MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 plasmid pSLPG

Total Repeats: 412

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015974	CG	3	6	398	403	0 %	0 %	50 %	50 %	347430513
2	NC_015974	CA	3	6	900	905	50 %	0 %	0 %	50 %	347430513
3	NC_015974	CG	3	6	1060	1065	0 %	0 %	50 %	50 %	347430513
4	NC_015974	CT	3	6	1355	1360	0 %	50 %	0 %	50 %	347430514
5	NC_015974	CG	3	6	1458	1463	0 %	0 %	50 %	50 %	347430514
6	NC_015974	GC	3	6	1996	2001	0 %	0 %	50 %	50 %	347430514
7	NC_015974	GC	3	6	2127	2132	0 %	0 %	50 %	50 %	347430514
8	NC_015974	CG	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
9	NC_015974	CG	3	6	2957	2962	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
10	NC_015974	GC	3	6	2987	2992	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
11	NC_015974	GC	3	6	3081	3086	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
12	NC_015974	GC	5	10	3107	3116	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
13	NC_015974	GC	4	8	3125	3132	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
14	NC_015974	CT	3	6	3298	3303	0 %	50 %	0 %	50 %	347430515
15	NC_015974	GT	3	6	3328	3333	0 %	50 %	50 %	0 %	347430515
16	NC_015974	CG	3	6	3405	3410	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
17	NC_015974	AT	3	6	4785	4790	50 %	50 %	0 %	0 %	347430518
18	NC_015974	GC	3	6	5246	5251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015974	GC	3	6	5441	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
20	NC_015974	CG	3	6	5565	5570	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
21	NC_015974	CG	3	6	5609	5614	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
22	NC_015974	CG	3	6	5846	5851	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
23	NC_015974	CG	3	6	5876	5881	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
24	NC_015974	GC	3	6	5907	5912	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
25	NC_015974	GC	3	6	6349	6354	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
26	NC_015974	GC	3	6	6684	6689	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
27	NC_015974	CG	3	6	6861	6866	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
28	NC_015974	CG	3	6	7093	7098	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
29	NC_015974	GC	3	6	7176	7181	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
30	NC_015974	GC	3	6	7492	7497	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
31	NC_015974	CG	3	6	7570	7575	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
32	NC_015974	GC	3	6	7586	7591	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
33	NC_015974	CG	3	6	9361	9366	0 %	0 %	50 %	50 %	347430522
34	NC_015974	GC	3	6	9434	9439	0 %	0 %	50 %	50 %	347430522
35	NC_015974	AG	3	6	9576	9581	50 %	0 %	50 %	0 %	347430522
36	NC_015974	CG	3	6	10789	10794	0 %	0 %	50 %	50 %	347430523
37	NC_015974	GC	3	6	11371	11376	0 %	0 %	50 %	50 %	347430523
38	NC_015974	CG	3	6	11501	11506	0 %	0 %	50 %	50 %	347430523
39	NC_015974	GT	3	6	11513	11518	0 %	50 %	50 %	0 %	347430523
40	NC_015974	GC	4	8	11858	11865	0 %	0 %	50 %	50 %	347430523
41	NC_015974	GT	3	6	12299	12304	0 %	50 %	50 %	0 %	347430523
42	NC_015974	GC	4	8	12491	12498	0 %	0 %	50 %	50 %	347430523
43	NC_015974	GC	3	6	13294	13299	0 %	0 %	50 %	50 %	347430524
