MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	ATACT	2	10	1109	1118	40 %	40 %	0 %	20 %	347533701
2	NC_015979	GGAAA	2	10	1574	1583	60 %	0 %	40 %	0 %	347533701
3	NC_015979	AATTA	3	15	2822	2836	60 %	40 %	0 %	0 %	347533703
4	NC_015979	AAAAT	2	10	4206	4215	80 %	20 %	0 %	0 %	347533704
5	NC_015979	GAAAT	2	10	6257	6266	60 %	20 %	20 %	0 %	347533708
6	NC_015979	CTAGC	2	10	7481	7490	20 %	20 %	20 %	40 %	347533708
7	NC_015979	TAATT	2	10	8118	8127	40 %	60 %	0 %	0 %	347533709
8	NC_015979	AAAAT	2	10	8597	8606	80 %	20 %	0 %	0 %	347533710
9	NC_015979	AATTA	2	10	19867	19876	60 %	40 %	0 %	0 %	347533722
10	NC_015979	TTATT	2	10	21192	21201	20 %	80 %	0 %	0 %	347533722
11	NC_015979	AATTT	2	10	21511	21520	40 %	60 %	0 %	0 %	347533723
12	NC_015979	GATTA	2	10	24994	25003	40 %	40 %	20 %	0 %	347533726
13	NC_015979	AGAAA	2	10	27710	27719	80 %	0 %	20 %	0 %	347533728
14	NC_015979	GCCAA	2	10	29104	29113	40 %	0 %	20 %	40 %	347533730
15	NC_015979	GCCGG	2	10	29349	29358	0 %	0 %	60 %	40 %	347533731
16	NC_015979	TGAAT	2	10	29437	29446	40 %	40 %	20 %	0 %	347533731
17	NC_015979	ATTGA	2	10	35615	35624	40 %	40 %	20 %	0 %	347533735
18	NC_015979	GTTTT	2	10	40539	40548	0 %	80 %	20 %	0 %	347533738
19	NC_015979	GCTTT	2	10	41085	41094	0 %	60 %	20 %	20 %	347533738
20	NC_015979	TTTGT	2	10	41526	41535	0 %	80 %	20 %	0 %	347533738
21	NC_015979	GAATG	2	10	43857	43866	40 %	20 %	40 %	0 %	347533740
22	NC_015979	AACTT	2	10	50976	50985	40 %	40 %	0 %	20 %	347533743
23	NC_015979	ATTCA	2	10	54005	54014	40 %	40 %	0 %	20 %	347533746
24	NC_015979	CCGGC	2	10	54093	54102	0 %	0 %	40 %	60 %	347533746
25	NC_015979	TTGGC	2	10	54338	54347	0 %	40 %	40 %	20 %	347533747
26	NC_015979	TGTTT	2	10	54438	54447	0 %	80 %	20 %	0 %	347533747
27	NC_015979	CTTTT	2	10	57894	57903	0 %	80 %	0 %	20 %	347533752
28	NC_015979	TACAG	2	10	58254	58263	40 %	20 %	20 %	20 %	347533752

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.