MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 plasmid pSLPG

Total Repeats: 414

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015974	CCGC	2	8	237	244	0 %	0 %	25 %	75 %	347430513
2	NC_015974	TGCG	2	8	620	627	0 %	25 %	50 %	25 %	347430513
3	NC_015974	TCGG	2	8	830	837	0 %	25 %	50 %	25 %	347430513
4	NC_015974	GCAA	2	8	2884	2891	50 %	0 %	25 %	25 %	347430515
5	NC_015974	GGTG	2	8	4523	4530	0 %	25 %	75 %	0 %	347430517
6	NC_015974	CATC	2	8	4760	4767	25 %	25 %	0 %	50 %	347430517
7	NC_015974	TATG	2	8	5189	5196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015974	AACG	2	8	5859	5866	50 %	0 %	25 %	25 %	347430519
9	NC_015974	AGCG	2	8	6055	6062	25 %	0 %	50 %	25 %	347430519
10	NC_015974	GCCG	2	8	6334	6341	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
11	NC_015974	GAAC	2	8	6480	6487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015974	GCCG	2	8	6636	6643	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
13	NC_015974	GCCG	2	8	6651	6658	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
14	NC_015974	GCCG	2	8	6881	6888	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
15	NC_015974	CGAT	2	8	7223	7230	25 %	25 %	25 %	25 %	347430520
16	NC_015974	CGCT	2	8	7742	7749	0 %	25 %	25 %	50 %	347430520
17	NC_015974	ACTC	2	8	8399	8406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015974	CGCC	2	8	8500	8507	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_015974	TGTT	2	8	8596	8603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015974	CAAC	2	8	8668	8675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015974	ACGC	2	8	8937	8944	25 %	0 %	25 %	50 %	347430521
22	NC_015974	GCAG	2	8	9045	9052	25 %	0 %	50 %	25 %	347430521
23	NC_015974	GGGA	2	8	9146	9153	25 %	0 %	75 %	0 %	347430521
24	NC_015974	ATCG	2	8	9174	9181	25 %	25 %	25 %	25 %	347430522
25	NC_015974	TCAT	2	8	9721	9728	25 %	50 %	0 %	25 %	347430522
26	NC_015974	GTGG	2	8	9851	9858	0 %	25 %	75 %	0 %	347430523
27	NC_015974	AGCG	2	8	10081	10088	25 %	0 %	50 %	25 %	347430523
28	NC_015974	TTGA	2	8	10324	10331	25 %	50 %	25 %	0 %	347430523
29	NC_015974	TTGT	2	8	11182	11189	0 %	75 %	25 %	0 %	347430523
30	NC_015974	TCAA	2	8	11728	11735	50 %	25 %	0 %	25 %	347430523
31	NC_015974	CGCC	2	8	11955	11962	0 %	0 %	25 %	75 %	347430523
32	NC_015974	CAAG	2	8	12101	12108	50 %	0 %	25 %	25 %	347430523
33	NC_015974	TGCG	2	8	12260	12267	0 %	25 %	50 %	25 %	347430523
34	NC_015974	CTGT	2	8	12373	12380	0 %	50 %	25 %	25 %	347430523
35	NC_015974	CCAA	2	8	12664	12671	50 %	0 %	0 %	50 %	347430523
36	NC_015974	GGAG	2	8	12836	12843	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015974	CGCC	2	8	13356	13363	0 %	0 %	25 %	75 %	347430524
38	NC_015974	CACT	2	8	13629	13636	25 %	25 %	0 %	50 %	347430524
39	NC_015974	TAGG	2	8	13795	13802	25 %	25 %	50 %	0 %	347430524
40	NC_015974	CATC	2	8	14031	14038	25 %	25 %	0 %	50 %	347430524
41	NC_015974	GGAA	2	8	14119	14126	50 %	0 %	50 %	0 %	347430524
42	NC_015974	TCCT	2	8	14257	14264	0 %	50 %	0 %	50 %	347430524
43	NC_015974	GTTG	2	8	14363	14370	0 %	50 %	50 %	0 %	347430525
44	NC_015974	ATAC	2	8	14640	14647	50 %	25 %	0 %	25 %	347430525
45	NC_015974	GCTG	2	8	15036	15043	0 %	25 %	50 %	25 %	347430526
46	NC_015974	CCAG	2	8	16403	16410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015974	CGAG	2	8	16531	16538	25 %	0 %	50 %	25 %	347430529
