MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	TCAA	2	8	356	363	50 %	25 %	0 %	25 %	347533701
2	NC_015979	TAGA	2	8	617	624	50 %	25 %	25 %	0 %	347533701
3	NC_015979	AGTC	2	8	953	960	25 %	25 %	25 %	25 %	347533701
4	NC_015979	TAAT	2	8	1001	1008	50 %	50 %	0 %	0 %	347533701
5	NC_015979	AAAC	2	8	1030	1037	75 %	0 %	0 %	25 %	347533701
6	NC_015979	TAAT	2	8	1433	1440	50 %	50 %	0 %	0 %	347533701
7	NC_015979	TAGA	2	8	1757	1764	50 %	25 %	25 %	0 %	347533701
8	NC_015979	AGCA	2	8	2443	2450	50 %	0 %	25 %	25 %	347533702
9	NC_015979	TGAG	2	8	2561	2568	25 %	25 %	50 %	0 %	347533703
10	NC_015979	ACTC	2	8	2647	2654	25 %	25 %	0 %	50 %	347533703
11	NC_015979	ATGA	2	8	4098	4105	50 %	25 %	25 %	0 %	347533704
12	NC_015979	TGTT	2	8	5739	5746	0 %	75 %	25 %	0 %	347533707
13	NC_015979	AACT	2	8	6441	6448	50 %	25 %	0 %	25 %	347533708
14	NC_015979	CTAA	2	8	6662	6669	50 %	25 %	0 %	25 %	347533708
15	NC_015979	TGGC	2	8	7240	7247	0 %	25 %	50 %	25 %	347533708
16	NC_015979	GGAC	2	8	7368	7375	25 %	0 %	50 %	25 %	347533708
17	NC_015979	GTTA	2	8	8287	8294	25 %	50 %	25 %	0 %	347533709
18	NC_015979	GTAT	2	8	8324	8331	25 %	50 %	25 %	0 %	347533709
19	NC_015979	AAGA	2	8	8626	8633	75 %	0 %	25 %	0 %	347533710
20	NC_015979	CCAA	2	8	8696	8703	50 %	0 %	0 %	50 %	347533710
21	NC_015979	TTAA	2	8	10004	10011	50 %	50 %	0 %	0 %	347533714
22	NC_015979	ACTG	2	8	10081	10088	25 %	25 %	25 %	25 %	347533714
23	NC_015979	CAGG	2	8	11569	11576	25 %	0 %	50 %	25 %	347533716
24	NC_015979	TAAC	2	8	12647	12654	50 %	25 %	0 %	25 %	347533718
25	NC_015979	GCGT	2	8	12799	12806	0 %	25 %	50 %	25 %	347533718
26	NC_015979	CAGG	2	8	12932	12939	25 %	0 %	50 %	25 %	347533718
27	NC_015979	TGGT	2	8	13236	13243	0 %	50 %	50 %	0 %	347533718
28	NC_015979	CTTG	2	8	13259	13266	0 %	50 %	25 %	25 %	347533718
29	NC_015979	GCCG	2	8	13413	13420	0 %	0 %	50 %	50 %	347533718
30	NC_015979	TGAT	2	8	13599	13606	25 %	50 %	25 %	0 %	347533718
31	NC_015979	TCAA	2	8	13648	13655	50 %	25 %	0 %	25 %	347533718
32	NC_015979	ATTC	2	8	13772	13779	25 %	50 %	0 %	25 %	347533718
33	NC_015979	TTAG	2	8	15546	15553	25 %	50 %	25 %	0 %	347533720
34	NC_015979	TCGA	2	8	15617	15624	25 %	25 %	25 %	25 %	347533720
35	NC_015979	GATT	2	8	15747	15754	25 %	50 %	25 %	0 %	347533720
36	NC_015979	TTCG	2	8	16126	16133	0 %	50 %	25 %	25 %	347533720
37	NC_015979	GTTA	2	8	17648	17655	25 %	50 %	25 %	0 %	347533721
38	NC_015979	TGAT	2	8	18747	18754	25 %	50 %	25 %	0 %	347533722
39	NC_015979	CTAA	2	8	18755	18762	50 %	25 %	0 %	25 %	347533722
40	NC_015979	TCAC	2	8	18828	18835	25 %	25 %	0 %	50 %	347533722
41	NC_015979	AATT	2	8	18856	18863	50 %	50 %	0 %	0 %	347533722
42	NC_015979	AATT	2	8	18900	18907	50 %	50 %	0 %	0 %	347533722
43	NC_015979	GATC	2	8	19019	19026	25 %	25 %	25 %	25 %	347533722
