MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 52863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015966	ATC	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301889
2	NC_015966	GAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301889
3	NC_015966	GAC	2	6	337	342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301889
4	NC_015966	ACT	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301889
5	NC_015966	TCC	2	6	534	539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301889
6	NC_015966	GAC	3	9	543	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301889
7	NC_015966	CCG	2	6	559	564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301889
8	NC_015966	GCC	2	6	639	644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301889
9	NC_015966	CAT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301889
10	NC_015966	CTG	2	6	1006	1011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301889
11	NC_015966	TCG	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301889
12	NC_015966	CGG	2	6	1035	1040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301889
13	NC_015966	AGG	2	6	1055	1060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301889
14	NC_015966	GCC	2	6	1125	1130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301889
15	NC_015966	GCC	2	6	1200	1205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301889
16	NC_015966	CGA	2	6	1269	1274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301889
17	NC_015966	GCT	2	6	1332	1337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301889
18	NC_015966	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301889
19	NC_015966	GCA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301889
20	NC_015966	AAT	2	6	1683	1688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345301889
21	NC_015966	CTG	2	6	1813	1818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301890
22	NC_015966	CGG	2	6	1829	1834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301890
23	NC_015966	GTG	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301890
24	NC_015966	GCT	2	6	2022	2027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301890
25	NC_015966	CGA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301890
26	NC_015966	ACC	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301890
27	NC_015966	TGG	2	6	2123	2128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301890
28	NC_015966	GCC	2	6	2194	2199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301890
29	NC_015966	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301890
30	NC_015966	AGA	2	6	2219	2224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301890
31	NC_015966	ATG	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301890
32	NC_015966	TCT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301890
33	NC_015966	GTG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301890
34	NC_015966	TGG	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301890
35	NC_015966	GCC	2	6	2419	2424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301890
36	NC_015966	CAT	2	6	2493	2498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301890
37	NC_015966	GCC	2	6	2501	2506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301890
38	NC_015966	CGA	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301890
39	NC_015966	CGG	2	6	2560	2565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301890
40	NC_015966	TGG	3	9	2567	2575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301890
41	NC_015966	ACG	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301890
42	NC_015966	CGA	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301890
43	NC_015966	CGT	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301891
44	NC_015966	GCA	2	6	3051	3056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301891
45	NC_015966	CCT	2	6	3084	3089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301891
46	NC_015966	GAC	2	6	3101	3106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301891
47	NC_015966	CAC	2	6	3121	3126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301891
48	NC_015966	CCA	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301891
49	NC_015966	CCT	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301891
50	NC_015966	CCA	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301891
51	NC_015966	TCC	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301891
52	NC_015966	ACC	2	6	3383	3388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301891
53	NC_015966	CTC	2	6	3508	3513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301891
54	NC_015966	CGA	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301891
55	NC_015966	CGG	2	6	3700	3705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301891
56	NC_015966	TTC	2	6	3754	3759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301891
57	NC_015966	GCA	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301891
58	NC_015966	GGC	2	6	4076	4081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301892
59	NC_015966	CGG	2	6	4116	4121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301892
60	NC_015966	GCC	2	6	4130	4135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301892
61	NC_015966	CAG	2	6	4164	4169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301892
62	NC_015966	CGG	2	6	4214	4219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301892
63	NC_015966	AGC	2	6	4234	4239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301892
64	NC_015966	GAT	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301892
65	NC_015966	AGG	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301892
66	NC_015966	GGC	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301892
67	NC_015966	GCT	2	6	4448	4453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301892
68	NC_015966	CAG	2	6	4536	4541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301892
69	NC_015966	CCA	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301892
70	NC_015966	TCG	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301892
71	NC_015966	AAG	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301893
72	NC_015966	TGC	2	6	5241	5246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301893
73	NC_015966	GCG	2	6	5263	5268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301893
74	NC_015966	TGC	2	6	5271	5276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301893
75	NC_015966	CCG	2	6	5469	5474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301894
76	NC_015966	GAA	2	6	5482	5487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301894
77	NC_015966	GGC	2	6	5504	5509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301894
78	NC_015966	ACG	2	6	5545	5550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301894
79	NC_015966	GCG	2	6	5582	5587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301894
80	NC_015966	AAG	2	6	5716	5721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301894
81	NC_015966	GAC	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301895
82	NC_015966	GAG	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301895
83	NC_015966	CAT	2	6	6101	6106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301895
84	NC_015966	GCA	2	6	6122	6127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301895
85	NC_015966	CTC	2	6	6129	6134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301895
86	NC_015966	AGC	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301895
87	NC_015966	AAG	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301895
88	NC_015966	TCG	2	6	6190	6195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301895
89	NC_015966	AAG	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301895
90	NC_015966	CGT	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301895
91	NC_015966	GGC	2	6	6276	6281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301895
92	NC_015966	CCG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301895
93	NC_015966	GAA	2	6	6345	6350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301895
94	NC_015966	TGA	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301895
95	NC_015966	CGG	2	6	6428	6433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301895
