MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015970	TCGGGC	2	12	2863	2874	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015970	CGGGTG	2	12	4891	4902	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345301803
3	NC_015970	CCCGTG	2	12	6974	6985	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345301804
4	NC_015970	CACCTG	2	12	7937	7948	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015970	TCGATC	2	12	11546	11557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345301807
6	NC_015970	ACGACA	2	12	12398	12409	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345301807
7	NC_015970	TTCCGT	2	12	13913	13924	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	345301809
8	NC_015970	TTTGTT	2	12	15440	15451	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015970	AACCAG	2	12	17775	17786	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345301811
10	NC_015970	GTTGGC	2	12	24685	24696	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345301817
11	NC_015970	CCCCGA	2	12	27192	27203	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345301820
12	NC_015970	AATTGA	2	12	29030	29041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015970	GGTGAC	2	12	31900	31911	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345301826
14	NC_015970	CCGATG	2	12	33258	33269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345301827
15	NC_015970	AGCGAA	2	12	38318	38329	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345301832
16	NC_015970	AGCTGG	2	12	39053	39064	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015970	AGGGCA	2	12	39196	39207	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015970	GCTACC	2	12	42829	42840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345301836
19	NC_015970	GGAGCC	2	12	45103	45114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345301837
20	NC_015970	ACTGAT	2	12	46922	46933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345301838
21	NC_015970	AAGTTA	2	12	46960	46971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	345301838
22	NC_015970	CAGCTC	2	12	52983	52994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345301840
23	NC_015970	GGCGCT	2	12	61561	61572	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345301847
24	NC_015970	GGTTCT	2	12	62728	62739	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345301848
25	NC_015970	GTGCTG	2	12	63255	63266	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345301848
26	NC_015970	GCTGGC	2	12	63956	63967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345301849
27	NC_015970	GGGCTG	2	12	66809	66820	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345301853
28	NC_015970	AACCTG	2	12	68099	68110	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345301854
29	NC_015970	CGCGCA	2	12	68851	68862	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345301855
30	NC_015970	CCAGCG	2	12	69235	69246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345301855
31	NC_015970	GCTACG	2	12	76591	76602	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345301863
32	NC_015970	CCAGAT	2	12	82180	82191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345301867
33	NC_015970	AAATTC	2	12	82364	82375	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	345301867
34	NC_015970	GCATGC	2	12	85531	85542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345301869
35	NC_015970	CTCGGC	2	12	89473	89484	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345301872
36	NC_015970	GACGCA	2	12	89571	89582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301872
37	NC_015970	GACAGC	2	12	93548	93559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301874
38	NC_015970	GATGCA	2	12	95114	95125	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345301875
39	NC_015970	ATGGGA	2	12	96468	96479	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345301876
40	NC_015970	GACGCT	2	12	97147	97158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345301877
41	NC_015970	TCAATT	2	12	102223	102234	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	345301882
42	NC_015970	CACCAG	2	12	102899	102910	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015970	CGCCAC	2	12	104586	104597	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345301884

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.