48	NC_015974	CTCG	2	8	16677	16684	0 %	25 %	25 %	50 %	347430529
49	NC_015974	GCTG	2	8	17080	17087	0 %	25 %	50 %	25 %	347430530
50	NC_015974	GCGA	2	8	17280	17287	25 %	0 %	50 %	25 %	347430530
51	NC_015974	CCCG	2	8	17706	17713	0 %	0 %	25 %	75 %	347430531
52	NC_015974	GCGT	2	8	19430	19437	0 %	25 %	50 %	25 %	347430533
53	NC_015974	CTTG	2	8	19988	19995	0 %	50 %	25 %	25 %	347430534
54	NC_015974	GGCG	2	8	20093	20100	0 %	0 %	75 %	25 %	347430535
55	NC_015974	GGCC	2	8	20330	20337	0 %	0 %	50 %	50 %	347430535
56	NC_015974	TCCG	2	8	20414	20421	0 %	25 %	25 %	50 %	347430535
57	NC_015974	CCGA	2	8	20706	20713	25 %	0 %	25 %	50 %	347430536
58	NC_015974	AGCG	2	8	20766	20773	25 %	0 %	50 %	25 %	347430536
59	NC_015974	CGCT	2	8	21084	21091	0 %	25 %	25 %	50 %	347430537
60	NC_015974	CAGC	2	8	21471	21478	25 %	0 %	25 %	50 %	347430537
61	NC_015974	ACGG	2	8	21933	21940	25 %	0 %	50 %	25 %	347430537
62	NC_015974	CGAT	2	8	21964	21971	25 %	25 %	25 %	25 %	347430537
63	NC_015974	CGGG	2	8	21988	21995	0 %	0 %	75 %	25 %	347430537
64	NC_015974	GCGG	2	8	23355	23362	0 %	0 %	75 %	25 %	347430539
65	NC_015974	CGAG	2	8	23676	23683	25 %	0 %	50 %	25 %	347430539
66	NC_015974	TTGC	2	8	23933	23940	0 %	50 %	25 %	25 %	347430539
67	NC_015974	CGGT	2	8	24146	24153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015974	CTGC	2	8	24388	24395	0 %	25 %	25 %	50 %	347430540
69	NC_015974	GCGG	2	8	24677	24684	0 %	0 %	75 %	25 %	347430540
70	NC_015974	AGCG	2	8	24823	24830	25 %	0 %	50 %	25 %	347430540
71	NC_015974	CGGC	2	8	24932	24939	0 %	0 %	50 %	50 %	347430540
72	NC_015974	GGCA	2	8	25131	25138	25 %	0 %	50 %	25 %	347430541
73	NC_015974	CGCT	2	8	26323	26330	0 %	25 %	25 %	50 %	347430541
74	NC_015974	TGCC	2	8	26481	26488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015974	CGCT	2	8	26834	26841	0 %	25 %	25 %	50 %	347430542
76	NC_015974	GGAT	2	8	26855	26862	25 %	25 %	50 %	0 %	347430542
77	NC_015974	ACCT	2	8	26864	26871	25 %	25 %	0 %	50 %	347430542
78	NC_015974	GGCC	3	12	27044	27055	0 %	0 %	50 %	50 %	347430542
79	NC_015974	CGTT	2	8	27302	27309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015974	GCGG	2	8	27692	27699	0 %	0 %	75 %	25 %	347430543
81	NC_015974	CGAT	2	8	27916	27923	25 %	25 %	25 %	25 %	347430543
82	NC_015974	GGCT	2	8	28526	28533	0 %	25 %	50 %	25 %	347430543
83	NC_015974	TCGA	2	8	28572	28579	25 %	25 %	25 %	25 %	347430543
84	NC_015974	AACG	2	8	28902	28909	50 %	0 %	25 %	25 %	347430544
85	NC_015974	GCTT	2	8	29146	29153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015974	AAGG	2	8	29174	29181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015974	GCTC	2	8	30674	30681	0 %	25 %	25 %	50 %	347430546
88	NC_015974	TCGA	2	8	30865	30872	25 %	25 %	25 %	25 %	347430546
89	NC_015974	GCGG	2	8	31123	31130	0 %	0 %	75 %	25 %	347430546
90	NC_015974	TCGG	2	8	31231	31238	0 %	25 %	50 %	25 %	347430546
91	NC_015974	CGGG	2	8	31313	31320	0 %	0 %	75 %	25 %	347430546
92	NC_015974	GCGT	2	8	32162	32169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015974	GCGG	2	8	32339	32346	0 %	0 %	75 %	25 %	347430548
94	NC_015974	GCAG	2	8	32734	32741	25 %	0 %	50 %	25 %	347430548
95	NC_015974	CCGC	2	8	33306	33313	0 %	0 %	25 %	75 %	347430548
96	NC_015974	ACGC	2	8	33373	33380	25 %	0 %	25 %	50 %	347430548
97	NC_015974	TCGC	2	8	33517	33524	0 %	25 %	25 %	50 %	347430549
