MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015966	GAAC	2	8	95	102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015966	TTCT	2	8	3981	3988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015966	GCGG	2	8	5816	5823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015966	CCGA	2	8	9176	9183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015966	ACCA	2	8	18481	18488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015966	CCTT	2	8	20200	20207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015966	AGCC	2	8	26405	26412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015966	TCAT	2	8	31596	31603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015966	CTGC	2	8	34652	34659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015966	GGAG	2	8	43642	43649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015966	CGGG	2	8	58824	58831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015966	GCCG	2	8	58997	59004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015966	GGGT	2	8	59601	59608	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015966	ACGG	2	8	62569	62576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015966	ACCG	2	8	63507	63514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015966	CGAT	2	8	72678	72685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015966	CCCT	2	8	81438	81445	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015966	AAAC	2	8	81640	81647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015966	GGGC	2	8	88611	88618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015966	CGGG	2	8	96382	96389	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015966	AAAC	2	8	96413	96420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015966	AACC	2	8	101603	101610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015966	GAAA	2	8	105156	105163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015966	AAGC	2	8	107656	107663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015966	GCTT	2	8	115895	115902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015966	CCAA	2	8	116216	116223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015966	CCGG	2	8	120218	120225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015966	CATG	2	8	120963	120970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015966	AATT	2	8	126689	126696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015966	CCGG	2	8	130805	130812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015966	AGTG	2	8	133330	133337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015966	CAAA	2	8	136115	136122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015966	GTTT	2	8	138824	138831	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015966	GTCG	2	8	138902	138909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015966	AAAT	2	8	141213	141220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015966	GTTG	2	8	154501	154508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015966	CGTG	2	8	157788	157795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015966	TGCC	2	8	165740	165747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015966	GGCG	2	8	166789	166796	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015966	GATG	2	8	166877	166884	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015966	CTGC	2	8	167216	167223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015966	CCGG	2	8	168171	168178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015966	AAAG	2	8	168262	168269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015966	GCGA	2	8	168293	168300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015966	CCGA	2	8	168433	168440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015966	CCAA	2	8	168895	168902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015966	AAGG	2	8	169962	169969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015966	CCGA	2	8	170002	170009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015966	GCAG	2	8	170586	170593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015966	CTGC	2	8	170750	170757	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015966	GGGC	2	8	170834	170841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015966	TTCT	2	8	171219	171226	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015966	CGAC	2	8	171365	171372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015966	GCTG	2	8	171398	171405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015966	CTGG	2	8	171708	171715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015966	GGTG	2	8	171757	171764	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015966	CGGT	2	8	171825	171832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015966	GGAC	2	8	172196	172203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015966	GCAA	2	8	172424	172431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015966	CTGC	2	8	172659	172666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015966	GCCG	2	8	183624	183631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015966	ACGC	2	8	190277	190284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015966	GGCA	2	8	201845	201852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015966	TGGC	2	8	202032	202039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015966	GGAT	2	8	207654	207661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015966	ACGA	2	8	207709	207716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015966	AAAG	2	8	207771	207778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015966	ATCA	2	8	222756	222763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015966	CGTT	2	8	224088	224095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015966	GCCC	2	8	229609	229616	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_015966	GATA	2	8	230712	230719	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015966	TCGT	2	8	231133	231140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015966	GGTT	2	8	245153	245160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015966	ACAG	2	8	245394	245401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015966	CGAA	2	8	253859	253866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015966	CCGC	2	8	255117	255124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_015966	TCGT	2	8	262961	262968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015966	ACAA	2	8	264194	264201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015966	TCAA	2	8	264227	264234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015966	AAGA	2	8	264322	264329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015966	GATT	2	8	267169	267176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015966	GATC	2	8	271004	271011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015966	TTCG	2	8	271810	271817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015966	GCCT	2	8	271900	271907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015966	ACGC	2	8	271915	271922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015966	GGCT	2	8	274879	274886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015966	AACC	2	8	285556	285563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015966	TGGA	2	8	292762	292769	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015966	ATCC	2	8	297604	297611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015966	GCAG	2	8	312078	312085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015966	TTTA	2	8	313399	313406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015966	TATT	2	8	314173	314180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015966	ACCA	2	8	315812	315819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015966	GGTG	2	8	319887	319894	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015966	TCCC	2	8	319958	319965	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_015966	TGTT	2	8	320015	320022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015966	CGGG	2	8	320036	320043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015966	TACA	2	8	324317	324324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015966	GGAC	2	8	332826	332833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015966	CCCG	2	8	340158	340165	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_015966	CGGG	2	8	340171	340178	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015966	CGCC	2	8	343382	343389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_015966	CTTC	2	8	343633	343640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015966	GCCA	2	8	357463	357470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015966	AAAT	2	8	358870	358877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015966	CTAT	2	8	364517	364524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015966	CGAG	2	8	370592	370599	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015966	GCGG	2	8	381310	381317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015966	TTAA	2	8	385060	385067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015966	CGGA	2	8	385460	385467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015966	GGGC	2	8	385550	385557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015966	CGGT	2	8	385712	385719	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015966	CGGG	2	8	411991	411998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015966	GGTC	2	8	420040	420047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015966	CCCG	2	8	423329	423336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_015966	CGGG	2	8	423337	423344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015966	GCCG	2	8	423506	423513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015966	ACTT	2	8	423687	423694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015966	TCGG	2	8	424281	424288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015966	AAGC	2	8	424445	424452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015966	CGGA	2	8	425493	425500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015966	CCAC	2	8	425522	425529	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_015966	GGCA	2	8	438644	438651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015966	AACG	2	8	440630	440637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015966	CGGG	2	8	440727	440734	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015966	TTTC	2	8	442428	442435	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015966	AAGC	2	8	447479	447486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015966	GATG	2	8	448845	448852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015966	ACGC	2	8	451364	451371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015966	ACCA	2	8	453146	453153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015966	AGAC	2	8	453803	453810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015966	GAAA	2	8	455273	455280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015966	ACCG	2	8	458550	458557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015966	CCGG	2	8	463215	463222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015966	CAAC	2	8	463931	463938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015966	GGAC	2	8	470023	470030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015966	GCCG	2	8	476742	476749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015966	GCTT	2	8	481049	481056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015966	CGAA	2	8	489145	489152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015966	GTAC	2	8	489209	489216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015966	GTTG	2	8	496432	496439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015966	ACGG	2	8	497380	497387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015966	CGGC	2	8	497388	497395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015966	TCGC	2	8	497543	497550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015966	CGAC	2	8	502585	502592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015966	TGGT	2	8	506731	506738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015966	CCGG	2	8	511956	511963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015966	GCCG	2	8	511968	511975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015966	CATT	2	8	515986	515993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015966	AAAT	2	8	515999	516006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015966	GCTT	2	8	516068	516075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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