MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 3328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015978	TGAA	2	8	381	388	50 %	25 %	25 %	0 %	347533754
2	NC_015978	CTAC	2	8	515	522	25 %	25 %	0 %	50 %	347533754
3	NC_015978	TTGA	2	8	1019	1026	25 %	50 %	25 %	0 %	347533754
4	NC_015978	AATT	2	8	1144	1151	50 %	50 %	0 %	0 %	347533754
5	NC_015978	TCAA	2	8	1951	1958	50 %	25 %	0 %	25 %	347533755
6	NC_015978	TTCA	2	8	1965	1972	25 %	50 %	0 %	25 %	347533755
7	NC_015978	AGTT	2	8	2216	2223	25 %	50 %	25 %	0 %	347533755
8	NC_015978	CCAA	2	8	2889	2896	50 %	0 %	0 %	50 %	347533755
9	NC_015978	GCAA	2	8	3338	3345	50 %	0 %	25 %	25 %	347533756
10	NC_015978	ATTT	2	8	4007	4014	25 %	75 %	0 %	0 %	347533757
11	NC_015978	GAAA	2	8	4240	4247	75 %	0 %	25 %	0 %	347533757
12	NC_015978	AATT	2	8	4539	4546	50 %	50 %	0 %	0 %	347533757
13	NC_015978	AAGT	2	8	4589	4596	50 %	25 %	25 %	0 %	347533757
14	NC_015978	GACA	2	8	4617	4624	50 %	0 %	25 %	25 %	347533758
15	NC_015978	AAAT	2	8	6273	6280	75 %	25 %	0 %	0 %	347533758
16	NC_015978	AAAC	2	8	7383	7390	75 %	0 %	0 %	25 %	347533759
17	NC_015978	AATT	2	8	7432	7439	50 %	50 %	0 %	0 %	347533759
18	NC_015978	TGCT	2	8	7618	7625	0 %	50 %	25 %	25 %	347533759
19	NC_015978	GAAA	2	8	7658	7665	75 %	0 %	25 %	0 %	347533759
20	NC_015978	AAAG	2	8	7727	7734	75 %	0 %	25 %	0 %	347533759
21	NC_015978	AAGC	2	8	7872	7879	50 %	0 %	25 %	25 %	347533759
22	NC_015978	AGTT	2	8	8627	8634	25 %	50 %	25 %	0 %	347533759
23	NC_015978	GTTC	2	8	8649	8656	0 %	50 %	25 %	25 %	347533759
24	NC_015978	TGTT	2	8	8749	8756	0 %	75 %	25 %	0 %	347533759
25	NC_015978	TTAC	2	8	9332	9339	25 %	50 %	0 %	25 %	347533760
26	NC_015978	TGAC	2	8	9404	9411	25 %	25 %	25 %	25 %	347533760
27	NC_015978	AAAC	2	8	9889	9896	75 %	0 %	0 %	25 %	347533761
28	NC_015978	TAAT	2	8	10151	10158	50 %	50 %	0 %	0 %	347533761
29	NC_015978	AGTT	2	8	10645	10652	25 %	50 %	25 %	0 %	347533763
30	NC_015978	CTTA	2	8	10893	10900	25 %	50 %	0 %	25 %	347533763
31	NC_015978	TCAA	2	8	11167	11174	50 %	25 %	0 %	25 %	347533763
32	NC_015978	TTTA	2	8	11250	11257	25 %	75 %	0 %	0 %	347533763
33	NC_015978	AATG	2	8	11692	11699	50 %	25 %	25 %	0 %	347533763
34	NC_015978	ACGA	2	8	11898	11905	50 %	0 %	25 %	25 %	347533763
35	NC_015978	AATT	2	8	12009	12016	50 %	50 %	0 %	0 %	347533763
36	NC_015978	GAAA	2	8	12202	12209	75 %	0 %	25 %	0 %	347533763
37	NC_015978	ATTA	2	8	12277	12284	50 %	50 %	0 %	0 %	347533763
38	NC_015978	CTTC	2	8	12366	12373	0 %	50 %	0 %	50 %	347533763
39	NC_015978	AATT	2	8	12441	12448	50 %	50 %	0 %	0 %	347533763
40	NC_015978	CAAA	2	8	12904	12911	75 %	0 %	0 %	25 %	347533764
41	NC_015978	CTTG	2	8	13511	13518	0 %	50 %	25 %	25 %	347533765
42	NC_015978	TGGT	2	8	13591	13598	0 %	50 %	50 %	0 %	347533765
43	NC_015978	CGGC	2	8	13731	13738	0 %	0 %	50 %	50 %	347533765
44	NC_015978	GAAG	2	8	13863	13870	50 %	0 %	50 %	0 %	347533765
45	NC_015978	TGAT	2	8	14080	14087	25 %	50 %	25 %	0 %	347533765
46	NC_015978	TTTA	2	8	14674	14681	25 %	75 %	0 %	0 %	347533766
