MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 1495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015976	CTCG	2	8	4471	4478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015976	TCAG	2	8	9601	9608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015976	CCGC	2	8	18191	18198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_015976	GCGG	2	8	22419	22426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015976	CGAG	2	8	22544	22551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015976	CCTG	2	8	26718	26725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015976	TGAA	2	8	32144	32151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015976	GATC	2	8	40231	40238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015976	CGGG	2	8	52678	52685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015976	GCCC	2	8	52853	52860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015976	ACCG	2	8	55199	55206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015976	GGCC	2	8	57679	57686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015976	CCAA	2	8	58556	58563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015976	TGCA	2	8	58575	58582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015976	ATCC	2	8	58677	58684	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015976	TTCC	2	8	62808	62815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015976	GGCT	2	8	62817	62824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015976	AAAG	2	8	66428	66435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015976	TTCC	2	8	66495	66502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015976	GCCA	3	12	75525	75536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015976	GCGG	2	8	78588	78595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015976	GAAC	2	8	78782	78789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015976	TCCA	2	8	79199	79206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015976	TTCG	2	8	80984	80991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015976	ATCC	2	8	81155	81162	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015976	TCCC	2	8	81173	81180	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_015976	GCAG	2	8	82288	82295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015976	CAGC	2	8	82384	82391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015976	GGAA	2	8	82997	83004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015976	GGAT	2	8	83439	83446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015976	CCCG	2	8	83471	83478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_015976	GCTT	2	8	89893	89900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015976	GCCG	2	8	95132	95139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015976	CGGC	2	8	96049	96056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015976	CGCC	2	8	97348	97355	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_015976	AGGG	2	8	98438	98445	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015976	CCGG	2	8	104394	104401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015976	GACA	2	8	110684	110691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015976	GTTC	2	8	111985	111992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015976	GCAG	2	8	113375	113382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015976	CCGA	2	8	113920	113927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015976	CCCA	2	8	114465	114472	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_015976	CAAG	2	8	116339	116346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015976	GGGC	2	8	116602	116609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015976	CATT	2	8	121830	121837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015976	GCGT	2	8	123528	123535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015976	CGGC	2	8	124782	124789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015976	GAGC	2	8	126125	126132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015976	GAAT	2	8	133603	133610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015976	GGGA	2	8	133923	133930	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015976	CGGT	2	8	134005	134012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015976	CCCG	2	8	143419	143426	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_015976	GCGA	2	8	145114	145121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015976	TCCA	2	8	152662	152669	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015976	AAGA	2	8	154590	154597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015976	GCAG	2	8	164993	165000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015976	ATGA	2	8	169162	169169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015976	TGGA	2	8	173243	173250	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015976	AGCT	2	8	175997	176004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015976	GCTG	2	8	181740	181747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015976	TGCT	2	8	183958	183965	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015976	CGGC	2	8	184012	184019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015976	GGAC	2	8	185623	185630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015976	CCCG	2	8	187300	187307	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_015976	CCGG	2	8	190323	190330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015976	GCAG	2	8	190416	190423	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015976	GGGA	2	8	194289	194296	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015976	CGTC	2	8	196670	196677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015976	GTTG	2	8	204809	204816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015976	CGAC	2	8	208319	208326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015976	CGGC	2	8	212714	212721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015976	CGGC	2	8	212805	212812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015976	CGTC	2	8	212887	212894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015976	TCGA	2	8	213152	213159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015976	GCTC	2	8	216510	216517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015976	TCGG	2	8	217831	217838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015976	TCGC	2	8	227042	227049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015976	GTCG	2	8	228865	228872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015976	CTGC	2	8	231712	231719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015976	GCAG	2	8	231778	231785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015976	GCAT	2	8	237855	237862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015976	GCAT	2	8	238042	238049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015976	GCCA	2	8	238934	238941	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015976	ACAG	3	12	242226	242237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015976	CGGG	2	8	242666	