722945
76	NC_016010	CAG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
77	NC_016010	AGC	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
78	NC_016010	CAC	2	6	5541	5546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722945
79	NC_016010	CGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
80	NC_016010	GCG	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
81	NC_016010	CGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
82	NC_016010	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
83	NC_016010	CAT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722945
84	NC_016010	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722945
85	NC_016010	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
86	NC_016010	GCG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
87	NC_016010	CGA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
88	NC_016010	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
89	NC_016010	TCG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
90	NC_016010	GCC	2	6	6199	6204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
91	NC_016010	CGC	2	6	6226	6231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
92	NC_016010	TCG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
93	NC_016010	CGG	2	6	6329	6334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
94	NC_016010	TGC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
95	NC_016010	CGA	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
96	NC_016010	ACC	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722945
97	NC_016010	CAT	2	6	6525	6530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722945
98	NC_016010	TGA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722945
99	NC_016010	CTG	3	9	6574	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
100	NC_016010	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722945
101	NC_016010	GCC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
102	NC_016010	GAC	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
103	NC_016010	GCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
104	NC_016010	GCG	2	6	6739	6744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
105	NC_016010	CGA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
106	NC_016010	CCG	2	6	6766	6771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
107	NC_016010	TTG	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722945
108	NC_016010	GCC	2	6	6885	6890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
109	NC_016010	TGG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722945
110	NC_016010	CCG	2	6	7044	7049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
111	NC_016010	TGC	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
112	NC_016010	GCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
113	NC_016010	CAA	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722945
114	NC_016010	AAG	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722945
115	NC_016010	GCC	2	6	7247	7252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
116	NC_016010	AGC	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
117	NC_016010	GCC	2	6	7363	7368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
118	NC_016010	CGC	2	6	7411	7416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
119	NC_016010	GTG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016010	TGA	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722946
121	NC_016010	GCC	2	6	7583	7588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
122	NC_016010	GCT	2	6	7589	7594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
123	NC_016010	CGC	2	6	7631	7636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
124	NC_016010	CTG	2	6	7641	7646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
125	NC_016010	GGC	2	6	7709	7714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722946
126	NC_016010	GCC	2	6	7755	7760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
127	NC_016010	GCT	2	6	7787	7792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
128	NC_016010	GCT	2	6	7823	7828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
129	NC_016010	TAC	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722946
130	NC_016010	GCC	2	6	7843	7848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
131	NC_016010	CGC	3	9	7925	7933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
132	NC_016010	GGC	2	6	7964	7969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722946
133	NC_016010	CCA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722946
134	NC_016010	CAG	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722946
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136	NC_016010	GAA	2	6	8082	8087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722946
137	NC_016010	CTG	2	6	8088	8093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
138	NC_016010	TCG	2	6	8096	8101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
139	NC_016010	GCA	2	6	8245	8250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722946
140	NC_016010	GCG	2	6	8256	8261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722946
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142	NC_016010	GCG	2	6	8405	8410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016010	GTT	2	6	8574	8579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722947
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145	NC_016010	GCC	2	6	8626	8631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722947
146	NC_016010	GGT	2	6	8636	8641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722947
147	NC_016010	GCC	2	6	8780	8785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722947
148	NC_016010	CGG	2	6	8855	8860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722947
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150	NC_016010	CAT	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722947
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153	NC_016010	CGG	2	6	9071	9076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722947
154	NC_016010	CTG	2	6	9099	9104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722947
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158	NC_016010	TGC	2	6	9360	9365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_016010	GCC	2	6	9382	9387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_016010	TGG	2	6	9436	9441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016010	CGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_016010	CGG	2	6	9614	9619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_016010	TGT	2	6	9665	9670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722948
164	NC_016010	CGC	2	6	9681	9686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722948
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189	NC_016010	CAG	2	6	10765	10770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
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192	NC_016010	ATC	2	6	10939	10944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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224	NC_016010	TCG	2	6	12242	12247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722950
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226	NC_016010	CTT	2	6	12405	12410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722950
227	NC_016010	CTT	2	6	12471	12476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722950
228	NC_016010	GTC	2	6	12506	12511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
229	NC_016010	AGT	2	6	12557	12562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722951
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239	NC_016010	ATC	2	6	13058	13063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722952
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241	NC_016010	CCG	4	12	13151	13162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722952
242	NC_016010	AAC	2	6	13202	13207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722952
243	NC_016010	AGA	2	6	13236	13241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722952
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245	NC_016010	GTG	2	6	13250	13255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722952
246	NC_016010	GAA	2	6	13345	13350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722952
247	NC_016010	GAA	2	6	13360	13365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722952
248	NC_016010	GCA	2	6	13378	13383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722952
249	NC_016010	GCA	2	6	13601	13606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_016010	CGC	2	6	13686	13691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722953
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252	NC_016010	GTT	2	6	13711	13716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722953
253	NC_016010	GCA	2	6	13774	13779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722953
254	NC_016010	GCC	2	6	13807	13812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722953
255	NC_016010	GCA	2	6	13879	13884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722953
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257	NC_016010	GGC	2	6	13993	13998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722953
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