47	NC_015978	ACTG	2	8	14845	14852	25 %	25 %	25 %	25 %	347533766
48	NC_015978	TCAG	2	8	16314	16321	25 %	25 %	25 %	25 %	347533767
49	NC_015978	TAAT	2	8	17140	17147	50 %	50 %	0 %	0 %	347533768
50	NC_015978	TTGT	2	8	17770	17777	0 %	75 %	25 %	0 %	347533768
51	NC_015978	GGAT	2	8	18007	18014	25 %	25 %	50 %	0 %	347533768
52	NC_015978	TGAT	2	8	18692	18699	25 %	50 %	25 %	0 %	347533769
53	NC_015978	AATT	2	8	18716	18723	50 %	50 %	0 %	0 %	347533769
54	NC_015978	AAAC	2	8	19612	19619	75 %	0 %	0 %	25 %	347533769
55	NC_015978	ATTG	2	8	19647	19654	25 %	50 %	25 %	0 %	347533769
56	NC_015978	ATTA	2	8	19789	19796	50 %	50 %	0 %	0 %	347533769
57	NC_015978	ATTA	2	8	20072	20079	50 %	50 %	0 %	0 %	347533770
58	NC_015978	AGTT	2	8	20259	20266	25 %	50 %	25 %	0 %	347533770
59	NC_015978	AATC	2	8	20821	20828	50 %	25 %	0 %	25 %	347533771
60	NC_015978	GAAT	2	8	20920	20927	50 %	25 %	25 %	0 %	347533771
61	NC_015978	AACC	2	8	20941	20948	50 %	0 %	0 %	50 %	347533771
62	NC_015978	TTTG	2	8	21185	21192	0 %	75 %	25 %	0 %	347533771
63	NC_015978	ATAA	2	8	22574	22581	75 %	25 %	0 %	0 %	347533772
64	NC_015978	TATT	2	8	23843	23850	25 %	75 %	0 %	0 %	347533774
65	NC_015978	TAAA	2	8	27177	27184	75 %	25 %	0 %	0 %	347533775
66	NC_015978	GATT	2	8	27269	27276	25 %	50 %	25 %	0 %	347533775
67	NC_015978	ATAG	2	8	27386	27393	50 %	25 %	25 %	0 %	347533775
68	NC_015978	TTTG	2	8	27526	27533	0 %	75 %	25 %	0 %	347533775
69	NC_015978	ATTA	2	8	28516	28523	50 %	50 %	0 %	0 %	347533776
70	NC_015978	GATT	2	8	28708	28715	25 %	50 %	25 %	0 %	347533776
71	NC_015978	TTAT	2	8	28861	28868	25 %	75 %	0 %	0 %	347533776
72	NC_015978	TTGG	2	8	29097	29104	0 %	50 %	50 %	0 %	347533777
73	NC_015978	GGAT	2	8	29325	29332	25 %	25 %	50 %	0 %	347533777
74	NC_015978	ATGG	2	8	29786	29793	25 %	25 %	50 %	0 %	347533777
75	NC_015978	TACT	2	8	29797	29804	25 %	50 %	0 %	25 %	347533777
76	NC_015978	TAGT	2	8	30062	30069	25 %	50 %	25 %	0 %	347533778
77	NC_015978	TGAT	2	8	30080	30087	25 %	50 %	25 %	0 %	347533778
78	NC_015978	CAAA	2	8	30606	30613	75 %	0 %	0 %	25 %	347533778
79	NC_015978	TCCA	2	8	30667	30674	25 %	25 %	0 %	50 %	347533778
80	NC_015978	CCAA	2	8	30850	30857	50 %	0 %	0 %	50 %	347533778
81	NC_015978	AGCA	2	8	32252	32259	50 %	0 %	25 %	25 %	347533779
82	NC_015978	AGAA	2	8	32484	32491	75 %	0 %	25 %	0 %	347533779
83	NC_015978	TATG	2	8	32563	32570	25 %	50 %	25 %	0 %	347533779
84	NC_015978	TTAA	2	8	32881	32888	50 %	50 %	0 %	0 %	347533780
85	NC_015978	AGTT	2	8	32970	32977	25 %	50 %	25 %	0 %	347533780
86	NC_015978	CTTA	2	8	33491	33498	25 %	50 %	0 %	25 %	347533780
87	NC_015978	GGGC	2	8	33745	33752	0 %	0 %	75 %	25 %	347533780
88	NC_015978	ATTA	2	8	33839	33846	50 %	50 %	0 %	0 %	347533780
89	NC_015978	AATT	2	8	33889	33896	50 %	50 %	0 %	0 %	347533781
90	NC_015978	TTAA	2	8	34113	34120	50 %	50 %	0 %	0 %	347533781
91	NC_015978	TTGG	2	8	34321	34328	0 %	50 %	50 %	0 %	347533781
92	NC_015978	ATTA	2	8	35498	35505	50 %	50 %	0 %	0 %	347533782
93	NC_015978	AATT	2	8	36279	36286	50 %	50 %	0 %	0 %	347533783
