MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	ATACT	2	10	1109	1118	40 %	40 %	0 %	20 %	347533701
2	NC_015979	GGAAA	2	10	1574	1583	60 %	0 %	40 %	0 %	347533701
3	NC_015979	AATTA	3	15	2822	2836	60 %	40 %	0 %	0 %	347533703
4	NC_015979	AAAAT	2	10	4206	4215	80 %	20 %	0 %	0 %	347533704
5	NC_015979	TAATT	2	10	4647	4656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015979	TATCA	2	10	6213	6222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015979	GAAAT	2	10	6257	6266	60 %	20 %	20 %	0 %	347533708
8	NC_015979	CTAGC	2	10	7481	7490	20 %	20 %	20 %	40 %	347533708
9	NC_015979	TAATT	2	10	8118	8127	40 %	60 %	0 %	0 %	347533709
10	NC_015979	AAAAT	2	10	8597	8606	80 %	20 %	0 %	0 %	347533710
11	NC_015979	AAAAT	2	10	11883	11892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015979	AACTC	2	10	14841	14850	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015979	AAAAT	2	10	15195	15204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015979	GTTTT	2	10	18275	18284	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015979	AATTA	2	10	19867	19876	60 %	40 %	0 %	0 %	347533722
16	NC_015979	TTATT	2	10	21192	21201	20 %	80 %	0 %	0 %	347533722
17	NC_015979	AATTT	2	10	21511	21520	40 %	60 %	0 %	0 %	347533723
18	NC_015979	AAATT	2	10	23806	23815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015979	GATTA	2	10	24994	25003	40 %	40 %	20 %	0 %	347533726
20	NC_015979	AGAAA	2	10	27710	27719	80 %	0 %	20 %	0 %	347533728
21	NC_015979	GCCAA	2	10	29104	29113	40 %	0 %	20 %	40 %	347533730
22	NC_015979	GCCGG	2	10	29349	29358	0 %	0 %	60 %	40 %	347533731
23	NC_015979	TGAAT	2	10	29437	29446	40 %	40 %	20 %	0 %	347533731
24	NC_015979	AATTG	2	10	30515	30524	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015979	AGCGT	2	10	31820	31829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015979	ATTGA	2	10	35615	35624	40 %	40 %	20 %	0 %	347533735
27	NC_015979	CAAAA	2	10	39802	39811	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015979	GTTTT	2	10	40539	40548	0 %	80 %	20 %	0 %	347533738
29	NC_015979	GCTTT	2	10	41085	41094	0 %	60 %	20 %	20 %	347533738
30	NC_015979	TTTGT	2	10	41526	41535	0 %	80 %	20 %	0 %	347533738
31	NC_015979	GAATG	2	10	43857	43866	40 %	20 %	40 %	0 %	347533740
32	NC_015979	TTATA	2	10	49717	49726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015979	TTTAA	2	10	50180	50189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015979	ATGCT	2	10	50256	50265	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015979	AACTT	2	10	50976	50985	40 %	40 %	0 %	20 %	347533743
36	NC_015979	CATTT	2	10	51965	51974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015979	ATTCA	2	10	54005	54014	40 %	40 %	0 %	20 %	347533746
38	NC_015979	CCGGC	2	10	54093	54102	0 %	0 %	40 %	60 %	347533746
39	NC_015979	TTGGC	2	10	54338	54347	0 %	40 %	40 %	20 %	347533747
40	NC_015979	TGTTT	2	10	54438	54447	0 %	80 %	20 %	0 %	347533747
41	NC_015979	CTTTT	2	10	57894	57903	0 %	80 %	0 %	20 %	347533752
42	NC_015979	TACAG	2	10	58254	58263	40 %	20 %	20 %	20 %	347533752

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.