MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015970	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015970	G	6	6	738	743	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015970	G	6	6	1178	1183	0 %	0 %	100 %	0 %	345301800
4	NC_015970	T	7	7	4569	4575	0 %	100 %	0 %	0 %	345301803
5	NC_015970	G	6	6	4992	4997	0 %	0 %	100 %	0 %	345301803
6	NC_015970	G	6	6	5500	5505	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015970	T	7	7	6323	6329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015970	A	7	7	7256	7262	100 %	0 %	0 %	0 %	345301804
9	NC_015970	T	6	6	9546	9551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015970	T	6	6	15450	15455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015970	T	8	8	15700	15707	0 %	100 %	0 %	0 %	345301811
12	NC_015970	T	6	6	16083	16088	0 %	100 %	0 %	0 %	345301811
13	NC_015970	G	6	6	17364	17369	0 %	0 %	100 %	0 %	345301811
14	NC_015970	C	6	6	17505	17510	0 %	0 %	0 %	100 %	345301811
15	NC_015970	G	6	6	20567	20572	0 %	0 %	100 %	0 %	345301814
16	NC_015970	T	6	6	22680	22685	0 %	100 %	0 %	0 %	345301814
17	NC_015970	T	6	6	23655	23660	0 %	100 %	0 %	0 %	345301815
18	NC_015970	A	7	7	23799	23805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015970	T	7	7	23810	23816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015970	T	6	6	24485	24490	0 %	100 %	0 %	0 %	345301817
21	NC_015970	A	6	6	28460	28465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015970	T	6	6	29301	29306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015970	A	6	6	29929	29934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015970	T	6	6	30007	30012	0 %	100 %	0 %	0 %	345301825
25	NC_015970	G	6	6	31562	31567	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015970	G	6	6	32971	32976	0 %	0 %	100 %	0 %	345301827
27	NC_015970	T	6	6	35845	35850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015970	A	7	7	35910	35916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015970	C	7	7	37700	37706	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_015970	A	6	6	45226	45231	100 %	0 %	0 %	0 %	345301837
31	NC_015970	T	6	6	45787	45792	0 %	100 %	0 %	0 %	345301837
32	NC_015970	A	6	6	48364	48369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015970	A	6	6	48978	48983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015970	T	6	6	50861	50866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015970	A	6	6	50882	50887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015970	T	6	6	51039	51044	0 %	100 %	0 %	0 %	345301839
37	NC_015970	A	6	6	51814	51819	100 %	0 %	0 %	0 %	345301839
38	NC_015970	T	7	7	52026	52032	0 %	100 %	0 %	0 %	345301839
39	NC_015970	A	7	7	52073	52079	100 %	0 %	0 %	0 %	345301839
40	NC_015970	C	6	6	54649	54654	0 %	0 %	0 %	100 %	345301842
41	NC_015970	A	6	6	59349	59354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015970	C	6	6	59455	59460	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_015970	C	6	6	60951	60956	0 %	0 %	0 %	100 %	345301847
44	NC_015970	A	6	6	63785	63790	100 %	0 %	0 %	0 %	345301849
45	NC_015970	C	6	6	66510	66515	0 %	0 %	0 %	100 %	345301853
46	NC_015970	G	6	6	67089	67094	0 %	0 %	100 %	0 %	345301853
47	NC_015970	T	6	6	67829	67834	0 %	100 %	0 %	0 %	345301854
48	NC_015970	A	6	6	68383	68388	100 %	0 %	0 %	0 %	345301854
49	NC_015970	C	6	6	69189	69194	0 %	0 %	0 %	100 %	345301855
50	NC_015970	T	6	6	69684	69689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015970	A	6	6	70680	70685	100 %	0 %	0 %	0 %	345301857
52	NC_015970	A	6	6	71947	71952	100 %	0 %	0 %	0 %	345301858
53	NC_015970	T	6	6	72585	72590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015970	A	6	6	73320	73325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015970	C	6	6	73372	73377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_015970	C	6	6	75405	75410	0 %	0 %	0 %	100 %	345301863
57	NC_015970	A	6	6	77993	77998	100 %	0 %	0 %	0 %	345301864
58	NC_015970	T	6	6	78877	78882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015970	A	6	6	79321	79326	100 %	0 %	0 %	0 %	345301865
60	NC_015970	A	6	6	79418	79423	100 %	0 %	0 %	0 %	345301865
61	NC_015970	T	6	6	79556	79561	0 %	100 %	0 %	0 %	345301865
62	NC_015970	T	6	6	80899	80904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015970	A	6	6	80920	80925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015970	C	6	6	82224	82229	0 %	0 %	0 %	100 %	345301867
65	NC_015970	T	6	6	82635	82640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015970	C	6	6	83109	83114	0 %	0 %	0 %	100 %	345301868
67	NC_015970	C	6	6	88023	88028	0 %	0 %	0 %	100 %	345301872
68	NC_015970	A	6	6	92295	92300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015970	C	6	6	92347	92352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_015970	T	7	7	95562	95568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015970	A	6	6	95732	95737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015970	A	6	6	95753	95758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015970	T	7	7	100772	100778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.