242673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015976	GCCT	2	8	247112	247119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015976	TCAT	2	8	247368	247375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015976	AGAA	2	8	251771	251778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015976	AAGG	2	8	251863	251870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015976	AAAG	2	8	253284	253291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015976	GCCT	2	8	253695	253702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015976	CGGC	2	8	258728	258735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015976	CGCC	2	8	258736	258743	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_015976	AATC	2	8	266683	266690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015976	CGCC	2	8	274072	274079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_015976	CGGG	2	8	281885	281892	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015976	GATG	2	8	287742	287749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015976	GGAC	2	8	291951	291958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015976	AGGG	2	8	306085	306092	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015976	TCGG	2	8	307074	307081	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015976	CGGG	2	8	307193	307200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015976	GGGA	2	8	307281	307288	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015976	GGAG	2	8	307525	307532	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015976	CGTC	2	8	307770	307777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015976	CCGC	2	8	315539	315546	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_015976	TCGA	2	8	317390	317397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015976	GATC	2	8	317801	317808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015976	TCGC	2	8	322342	322349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015976	GGAA	2	8	322386	322393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015976	TGTT	2	8	323182	323189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015976	TCGC	2	8	324331	324338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015976	GGGC	2	8	327670	327677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015976	TCGT	2	8	329206	329213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015976	ACGG	2	8	329276	329283	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015976	TCCG	2	8	329512	329519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015976	TTCA	2	8	330876	330883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015976	CCGG	2	8	335974	335981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015976	CCGG	2	8	337789	337796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015976	CTCC	2	8	337850	337857	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_015976	CCGG	2	8	342146	342153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015976	GGTC	2	8	346467	346474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015976	AATA	2	8	346542	346549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015976	AGCC	2	8	349722	349729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015976	TGGA	2	8	351418	351425	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015976	CTCG	2	8	354549	354556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015976	CGGG	2	8	354566	354573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015976	GAAG	2	8	354574	354581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015976	CTCC	2	8	354609	354616	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_015976	AGGA	2	8	356591	356598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015976	GCCT	2	8	357911	357918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015976	CAGC	2	8	357995	358002	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015976	CCGC	2	8	358032	358039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_015976	CGAT	2	8	365748	365755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015976	CATT	2	8	365776	365783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015976	GCCC	2	8	366311	366318	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_015976	ATGA	2	8	372246	372253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015976	GGGT	2	8	373578	373585	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015976	CAGT	2	8	374380	374387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015976	GCGT	2	8	374401	374408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015976	GGCT	2	8	375146	375153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015976	AGCC	2	8	379443	379450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015976	TCCC	2	8	380492	380499	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_015976	GCGG	2	8	381598	381605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015976	CTGA	3	12	383155	383166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015976	TGCC	2	8	384833	384840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015976	GCGG	2	8	390802	390809	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015976	CGAG	2	8	390818	390825	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015976	AAGG	2	8	392069	392076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015976	GCAG	2	8	398744	398751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015976	CAAC	2	8	401606	401613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015976	AGAC	2	8	401774	401781	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015976	ACGG	2	8	405427	405434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_015976	GGCC	2	8	414850	414857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015976	TGCC	2	8	414929	414936	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_015976	GGGC	2	8	423612	423619	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_015976	AATG	2	8	424517	424524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015976	AGGG	2	8	430019	430026	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015976	CGCC	2	8	430115	430122	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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160	NC_015976	CGTG	2	8	430797	430804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_015976	GCCG	3	12	442089	442100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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165	NC_015976	TGCC	2	8	447410	447417	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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167	NC_015976	GGGC	2	8	452933	452940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_015976	CCTC	2	8	456635	456642	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
170	NC_015976	GCGG	2	8	456643	456650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
171	NC_015976	TCGG	2	8	456775	456782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_015976	GATC	2	8	1372289	1372296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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