MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015976	CTGTC	2	10	106	115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015976	GCGGG	2	10	4450	4459	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015976	ACCCC	2	10	4505	4514	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_015976	GTCCG	2	10	7483	7492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015976	CGGCG	2	10	9508	9517	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015976	CCGCG	2	10	9721	9730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015976	AGCGA	2	10	18537	18546	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015976	GCTCC	2	10	27833	27842	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015976	CGGAA	2	10	30351	30360	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015976	CGGGA	2	10	55241	55250	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015976	GCCGC	2	10	63853	63862	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_015976	GGCCC	2	10	72695	72704	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_015976	GCCGC	2	10	81058	81067	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_015976	GCCCG	2	10	82000	82009	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_015976	GGGCG	2	10	82039	82048	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015976	CCATC	2	10	82351	82360	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_015976	AGGCA	2	10	82737	82746	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015976	GCCGG	2	10	92390	92399	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015976	CTCTG	2	10	104377	104386	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015976	CGTCG	2	10	108184	108193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015976	GGCGC	2	10	114419	114428	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015976	GAGGG	2	10	116887	116896	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015976	CGGGG	2	10	117897	117906	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015976	TGCCT	2	10	126493	126502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015976	CGGCG	2	10	144382	144391	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015976	CTTAA	2	10	144983	144992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015976	TGAAC	2	10	152798	152807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015976	CGATA	2	10	156428	156437	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015976	CCTTG	2	10	156539	156548	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015976	GCCCG	2	10	184076	184085	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_015976	TGCCT	2	10	213010	213019	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015976	GGCGG	2	10	216533	216542	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015976	CGCGC	2	10	220257	220266	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_015976	CAGGG	2	10	225575	225584	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015976	ACCGC	2	10	231683	231692	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015976	GCGCA	2	10	234751	234760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015976	CTCGG	2	10	241221	241230	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015976	CCGGC	2	10	245552	245561	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_015976	ATCGG	2	10	254117	254126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015976	GGATC	2	10	258592	258601	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015976	CCGGC	2	10	274046	274055	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_015976	GCGCG	2	10	277791	277800	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_015976	CACGG	2	10	281939	281948	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015976	GCCCG	2	10	283859	283868	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_015976	GCGCA	2	10	307728	307737	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015976	GGCCA	2	10	317296	317305	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015976	CCCCG	2	10	319034	319043	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_015976	GGCCG	2	10	325676	325685	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015976	CGGAG	2	10	329560	329569	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015976	GGGGC	2	10	333923	333932	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015976	GTGCC	2	10	343971	343980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015976	GGGCA	2	10	348772	348781	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015976	TCGCA	2	10	359157	359166	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015976	GACCA	2	10	373655	373664	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015976	GAAGA	2	10	374433	374442	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015976	CGAGG	2	10	381541	381550	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015976	AAGGC	2	10	390628	390637	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015976	TGCCG	2	10	401691	401700	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015976	TTCGC	2	10	420150	420159	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015976	GTCTC	2	10	422604	422613	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015976	GGCGA	2	10	424528	424537	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015976	CCAGA	2	10	452862	452871	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015976	CGCGC	2	10	478787	478796	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_015976	CGAAT	2	10	481136	481145	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015976	GGACA	2	10	495758	495767	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015976	CGGGC	2	10	497022	497031	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015976	CTTTT	2	10	497645	497654	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015976	GCGCC	2	10	508652	508661	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_015976	TCCGG	2	10	511979	511988	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015976	GGCGC	2	10	515029	515038	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015976	GCGGG	2	10	537740	537749	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015976	GGGGA	2	10	540825	540834	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015976	TGGGC	2	10	550166	550175	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015976	CGCAC	2	10	552500	552509	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_015976	TGCGA	2	10	555846	555855	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015976	AGCGT	2	10	555902	555911	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015976	GTCGG	2	10	558602	558611	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015976	GCCGC	2	10	559591	559600	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_015976	GCCCG	2	10	565901	565910	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_015976	AAGCC	2	10	566807	566816	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015976	CCCGG	2	10	588463	588472	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_015976	TTATT	2	10	632715	632724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015976	CGGGC	2	10	644077	644086	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015976	GGCCG	2	10	653749	653758	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_015976	GCCGG	2	10	655328	655337	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015976	CCGCC	2	10	657661	657670	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