44	NC_015979	TTAG	2	8	19052	19059	25 %	50 %	25 %	0 %	347533722
45	NC_015979	CAAT	2	8	20166	20173	50 %	25 %	0 %	25 %	347533722
46	NC_015979	ACAA	2	8	20283	20290	75 %	0 %	0 %	25 %	347533722
47	NC_015979	TTTC	2	8	20582	20589	0 %	75 %	0 %	25 %	347533722
48	NC_015979	TGGT	2	8	21103	21110	0 %	50 %	50 %	0 %	347533722
49	NC_015979	AGGA	2	8	21485	21492	50 %	0 %	50 %	0 %	347533722
50	NC_015979	TGGC	2	8	21622	21629	0 %	25 %	50 %	25 %	347533723
51	NC_015979	CCAA	2	8	21960	21967	50 %	0 %	0 %	50 %	347533723
52	NC_015979	GGAA	2	8	23041	23048	50 %	0 %	50 %	0 %	347533723
53	NC_015979	CAAG	2	8	23091	23098	50 %	0 %	25 %	25 %	347533723
54	NC_015979	GCAA	2	8	23600	23607	50 %	0 %	25 %	25 %	347533724
55	NC_015979	TTGA	2	8	23655	23662	25 %	50 %	25 %	0 %	347533724
56	NC_015979	GATT	2	8	24066	24073	25 %	50 %	25 %	0 %	347533725
57	NC_015979	TTAG	2	8	24172	24179	25 %	50 %	25 %	0 %	347533725
58	NC_015979	GAAC	2	8	24498	24505	50 %	0 %	25 %	25 %	347533725
59	NC_015979	CATT	2	8	24551	24558	25 %	50 %	0 %	25 %	347533725
60	NC_015979	AGTA	2	8	24805	24812	50 %	25 %	25 %	0 %	347533725
61	NC_015979	ATCC	2	8	25065	25072	25 %	25 %	0 %	50 %	347533726
62	NC_015979	TGAA	2	8	25143	25150	50 %	25 %	25 %	0 %	347533726
63	NC_015979	TGAT	2	8	25302	25309	25 %	50 %	25 %	0 %	347533726
64	NC_015979	CAAG	2	8	25486	25493	50 %	0 %	25 %	25 %	347533726
65	NC_015979	GAAC	2	8	25655	25662	50 %	0 %	25 %	25 %	347533726
66	NC_015979	TATC	2	8	25740	25747	25 %	50 %	0 %	25 %	347533727
67	NC_015979	AATT	2	8	26164	26171	50 %	50 %	0 %	0 %	347533727
68	NC_015979	AAAC	2	8	26328	26335	75 %	0 %	0 %	25 %	347533727
69	NC_015979	TCAA	2	8	26805	26812	50 %	25 %	0 %	25 %	347533728
70	NC_015979	TAAC	2	8	27855	27862	50 %	25 %	0 %	25 %	347533728
71	NC_015979	CAAA	2	8	29003	29010	75 %	0 %	0 %	25 %	347533730
72	NC_015979	GGCT	2	8	29161	29168	0 %	25 %	50 %	25 %	347533730
73	NC_015979	ATTC	2	8	29718	29725	25 %	50 %	0 %	25 %	347533731
74	NC_015979	CAAC	2	8	29848	29855	50 %	0 %	0 %	50 %	347533731
75	NC_015979	TTGG	2	8	30767	30774	0 %	50 %	50 %	0 %	347533732
76	NC_015979	GCCC	2	8	30844	30851	0 %	0 %	25 %	75 %	347533732
77	NC_015979	CCAG	2	8	30928	30935	25 %	0 %	25 %	50 %	347533732
78	NC_015979	TCTT	2	8	30936	30943	0 %	75 %	0 %	25 %	347533732
79	NC_015979	TCAT	2	8	30992	30999	25 %	50 %	0 %	25 %	347533732
80	NC_015979	GGTT	2	8	31056	31063	0 %	50 %	50 %	0 %	347533732
81	NC_015979	CAAC	2	8	31294	31301	50 %	0 %	0 %	50 %	347533732
82	NC_015979	AATC	2	8	33169	33176	50 %	25 %	0 %	25 %	347533733
83	NC_015979	AAAG	2	8	33297	33304	75 %	0 %	25 %	0 %	347533733
84	NC_015979	TGCT	2	8	33982	33989	0 %	50 %	25 %	25 %	347533734
85	NC_015979	AAAG	2	8	34349	34356	75 %	0 %	25 %	0 %	347533734
