MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 1114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015978	TTGGA	2	10	460	469	20 %	40 %	40 %	0 %	347533754
2	NC_015978	TTCAA	2	10	2094	2103	40 %	40 %	0 %	20 %	347533755
3	NC_015978	AATTA	2	10	2805	2814	60 %	40 %	0 %	0 %	347533755
4	NC_015978	TATGG	2	10	6768	6777	20 %	40 %	40 %	0 %	347533759
5	NC_015978	ATTTG	2	10	7856	7865	20 %	60 %	20 %	0 %	347533759
6	NC_015978	ATATA	2	10	9222	9231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015978	AACTT	2	10	9505	9514	40 %	40 %	0 %	20 %	347533760
8	NC_015978	TTTCA	2	10	10320	10329	20 %	60 %	0 %	20 %	347533762
9	NC_015978	ATAGA	2	10	10523	10532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015978	AATTG	2	10	12961	12970	40 %	40 %	20 %	0 %	347533764
11	NC_015978	CAAAT	2	10	13237	13246	60 %	20 %	0 %	20 %	347533765
12	NC_015978	CCAAT	2	10	15066	15075	40 %	20 %	0 %	40 %	347533766
13	NC_015978	GTTAT	2	10	15866	15875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015978	TTTAG	2	10	16015	16024	20 %	60 %	20 %	0 %	347533767
15	NC_015978	ATCGA	2	10	19112	19121	40 %	20 %	20 %	20 %	347533769
16	NC_015978	ACATT	2	10	22406	22415	40 %	40 %	0 %	20 %	347533772
17	NC_015978	TCTTT	2	10	27088	27097	0 %	80 %	0 %	20 %	347533775
18	NC_015978	TTTCA	2	10	30088	30097	20 %	60 %	0 %	20 %	347533778
19	NC_015978	ATTTT	2	10	31424	31433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015978	AGGAC	2	10	32098	32107	40 %	0 %	40 %	20 %	347533779
21	NC_015978	AATGG	2	10	34362	34371	40 %	20 %	40 %	0 %	347533781
22	NC_015978	ACGAG	2	10	34841	34850	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015978	GCAAT	2	10	36449	36458	40 %	20 %	20 %	20 %	347533783
24	NC_015978	TTAAT	2	10	37725	37734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015978	TGAAT	2	10	38101	38110	40 %	40 %	20 %	0 %	347533784
26	NC_015978	TTAGC	2	10	38205	38214	20 %	40 %	20 %	20 %	347533784
27	NC_015978	GAATG	2	10	38768	38777	40 %	20 %	40 %	0 %	347533784
28	NC_015978	GATTG	2	10	39633	39642	20 %	40 %	40 %	0 %	347533784
29	NC_015978	AAAAG	2	10	40270	40279	80 %	0 %	20 %	0 %	347533784
30	NC_015978	TCGTG	2	10	41799	41808	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015978	GTTAA	2	10	42495	42504	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015978	TTTAT	2	10	45698	45707	20 %	80 %	0 %	0 %	347533785
33	NC_015978	AGTGC	2	10	50274	50283	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015978	TTAGC	2	10	51017	51026	20 %	40 %	20 %	20 %	347533789
35	NC_015978	TCTTT	2	10	51456	51465	0 %	80 %	0 %	20 %	347533790
36	NC_015978	ATGTT	2	10	56510	56519	20 %	60 %	20 %	0 %	347533795
37	NC_015978	AGTTA	2	10	56733	56742	40 %	40 %	20 %	0 %	347533795
38	NC_015978	ACGTT	2	10	58428	58437	20 %	40 %	20 %	20 %	347533797
39	NC_015978	AAATT	2	10	62118	62127	60 %	40 %	0 %	0 %	347533801
40	NC_015978	TCTTT	2	10	62980	62989	0 %	80 %	0 %	20 %	347533801
41	NC_015978	ATTGG	2	10	63067	63076	20 %	40 %	40 %	0 %	347533801
42	NC_015978	TAATA	2	10	64023	64032	60 %	40 %	0 %	0 %	347533801
43	NC_015978	TATAA	2	10	66119	66128	60 %	40 %	0 %	0 %	347533802
44	NC_015978	TTTAG	2	10	66149	66158	20 %	60 %	20 %	0 %	347533802
45	NC_015978	GGCAA	2	10	66780	66789	40 %	0 %	40 %	20 %	347533803
46	NC_015978	AATTA	2	10	67069	67078	60 %	40 %	0 %	0 %	347533803
47	NC_015978	TTACT	2	10	68101	68110	20 %	60 %	0 %	20 %	347533804
