MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	A	7	7	318	324	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
2	NC_015979	A	6	6	333	338	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
3	NC_015979	A	6	6	827	832	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
4	NC_015979	T	8	8	899	906	0 %	100 %	0 %	0 %	347533701
5	NC_015979	T	6	6	936	941	0 %	100 %	0 %	0 %	347533701
6	NC_015979	A	6	6	965	970	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
7	NC_015979	A	6	6	1149	1154	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
8	NC_015979	A	6	6	1566	1571	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
9	NC_015979	T	6	6	1680	1685	0 %	100 %	0 %	0 %	347533701
10	NC_015979	A	6	6	2386	2391	100 %	0 %	0 %	0 %	347533702
11	NC_015979	A	6	6	2684	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	347533703
12	NC_015979	A	6	6	4165	4170	100 %	0 %	0 %	0 %	347533704
13	NC_015979	T	6	6	4299	4304	0 %	100 %	0 %	0 %	347533704
14	NC_015979	T	6	6	4315	4320	0 %	100 %	0 %	0 %	347533704
15	NC_015979	A	7	7	5882	5888	100 %	0 %	0 %	0 %	347533707
16	NC_015979	T	6	6	6153	6158	0 %	100 %	0 %	0 %	347533707
17	NC_015979	A	6	6	6648	6653	100 %	0 %	0 %	0 %	347533708
18	NC_015979	A	7	7	7024	7030	100 %	0 %	0 %	0 %	347533708
19	NC_015979	T	6	6	8201	8206	0 %	100 %	0 %	0 %	347533709
20	NC_015979	A	7	7	8644	8650	100 %	0 %	0 %	0 %	347533710
21	NC_015979	A	6	6	10364	10369	100 %	0 %	0 %	0 %	347533715
22	NC_015979	A	6	6	11213	11218	100 %	0 %	0 %	0 %	347533716
23	NC_015979	T	6	6	15928	15933	0 %	100 %	0 %	0 %	347533720
24	NC_015979	A	6	6	16913	16918	100 %	0 %	0 %	0 %	347533721
25	NC_015979	A	7	7	18159	18165	100 %	0 %	0 %	0 %	347533721
26	NC_015979	A	7	7	18785	18791	100 %	0 %	0 %	0 %	347533722
27	NC_015979	A	6	6	18849	18854	100 %	0 %	0 %	0 %	347533722
28	NC_015979	A	6	6	19997	20002	100 %	0 %	0 %	0 %	347533722
29	NC_015979	T	6	6	20905	20910	0 %	100 %	0 %	0 %	347533722
30	NC_015979	A	6	6	20911	20916	100 %	0 %	0 %	0 %	347533722
31	NC_015979	T	6	6	21223	21228	0 %	100 %	0 %	0 %	347533722
32	NC_015979	A	6	6	21568	21573	100 %	0 %	0 %	0 %	347533723
33	NC_015979	T	6	6	22057	22062	0 %	100 %	0 %	0 %	347533723
34	NC_015979	A	6	6	22664	22669	100 %	0 %	0 %	0 %	347533723
35	NC_015979	A	6	6	24028	24033	100 %	0 %	0 %	0 %	347533725
36	NC_015979	A	6	6	24235	24240	100 %	0 %	0 %	0 %	347533725
37	NC_015979	A	7	7	25467	25473	100 %	0 %	0 %	0 %	347533726
38	NC_015979	A	6	6	25542	25547	100 %	0 %	0 %	0 %	347533726
39	NC_015979	A	6	6	25777	25782	100 %	0 %	0 %	0 %	347533727
40	NC_015979	A	7	7	26797	26803	100 %	0 %	0 %	0 %	347533728
41	NC_015979	T	7	7	27136	27142	0 %	100 %	0 %	0 %	347533728
42	NC_015979	A	6	6	27185	27190	100 %	0 %	0 %	0 %	347533728
43	NC_015979	A	6	6	27236	27241	100 %	0 %	0 %	0 %	347533728
44	NC_015979	A	6	6	27549	27554	100 %	0 %	0 %	0 %	347533728
45	NC_015979	T	7	7	28412	28418	0 %	100 %	0 %	0 %	347533729
46	NC_015979	A	6	6	28426	28431	100 %	0 %	0 %	0 %	347533729
47	NC_015979	A	7	7	29195	29201	100 %	0 %	0 %	0 %	347533730
48	NC_015979	A	6	6	29728	29733	100 %	0 %	0 %	0 %	347533731
49	NC_015979	A	6	6	32840	32845	100 %	0 %	0 %	0 %	347533733
50	NC_015979	T	6	6	32896	32901	0 %	100 %	0 %	0 %	347533733
51	NC_015979	A	7	7	33234	33240	100 %	0 %	0 %	0 %	347533733
52	NC_015979	A	7	7	33481	33487	100 %	0 %	0 %	0 %	347533733
53	NC_015979	A	8	8	34676	34683	100 %	0 %	0 %	0 %	347533735
54	NC_015979	T	6	6	34709	34714	0 %	100 %	0 %	0 %	347533735
55	NC_015979	A	7	7	35113	35119	100 %	0 %	0 %	0 %	347533735
56	NC_015979	A	7	7	35168	35174	100 %	0 %	0 %	0 %	347533735
57	NC_015979	A	6	6	35555	35560	100 %	0 %	0 %	0 %	347533735
58	NC_015979	A	6	6	36121	36126	100 %	0 %	0 %	0 %	347533735
59	NC_015979	A	7	7	36582	36588	100 %	0 %	0 %	0 %	347533736
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61	NC_015979	A	6	6	37172	37177	100 %	0 %	0 %	0 %	347533736
62	NC_015979	A	7	7	37365	37371	100 %	0 %	0 %	0 %	347533736
63	NC_015979	A	6	6	37416	37421	100 %	0 %	0 %	0 %	347533736
64	NC_015979	A	6	6	37520	37525	100 %	0 %	0 %	0 %	347533736
65	NC_015979	A	7	7	39054	39060	100 %	0 %	0 %	0 %	347533737
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68	NC_015979	A	7	7	41239	41245	100 %	0 %	0 %	0 %	347533738
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72	NC_015979	A	6	6	43634	43639	100 %	0 %	0 %	0 %	347533740
73	NC_015979	A	7	7	43938	43944	100 %	0 %	0 %	0 %	347533740
74	NC_015979	A	7	7	44251	44257	100 %	0 %	0 %	0 %	347533740
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82	NC_015979	A	6	6	54814	54819	100 %	0 %	0 %	0 %	347533748
83	NC_015979	A	8	8	54866	54873	100 %	0 %	0 %	0 %	347533748
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91	NC_015979	T	7	7	57380	57386	0 %	100 %	0 %	0 %	347533751
92	NC_015979	T	7	7	57399	57405	0 %	100 %	0 %	0 %	347533751
93	NC_015979	C	6	6	57442	57447	0 %	0 %	0 %	100 %	347533752
94	NC_015979	T	7	7	57642	57648	0 %	100 %	0 %	0 %	347533752

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.