MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015978	TTAT	2	8	3144	3151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015978	GTAA	2	8	3229	3236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015978	TCCT	2	8	15661	15668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015978	ACGA	2	8	21696	21703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015978	AATT	2	8	24697	24704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015978	ATGG	2	8	25319	25326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015978	TTTG	2	8	25840	25847	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015978	CTTG	2	8	26203	26210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015978	TGAA	2	8	27802	27809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015978	AGAA	2	8	28068	28075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015978	TAAT	2	8	31324	31331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015978	GTTA	2	8	31389	31396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015978	AAAG	2	8	31470	31477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015978	TAAA	2	8	31569	31576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015978	ATTA	2	8	31636	31643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015978	ATTA	2	8	31647	31654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015978	CTTT	2	8	31723	31730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015978	ATTA	2	8	31742	31749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015978	CGGT	2	8	31790	31797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015978	AAAT	2	8	34815	34822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015978	TAAT	2	8	37641	37648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015978	AAAT	2	8	40664	40671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015978	CGAA	2	8	40758	40765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015978	TGGA	2	8	40954	40961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015978	GTGA	2	8	41133	41140	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015978	AACT	2	8	42553	42560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015978	TGCA	2	8	43128	43135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015978	TAGT	2	8	44117	44124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015978	AATT	2	8	44125	44132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015978	TAGG	2	8	44627	44634	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015978	AAGC	2	8	44844	44851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015978	TATG	2	8	45233	45240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015978	AGCT	2	8	47054	47061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015978	TTTA	2	8	50007	50014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015978	ATTG	2	8	51790	51797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015978	CTTT	2	8	53226	53233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015978	AAAC	2	8	55849	55856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015978	TAAC	2	8	60922	60929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015978	TTTA	2	8	64206	64213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015978	TAAG	2	8	67097	67104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015978	CTGT	2	8	69690	69697	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015978	ATTC	2	8	73972	73979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015978	AGTC	2	8	78387	78394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015978	CCTT	2	8	79857	79864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015978	ATGA	2	8	84631	84638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015978	AATT	2	8	87065	87072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015978	CTTT	2	8	87466	87473	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015978	TTTG	2	8	87575	87582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015978	TAAT	2	8	88196	88203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015978	TTAA	2	8	89028	89035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015978	TTAG	2	8	92428	92435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015978	AATT	2	8	96689	96696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015978	GATT	2	8	96766	96773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015978	ATTC	2	8	99123	99130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015978	GAGT	2	8	99143	99150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015978	AAAT	2	8	101375	101382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015978	TTAA	2	8	101626	101633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015978	TTTG	2	8	102742	102749	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015978	AATA	2	8	102836	102843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015978	TCTG	2	8	102933	102940	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015978	GAAA	2	8	103068	103075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015978	TAAT	2	8	103304	103311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015978	ACTG	2	8	104176	104183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015978	ATTT	2	8	104190	104197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015978	AATT	2	8	105784	105791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015978	CTTA	2	8	109209	109216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015978	AAAG	2	8	112606	112613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015978	GAAA	2	8	113104	113111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015978	AGTA	2	8	114911	114918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015978	CAAA	2	8	115766	115773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015978	TTAC	2	8	116998	117005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015978	AAAT	2	8	117019	117026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015978	ATTA	2	8	117037	117044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015978	AATT	2	8	117078	117085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015978	AATA	2	8	117105	117112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015978	CTTA	2	8	118928	118935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015978	AAAT	2	8	120890	120897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015978	TTAA	2	8	120911	120918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015978	ATAA	2	8	121090	121097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015978	CGAA	2	8	121182	121189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015978	TGGA	2	8	121378	121385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015978	GTGA	2	8	121557	121564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015978	CTTG	2	8	122794	122801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015978	AACT	2	8	123069	123076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015978	TGCA	2	8	123644	123651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015978	TAGT	2	8	124633	124640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015978	AATT	2	8	124641	124648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015978	TAGG	2	8	125143	125150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015978	AAGC	2	8	125360	125367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015978	TATG	2	8	125749	125756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015978	GAAA	2	8	126130	126137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015978	TATT	2	8	126261	126268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015978	ATCA	2	8	126336	126343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015978	AATT	2	8	132406	132413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015978	AGTA	2	8	136703	136710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015978	TGTT	2	8	137191	137198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015978	TAAT	2	8	140627	140634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015978	CAAT	2	8	140951	140958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015978	TTTA	2	8	141436	141443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015978	ATTT	2	8	144294	144301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015978	TGAA	2	8	144321	144328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015978	TAAA	2	8	144362	144369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015978	CCAA	2	8	146208	146215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015978	AATT	2	8	146571	146578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015978	GTAT	2	8	146809	146816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015978	GCTT	2	8	146984	146991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015978	GTTG	2	8	147047	147054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015978	TTAT	2	8	147236	147243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015978	GTTA	2	8	147458	147465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015978	GTCA	2	8	147754	147761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015978	CCTA	2	8	147999	148006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015978	TAAT	2	8	148472	148479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015978	CAAC	2	8	148579	148586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015978	GCGA	2	8	148871	148878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015978	ATTA	2	8	149097	149104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015978	TAAT	2	8	156569	156576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015978	AATT	2	8	157452	157459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015978	AAAC	2	8	157788	157795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015978	CAAA	2	8	159614	159621	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015978	CTAA	2	8	161181	161188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015978	TTAA	2	8	163149	163156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015978	AATT	2	8	163364	163371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015978	TAAT	2	8	163436	163443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015978	ATAA	2	8	163456	163463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015978	TATT	2	8	165770	165777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015978	TTTA	2	8	166088	166095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015978	TTTA	2	8	166214	166221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015978	TATT	3	12	166381	166392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015978	AAAT	2	8	166420	166427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015978	TTAT	3	12	166619	166630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015978	ATTT	2	8	166858	166865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015978	TAGA	2	8	175952	175959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015978	AATA	2	8	176009	176016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015978	GAAA	2	8	176055	176062	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015978	TAAT	2	8	180391	180398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015978	ATTT	2	8	181948	181955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015978	CTGA	2	8	181988	181995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015978	ACGA	2	8	182166	182173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015978	AGTA	2	8	188901	188908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015978	TTTA	2	8	189148	189155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015978	ATTG	2	8	189161	189168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015978	TAAT	2	8	189270	189277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015978	TTTC	2	8	189303	189310	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015978	TATT	2	8	190863	190870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015978	TTTG	2	8	192205	192212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015978	TAAT	2	8	193653	193660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015978	AAAG	2	8	196037	196044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015978	TCAA	2	8	196975	196982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015978	TAAA	2	8	200659	200666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015978	ATTT	2	8	204730	204737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_015978	AGAA	2	8	204796	204803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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