44	NC_015974	GC	3	6	14065	14070	0 %	0 %	50 %	50 %	347430524
45	NC_015974	GC	4	8	14343	14350	0 %	0 %	50 %	50 %	347430525
46	NC_015974	GC	4	8	14418	14425	0 %	0 %	50 %	50 %	347430525
47	NC_015974	GC	5	10	15314	15323	0 %	0 %	50 %	50 %	347430527
48	NC_015974	GA	3	6	15724	15729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015974	GC	3	6	16090	16095	0 %	0 %	50 %	50 %	347430528
50	NC_015974	CG	4	8	16237	16244	0 %	0 %	50 %	50 %	347430528
51	NC_015974	GC	3	6	16620	16625	0 %	0 %	50 %	50 %	347430529
52	NC_015974	GA	3	6	16667	16672	50 %	0 %	50 %	0 %	347430529
53	NC_015974	CG	3	6	16683	16688	0 %	0 %	50 %	50 %	347430529
54	NC_015974	CG	3	6	16811	16816	0 %	0 %	50 %	50 %	347430530
55	NC_015974	CG	3	6	17262	17267	0 %	0 %	50 %	50 %	347430530
56	NC_015974	GA	3	6	17986	17991	50 %	0 %	50 %	0 %	347430531
57	NC_015974	TC	3	6	18078	18083	0 %	50 %	0 %	50 %	347430532
58	NC_015974	GC	3	6	18525	18530	0 %	0 %	50 %	50 %	347430532
59	NC_015974	GC	3	6	19477	19482	0 %	0 %	50 %	50 %	347430533
60	NC_015974	GC	4	8	20288	20295	0 %	0 %	50 %	50 %	347430535
61	NC_015974	GC	3	6	20347	20352	0 %	0 %	50 %	50 %	347430535
62	NC_015974	CG	4	8	20610	20617	0 %	0 %	50 %	50 %	347430536
63	NC_015974	AT	3	6	20873	20878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015974	GC	3	6	21908	21913	0 %	0 %	50 %	50 %	347430537
65	NC_015974	CG	3	6	22399	22404	0 %	0 %	50 %	50 %	347430537
66	NC_015974	GC	3	6	22836	22841	0 %	0 %	50 %	50 %	347430538
67	NC_015974	TG	3	6	23024	23029	0 %	50 %	50 %	0 %	347430538
68	NC_015974	CG	4	8	24265	24272	0 %	0 %	50 %	50 %	347430540
69	NC_015974	CG	3	6	24367	24372	0 %	0 %	50 %	50 %	347430540
70	NC_015974	CG	3	6	24904	24909	0 %	0 %	50 %	50 %	347430540
71	NC_015974	AC	3	6	24944	24949	50 %	0 %	0 %	50 %	347430540
72	NC_015974	GC	3	6	24967	24972	0 %	0 %	50 %	50 %	347430540
73	NC_015974	GC	3	6	25171	25176	0 %	0 %	50 %	50 %	347430541
74	NC_015974	CG	3	6	25182	25187	0 %	0 %	50 %	50 %	347430541
75	NC_015974	GC	3	6	25534	25539	0 %	0 %	50 %	50 %	347430541
76	NC_015974	CG	3	6	26095	26100	0 %	0 %	50 %	50 %	347430541
77	NC_015974	CG	3	6	26266	26271	0 %	0 %	50 %	50 %	347430541
78	NC_015974	AC	3	6	26799	26804	50 %	0 %	0 %	50 %	347430542
79	NC_015974	CG	3	6	27566	27571	0 %	0 %	50 %	50 %	347430543
80	NC_015974	GC	3	6	28031	28036	0 %	0 %	50 %	50 %	347430543
81	NC_015974	GC	3	6	28751	28756	0 %	0 %	50 %	50 %	347430544
82	NC_015974	TC	3	6	28817	28822	0 %	50 %	0 %	50 %	347430544
83	NC_015974	CG	5	10	29227	29236	0 %	0 %	50 %	50 %	347430545
84	NC_015974	GC	3	6	29500	29505	0 %	0 %	50 %	50 %	347430545
85	NC_015974	CG	3	6	29624	29629	0 %	0 %	50 %	50 %	347430545
86	NC_015974	GC	3	6	30177	30182	0 %	0 %	50 %	50 %	347430546
87	NC_015974	GC	5	10	30342	30351	0 %	0 %	50 %	50 %	347430546
88	NC_015974	GC	3	6	30493	30498	0 %	0 %	50 %	50 %	347430546
89	NC_015974	GC	3	6	30736	30741	0 %	0 %	50 %	50 %	347430546
90	NC_015974	CG	4	8	30807	30814	0 %	0 %	50 %	50 %	347430546
91	NC_015974	GC	3	6	32025	32030	0 %	0 %	50 %	50 %	347430547
92	NC_015974	GC	3	6	32033	32038	0 %	0 %	50 %	50 %	347430547
93	NC_015974	GC	3	6	32172	32177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015974	GC	3	6	32767	32772	0 %	0 %	50 %	50 %	347430548
95	NC_015974	CG	3	6	32779	32784	0 %	0 %	50 %	50 %	347430548
