MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	CAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015979	TAA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015979	ACT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015979	ATA	2	6	377	382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
5	NC_015979	TAA	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
6	NC_015979	ATC	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533701
7	NC_015979	GAA	2	6	454	459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533701
8	NC_015979	AGC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533701
9	NC_015979	GTA	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
10	NC_015979	ATA	2	6	890	895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
11	NC_015979	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533701
12	NC_015979	TGA	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
13	NC_015979	TGA	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
14	NC_015979	ATG	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
15	NC_015979	TTA	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533701
16	NC_015979	TGA	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
17	NC_015979	TAA	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
18	NC_015979	TGA	3	9	1746	1754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
19	NC_015979	ATA	2	6	1888	1893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015979	ATC	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015979	GAC	2	6	1996	2001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015979	GAA	2	6	2002	2007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015979	AAG	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015979	ACT	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015979	TGG	2	6	2128	2133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015979	GAA	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015979	ATT	2	6	2259	2264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015979	TGA	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015979	AAG	2	6	2377	2382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533702
30	NC_015979	TTG	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533702
31	NC_015979	GTT	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533702
32	NC_015979	CAT	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533703
33	NC_015979	ATT	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533703
34	NC_015979	GAA	2	6	2737	2742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533703
35	NC_015979	AAC	2	6	2747	2752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533703
36	NC_015979	AAC	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533703
37	NC_015979	GTT	2	6	2964	2969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015979	ATA	2	6	3043	3048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015979	ATT	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015979	TCT	2	6	3295	3300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015979	CCA	2	6	3388	3393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015979	TAA	2	6	3396	3401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015979	GAA	2	6	3415	3420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015979	ATT	2	6	3500	3505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015979	ATT	2	6	3509	3514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015979	CTA	2	6	3522	3527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015979	TTG	2	6	3617	3622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015979	ACT	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015979	TAG	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015979	TCT	2	6	3857	3862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015979	TTC	2	6	3959	3964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015979	ATA	2	6	3978	3983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015979	ATT	3	9	4032	4040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533704
54	NC_015979	CTT	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533704
55	NC_015979	ATA	2	6	4148	4153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
56	NC_015979	GCA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533704
57	NC_015979	ATA	2	6	4182	4187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
58	NC_015979	ATA	3	9	4223	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
59	NC_015979	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533704
60	NC_015979	ATT	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533705
61	NC_015979	CCT	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533705
62	NC_015979	TTC	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533705
63	NC_015979	CTT	2	6	4428	4433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533705
64	NC_015979	TAA	2	6	4501	4506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533705
65	NC_015979	AAC	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533705
66	NC_015979	TAA	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015979	CAT	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015979	CAA	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015979	ACT	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533706
70	NC_015979	TGT	2	6	4757	4762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533706
71	NC_015979	CCA	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533706
72	NC_015979	ATG	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533706
73	NC_015979	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533706
74	NC_015979	TCA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533706
75	NC_015979	AAT	2	6	4886	4891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015979	GAT	3	9	4950	4958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015979	TCG	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015979	AAG	2	6	5172	5177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015979	AAG	2	6	5182	5187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015979	CAA	2	6	5201	5206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015979	TGA	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015979	TAC	2	6	5513	5518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015979	AGT	2	6	5555	5560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015979	CTT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533707
85	NC_015979	GAT	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533707
86	NC_015979	TGC	2	6	6023	6028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533707
87	NC_015979	ACG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533707
88	NC_015979	ATA	2	6	6167	6172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533707
89	NC_015979	CAT	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015979	AGG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015979	GCT	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533708
92	NC_015979	CAA	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533708
93	NC_015979	AGA	2	6	6493	6498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533708
94	NC_015979	ATA	2	6	6690	6695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533708
95	NC_015979	CTT	2	6	6817	6822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533708
96	NC_015979	ACT	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533708
97	NC_015979	CTT	2	6	6913	6918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533708
98	NC_015979	CAA	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533708
99	NC_015979	CAA	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533708
100	NC_015979	TAG	3	9	7167	7175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533708
101	NC_015979	GAG	2	6	7178	7183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533708
102	NC_015979	TAC	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533708
103	NC_015979	GAC	2	6	7539	7544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015979	ATG	2	6	7615	7620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015979	GTG	2	6	7653	7658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015979	TAT	2	6	7728	7733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533709
107	NC_015979	ACA	2	6	7766	7771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533709
108	NC_015979	TTG	2	6	7787	7792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533709
109	NC_015979	TAT	2	6	7899	7904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533709
110	NC_015979	TGC	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533709
111	NC_015979	AAC	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533709
112	NC_015979	TTC	2	6	7954	7959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533709
113	NC_015979	TTC	2	6	8302	8307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533709
114	NC_015979	AAG	2	6	8342	8347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533709
115	NC_015979	AAT	2	6	8366	8371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533709
116	NC_015979	TAT	2	6	8432	8437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015979	AAT	2	6	8453	8458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015979	TAG	2	6	8528	8533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533710
119	NC_015979	TAT	2	6	8869	8874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015979	GCA	2	6	8876	8881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015979	TAG	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015979	ATT	2	6	8975	8980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015979	CAC	3	9	9045	9053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015979	AAT	2	6	9177	9182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533711
125	NC_015979	ATT	2	6	9204	9209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533711
126	NC_015979	ATT	2	6	9228	9233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533711
127	NC_015979	ATT	2	6	9431	9436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533712
128	NC_015979	ATG	2	6	9450	9455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533712
129	NC_015979	GGA	2	6	9485	9490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015979	ATG	2	6	9492	9497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015979	AAT	2	6	9501	9506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015979	CGT	2	6	9623	9628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533713
133	NC_015979	TCG	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533713
134	NC_015979	CAC	2	6	9740	9745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533713
135	NC_015979	TCT	2	6	9808	9813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533713
136	NC_015979	TGG	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533713
137	NC_015979	TCC	2	6	9847	9852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533713
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265	NC_015979	TGG	2	6	20482	20487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533722
266	NC_015979	CGA	2	6	20516	20521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533722
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268	NC_015979	TTC	2	6	20568	20573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533722
269	NC_015979	GTC	2	6	20763	20768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533722
270	NC_015979	ATT	2	6	20901	20906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533722
271	NC_015979	ATT	2	6	20921	20926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533722
272	NC_015979	GAT	2	6	20933	20938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533722
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291	NC_015979	TGA	2	6	22619	22624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533723
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293	NC_015979	CAT	2	6	22676	22681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533723
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296	NC_015979	ATT	2	6	22863	22868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533723
297	NC_015979	ATG	2	6	23011	23016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533723
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373	NC_015979	GAT	3	9	30275	30283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
374	NC_015979	GCC	2	6	30354	30359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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376	NC_015979	CAC	2	6	30442	30447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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378	NC_015979	GAC	2	6	30477	30482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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