MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 5823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015975	CCTG	2	8	322	329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015975	AAAT	2	8	355	362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015975	TTGT	2	8	425	432	0 %	75 %	25 %	0 %	347524523
4	NC_015975	CAGA	2	8	1935	1942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015975	AAGC	2	8	2578	2585	50 %	0 %	25 %	25 %	347524524
6	NC_015975	GTTC	2	8	3057	3064	0 %	50 %	25 %	25 %	347524524
7	NC_015975	AAAG	2	8	3174	3181	75 %	0 %	25 %	0 %	347524525
8	NC_015975	AATC	2	8	3702	3709	50 %	25 %	0 %	25 %	347524527
9	NC_015975	TGCA	2	8	4209	4216	25 %	25 %	25 %	25 %	347524527
10	NC_015975	AACG	2	8	4446	4453	50 %	0 %	25 %	25 %	347524527
11	NC_015975	CCAG	2	8	4838	4845	25 %	0 %	25 %	50 %	347524528
12	NC_015975	GCGG	2	8	5488	5495	0 %	0 %	75 %	25 %	347524528
13	NC_015975	GAAA	2	8	5742	5749	75 %	0 %	25 %	0 %	347524528
14	NC_015975	TGCT	2	8	5960	5967	0 %	50 %	25 %	25 %	347524528
15	NC_015975	TCTG	2	8	6621	6628	0 %	50 %	25 %	25 %	347524528
16	NC_015975	GAAC	2	8	6939	6946	50 %	0 %	25 %	25 %	347524529
17	NC_015975	GCAA	2	8	7899	7906	50 %	0 %	25 %	25 %	347524529
18	NC_015975	CGGG	2	8	8511	8518	0 %	0 %	75 %	25 %	347524529
19	NC_015975	TTGG	2	8	9913	9920	0 %	50 %	50 %	0 %	347524531
20	NC_015975	TCGA	2	8	9992	9999	25 %	25 %	25 %	25 %	347524531
21	NC_015975	AGTC	2	8	10276	10283	25 %	25 %	25 %	25 %	347524531
22	NC_015975	TTCG	2	8	10284	10291	0 %	50 %	25 %	25 %	347524531
23	NC_015975	GCTT	2	8	10669	10676	0 %	50 %	25 %	25 %	347524532
24	NC_015975	TAAA	2	8	10714	10721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015975	GAAA	2	8	10811	10818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015975	TACT	2	8	10830	10837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015975	ATCA	3	12	10900	10911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015975	GTAA	2	8	11378	11385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015975	CGAC	2	8	11664	11671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015975	CATT	2	8	11680	11687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015975	GTTG	2	8	11968	11975	0 %	50 %	50 %	0 %	347524533
32	NC_015975	CTTG	2	8	12036	12043	0 %	50 %	25 %	25 %	347524533
33	NC_015975	TTGG	2	8	12178	12185	0 %	50 %	50 %	0 %	347524533
34	NC_015975	GAAC	2	8	12554	12561	50 %	0 %	25 %	25 %	347524533
35	NC_015975	TGAT	2	8	12873	12880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015975	CATT	2	8	13204	13211	25 %	50 %	0 %	25 %	347524534
37	NC_015975	AGCA	2	8	13728	13735	50 %	0 %	25 %	25 %	347524534
38	NC_015975	ACGA	2	8	13752	13759	50 %	0 %	25 %	25 %	347524534
39	NC_015975	GATT	2	8	14151	14158	25 %	50 %	25 %	0 %	347524535
40	NC_015975	ATGA	2	8	14627	14634	50 %	25 %	25 %	0 %	347524535
41	NC_015975	TCGG	2	8	15617	15624	0 %	25 %	50 %	25 %	347524535
42	NC_015975	GAAA	2	8	15655	15662	75 %	0 %	25 %	0 %	347524535
43	NC_015975	TTGA	2	8	15692	15699	25 %	50 %	25 %	0 %	347524535
44	NC_015975	AAGG	2	8	16133	16140	50 %	0 %	50 %	0 %	347524536
45	NC_015975	GAAG	2	8	16207	16214	50 %	0 %	50 %	0 %	347524536
46	NC_015975	ATCA	2	8	16318	16325	50 %	25 %	0 %	25 %	347524536
47	NC_015975	TTGA	2	8	17501	17508	25 %	50 %	25 %	0 %	347524537
