MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 74023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016010	TCG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
2	NC_016010	GCG	3	9	300	308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722941
3	NC_016010	TCG	2	6	385	390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
4	NC_016010	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
5	NC_016010	GCC	2	6	417	422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722941
6	NC_016010	GGC	2	6	431	436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722941
7	NC_016010	TGC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
8	NC_016010	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
9	NC_016010	GCC	2	6	549	554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722941
10	NC_016010	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722941
11	NC_016010	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722941
12	NC_016010	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
13	NC_016010	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
14	NC_016010	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
15	NC_016010	TTC	2	6	681	686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722941
16	NC_016010	TTC	2	6	714	719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722941
17	NC_016010	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722941
18	NC_016010	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722941
19	NC_016010	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722941
20	NC_016010	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722941
21	NC_016010	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722941
22	NC_016010	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722941
23	NC_016010	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722941
24	NC_016010	TGC	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
25	NC_016010	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722941
26	NC_016010	TAC	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722941
27	NC_016010	CTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
28	NC_016010	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722941
29	NC_016010	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722941
30	NC_016010	TGG	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722942
31	NC_016010	CGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722942
32	NC_016010	CAG	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722942
33	NC_016010	CTA	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722942
34	NC_016010	TGT	2	6	2116	2121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722942
35	NC_016010	TGC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722942
36	NC_016010	CGG	2	6	2204	2209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722942
37	NC_016010	ATC	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722942
38	NC_016010	GCC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722942
39	NC_016010	CGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722942
40	NC_016010	CGA	2	6	2642	2647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722942
41	NC_016010	GTG	2	6	2652	2657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722942
42	NC_016010	CAG	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722942
43	NC_016010	CTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722944
44	NC_016010	CAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722944
45	NC_016010	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722944
46	NC_016010	CGC	3	9	4204	4212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722944
47	NC_016010	CTG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722944
48	NC_016010	GGA	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	346722944
49	NC_016010	GAT	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722944
50	NC_016010	TGC	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722944
51	NC_016010	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722944
52	NC_016010	GCA	2	6	4851	4856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722944
53	NC_016010	CGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
54	NC_016010	TGC	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
55	NC_016010	GGT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722945
56	NC_016010	CGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
57	NC_016010	GAC	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
58	NC_016010	GTG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722945
59	NC_016010	GCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
60	NC_016010	GAA	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722945
61	NC_016010	CGG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
62	NC_016010	TGC	2	6	5339	5344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
63	NC_016010	CGG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
64	NC_016010	CGA	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
65	NC_016010	CGG	2	6	5385	5390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
66	NC_016010	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722945
67	NC_016010	CAG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
68	NC_016010	AGC	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
69	NC_016010	CAC	2	6	5541	5546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722945
70	NC_016010	CGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
71	NC_016010	GCG	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
72	NC_016010	CGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
73	NC_016010	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
74	NC_016010	CAT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722945
75	NC_016010	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722945
76	NC_016010	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
77	NC_016010	GCG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
78	NC_016010	CGA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
79	NC_016010	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
80	NC_016010	TCG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
81	NC_016010	GCC	2	6	6199	6204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
82	NC_016010	CGC	2	6	6226	6231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
83	NC_016010	TCG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
84	NC_016010	CGG	2	6	6329	6334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
85	NC_016010	TGC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
86	NC_016010	CGA	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
87	NC_016010	ACC	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722945
88	NC_016010	CAT	2	6	6525	6530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722945
89	NC_016010	TGA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722945
90	NC_016010	CTG	3	9	6574	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
91	NC_016010	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	346722945
92	NC_016010	GCC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
93	NC_016010	GAC	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
94	NC_016010	GCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
95	NC_016010	GCG	2	6	6739	6744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
96	NC_016010	CGA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
97	NC_016010	CCG	2	6	6766	6771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
98	NC_016010	TTG	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722945
99	NC_016010	GCC	2	6	6885	6890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
100	NC_016010	TGG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722945
101	NC_016010	CCG	2	6	7044	7049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
102	NC_016010	TGC	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722945
103	NC_016010	GCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722945
104	NC_016010	CAA	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722945
105	NC_016010	AAG	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722945
106	NC_016010	GCC	2	6	7247	7252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
107	NC_016010	AGC	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722945
108	NC_016010	GCC	2	6	7363	7368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
109	NC_016010	CGC	2	6	7411	7416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722945
110	NC_016010	TGA	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722946
111	NC_016010	GCC	2	6	7583	7588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
112	NC_016010	GCT	2	6	7589	7594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
113	NC_016010	CGC	2	6	7631	7636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