98	NC_015974	CTGC	2	8	33536	33543	0 %	25 %	25 %	50 %	347430549
99	NC_015974	TCGG	2	8	33832	33839	0 %	25 %	50 %	25 %	347430549
100	NC_015974	CCGC	2	8	34292	34299	0 %	0 %	25 %	75 %	347430549
101	NC_015974	GTCG	2	8	34485	34492	0 %	25 %	50 %	25 %	347430549
102	NC_015974	CGCC	2	8	34983	34990	0 %	0 %	25 %	75 %	347430550
103	NC_015974	GCGA	2	8	35183	35190	25 %	0 %	50 %	25 %	347430550
104	NC_015974	ACCT	2	8	35215	35222	25 %	25 %	0 %	50 %	347430550
105	NC_015974	CTCG	2	8	35346	35353	0 %	25 %	25 %	50 %	347430550
106	NC_015974	GCTT	2	8	36390	36397	0 %	50 %	25 %	25 %	347430550
107	NC_015974	CGAC	2	8	36605	36612	25 %	0 %	25 %	50 %	347430550
108	NC_015974	CGTG	2	8	37224	37231	0 %	25 %	50 %	25 %	347430550
109	NC_015974	CTGC	2	8	37291	37298	0 %	25 %	25 %	50 %	347430550
110	NC_015974	GCTT	2	8	37375	37382	0 %	50 %	25 %	25 %	347430550
111	NC_015974	GATG	2	8	37913	37920	25 %	25 %	50 %	0 %	347430550
112	NC_015974	GAAA	2	8	38519	38526	75 %	0 %	25 %	0 %	347430552
113	NC_015974	GGCG	2	8	39219	39226	0 %	0 %	75 %	25 %	347430553
114	NC_015974	GATC	2	8	39227	39234	25 %	25 %	25 %	25 %	347430553
115	NC_015974	GGCG	2	8	39624	39631	0 %	0 %	75 %	25 %	347430554
116	NC_015974	TCGC	2	8	39720	39727	0 %	25 %	25 %	50 %	347430554
117	NC_015974	CTGC	2	8	40337	40344	0 %	25 %	25 %	50 %	347430555
118	NC_015974	TGCC	2	8	40645	40652	0 %	25 %	25 %	50 %	347430556
119	NC_015974	CGGC	2	8	41358	41365	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
120	NC_015974	GCCT	2	8	41589	41596	0 %	25 %	25 %	50 %	347430556
121	NC_015974	ACCG	2	8	41873	41880	25 %	0 %	25 %	50 %	347430556
122	NC_015974	CGGG	2	8	43202	43209	0 %	0 %	75 %	25 %	347430557
123	NC_015974	GCAG	2	8	43485	43492	25 %	0 %	50 %	25 %	347430557
124	NC_015974	ATCG	2	8	43605	43612	25 %	25 %	25 %	25 %	347430557
125	NC_015974	GATC	2	8	44238	44245	25 %	25 %	25 %	25 %	347430558
126	NC_015974	CTGG	2	8	44453	44460	0 %	25 %	50 %	25 %	347430558
127	NC_015974	TCAT	2	8	44724	44731	25 %	50 %	0 %	25 %	347430558
128	NC_015974	CGGG	2	8	45223	45230	0 %	0 %	75 %	25 %	347430558
129	NC_015974	GCCA	2	8	45399	45406	25 %	0 %	25 %	50 %	347430558
130	NC_015974	CCAG	2	8	45848	45855	25 %	0 %	25 %	50 %	347430558
131	NC_015974	GAGC	2	8	46720	46727	25 %	0 %	50 %	25 %	347430558
132	NC_015974	TTGA	2	8	46959	46966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015974	CACC	2	8	47265	47272	25 %	0 %	0 %	75 %	347430559
134	NC_015974	TGGC	2	8	47435	47442	0 %	25 %	50 %	25 %	347430559
135	NC_015974	GCTC	2	8	47511	47518	0 %	25 %	25 %	50 %	347430559
136	NC_015974	TGCT	2	8	47642	47649	0 %	50 %	25 %	25 %	347430559
137	NC_015974	GCCA	2	8	48571	48578	25 %	0 %	25 %	50 %	347430561
138	NC_015974	CAGC	2	8	48667	48674	25 %	0 %	25 %	50 %	347430561
139	NC_015974	GCGT	2	8	48760	48767	0 %	25 %	50 %	25 %	347430561
140	NC_015974	GCTC	2	8	49511	49518	0 %	25 %	25 %	50 %	347430561
141	NC_015974	CTGG	2	8	49555	49562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015974	CGGC	2	8	49734	49741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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253	NC_015974	ATCG	2	8	90804	90811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
254	NC_015974	ACGC	2	8	91182	91189	25 %	0 %	25 %	50 %	347430606
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.