MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015970	TG	4	8	131	138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015970	CT	3	6	554	559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015970	AC	3	6	660	665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015970	TA	3	6	732	737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015970	AT	3	6	1107	1112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015970	GT	3	6	3835	3840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015970	CT	3	6	7558	7563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015970	AT	3	6	7667	7672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015970	AG	3	6	8528	8533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015970	GC	3	6	9151	9156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015970	TC	3	6	15170	15175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015970	GT	3	6	15474	15479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015970	AT	3	6	15643	15648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015970	CG	3	6	26021	26026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015970	CG	3	6	28312	28317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015970	GA	3	6	29115	29120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015970	GC	3	6	29347	29352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015970	TA	3	6	29920	29925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015970	GC	3	6	31284	31289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015970	CA	3	6	36059	36064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015970	CG	4	8	37558	37565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015970	CG	3	6	39190	39195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015970	CT	3	6	39381	39386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015970	CG	3	6	39402	39407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015970	GC	3	6	39600	39605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015970	GC	3	6	43297	43302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015970	AC	4	8	44455	44462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015970	AT	3	6	44516	44521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015970	CG	3	6	46141	46146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015970	GC	4	8	46188	46195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015970	GC	4	8	46249	46256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015970	GC	4	8	46310	46317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015970	GC	4	8	46371	46378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015970	GC	4	8	46432	46439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015970	GC	4	8	46493	46500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015970	GC	4	8	46554	46561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015970	CG	4	8	47630	47637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015970	CG	3	6	48812	48817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015970	GC	3	6	49385	49390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015970	AT	3	6	49933	49938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015970	CT	3	6	50942	50947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015970	GT	3	6	72930	72935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015970	GC	3	6	73304	73309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015970	TG	3	6	91541	91546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015970	GC	3	6	91669	91674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015970	GC	4	8	92279	92286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015970	GT	3	6	92585	92590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015970	CA	3	6	98727	98732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015970	CT	3	6	101999	102004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.