48	NC_015975	AAAG	2	8	17519	17526	75 %	0 %	25 %	0 %	347524537
49	NC_015975	AAGA	2	8	18147	18154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015975	CAGG	2	8	18662	18669	25 %	0 %	50 %	25 %	347524538
51	NC_015975	TCTT	2	8	18811	18818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015975	GTCG	2	8	18957	18964	0 %	25 %	50 %	25 %	347524539
53	NC_015975	TTGA	2	8	19093	19100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015975	CTGG	2	8	19681	19688	0 %	25 %	50 %	25 %	347524540
55	NC_015975	TTTG	2	8	19803	19810	0 %	75 %	25 %	0 %	347524540
56	NC_015975	GGGC	2	8	19981	19988	0 %	0 %	75 %	25 %	347524540
57	NC_015975	TCGG	2	8	20183	20190	0 %	25 %	50 %	25 %	347524540
58	NC_015975	GCAG	2	8	21223	21230	25 %	0 %	50 %	25 %	347524541
59	NC_015975	ATAA	2	8	21457	21464	75 %	25 %	0 %	0 %	347524542
60	NC_015975	GATC	2	8	21510	21517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015975	CTGC	2	8	22446	22453	0 %	25 %	25 %	50 %	347524544
62	NC_015975	GAAA	2	8	22540	22547	75 %	0 %	25 %	0 %	347524544
63	NC_015975	GACC	2	8	22677	22684	25 %	0 %	25 %	50 %	347524544
64	NC_015975	CCCG	2	8	22822	22829	0 %	0 %	25 %	75 %	347524544
65	NC_015975	GTTT	2	8	24122	24129	0 %	75 %	25 %	0 %	347524545
66	NC_015975	GATC	2	8	24412	24419	25 %	25 %	25 %	25 %	347524545
67	NC_015975	TCGA	2	8	24849	24856	25 %	25 %	25 %	25 %	347524545
68	NC_015975	CAAA	2	8	25372	25379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015975	TGGG	2	8	25596	25603	0 %	25 %	75 %	0 %	347524546
70	NC_015975	TTGC	2	8	26127	26134	0 %	50 %	25 %	25 %	347524546
71	NC_015975	AACG	2	8	26681	26688	50 %	0 %	25 %	25 %	347524546
72	NC_015975	GAAA	2	8	27134	27141	75 %	0 %	25 %	0 %	347524547
73	NC_015975	AGCG	2	8	28132	28139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015975	AGCG	2	8	28255	28262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015975	AGCG	2	8	28378	28385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015975	ATCA	2	8	28749	28756	50 %	25 %	0 %	25 %	347524548
77	NC_015975	TCAA	2	8	30058	30065	50 %	25 %	0 %	25 %	347524550
78	NC_015975	AGGA	2	8	30710	30717	50 %	0 %	50 %	0 %	347524550
79	NC_015975	TTCC	2	8	30718	30725	0 %	50 %	0 %	50 %	347524550
80	NC_015975	ACGA	2	8	31085	31092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015975	GCAA	2	8	32134	32141	50 %	0 %	25 %	25 %	347524552
82	NC_015975	CGGT	2	8	32354	32361	0 %	25 %	50 %	25 %	347524552
83	NC_015975	AGAA	2	8	33169	33176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015975	GTTT	2	8	34212	34219	0 %	75 %	25 %	0 %	347524554
85	NC_015975	CGTT	2	8	34416	34423	0 %	50 %	25 %	25 %	347524554
86	NC_015975	TGCA	2	8	34501	34508	25 %	25 %	25 %	25 %	347524554
87	NC_015975	TTTG	2	8	34689	34696	0 %	75 %	25 %	0 %	347524554
88	NC_015975	GGAA	2	8	34839	34846	50 %	0 %	50 %	0 %	347524554
89	NC_015975	ATTA	2	8	35443	35450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015975	ATCG	2	8	36285	36292	25 %	25 %	25 %	25 %	347524555
91	NC_015975	GAAG	2	8	36308	36315	50 %	0 %	50 %	0 %	347524555
92	NC_015975	TGAC	2	8	36343	36350	25 %	25 %	25 %	25 %	347524555
93	NC_015975	ATTG	2	8	36617	36624	25 %	50 %	25 %	0 %	347524555
94	NC_015975	GACG	2	8	36738	36745	25 %	0 %	50 %	25 %	347524555
95	NC_015975	CCAT	2	8	37195	37202	25 %	25 %	0 %	50 %	347524555
96	NC_015975	TGAT	2	8	38826	38833	25 %	50 %	25 %	0 %	347524556