48	NC_015978	CGAAA	2	10	68475	68484	60 %	0 %	20 %	20 %	347533804
49	NC_015978	CTAAA	2	10	69761	69770	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015978	AAACA	2	10	70607	70616	80 %	0 %	0 %	20 %	347533806
51	NC_015978	AATTA	2	10	70709	70718	60 %	40 %	0 %	0 %	347533807
52	NC_015978	CAGAA	2	10	71717	71726	60 %	0 %	20 %	20 %	347533808
53	NC_015978	ATTGG	2	10	72904	72913	20 %	40 %	40 %	0 %	347533809
54	NC_015978	TTTGA	2	10	72976	72985	20 %	60 %	20 %	0 %	347533809
55	NC_015978	AATTT	2	10	74545	74554	40 %	60 %	0 %	0 %	347533812
56	NC_015978	ATTTG	2	10	77037	77046	20 %	60 %	20 %	0 %	347533815
57	NC_015978	TAAAA	2	10	77447	77456	80 %	20 %	0 %	0 %	347533815
58	NC_015978	GAAAC	2	10	78964	78973	60 %	0 %	20 %	20 %	347533816
59	NC_015978	TTTCC	2	10	81600	81609	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015978	GTTAC	2	10	84386	84395	20 %	40 %	20 %	20 %	347533820
61	NC_015978	ACATT	2	10	84664	84673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015978	TGTTA	2	10	87054	87063	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015978	AATTT	2	10	91281	91290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015978	TTTCC	2	10	94656	94665	0 %	60 %	0 %	40 %	347533835
65	NC_015978	ATTAT	2	10	96096	96105	40 %	60 %	0 %	0 %	347533836
66	NC_015978	GAATT	2	10	98284	98293	40 %	40 %	20 %	0 %	347533838
67	NC_015978	CCCGT	2	10	98662	98671	0 %	20 %	20 %	60 %	347533838
68	NC_015978	AACAG	2	10	99026	99035	60 %	0 %	20 %	20 %	347533838
69	NC_015978	GAGTT	2	10	99052	99061	20 %	40 %	40 %	0 %	347533838
70	NC_015978	AAAAC	2	10	100195	100204	80 %	0 %	0 %	20 %	347533839
71	NC_015978	TGTTT	2	10	101129	101138	0 %	80 %	20 %	0 %	347533840
72	NC_015978	TTTAT	2	10	101634	101643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015978	TAGAT	2	10	101755	101764	40 %	40 %	20 %	0 %	347533841
74	NC_015978	AACAA	2	10	102527	102536	80 %	0 %	0 %	20 %	347533842
75	NC_015978	GTTTC	2	10	103846	103855	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015978	CTATA	2	10	104204	104213	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015978	TTTCA	2	10	105326	105335	20 %	60 %	0 %	20 %	347533843
78	NC_015978	TTATT	2	10	106654	106663	20 %	80 %	0 %	0 %	347533845
79	NC_015978	TATTT	2	10	107738	107747	20 %	80 %	0 %	0 %	347533847
80	NC_015978	TTTTA	2	10	107821	107830	20 %	80 %	0 %	0 %	347533848
81	NC_015978	ATTTT	2	10	108649	108658	20 %	80 %	0 %	0 %	347533849
82	NC_015978	TCAAA	2	10	109414	109423	60 %	20 %	0 %	20 %	347533850
83	NC_015978	TTAAT	2	10	110060	110069	40 %	60 %	0 %	0 %	347533851
84	NC_015978	GAAAA	2	10	110848	110857	80 %	0 %	20 %	0 %	347533852
85	NC_015978	ATTGA	2	10	111101	111110	40 %	40 %	20 %	0 %	347533853
86	NC_015978	GAATA	2	10	111471	111480	60 %	20 %	20 %	0 %	347533853
87	NC_015978	TTTAA	2	10	115812	115821	40 %	60 %	0 %	0 %	347533860
88	NC_015978	TAAAT	2	10	117496	117505	60 %	40 %	0 %	0 %	347533861
89	NC_015978	ACAAA	2	10	118223	118232	80 %	0 %	0 %	20 %	347533863
90	NC_015978	TTAAT	2	10	118344	118353	40 %	60 %	0 %	0 %	347533863
91	NC_015978	AGTTT	2	10	118968	118977	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015978	TTCAA	2	10	119232	119241	40 %	40 %	0 %	20 %	347533865
93	NC_015978	ATTTT	2	10	120810	120819	20 %	80 %	0 %	0 %	347533866
