MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 plasmid pSLPG

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015974	TATG	2	8	5189	5196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015974	GAAC	2	8	6480	6487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015974	ACTC	2	8	8399	8406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015974	CGCC	2	8	8500	8507	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015974	TGTT	2	8	8596	8603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015974	CAAC	2	8	8668	8675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015974	GGAG	2	8	12836	12843	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015974	CCAG	2	8	16403	16410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015974	CGGT	2	8	24146	24153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015974	TGCC	2	8	26481	26488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015974	CGTT	2	8	27302	27309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015974	GCTT	2	8	29146	29153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015974	AAGG	2	8	29174	29181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015974	GCGT	2	8	32162	32169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015974	TTGA	2	8	46959	46966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015974	CTGG	2	8	49555	49562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015974	CGGC	2	8	49734	49741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015974	ATCG	2	8	56458	56465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015974	CCAA	2	8	56888	56895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015974	ACTT	2	8	64470	64477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015974	CGCT	2	8	72753	72760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015974	GCCG	2	8	73256	73263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015974	ATCG	2	8	73713	73720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015974	CGGC	2	8	75909	75916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015974	CCGG	2	8	75925	75932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015974	TTCG	2	8	76452	76459	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015974	AAGA	2	8	79622	79629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015974	CATC	2	8	80963	80970	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015974	GATC	2	8	86225	86232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015974	ATGC	2	8	86422	86429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015974	TTTC	2	8	90649	90656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015974	GCCT	2	8	90675	90682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015974	ATCG	2	8	90804	90811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015974	CCTG	2	8	102019	102026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015974	CCGC	2	8	102228	102235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_015974	CGAG	2	8	108330	108337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015974	CACC	2	8	108866	108873	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_015974	ACTG	2	8	115002	115009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015974	GATT	2	8	124444	124451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015974	CGCC	2	8	130725	130732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_015974	GGCG	2	8	130876	130883	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015974	TGCG	2	8	131235	131242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015974	CCGG	2	8	131277	131284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015974	CTGC	2	8	132482	132489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015974	TCCA	2	8	132493	132500	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015974	CGGC	2	8	133645	133652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015974	CCCA	2	8	133705	133712	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_015974	GCCG	2	8	134623	134630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015974	CGGC	2	8	134637	134644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015974	CTCC	2	8	146944	146951	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_015974	TGCC	2	8	148462	148469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015974	TCGC	2	8	148564	148571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.