MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	AAGTGA	2	12	2335	2346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015979	TGTTTT	2	12	3450	3461	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015979	TAGCAT	2	12	3814	3825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015979	AAAAAT	2	12	5208	5219	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015979	TGTCAT	2	12	6003	6014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347533707
6	NC_015979	TTGGGT	2	12	8232	8243	0 %	50 %	50 %	0 %	347533709
7	NC_015979	CTGCCG	2	12	10627	10638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	347533715
8	NC_015979	AGTGCC	2	12	14525	14536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347533719
9	NC_015979	TGATAT	2	12	19495	19506	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347533722
10	NC_015979	AAAACA	2	12	20059	20070	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347533722
11	NC_015979	GTTGAT	2	12	21125	21136	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347533722
12	NC_015979	ATGGCA	2	12	23278	23289	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347533724
13	NC_015979	TGTGAT	2	12	37306	37317	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347533736
14	NC_015979	ATTTTA	2	12	42122	42133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533739
15	NC_015979	GGTCAG	2	12	48537	48548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015979	AACTGA	2	12	51618	51629	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347533744
17	NC_015979	CGGCAG	2	12	53632	53643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347533746
18	NC_015979	CGATAA	2	12	54123	54134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347533746
19	NC_015979	TATATT	2	12	55553	55564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015979	TGAGTT	2	12	57251	57262	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347533751
21	NC_015979	TTATTT	2	12	58352	58363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.