MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015978	AT	3	6	281	286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015978	AG	3	6	3756	3761	50 %	0 %	50 %	0 %	347533757
3	NC_015978	AT	3	6	4153	4158	50 %	50 %	0 %	0 %	347533757
4	NC_015978	AC	3	6	5494	5499	50 %	0 %	0 %	50 %	347533758
5	NC_015978	AT	3	6	15767	15772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015978	GT	3	6	17776	17781	0 %	50 %	50 %	0 %	347533768
7	NC_015978	TA	3	6	21478	21483	50 %	50 %	0 %	0 %	347533771
8	NC_015978	GT	3	6	21865	21870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015978	CA	3	6	23135	23140	50 %	0 %	0 %	50 %	347533773
10	NC_015978	CA	3	6	27280	27285	50 %	0 %	0 %	50 %	347533775
11	NC_015978	AC	3	6	30795	30800	50 %	0 %	0 %	50 %	347533778
12	NC_015978	TA	3	6	31449	31454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015978	CA	3	6	32240	32245	50 %	0 %	0 %	50 %	347533779
14	NC_015978	TG	3	6	33533	33538	0 %	50 %	50 %	0 %	347533780
15	NC_015978	GT	3	6	33868	33873	0 %	50 %	50 %	0 %	347533781
16	NC_015978	CT	3	6	34851	34856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015978	TA	3	6	37747	37752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015978	CT	3	6	38884	38889	0 %	50 %	0 %	50 %	347533784
19	NC_015978	AT	3	6	40527	40532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015978	AT	3	6	41432	41437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015978	AG	3	6	41879	41884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015978	AC	3	6	41953	41958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015978	AC	3	6	42122	42127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015978	CT	3	6	42333	42338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015978	TA	4	8	42393	42400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015978	AG	3	6	42855	42860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015978	AC	3	6	42916	42921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015978	TC	3	6	43347	43352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015978	AT	3	6	43547	43552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015978	TG	3	6	43996	44001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015978	GA	3	6	44185	44190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015978	GA	3	6	45465	45470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015978	CA	3	6	49878	49883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015978	TG	3	6	50644	50649	0 %	50 %	50 %	0 %	347533788
35	NC_015978	TG	3	6	51389	51394	0 %	50 %	50 %	0 %	347533790
36	NC_015978	AT	6	12	51722	51733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015978	AC	3	6	52562	52567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015978	CA	3	6	53984	53989	50 %	0 %	0 %	50 %	347533793
39	NC_015978	CA	3	6	54508	54513	50 %	0 %	0 %	50 %	347533794
40	NC_015978	TA	3	6	54610	54615	50 %	50 %	0 %	0 %	347533794
41	NC_015978	AG	3	6	54676	54681	50 %	0 %	50 %	0 %	347533794
42	NC_015978	TA	3	6	55706	55711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015978	TG	3	6	56916	56921	0 %	50 %	50 %	0 %	347533795
44	NC_015978	GA	3	6	57317	57322	50 %	0 %	50 %	0 %	347533795
45	NC_015978	GA	3	6	60933	60938	50 %	0 %	50 %	0 %	347533800
46	NC_015978	TA	3	6	62097	62102	50 %	50 %	0 %	0 %	347533801
47	NC_015978	TA	3	6	63943	63948	50 %	50 %	0 %	0 %	347533801
48	NC_015978	AT	3	6	65551	65556	50 %	50 %	0 %	0 %	347533802
49	NC_015978	TA	3	6	65993	65998	50 %	50 %	0 %	0 %	347533802
50	NC_015978	TA	3	6	67692	67697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015978	TA	3	6	69729	69734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015978	TC	3	6	72185	72190	0 %	50 %	0 %	50 %	347533808
53	NC_015978	AC	4	8	73459	73466	50 %	0 %	0 %	50 %	347533810
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55	NC_015978	CA	3	6	76874	76879	50 %	0 %	0 %	50 %	347533815
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57	NC_015978	GA	3	6	77576	77581	50 %	0 %	50 %	0 %	347533815
58	NC_015978	GA	3	6	77981	77986	50 %	0 %	50 %	0 %	347533815
59	NC_015978	TA	3	6	78259	78264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015978	TA	3	6	81618	81623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015978	TA	3	6	84646	84651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015978	AT	3	6	84753	84758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015978	CT	3	6	86900	86905	0 %	50 %	0 %	50 %	347533823
64	NC_015978	TA	3	6	87246	87251	50 %	50 %	0 %	0 %	347533824
65	NC_015978	AT	3	6	90029	90034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_015978	AT	3	6	92648	92653	50 %	50 %	0 %	0 %	347533833
