MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 4994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015975	CTT	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015975	TAA	2	6	61	66	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015975	CAA	2	6	76	81	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015975	TTG	2	6	126	131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015975	TCT	2	6	176	181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015975	AAT	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015975	AGG	2	6	383	388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015975	TTA	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015975	CTA	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015975	TAC	3	9	1897	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015975	TAT	2	6	9411	9416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015975	AGT	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015975	TAA	2	6	9453	9458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015975	AGG	2	6	9547	9552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015975	AGG	2	6	9882	9887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015975	AGG	2	6	10447	10452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015975	ATA	2	6	10722	10727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015975	TAT	2	6	10744	10749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015975	TAT	2	6	10775	10780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015975	TGA	2	6	10892	10897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015975	CAA	2	6	11067	11072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015975	CTT	2	6	11227	11232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015975	AAT	2	6	11267	11272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015975	TAA	2	6	11281	11286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015975	TGA	2	6	11346	11351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015975	GTT	2	6	11467	11472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015975	ATT	2	6	11717	11722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015975	ATT	2	6	12909	12914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015975	TAA	2	6	12966	12971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015975	GGA	2	6	12988	12993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015975	ATC	2	6	13878	13883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015975	GGA	2	6	16031	16036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015975	GAT	2	6	17967	17972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015975	ATC	2	6	17990	17995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015975	AAT	2	6	18016	18021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015975	TGA	2	6	18095	18100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015975	TGC	2	6	18110	18115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015975	GCA	2	6	18116	18121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015975	TGA	2	6	20675	20680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015975	AAG	2	6	20742	20747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015975	GAC	2	6	20782	20787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015975	CAG	2	6	21258	21263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015975	AGC	2	6	21291	21296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015975	GAA	2	6	21299	21304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015975	TGC	2	6	23375	23380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015975	TCA	2	6	25437	25442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015975	GTT	2	6	25459	25464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015975	AAT	2	6	25475	25480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015975	ATT	2	6	25517	25522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015975	GAC	2	6	28165	28170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015975	GAC	2	6	28288	28293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015975	GAC	2	6	28411	28416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015975	ATG	2	6	28551	28556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015975	GGC	2	6	28579	28584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015975	TGC	2	6	28855	28860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015975	ATT	2	6	28908	28913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015975	TCA	2	6	28943	28948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015975	AGT	2	6	28980	28985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015975	TTG	2	6	28988	28993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015975	GTT	2	6	30897	30902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015975	ATT	2	6	31073	31078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015975	ATA	2	6	31482	31487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015975	TGC	2	6	31546	31551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015975	ATT	2	6	31609	31614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015975	TTC	3	9	31647	31655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015975	ATT	2	6	33102	33107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015975	TGC	2	6	33507	33512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015975	GCA	2	6	33665	33670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015975	TAA	2	6	35133	35138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015975	TCA	2	6	35159	35164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015975	CAG	2	6	35365	35370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015975	TTA	2	6	35462	35467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015975	AAT	2	6	35525	35530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015975	TTG	2	6	35537	35542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015975	AAC	2	6	35616	35621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015975	GTT	2	6	35661	35666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015975	GGA	2	6	35697	35702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015975	GAA	2	6	39106	39111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015975	GAA	2	6	39130	39135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015975	GAA	2	6	39151	39156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015975	TTG	2	6	39166	39171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015975	AGC	2	6	39217	39222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015975	GCT	2	6	39250	39255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015975	ACG	2	6	39829	39834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015975	ACG	2	6	39874	39879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015975	AAT	2	6	40212	40217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015975	ATT	2	6	40258	40263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015975	ATA	2	6	40331	40336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015975	CAA	2	6	41633	41638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015975	AAG	2	6	41649	41654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015975	TTG	3	9	41712	41720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015975	AAT	2	6	41778	41783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015975	AGT	2	6	41832	41837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015975	TCT	2	6	41857	41862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015975	GGT	2	6	41953	41958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015975	AAC	2	6	43917	43922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015975	ATT	2	6	43926	43931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015975	ATT	2	6	43999	44004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015975	ATA	3	9	44009	44017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015975	GGT	2	6	44040	44045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015975	ACC	2	6	44104	44109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015975	GGT	2	6	44219	44224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015975	ACC	2	6	44283	44288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015975	CGT	2	6	44404	44409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015975	ATT	2	6	44556	44561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015975	TCA	2	6	44584	44589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015975	CAT	2	6	50373	50378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015975	GCA	2	6	51746	51751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015975	TGT	2	6	52048	52053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015975	TAT	2	6	52098	52103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015975	AGG	2	6	52115	52120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015975	AGA	2	6	53516	53521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015975	ATT	2	6	53592	53597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015975	ATC	2	6	53602	53607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015975	TGA	2	6	53636	53641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015975	CCG	2	6	53736	53741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015975	CTG	2	6	53871	53876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015975	CCG	2	6	53985	53990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015975	GGA	2	6	54003	54008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015975	ATG	2	6	54194	54199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015975	GAT	3	9	54211	54219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015975	TCT	2	6	54301	54306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015975	AAC	2	6	55225	55230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015975	AAG	2	6	55287	55292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015975	TCC	2	6	55704	55709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015975	GAT	2	6	55726	55731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015975	TGA	2	6	55808	55813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015975	TAA	2	6	55864	55869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015975	ATC	2	6	55930	55935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015975	TTA	2	6	56316	56321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015975	CCA	2	6	56535	56540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015975	TGG	2	6	56547	56552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015975	GAA	2	6	56682	56687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015975	GGC	2	6	56705	56710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015975	TCA	2	6	56839	56844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015975	CGT	2	6	56969	56974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015975	ATC	2	6	57021	57026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015975	TGA	2	6	57037	57042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015975	AGA	2	6	57195	57200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015975	CAC	2	6	57203	57208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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