MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS2

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015980	CAAC	2	8	238	245	50 %	0 %	0 %	50 %	347533685
2	NC_015980	CAAA	2	8	260	267	75 %	0 %	0 %	25 %	347533685
3	NC_015980	AAGA	2	8	439	446	75 %	0 %	25 %	0 %	347533685
4	NC_015980	AAAT	2	8	883	890	75 %	25 %	0 %	0 %	347533685
5	NC_015980	AATA	2	8	1074	1081	75 %	25 %	0 %	0 %	347533686
6	NC_015980	AATT	2	8	3288	3295	50 %	50 %	0 %	0 %	347533687
7	NC_015980	AGCG	2	8	3487	3494	25 %	0 %	50 %	25 %	347533688
8	NC_015980	ATTA	2	8	3586	3593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015980	ATAA	2	8	3904	3911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015980	CCCA	2	8	4673	4680	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015980	TAAC	2	8	4739	4746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015980	GTTG	2	8	4752	4759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015980	TAAT	2	8	5617	5624	50 %	50 %	0 %	0 %	347533689
14	NC_015980	TAGG	2	8	5771	5778	25 %	25 %	50 %	0 %	347533689
15	NC_015980	ACTG	2	8	6756	6763	25 %	25 %	25 %	25 %	347533690
16	NC_015980	ATTA	2	8	7308	7315	50 %	50 %	0 %	0 %	347533690
17	NC_015980	CCAA	2	8	7697	7704	50 %	0 %	0 %	50 %	347533691
18	NC_015980	ATCA	2	8	7970	7977	50 %	25 %	0 %	25 %	347533691
19	NC_015980	GAAA	2	8	8353	8360	75 %	0 %	25 %	0 %	347533691
20	NC_015980	CAAT	2	8	8481	8488	50 %	25 %	0 %	25 %	347533691
21	NC_015980	CCAG	2	8	8611	8618	25 %	0 %	25 %	50 %	347533691
22	NC_015980	TCAG	2	8	8632	8639	25 %	25 %	25 %	25 %	347533691
23	NC_015980	AATC	2	8	8939	8946	50 %	25 %	0 %	25 %	347533691
24	NC_015980	TAAT	2	8	9858	9865	50 %	50 %	0 %	0 %	347533692
25	NC_015980	TCAC	2	8	10128	10135	25 %	25 %	0 %	50 %	347533692
26	NC_015980	TAAT	2	8	10299	10306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015980	CGAA	2	8	10679	10686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015980	ATTT	2	8	11417	11424	25 %	75 %	0 %	0 %	347533693
29	NC_015980	AAAT	2	8	11577	11584	75 %	25 %	0 %	0 %	347533693
30	NC_015980	TATT	2	8	11894	11901	25 %	75 %	0 %	0 %	347533693
31	NC_015980	ATTG	2	8	11929	11936	25 %	50 %	25 %	0 %	347533693
32	NC_015980	GACT	2	8	11999	12006	25 %	25 %	25 %	25 %	347533693
33	NC_015980	TTTG	2	8	12048	12055	0 %	75 %	25 %	0 %	347533693
34	NC_015980	ATTT	2	8	12527	12534	25 %	75 %	0 %	0 %	347533694
35	NC_015980	ATCA	2	8	13269	13276	50 %	25 %	0 %	25 %	347533695
36	NC_015980	TATT	2	8	13484	13491	25 %	75 %	0 %	0 %	347533695
37	NC_015980	GCTG	2	8	13693	13700	0 %	25 %	50 %	25 %	347533695
38	NC_015980	TTTA	2	8	13755	13762	25 %	75 %	0 %	0 %	347533695
39	NC_015980	GACT	2	8	13780	13787	25 %	25 %	25 %	25 %	347533695
40	NC_015980	AAAT	2	8	14002	14009	75 %	25 %	0 %	0 %	347533696
41	NC_015980	TGAT	2	8	14010	14017	25 %	50 %	25 %	0 %	347533696
42	NC_015980	TACA	2	8	14053	14060	50 %	25 %	0 %	25 %	347533696
43	NC_015980	TAAA	2	8	14381	14388	75 %	25 %	0 %	0 %	347533696
44	NC_015980	TTTC	2	8	16419	16426	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015980	ATTC	2	8	16950	16957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015980	TAAG	2	8	17032	17039	50 %	25 %	25 %	0 %	347533697
47	NC_015980	TCCT	2	8	17829	17836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015980	TTTA	2	8	17855	17862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015980	TGTT	2	8	18117	18124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015980	TCAT	2	8	18136	18143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015980	ATTA	2	8	18224	18231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015980	GAAG	2	8	18514	18521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.