96	NC_015974	CG	4	8	33016	33023	0 %	0 %	50 %	50 %	347430548
97	NC_015974	CG	3	6	33316	33321	0 %	0 %	50 %	50 %	347430548
98	NC_015974	CG	3	6	33434	33439	0 %	0 %	50 %	50 %	347430548
99	NC_015974	CG	4	8	33942	33949	0 %	0 %	50 %	50 %	347430549
100	NC_015974	AG	3	6	33968	33973	50 %	0 %	50 %	0 %	347430549
101	NC_015974	GC	3	6	34129	34134	0 %	0 %	50 %	50 %	347430549
102	NC_015974	CG	3	6	34822	34827	0 %	0 %	50 %	50 %	347430550
103	NC_015974	GC	3	6	35895	35900	0 %	0 %	50 %	50 %	347430550
104	NC_015974	CT	4	8	36214	36221	0 %	50 %	0 %	50 %	347430550
105	NC_015974	CG	3	6	38943	38948	0 %	0 %	50 %	50 %	347430553
106	NC_015974	GC	4	8	39165	39172	0 %	0 %	50 %	50 %	347430553
107	NC_015974	GC	3	6	39779	39784	0 %	0 %	50 %	50 %	347430554
108	NC_015974	GC	3	6	40096	40101	0 %	0 %	50 %	50 %	347430555
109	NC_015974	CG	4	8	40544	40551	0 %	0 %	50 %	50 %	347430555
110	NC_015974	GC	3	6	40795	40800	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
111	NC_015974	GC	3	6	40874	40879	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
112	NC_015974	GC	3	6	40990	40995	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
113	NC_015974	GC	3	6	41181	41186	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
114	NC_015974	GC	3	6	41226	41231	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
115	NC_015974	GC	3	6	41805	41810	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
116	NC_015974	CG	3	6	41978	41983	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
117	NC_015974	GC	3	6	42012	42017	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
118	NC_015974	GC	3	6	42438	42443	0 %	0 %	50 %	50 %	347430556
119	NC_015974	GC	3	6	43329	43334	0 %	0 %	50 %	50 %	347430557
120	NC_015974	GC	3	6	43560	43565	0 %	0 %	50 %	50 %	347430557
121	NC_015974	GC	3	6	44277	44282	0 %	0 %	50 %	50 %	347430558
122	NC_015974	GC	3	6	45020	45025	0 %	0 %	50 %	50 %	347430558
123	NC_015974	GC	3	6	45142	45147	0 %	0 %	50 %	50 %	347430558
124	NC_015974	CG	3	6	45435	45440	0 %	0 %	50 %	50 %	347430558
125	NC_015974	CG	4	8	46630	46637	0 %	0 %	50 %	50 %	347430558
126	NC_015974	GC	3	6	46785	46790	0 %	0 %	50 %	50 %	347430558
127	NC_015974	GC	3	6	47336	47341	0 %	0 %	50 %	50 %	347430559
128	NC_015974	CG	4	8	47455	47462	0 %	0 %	50 %	50 %	347430559
129	NC_015974	CT	3	6	47588	47593	0 %	50 %	0 %	50 %	347430559
130	NC_015974	TC	3	6	48072	48077	0 %	50 %	0 %	50 %	347430560
131	NC_015974	TC	3	6	48330	48335	0 %	50 %	0 %	50 %	347430561
132	NC_015974	GC	3	6	48404	48409	0 %	0 %	50 %	50 %	347430561
133	NC_015974	CG	3	6	48422	48427	0 %	0 %	50 %	50 %	347430561
134	NC_015974	CA	3	6	48706	48711	50 %	0 %	0 %	50 %	347430561
135	NC_015974	GC	3	6	48988	48993	0 %	0 %	50 %	50 %	347430561
136	NC_015974	GC	3	6	50430	50435	0 %	0 %	50 %	50 %	347430563
137	NC_015974	CG	3	6	50743	50748	0 %	0 %	50 %	50 %	347430563
138	NC_015974	CG	3	6	51024	51029	0 %	0 %	50 %	50 %	347430563
139	NC_015974	CG	3	6	51143	51148	0 %	0 %	50 %	50 %	347430563
140	NC_015974	CG	3	6	52345	52350	0 %	0 %	50 %	50 %	347430563
141	NC_015974	AT	3	6	52658	52663	50 %	50 %	0 %	0 %	347430563
142	NC_015974	GA	3	6	52886	52891	50 %	0 %	50 %	0 %	347430563
143	NC_015974	GC	3	6	52962	52967	0 %	0 %	50 %	50 %	347430563
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.