87	NC_015976	AAGCT	2	10	659804	659813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015976	TCCGC	2	10	660142	660151	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_015976	GACTC	2	10	666649	666658	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015976	TCGTC	2	10	666857	666866	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015976	TGCGC	2	10	680840	680849	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_015976	CATTT	2	10	680913	680922	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015976	CCCGG	2	10	680935	680944	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_015976	GGCGC	2	10	683507	683516	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015976	CCCGT	2	10	689426	689435	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_015976	GCGAC	2	10	694014	694023	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015976	GCCGG	2	10	697628	697637	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015976	GCGGT	2	10	697654	697663	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015976	CGCGC	2	10	708788	708797	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_015976	GGCGC	2	10	713136	713145	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015976	TTGGC	2	10	717153	717162	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015976	CGGGG	2	10	720018	720027	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015976	CGCTG	2	10	721316	721325	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_015976	GCGGG	2	10	735464	735473	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015976	CGCCA	2	10	743764	743773	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_015976	GCGCT	2	10	746704	746713	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015976	GCCCG	2	10	746718	746727	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_015976	GCAGC	2	10	754856	754865	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015976	GCGCC	2	10	755857	755866	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_015976	GGGAC	2	10	758538	758547	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015976	GGGGA	2	10	761052	761061	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015976	GAGCC	2	10	763307	763316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015976	CGCCA	2	10	767066	767075	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_015976	CCTGC	2	10	772898	772907	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_015976	CCAGA	2	10	780079	780088	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_015976	TCGCG	2	10	791926	791935	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_015976	CCCGC	2	10	806324	806333	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
118	NC_015976	TTGAC	2	10	808887	808896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015976	ATGAC	2	10	811952	811961	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015976	GCCAT	2	10	826873	826882	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015976	GGCGA	2	10	863226	863235	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015976	TGAGA	2	10	866950	866959	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015976	AGGGC	2	10	870163	870172	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015976	GATGC	2	10	870309	870318	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015976	GTTCG	2	10	881664	881673	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015976	CCCGG	2	10	889901	889910	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_015976	AATGA	2	10	893400	893409	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015976	CCGCT	2	10	906341	906350	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_015976	TTCAA	2	10	908791	908800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015976	GGGAA	2	10	908961	908970	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015976	CAGCC	2	10	923767	923776	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_015976	CATGG	2	10	923796	923805	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015976	CGGAA	2	10	955495	955504	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015976	TCCCG	2	10	955559	955568	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_015976	GGCCC	2	10	967998	968007	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_015976	GGCGA	2	10	968736	968745	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015976	GACCG	2	10	982771	982780	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015976	AGGAG	2	10	991198	991207	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015976	GCCGC	2	10	996891	996900	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_015976	CGGGG	2	10	1005098	1005107	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015976	GCCGG	2	10	1019055	1019064	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015976	CGGGG	2	10	1020581	1020590	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015976	GCGGG	2	10	1043728	1043737	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015976	GCGGG	2	10	1054492	1054501	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015976	ATCTC	2	10	1061106	1061115	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015976	AAAAT	2	10	1068588	1068597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015976	GCGCC	2	10	1069528	1069537	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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422	NC_015976	CGCAC	2	10	3205998	3206007	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
423	NC_015976	AGCCC	2	10	3207123	3207132	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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425	NC_015976	CCCGC	2	10	3212369	3212378	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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449	NC_015976	GCCCT	2	10	3461176	3461185	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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462	NC_015976	GGCCA	2	10	3517378	3517387	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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466	NC_015976	TTTCG	2	10	3543112	3543121	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
467	NC_015976	CGCGT	2	10	3543467	3543476	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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470	NC_015976	CCGCG	2	10	3589346	3589355	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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486	NC_015976	GATCC	2	10	3650192	3650201	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
487	NC_015976	CGGGC	2	10	3655910	3655919	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
488	NC_015976	GGGGC	2	10	3662191	3662200	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
489	NC_015976	GATCA	2	10	3669185	3669194	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
490	NC_015976	ATTGG	2	10	3672521	3672530	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_015976	CGGGC	2	10	3717241	3717250	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
499	NC_015976	AAGGC	2	10	3721633	3721642	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
500	NC_015976	TTCCT	2	10	3734838	3734847	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

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