96	NC_015966	TCG	2	6	6472	6477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301895
97	NC_015966	GTG	2	6	6480	6485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301895
98	NC_015966	CAT	2	6	6530	6535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301895
99	NC_015966	TCG	2	6	6541	6546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301895
100	NC_015966	ACG	3	9	6592	6600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301895
101	NC_015966	ATC	2	6	6645	6650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301895
102	NC_015966	GAA	2	6	6675	6680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301895
103	NC_015966	GCC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301895
104	NC_015966	ATG	2	6	6857	6862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301896
105	NC_015966	GCC	2	6	6905	6910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301896
106	NC_015966	TCG	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301896
107	NC_015966	GAG	2	6	7064	7069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301896
108	NC_015966	GCA	2	6	7084	7089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301896
109	NC_015966	AGC	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301896
110	NC_015966	GCT	2	6	7135	7140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301896
111	NC_015966	ACC	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301896
112	NC_015966	ATC	2	6	7259	7264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301896
113	NC_015966	GTC	2	6	7307	7312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301896
114	NC_015966	GCC	2	6	7361	7366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301896
115	NC_015966	GGA	2	6	7402	7407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301896
116	NC_015966	GCC	2	6	7442	7447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301896
117	NC_015966	TGC	2	6	7524	7529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301896
118	NC_015966	TCA	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301896
119	NC_015966	CGC	2	6	7552	7557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301896
120	NC_015966	CAG	2	6	7580	7585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301896
121	NC_015966	AAC	2	6	7789	7794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301897
122	NC_015966	CCG	2	6	7812	7817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301897
123	NC_015966	GCG	2	6	7835	7840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301897
124	NC_015966	GGT	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301897
125	NC_015966	CGG	3	9	7950	7958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301897
126	NC_015966	CCA	2	6	8033	8038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301897
127	NC_015966	GTG	2	6	8176	8181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301897
128	NC_015966	CAC	2	6	8214	8219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301897
129	NC_015966	GCC	3	9	8227	8235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301897
130	NC_015966	TGC	2	6	8264	8269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301897
131	NC_015966	CAC	2	6	8337	8342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301897
132	NC_015966	CAT	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301897
133	NC_015966	GCG	2	6	8477	8482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301897
134	NC_015966	CGC	2	6	8516	8521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301897
135	NC_015966	TGG	2	6	8577	8582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301898
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139	NC_015966	CAT	2	6	8839	8844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301898
140	NC_015966	ACG	2	6	8874	8879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301898
141	NC_015966	CAT	2	6	8884	8889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301898
142	NC_015966	GCC	2	6	8942	8947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301898
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144	NC_015966	GAG	2	6	9065	9070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301898
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152	NC_015966	TCG	2	6	9904	9909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301899
153	NC_015966	TGC	2	6	9994	9999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301899
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156	NC_015966	ACG	2	6	10159	10164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301899
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163	NC_015966	GAG	2	6	10461	10466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301900
164	NC_015966	ACC	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301900
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239	NC_015966	CGA	2	6	13861	13866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301903
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242	NC_015966	TCG	2	6	14007	14012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301903
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244	NC_015966	GAC	2	6	14250	14255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301903
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246	NC_015966	CAG	2	6	14282	14287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301903
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248	NC_015966	CCG	2	6	14497	14502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301903
249	NC_015966	GAA	2	6	14801	14806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301903
250	NC_015966	CGT	2	6	14890	14895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301903
251	NC_015966	AGC	2	6	14985	14990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301903
252	NC_015966	TCA	2	6	15024	15029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301903
253	NC_015966	CGA	2	6	15130	15135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301903
254	NC_015966	CCA	2	6	15379	15384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301904
255	NC_015966	CAG	2	6	15500	15505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301904
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378	NC_015966	CCG	2	6	23065	23070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301912
379	NC_015966	CAG	2	6	23090	23095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
380	NC_015966	AGC	2	6	23103	23108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
381	NC_015966	GCT	3	9	23264	23272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
382	NC_015966	CTG	2	6	23274	23279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
383	NC_015966	ACG	2	6	23320	23325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301913
384	NC_015966	CGT	2	6	23435	23440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
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386	NC_015966	CTG	2	6	23604	23609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
387	NC_015966	ATC	2	6	23652	23657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
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389	NC_015966	CGA	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301913
390	NC_015966	GAG	2	6	23847	23852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301913
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392	NC_015966	CAT	2	6	23873	23878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
393	NC_015966	CAT	2	6	23882	23887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
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398	NC_015966	AAG	2	6	24186	24191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301913
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402	NC_015966	CTA	2	6	24708	24713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301914
403	NC_015966	GCT	2	6	24741	24746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301914
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499	NC_015966	CTG	2	6	29781	29786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301919
500	NC_015966	TTC	2	6	29801	29806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301919

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