86	NC_015979	TAAA	2	8	34692	34699	75 %	25 %	0 %	0 %	347533735
87	NC_015979	GATT	2	8	34972	34979	25 %	50 %	25 %	0 %	347533735
88	NC_015979	AGTT	2	8	35016	35023	25 %	50 %	25 %	0 %	347533735
89	NC_015979	GAAT	2	8	35029	35036	50 %	25 %	25 %	0 %	347533735
90	NC_015979	CATC	2	8	35324	35331	25 %	25 %	0 %	50 %	347533735
91	NC_015979	ATTA	2	8	35546	35553	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
92	NC_015979	TTAT	2	8	35787	35794	25 %	75 %	0 %	0 %	347533735
93	NC_015979	TTGA	2	8	35822	35829	25 %	50 %	25 %	0 %	347533735
94	NC_015979	ACTA	2	8	36458	36465	50 %	25 %	0 %	25 %	347533735
95	NC_015979	TTTG	2	8	36679	36686	0 %	75 %	25 %	0 %	347533736
96	NC_015979	TAAG	2	8	36965	36972	50 %	25 %	25 %	0 %	347533736
97	NC_015979	AAAT	2	8	37047	37054	75 %	25 %	0 %	0 %	347533736
98	NC_015979	CTTA	2	8	37601	37608	25 %	50 %	0 %	25 %	347533736
99	NC_015979	AGAA	2	8	38391	38398	75 %	0 %	25 %	0 %	347533737
100	NC_015979	GATG	2	8	38428	38435	25 %	25 %	50 %	0 %	347533737
101	NC_015979	TGGT	2	8	38440	38447	0 %	50 %	50 %	0 %	347533737
102	NC_015979	AATC	2	8	40107	40114	50 %	25 %	0 %	25 %	347533738
103	NC_015979	AAAT	2	8	40806	40813	75 %	25 %	0 %	0 %	347533738
104	NC_015979	GTTT	2	8	40909	40916	0 %	75 %	25 %	0 %	347533738
105	NC_015979	TGGT	2	8	41248	41255	0 %	50 %	50 %	0 %	347533738
106	NC_015979	TGTT	2	8	41350	41357	0 %	75 %	25 %	0 %	347533738
107	NC_015979	TGTT	2	8	41537	41544	0 %	75 %	25 %	0 %	347533738
108	NC_015979	GAGT	2	8	42495	42502	25 %	25 %	50 %	0 %	347533739
109	NC_015979	TTCG	2	8	42963	42970	0 %	50 %	25 %	25 %	347533739
110	NC_015979	CCAA	2	8	43144	43151	50 %	0 %	0 %	50 %	347533739
111	NC_015979	TGAT	2	8	44044	44051	25 %	50 %	25 %	0 %	347533740
112	NC_015979	GCTA	2	8	50054	50061	25 %	25 %	25 %	25 %	347533741
113	NC_015979	AAGA	2	8	50071	50078	75 %	0 %	25 %	0 %	347533741
114	NC_015979	ATGA	2	8	50762	50769	50 %	25 %	25 %	0 %	347533743
115	NC_015979	ACTT	2	8	51254	51261	25 %	50 %	0 %	25 %	347533744
116	NC_015979	AGTT	2	8	51447	51454	25 %	50 %	25 %	0 %	347533744
117	NC_015979	AATT	2	8	52451	52458	50 %	50 %	0 %	0 %	347533745
118	NC_015979	AGCC	2	8	54283	54290	25 %	0 %	25 %	50 %	347533747
119	NC_015979	TATG	2	8	54677	54684	25 %	50 %	25 %	0 %	347533748
120	NC_015979	AAAG	2	8	55923	55930	75 %	0 %	25 %	0 %	347533749
121	NC_015979	TTCA	2	8	56686	56693	25 %	50 %	0 %	25 %	347533750
122	NC_015979	CTAA	2	8	56807	56814	50 %	25 %	0 %	25 %	347533750
123	NC_015979	CATA	2	8	57081	57088	50 %	25 %	0 %	25 %	347533751
124	NC_015979	ATGT	2	8	57763	57770	25 %	50 %	25 %	0 %	347533752
125	NC_015979	TAAT	2	8	57928	57935	50 %	50 %	0 %	0 %	347533752
126	NC_015979	AAGC	2	8	58193	58200	50 %	0 %	25 %	25 %	347533752

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.