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70	NC_015978	CT	3	6	101504	101509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015978	TA	3	6	101655	101660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015978	CT	3	6	105801	105806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015978	TC	3	6	106436	106441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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76	NC_015978	AT	3	6	108970	108975	50 %	50 %	0 %	0 %	347533849
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78	NC_015978	AC	3	6	110681	110686	50 %	0 %	0 %	50 %	347533852
79	NC_015978	TA	3	6	113685	113690	50 %	50 %	0 %	0 %	347533857
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81	NC_015978	TA	3	6	117096	117101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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83	NC_015978	TA	3	6	120785	120790	50 %	50 %	0 %	0 %	347533866
84	NC_015978	TA	3	6	120853	120858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015978	AT	3	6	120946	120951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015978	AT	3	6	121857	121862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_015978	AC	3	6	122378	122383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015978	AC	3	6	122547	122552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015978	TA	4	8	122909	122916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015978	AG	3	6	123371	123376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015978	AC	3	6	123432	123437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015978	TC	3	6	123863	123868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015978	AT	3	6	124063	124068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015978	TG	3	6	124512	124517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_015978	AG	3	6	126279	126284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015978	TA	3	6	127444	127449	50 %	50 %	0 %	0 %	347533868
100	NC_015978	TA	3	6	130007	130012	50 %	50 %	0 %	0 %	347533871
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102	NC_015978	AT	3	6	130428	130433	50 %	50 %	0 %	0 %	347533872
103	NC_015978	TA	3	6	130661	130666	50 %	50 %	0 %	0 %	347533872
104	NC_015978	AG	3	6	132453	132458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_015978	TA	3	6	135477	135482	50 %	50 %	0 %	0 %	347533879
107	NC_015978	TG	3	6	135537	135542	0 %	50 %	50 %	0 %	347533879
108	NC_015978	TA	3	6	139759	139764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_015978	CA	3	6	148201	148206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015978	AT	3	6	148766	148771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015978	AT	3	6	149134	149139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_015978	CA	3	6	151179	151184	50 %	0 %	0 %	50 %	347533887
116	NC_015978	CA	3	6	151930	151935	50 %	0 %	0 %	50 %	347533887
117	NC_015978	AT	3	6	152471	152476	50 %	50 %	0 %	0 %	347533887
118	NC_015978	CA	4	8	153098	153105	50 %	0 %	0 %	50 %	347533888
119	NC_015978	GC	3	6	154069	154074	0 %	0 %	50 %	50 %	347533889
120	NC_015978	TA	3	6	155682	155687	50 %	50 %	0 %	0 %	347533891
121	NC_015978	GA	3	6	155717	155722	50 %	0 %	50 %	0 %	347533891
122	NC_015978	AC	3	6	155806	155811	50 %	0 %	0 %	50 %	347533891
123	NC_015978	CT	3	6	156561	156566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015978	TC	3	6	157712	157717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015978	AT	3	6	157801	157806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015978	TA	3	6	158298	158303	50 %	50 %	0 %	0 %	347533894
127	NC_015978	AT	3	6	158373	158378	50 %	50 %	0 %	0 %	347533894
128	NC_015978	AT	3	6	158609	158614	50 %	50 %	0 %	0 %	347533894
129	NC_015978	TA	3	6	160680	160685	50 %	50 %	0 %	0 %	347533896
130	NC_015978	GA	3	6	160715	160720	50 %	0 %	50 %	0 %	347533896
131	NC_015978	AC	3	6	160804	160809	50 %	0 %	0 %	50 %	347533896
132	NC_015978	AT	3	6	162060	162065	50 %	50 %	0 %	0 %	347533899
133	NC_015978	TA	3	6	162404	162409	50 %	50 %	0 %	0 %	347533899
134	NC_015978	AT	3	6	164150	164155	50 %	50 %	0 %	0 %	347533900
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136	NC_015978	TA	3	6	166571	166576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015978	TG	3	6	166635	166640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015978	AT	3	6	167029	167034	50 %	50 %	0 %	0 %	347533902
139	NC_015978	AC	3	6	167714	167719	50 %	0 %	0 %	50 %	347533902
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141	NC_015978	TA	4	8	168471	168478	50 %	50 %	0 %	0 %	347533903
142	NC_015978	AT	6	12	168511	168522	50 %	50 %	0 %	0 %	347533903
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144	NC_015978	TA	3	6	169193	169198	50 %	50 %	0 %	0 %	347533903
145	NC_015978	AT	3	6	169274	169279	50 %	50 %	0 %	0 %	347533903
146	NC_015978	AT	3	6	169409	169414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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