MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS2

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015980	CAAC	2	8	238	245	50 %	0 %	0 %	50 %	347533685
2	NC_015980	CAAA	2	8	260	267	75 %	0 %	0 %	25 %	347533685
3	NC_015980	AAGA	2	8	439	446	75 %	0 %	25 %	0 %	347533685
4	NC_015980	AAAT	2	8	883	890	75 %	25 %	0 %	0 %	347533685
5	NC_015980	AATA	2	8	1074	1081	75 %	25 %	0 %	0 %	347533686
6	NC_015980	AATT	2	8	3288	3295	50 %	50 %	0 %	0 %	347533687
7	NC_015980	AGCG	2	8	3487	3494	25 %	0 %	50 %	25 %	347533688
8	NC_015980	TAAT	2	8	5617	5624	50 %	50 %	0 %	0 %	347533689
9	NC_015980	TAGG	2	8	5771	5778	25 %	25 %	50 %	0 %	347533689
10	NC_015980	ACTG	2	8	6756	6763	25 %	25 %	25 %	25 %	347533690
11	NC_015980	ATTA	2	8	7308	7315	50 %	50 %	0 %	0 %	347533690
12	NC_015980	CCAA	2	8	7697	7704	50 %	0 %	0 %	50 %	347533691
13	NC_015980	ATCA	2	8	7970	7977	50 %	25 %	0 %	25 %	347533691
14	NC_015980	GAAA	2	8	8353	8360	75 %	0 %	25 %	0 %	347533691
15	NC_015980	CAAT	2	8	8481	8488	50 %	25 %	0 %	25 %	347533691
16	NC_015980	CCAG	2	8	8611	8618	25 %	0 %	25 %	50 %	347533691
17	NC_015980	TCAG	2	8	8632	8639	25 %	25 %	25 %	25 %	347533691
18	NC_015980	AATC	2	8	8939	8946	50 %	25 %	0 %	25 %	347533691
19	NC_015980	TAAT	2	8	9858	9865	50 %	50 %	0 %	0 %	347533692
20	NC_015980	TCAC	2	8	10128	10135	25 %	25 %	0 %	50 %	347533692
21	NC_015980	ATTT	2	8	11417	11424	25 %	75 %	0 %	0 %	347533693
22	NC_015980	AAAT	2	8	11577	11584	75 %	25 %	0 %	0 %	347533693
23	NC_015980	TATT	2	8	11894	11901	25 %	75 %	0 %	0 %	347533693
24	NC_015980	ATTG	2	8	11929	11936	25 %	50 %	25 %	0 %	347533693
25	NC_015980	GACT	2	8	11999	12006	25 %	25 %	25 %	25 %	347533693
26	NC_015980	TTTG	2	8	12048	12055	0 %	75 %	25 %	0 %	347533693
27	NC_015980	ATTT	2	8	12527	12534	25 %	75 %	0 %	0 %	347533694
28	NC_015980	ATCA	2	8	13269	13276	50 %	25 %	0 %	25 %	347533695
29	NC_015980	TATT	2	8	13484	13491	25 %	75 %	0 %	0 %	347533695
30	NC_015980	GCTG	2	8	13693	13700	0 %	25 %	50 %	25 %	347533695
31	NC_015980	TTTA	2	8	13755	13762	25 %	75 %	0 %	0 %	347533695
32	NC_015980	GACT	2	8	13780	13787	25 %	25 %	25 %	25 %	347533695
33	NC_015980	AAAT	2	8	14002	14009	75 %	25 %	0 %	0 %	347533696
34	NC_015980	TGAT	2	8	14010	14017	25 %	50 %	25 %	0 %	347533696
35	NC_015980	TACA	2	8	14053	14060	50 %	25 %	0 %	25 %	347533696
36	NC_015980	TAAA	2	8	14381	14388	75 %	25 %	0 %	0 %	347533696
37	NC_015980	TAAG	2	8	17032	17039	50 %	25 %	25 %	0 %	347533697

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.