94	NC_015978	TCGTG	2	10	122224	122233	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015978	GTTAA	2	10	123011	123020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015978	TAAAA	2	10	126173	126182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015978	TTAAA	2	10	126973	126982	60 %	40 %	0 %	0 %	347533868
98	NC_015978	GAACG	2	10	128011	128020	40 %	0 %	40 %	20 %	347533869
99	NC_015978	CTTTC	2	10	129139	129148	0 %	60 %	0 %	40 %	347533870
100	NC_015978	TTAGT	2	10	129303	129312	20 %	60 %	20 %	0 %	347533870
101	NC_015978	ATATA	2	10	129847	129856	60 %	40 %	0 %	0 %	347533871
102	NC_015978	ATTTG	2	10	129889	129898	20 %	60 %	20 %	0 %	347533871
103	NC_015978	TTTTC	2	10	131065	131074	0 %	80 %	0 %	20 %	347533873
104	NC_015978	TGAAA	2	10	131474	131483	60 %	20 %	20 %	0 %	347533873
105	NC_015978	CCATT	2	10	137977	137986	20 %	40 %	0 %	40 %	347533880
106	NC_015978	AATTC	2	10	138829	138838	40 %	40 %	0 %	20 %	347533880
107	NC_015978	GTAAT	2	10	139633	139642	40 %	40 %	20 %	0 %	347533880
108	NC_015978	AATCA	2	10	141140	141149	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015978	CAAAC	2	10	141552	141561	60 %	0 %	0 %	40 %	347533883
110	NC_015978	TTTCA	2	10	142918	142927	20 %	60 %	0 %	20 %	347533883
111	NC_015978	ATTTA	2	10	147004	147013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015978	TAAAC	2	10	147608	147617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015978	TGAAT	2	10	147774	147783	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015978	CTATA	2	10	149115	149124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015978	TGCAA	2	10	149660	149669	40 %	20 %	20 %	20 %	347533886
116	NC_015978	TTGGT	2	10	150155	150164	0 %	60 %	40 %	0 %	347533886
117	NC_015978	AAAAC	2	10	150235	150244	80 %	0 %	0 %	20 %	347533886
118	NC_015978	TCCAT	2	10	153217	153226	20 %	40 %	0 %	40 %	347533888
119	NC_015978	AGAAA	2	10	154242	154251	80 %	0 %	20 %	0 %	347533889
120	NC_015978	ATTGG	2	10	154519	154528	20 %	40 %	40 %	0 %	347533889
121	NC_015978	AACAA	2	10	155119	155128	80 %	0 %	0 %	20 %	347533890
122	NC_015978	GAAAA	2	10	155535	155544	80 %	0 %	20 %	0 %	347533891
123	NC_015978	AAAAC	2	10	156052	156061	80 %	0 %	0 %	20 %	347533891
124	NC_015978	TTTTA	2	10	156170	156179	20 %	80 %	0 %	0 %	347533892
125	NC_015978	ATTCA	2	10	156680	156689	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015978	TTGAA	2	10	157095	157104	40 %	40 %	20 %	0 %	347533893
127	NC_015978	CTTTA	2	10	157441	157450	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015978	ATTTT	2	10	158206	158215	20 %	80 %	0 %	0 %	347533894
129	NC_015978	CCAGT	2	10	158272	158281	20 %	20 %	20 %	40 %	347533894
130	NC_015978	GTATT	2	10	159378	159387	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015978	ATCAA	2	10	159408	159417	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015978	AACAA	2	10	160117	160126	80 %	0 %	0 %	20 %	347533895
133	NC_015978	GAAAA	2	10	160533	160542	80 %	0 %	20 %	0 %	347533896
134	NC_015978	AAAAC	2	10	161050	161059	80 %	0 %	0 %	20 %	347533896
135	NC_015978	GAAAA	2	10	161993	162002	80 %	0 %	20 %	0 %	347533899
136	NC_015978	AAAAT	2	10	163072	163081	80 %	20 %	0 %	0 %	347533899
137	NC_015978	TTAAA	2	10	163102	163111	60 %	40 %	0 %	0 %	347533899
138	NC_015978	AAATG	2	10	164438	164447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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