94	NC_015978	TCAT	2	8	36470	36477	25 %	50 %	0 %	25 %	347533783
95	NC_015978	ACTT	2	8	38318	38325	25 %	50 %	0 %	25 %	347533784
96	NC_015978	ATTG	2	8	38947	38954	25 %	50 %	25 %	0 %	347533784
97	NC_015978	AATG	2	8	40067	40074	50 %	25 %	25 %	0 %	347533784
98	NC_015978	CTTT	2	8	40179	40186	0 %	75 %	0 %	25 %	347533784
99	NC_015978	ATTA	2	8	40240	40247	50 %	50 %	0 %	0 %	347533784
100	NC_015978	CAAT	2	8	46685	46692	50 %	25 %	0 %	25 %	347533785
101	NC_015978	GTTT	2	8	47158	47165	0 %	75 %	25 %	0 %	347533786
102	NC_015978	TGAT	2	8	47605	47612	25 %	50 %	25 %	0 %	347533786
103	NC_015978	AATT	2	8	47778	47785	50 %	50 %	0 %	0 %	347533786
104	NC_015978	AAGA	2	8	48376	48383	75 %	0 %	25 %	0 %	347533786
105	NC_015978	TAGT	2	8	48413	48420	25 %	50 %	25 %	0 %	347533786
106	NC_015978	GTTT	2	8	48490	48497	0 %	75 %	25 %	0 %	347533786
107	NC_015978	TGAT	2	8	49161	49168	25 %	50 %	25 %	0 %	347533787
108	NC_015978	ATAA	2	8	49567	49574	75 %	25 %	0 %	0 %	347533787
109	NC_015978	TGAT	2	8	49713	49720	25 %	50 %	25 %	0 %	347533787
110	NC_015978	ATTG	2	8	50691	50698	25 %	50 %	25 %	0 %	347533788
111	NC_015978	TTCC	2	8	50770	50777	0 %	50 %	0 %	50 %	347533788
112	NC_015978	TTTA	2	8	50891	50898	25 %	75 %	0 %	0 %	347533789
113	NC_015978	TGGT	2	8	50933	50940	0 %	50 %	50 %	0 %	347533789
114	NC_015978	TTTA	2	8	51523	51530	25 %	75 %	0 %	0 %	347533790
115	NC_015978	TTGG	2	8	52039	52046	0 %	50 %	50 %	0 %	347533791
116	NC_015978	GTTA	2	8	52322	52329	25 %	50 %	25 %	0 %	347533791
117	NC_015978	CAAC	2	8	52476	52483	50 %	0 %	0 %	50 %	347533791
118	NC_015978	TCCG	2	8	52934	52941	0 %	25 %	25 %	50 %	347533792
119	NC_015978	GTTG	2	8	53296	53303	0 %	50 %	50 %	0 %	347533793
120	NC_015978	AAAT	2	8	53331	53338	75 %	25 %	0 %	0 %	347533793
121	NC_015978	AATT	2	8	53382	53389	50 %	50 %	0 %	0 %	347533793
122	NC_015978	GTTG	2	8	54145	54152	0 %	50 %	50 %	0 %	347533793
123	NC_015978	TTTA	2	8	54650	54657	25 %	75 %	0 %	0 %	347533794
124	NC_015978	TTTA	2	8	55211	55218	25 %	75 %	0 %	0 %	347533794
125	NC_015978	TTCG	2	8	55519	55526	0 %	50 %	25 %	25 %	347533794
126	NC_015978	GTTA	2	8	56239	56246	25 %	50 %	25 %	0 %	347533795
127	NC_015978	TGCT	2	8	57209	57216	0 %	50 %	25 %	25 %	347533795
128	NC_015978	TGAT	2	8	57764	57771	25 %	50 %	25 %	0 %	347533796
129	NC_015978	TTAT	2	8	59093	59100	25 %	75 %	0 %	0 %	347533797
130	NC_015978	AATT	2	8	59318	59325	50 %	50 %	0 %	0 %	347533798
131	NC_015978	CCAA	2	8	59596	59603	50 %	0 %	0 %	50 %	347533798
132	NC_015978	GATG	2	8	59693	59700	25 %	25 %	50 %	0 %	347533798
133	NC_015978	GTGG	2	8	59853	59860	0 %	25 %	75 %	0 %	347533798
134	NC_015978	ACTG	2	8	60280	60287	25 %	25 %	25 %	25 %	347533799
135	NC_015978	GGAT	2	8	61229	61236	25 %	25 %	50 %	0 %	347533800
136	NC_015978	TCAA	2	8	62945	62952	50 %	25 %	0 %	25 %	347533801
137	NC_015978	AATT	2	8	63160	63167	50 %	50 %	0 %	0 %	347533801
138	NC_015978	TCAA	2	8	63353	63360	50 %	25 %	0 %	25 %	347533801
139	NC_015978	AAGC	2	8	63471	63478	50 %	0 %	25 %	25 %	347533801
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