MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS2

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015980	TAAAA	2	10	1	10	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015980	GAATT	2	10	175	184	40 %	40 %	20 %	0 %	347533685
3	NC_015980	GAAAA	2	10	754	763	80 %	0 %	20 %	0 %	347533685
4	NC_015980	ATTAT	2	10	1395	1404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015980	ATTAT	2	10	1656	1665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015980	ATTAT	2	10	1918	1927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015980	AATTT	2	10	3134	3143	40 %	60 %	0 %	0 %	347533687
8	NC_015980	TAGGA	2	10	3629	3638	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015980	TCGTG	2	10	4031	4040	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015980	ATTCA	2	10	4596	4605	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015980	TTTAA	2	10	5934	5943	40 %	60 %	0 %	0 %	347533689
12	NC_015980	CCGAA	2	10	6303	6312	40 %	0 %	20 %	40 %	347533690
13	NC_015980	TATTT	2	10	6351	6360	20 %	80 %	0 %	0 %	347533690
14	NC_015980	TGGCC	2	10	7047	7056	0 %	20 %	40 %	40 %	347533690
15	NC_015980	CATTT	2	10	10928	10937	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015980	TTTTC	2	10	11745	11754	0 %	80 %	0 %	20 %	347533693
17	NC_015980	TTTCG	2	10	12869	12878	0 %	60 %	20 %	20 %	347533695
18	NC_015980	GCAAT	2	10	15602	15611	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015980	TTTAG	2	10	17925	17934	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015980	TATAT	2	10	18635	18644	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.