MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseburia hominis A2-183 chromosome

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015977	ATTAAA	2	12	27313	27324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015977	GCTGAT	2	12	75135	75146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015977	TCTTCA	2	12	75771	75782	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015977	CAGACA	2	12	77462	77473	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015977	AATAAA	2	12	128985	128996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015977	CTTTTA	2	12	131564	131575	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015977	TCGTGC	2	12	208471	208482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015977	TAAAAA	2	12	215562	215573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015977	CACGAA	2	12	241823	241834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015977	ATGGAT	2	12	271058	271069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015977	CTAATT	2	12	355560	355571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015977	AAGATA	2	12	355628	355639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015977	AAAACA	2	12	391799	391810	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015977	AGATTG	2	12	405228	405239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015977	CTTTTT	2	12	432581	432592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015977	CTGGTC	2	12	436297	436308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015977	TTAGTT	2	12	463761	463772	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015977	TTAGTT	2	12	464621	464632	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015977	TAAGAT	2	12	475207	475218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015977	AACCGG	2	12	477843	477854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015977	ATGGAG	2	12	525542	525553	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015977	TTACTA	2	12	552261	552272	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015977	ACAGGA	2	12	554337	554348	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015977	AAGCGG	2	12	611932	611943	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015977	TGCAGT	2	12	618422	618433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015977	ATTAAA	2	12	627742	627753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015977	GAATAG	2	12	645293	645304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015977	ATATAA	2	12	670723	670734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015977	TAAAAA	2	12	720834	720845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015977	TACGAA	2	12	750512	750523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015977	AAGAGA	2	12	780315	780326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015977	AAGAAA	2	12	816852	816863	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015977	ATAAAA	2	12	818029	818040	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015977	ATATGG	2	12	832923	832934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015977	GAAAAA	2	12	863504	863515	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015977	AATATC	2	12	886510	886521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015977	TGAAAA	2	12	886627	886638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015977	GGAAAT	2	12	916853	916864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015977	AGATAA	2	12	1024486	1024497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015977	ATTAAA	2	12	1037232	1037243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015977	TGTATT	2	12	1138967	1138978	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015977	TCACCG	2	12	1146492	1146503	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015977	AGGAAA	2	12	1214849	1214860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015977	GAATAT	2	12	1221114	1221125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015977	TTATGA	2	12	1229279	1229290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015977	CGGACA	2	12	1229347	1229358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015977	GGGGCA	2	12	1247749	1247760	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015977	GGAGAG	2	12	1251187	1251198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015977	AAAGAG	2	12	1358870	1358881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015977	GAAAAA	2	12	1368277	1368288	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015977	GAAAAA	2	12	1374131	1374142	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015977	AAAAAT	2	12	1415472	1415483	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015977	AAAGGA	2	12	1468644	1468655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015977	CAAAAT	2	12	1545196	1545207	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015977	ATAAAG	2	12	1561994	1562005	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015977	TTTTTC	2	12	1582677	1582688	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015977	GGCAAA	2	12	1583100	1583111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015977	TTGATA	2	12	1583165	1583176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015977	AAGATA	2	12	1587527	1587538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015977	CGGAAA	2	12	1639831	1639842	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015977	TCTCCT	2	12	1705537	1705548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015977	TTTGCC	2	12	1719469	1719480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015977	TAGCTA	2	12	1737710	1737721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015977	AGCGCG	2	12	1892733	1892744	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015977	CCGGAT	2	12	1893131	1893142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015977	TTCTTT	2	12	1896897	1896908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015977	CGGAGT	2	12	1935424	1935435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015977	TTTTAT	2	12	2068584	2068595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015977	TGTATT	2	12	2075856	2075867	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015977	TGCAAT	2	12	2076289	2076300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015977	CAACCT	2	12	2082341	2082352	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015977	CTTTTT	2	12	2147646	2147657	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015977	TTTTTC	2	12	2186968	2186979	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015977	TTGCCT	2	12	2283335	2283346	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015977	GTATTC	2	12	2299952	2299963	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015977	GCTCCA	2	12	2301139	2301150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015977	CTGTGC	2	12	2301407	2301418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015977	TCCAGT	2	12	2301444	2301455	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015977	AGTTCC	2	12	2304372	2304383	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015977	AATGAA	2	12	2318928	2318939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015977	CAAAAT	2	12	2319218	2319229	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015977	AATAAG	2	12	2334300	2334311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015977	TTTTCC	2	12	2361719	2361730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015977	AGGGCA	2	12	2396021	2396032	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015977	TATCAT	2	12	2411890	2411901	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015977	TTTTCT	2	12	2575179	2575190	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015977	CTTTTT	2	12	2643325	2643336	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015977	GATTTT	2	12	2729895	2729906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015977	TTCAAT	2	12	2760403	2760414	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015977	TTATAA	2	12	2864523	2864534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015977	TTCCTT	2	12	2879390	2879401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015977	TTCTAT	2	12	2912967	2912978	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015977	GTGTTG	2	12	2944738	2944749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015977	TCTTAT	2	12	2978208	2978219	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015977	CCTTTC	2	12	2986128	2986139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015977	ATCATT	2	12	2986238	2986249	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015977	ATTTTT	4	24	3019528	3019551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015977	TTCCCT	2	12	3160106	3160117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015977	GGGGTT	2	12	3167635	3167646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015977	TTCTTT	2	12	3202990	3203001	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015977	TCCTTT	2	12	3213009	3213020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015977	TCTTAT	2	12	3255818	3255829	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015977	TTATTT	2	12	3305705	3305716	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015977	ATTTTG	2	12	3338976	3338987	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015977	CAGTCA	2	12	3415147	3415158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015977	CTATAT	2	12	3440148	3440159	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015977	AGTTTA	2	12	3452308	3452319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015977	TTTTCT	2	12	3455754	3455765	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015977	AATTTT	2	12	3463516	3463527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015977	ATTTTT	2	12	3476685	3476696	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015977	ACCATA	2	12	3476862	3476873	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015977	TATAAT	2	12	3485260	3485271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015977	CCTTAA	2	12	3488764	3488775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015977	GCAAAG	2	12	3571019	3571030	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.