97	NC_015975	CATT	2	8	39051	39058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015975	TGAC	2	8	39198	39205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015975	TCGA	2	8	39500	39507	25 %	25 %	25 %	25 %	347524557
100	NC_015975	TCAG	2	8	39840	39847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015975	TTAA	2	8	39955	39962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015975	ATCC	2	8	39975	39982	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015975	TCTG	2	8	41133	41140	0 %	50 %	25 %	25 %	347524558
104	NC_015975	CGTT	2	8	41180	41187	0 %	50 %	25 %	25 %	347524558
105	NC_015975	ACGA	2	8	41347	41354	50 %	0 %	25 %	25 %	347524558
106	NC_015975	CGCT	2	8	42257	42264	0 %	25 %	25 %	50 %	347524559
107	NC_015975	TCAG	2	8	42524	42531	25 %	25 %	25 %	25 %	347524560
108	NC_015975	CTTG	2	8	42576	42583	0 %	50 %	25 %	25 %	347524560
109	NC_015975	ATCT	2	8	42733	42740	25 %	50 %	0 %	25 %	347524560
110	NC_015975	GATT	2	8	43053	43060	25 %	50 %	25 %	0 %	347524560
111	NC_015975	TCGT	2	8	44473	44480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015975	AAGG	2	8	44701	44708	50 %	0 %	50 %	0 %	347524562
113	NC_015975	TGAT	2	8	45340	45347	25 %	50 %	25 %	0 %	347524562
114	NC_015975	AAAC	2	8	45435	45442	75 %	0 %	0 %	25 %	347524563
115	NC_015975	TGAT	2	8	45718	45725	25 %	50 %	25 %	0 %	347524563
116	NC_015975	CGAT	2	8	46069	46076	25 %	25 %	25 %	25 %	347524563
117	NC_015975	TCTG	2	8	46181	46188	0 %	50 %	25 %	25 %	347524563
118	NC_015975	ATCG	2	8	46560	46567	25 %	25 %	25 %	25 %	347524563
119	NC_015975	TTCA	2	8	46953	46960	25 %	50 %	0 %	25 %	347524563
120	NC_015975	ATTT	2	8	47797	47804	25 %	75 %	0 %	0 %	347524564
121	NC_015975	AACA	2	8	48065	48072	75 %	0 %	0 %	25 %	347524564
122	NC_015975	GAAT	2	8	48528	48535	50 %	25 %	25 %	0 %	347524564
123	NC_015975	AAAG	2	8	49199	49206	75 %	0 %	25 %	0 %	347524565
124	NC_015975	CGGA	2	8	49603	49610	25 %	0 %	50 %	25 %	347524566
125	NC_015975	CACG	2	8	49639	49646	25 %	0 %	25 %	50 %	347524566
126	NC_015975	CGAG	2	8	49845	49852	25 %	0 %	50 %	25 %	347524566
127	NC_015975	CGAA	2	8	50055	50062	50 %	0 %	25 %	25 %	347524566
128	NC_015975	TCGG	2	8	50536	50543	0 %	25 %	50 %	25 %	347524567
129	NC_015975	CGGC	2	8	51358	51365	0 %	0 %	50 %	50 %	347524567
130	NC_015975	CAAG	2	8	51434	51441	50 %	0 %	25 %	25 %	347524567
131	NC_015975	GCTC	2	8	52452	52459	0 %	25 %	25 %	50 %	347524568
132	NC_015975	AAGG	2	8	52630	52637	50 %	0 %	50 %	0 %	347524569
133	NC_015975	GTCA	2	8	52931	52938	25 %	25 %	25 %	25 %	347524569
134	NC_015975	CAAG	2	8	53094	53101	50 %	0 %	25 %	25 %	347524569
135	NC_015975	TCGT	2	8	53443	53450	0 %	50 %	25 %	25 %	347524569
136	NC_015975	AGAA	2	8	54877	54884	75 %	0 %	25 %	0 %	347524570
137	NC_015975	CGAA	2	8	55141	55148	50 %	0 %	25 %	25 %	347524570
138	NC_015975	GGGT	2	8	55312	55319	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015975	TGCT	2	8	55438	55445	0 %	50 %	25 %	25 %	347524571
140	NC_015975	GACG	2	8	55615	55622	25 %	0 %	50 %	25 %	347524571
141	NC_015975	GCTG	2	8	56119	56126	0 %	25 %	50 %	25 %	347524572
142	NC_015975	CAAT	2	8	56347	56354	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015975	GTCG	2	8	56845	56852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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