MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacterium branchiophilum FL-15

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016001	TTTAAT	2	12	7538	7549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016001	TGTACT	2	12	25393	25404	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016001	GTGCGT	2	12	25454	25465	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016001	AAAAAT	2	12	32505	32516	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016001	TGAAAA	2	12	32581	32592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016001	AAATTA	2	12	37144	37155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016001	AACAAA	2	12	86612	86623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016001	ATTACA	2	12	95160	95171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016001	TTCATT	2	12	107327	107338	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016001	CAATTT	2	12	112607	112618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016001	CAGATT	2	12	124220	124231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016001	TTTGAT	2	12	124264	124275	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016001	AAAATT	2	12	124963	124974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016001	TAATTT	2	12	145198	145209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016001	ATTTTG	2	12	203410	203421	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016001	AAAATA	2	12	232574	232585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016001	ACTACA	2	12	256387	256398	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016001	CAAGCC	2	12	258539	258550	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016001	ACCATC	2	12	265029	265040	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016001	TAAAAT	2	12	265866	265877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016001	GCCTTT	2	12	271510	271521	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016001	TTTTTA	2	12	273488	273499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016001	TTCAAT	2	12	299245	299256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016001	TGCCCG	2	12	311147	311158	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016001	TAATTG	2	12	316065	316076	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016001	AATTAA	2	12	316719	316730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016001	AATTAA	2	12	317982	317993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016001	TAATTG	2	12	318586	318597	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016001	AATTAA	2	12	319240	319251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016001	AAAATG	2	12	326724	326735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016001	AAGAAA	2	12	333185	333196	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016001	CCAAAA	2	12	361980	361991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016001	ATACCA	2	12	362593	362604	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016001	TATAAT	2	12	363501	363512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016001	TGAAAA	2	12	363827	363838	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016001	AATCAA	2	12	398583	398594	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016001	AGTATG	2	12	401656	401667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016001	TTTATT	2	12	423518	423529	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016001	AATTAA	2	12	434251	434262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016001	ATTGTT	2	12	434286	434297	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016001	ATTTTT	2	12	450223	450234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016001	ATTAAA	2	12	451030	451041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016001	TTTATT	2	12	476322	476333	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016001	ACCAAG	2	12	490410	490421	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016001	AAATTA	2	12	495189	495200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016001	CTTGGT	2	12	507605	507616	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016001	AATCAA	2	12	527971	527982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016001	CGACCT	2	12	528651	528662	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016001	ATTAAA	2	12	531606	531617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016001	ATTGTA	2	12	532105	532116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016001	TCAAAT	2	12	537579	537590	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016001	TATAAA	2	12	561934	561945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016001	TCAAAT	2	12	594780	594791	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016001	ATAAAA	2	12	594950	594961	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016001	ATGGTG	2	12	595057	595068	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016001	CCGGAG	2	12	615781	615792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016001	ATTTAT	2	12	624786	624797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016001	ATTTGA	2	12	629276	629287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016001	AATTTT	2	12	655384	655395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016001	CAATTT	2	12	655476	655487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016001	AATAAA	2	12	658529	658540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016001	AACTAA	2	12	665469	665480	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016001	AGAAAT	2	12	679063	679074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016001	TAAAAA	2	12	694680	694691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016001	GTTTTT	2	12	715810	715821	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016001	TTTTAA	2	12	719298	719309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016001	TCAATT	2	12	719351	719362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016001	AAAATT	2	12	753067	753078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016001	AAATAC	2	12	763615	763626	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016001	ATTCAA	2	12	765187	765198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016001	CAAAAA	2	12	773013	773024	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016001	TGGTTT	2	12	773381	773392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016001	GCATTG	2	12	773425	773436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016001	AATTTT	2	12	777663	777674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016001	AAAACA	2	12	781385	781396	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016001	ATAAGA	2	12	816385	816396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016001	TATTTT	2	12	859313	859324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016001	ATTAAT	2	12	866642	866653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016001	ATTTTT	2	12	889024	889035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016001	TCAATT	2	12	895760	895771	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016001	AATAAA	2	12	945152	945163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016001	TTAATT	2	12	950368	950379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016001	ATTTTT	2	12	954247	954258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016001	TATTTT	2	12	967068	967079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016001	AATGGA	2	12	1002833	1002844	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016001	AAAATT	2	12	1014255	1014266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016001	AATGGA	2	12	1021673	1021684	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016001	AATGGA	2	12	1023333	1023344	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016001	AATGGA	2	12	1027012	1027023	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016001	AATGGA	2	12	1028672	1028683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016001	TTTTTA	2	12	1036703	1036714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016001	AAAATT	2	12	1039967	1039978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016001	TTAATT	2	12	1040072	1040083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016001	TTATAT	2	12	1043405	1043416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016001	ACAATT	2	12	1061367	1061378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016001	AAATAA	2	12	1061389	1061400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016001	AAATAT	3	18	1074993	1075010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016001	GTTTTG	2	12	1088401	1088412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016001	ATCAAA	2	12	1092046	1092057	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016001	GAATTT	2	12	1095230	1095241	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016001	GCTATC	2	12	1150549	1150560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016001	ATAAAA	2	12	1154237	1154248	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016001	ATTTTT	2	12	1162220	1162231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016001	TTTTTA	2	12	1163105	1163116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016001	TTTGAA	2	12	1165923	1165934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016001	AAACCA	2	12	1178437	1178448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016001	GCAACA	2	12	1184212	1184223	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016001	TCAAAA	2	12	1249161	1249172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016001	TTTTAA	2	12	1254643	1254654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016001	TACCCA	2	12	1283999	1284010	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016001	ATTTTT	2	12	1326783	1326794	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016001	ATAATT	2	12	1357672	1357683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016001	AAAATT	2	12	1420429	1420440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016001	TTATTT	2	12	1447424	1447435	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016001	TAAATA	2	12	1447560	1447571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016001	TGAAAA	2	12	1447717	1447728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016001	TATTTT	2	12	1458939	1458950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016001	ATTTTT	2	12	1460982	1460993	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016001	TAGATG	2	12	1466092	1466103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016001	AATTTT	2	12	1491915	1491926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016001	TAAAAA	3	18	1496607	1496624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016001	TTTTAT	2	12	1498375	1498386	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016001	CAAATA	2	12	1508403	1508414	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016001	AAAATT	2	12	1511874	1511885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016001	AAAAGC	2	12	1517629	1517640	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016001	AAATAA	2	12	1525261	1525272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016001	ATAATG	2	12	1525376	1525387	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016001	AATTTG	2	12	1556084	1556095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016001	TATTTT	2	12	1559317	1559328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016001	AATTAA	2	12	1560362	1560373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016001	TAAAAT	2	12	1564753	1564764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016001	ATTTCC	2	12	1582445	1582456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016001	CAAAAC	2	12	1585048	1585059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016001	AAATAA	2	12	1640750	1640761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016001	TTAATT	2	12	1652676	1652687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_016001	ATTTTT	2	12	1671511	1671522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_016001	ATTTTT	2	12	1697627	1697638	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_016001	TATTTT	2	12	2767097	2767108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_016001	TTTGCT	2	12	2777663	2777674	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.