114	NC_016010	CTG	2	6	7641	7646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
115	NC_016010	GGC	2	6	7709	7714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722946
116	NC_016010	GCC	2	6	7755	7760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
117	NC_016010	GCT	2	6	7787	7792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
118	NC_016010	GCT	2	6	7823	7828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
119	NC_016010	TAC	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722946
120	NC_016010	GCC	2	6	7843	7848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
121	NC_016010	CGC	3	9	7925	7933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722946
122	NC_016010	GGC	2	6	7964	7969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722946
123	NC_016010	CCA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722946
124	NC_016010	CAG	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722946
125	NC_016010	GGT	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722946
126	NC_016010	GAA	2	6	8082	8087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722946
127	NC_016010	CTG	2	6	8088	8093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
128	NC_016010	TCG	2	6	8096	8101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722946
129	NC_016010	GCA	2	6	8245	8250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722946
130	NC_016010	GCG	2	6	8256	8261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722946
131	NC_016010	CAA	2	6	8321	8326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722946
132	NC_016010	GTT	2	6	8574	8579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722947
133	NC_016010	CCA	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722947
134	NC_016010	GCC	2	6	8626	8631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722947
135	NC_016010	GGT	2	6	8636	8641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722947
136	NC_016010	GCC	2	6	8780	8785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722947
137	NC_016010	CGG	2	6	8855	8860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722947
138	NC_016010	CGC	2	6	8915	8920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722947
139	NC_016010	CAT	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722947
140	NC_016010	GCC	2	6	9030	9035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722947
141	NC_016010	GGC	2	6	9047	9052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722947
142	NC_016010	CGG	2	6	9071	9076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722947
143	NC_016010	CTG	2	6	9099	9104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722947
144	NC_016010	ATG	2	6	9207	9212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722947
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146	NC_016010	CAG	2	6	9318	9323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722947
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148	NC_016010	CGC	2	6	9681	9686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722948
149	NC_016010	GTC	2	6	9703	9708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722948
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152	NC_016010	CGA	2	6	9812	9817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
153	NC_016010	TCC	2	6	9826	9831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	346722948
154	NC_016010	AGC	2	6	9838	9843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
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156	NC_016010	ACG	2	6	9938	9943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
157	NC_016010	GGC	2	6	9957	9962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722948
158	NC_016010	GAC	2	6	9994	9999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
159	NC_016010	CCG	2	6	10001	10006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722948
160	NC_016010	AAG	2	6	10012	10017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722948
161	NC_016010	GCA	2	6	10023	10028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
162	NC_016010	ACA	2	6	10052	10057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722948
163	NC_016010	GAC	2	6	10105	10110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
164	NC_016010	CAG	2	6	10111	10116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
165	NC_016010	GCT	2	6	10290	10295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722948
166	NC_016010	GCC	2	6	10342	10347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722948
167	NC_016010	GCC	2	6	10357	10362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722948
168	NC_016010	GAA	2	6	10480	10485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722948
169	NC_016010	TCA	2	6	10553	10558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722948
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171	NC_016010	CGA	2	6	10635	10640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
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173	NC_016010	CAG	2	6	10765	10770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722948
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189	NC_016010	CCG	2	6	11364	11369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722949
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214	NC_016010	ACG	2	6	12777	12782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722951
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226	NC_016010	GTG	2	6	13250	13255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722952
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229	NC_016010	GCA	2	6	13378	13383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722952
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233	NC_016010	GCA	2	6	13774	13779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722953
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235	NC_016010	GCA	2	6	13879	13884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722953
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237	NC_016010	GGC	2	6	13993	13998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722953
238	NC_016010	GAA	2	6	14002	14007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722953
239	NC_016010	GCG	2	6	14418	14423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722954
240	NC_016010	CGA	2	6	14632	14637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722954
241	NC_016010	GCT	2	6	14659	14664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722954
242	NC_016010	CTG	2	6	14765	14770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722954
243	NC_016010	GCG	3	9	14818	14826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722954
244	NC_016010	CGT	2	6	14893	14898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722954
245	NC_016010	CGG	2	6	14953	14958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722954
246	NC_016010	CAC	2	6	14981	14986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722954
247	NC_016010	GCC	2	6	14999	15004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722954
248	NC_016010	TTG	2	6	15030	15035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722954
249	NC_016010	GGT	2	6	15053	15058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	346722954
250	NC_016010	GCG	2	6	15094	15099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722955
251	NC_016010	GGC	2	6	15105	15110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722955
252	NC_016010	GGC	2	6	15140	15145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722955
253	NC_016010	TGC	2	6	15167	15172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722955
254	NC_016010	CAG	3	9	15228	15236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722955
255	NC_016010	CCA	2	6	15245	15250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722955
256	NC_016010	ACC	2	6	15259	15264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	346722955
257	NC_016010	GCG	2	6	15278	15283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	346722955
258	NC_016010	AGC	2	6	15418	15423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722956
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263	NC_016010	CGA	2	6	15620	15625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722956
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284	NC_016010	GCT	2	6	16599	16604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722956
285	NC_016010	CGC	2	6	16636	16641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722956
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288	NC_016010	GCC	2	6	16708	16713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	346722956
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500	NC_016010	TTG	2	6	31536	31541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722970

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