MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015964	ATTT	2	8	1200	1207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015964	GATG	2	8	6058	6065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015964	CAAA	2	8	8385	8392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015964	TAAA	2	8	9052	9059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015964	CGTG	2	8	9969	9976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015964	AATA	2	8	10195	10202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015964	TTAG	2	8	12876	12883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015964	TAAC	2	8	13007	13014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015964	CGTG	2	8	16277	16284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015964	ACCG	2	8	16312	16319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015964	CTTT	2	8	17641	17648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015964	AGCG	2	8	19778	19785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015964	AAAC	2	8	20359	20366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015964	TTTA	2	8	20534	20541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015964	CAAT	2	8	35235	35242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015964	TTTA	2	8	53115	53122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015964	CCTT	2	8	58772	58779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015964	AAGT	2	8	58830	58837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015964	AATG	2	8	64048	64055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015964	CAAA	2	8	64267	64274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015964	ATTA	2	8	67952	67959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015964	AAGC	2	8	68773	68780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015964	TTTA	2	8	70991	70998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015964	TTTA	2	8	79296	79303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015964	TTTA	2	8	85471	85478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015964	TTAG	2	8	85489	85496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015964	TGAA	2	8	88624	88631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015964	TTAA	2	8	89886	89893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015964	TATT	2	8	97224	97231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015964	AATT	2	8	97269	97276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015964	CAGT	2	8	102814	102821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015964	TATT	2	8	107886	107893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015964	TTTA	2	8	115822	115829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015964	AATA	2	8	126790	126797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015964	TTAC	2	8	133200	133207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015964	CGAA	2	8	135413	135420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015964	AACC	2	8	135462	135469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015964	AAGC	2	8	135533	135540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015964	CAAC	2	8	138253	138260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015964	TACC	2	8	138269	138276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015964	AGAA	2	8	149020	149027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015964	AAGG	2	8	149037	149044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015964	AATA	2	8	150150	150157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015964	AAAT	2	8	154501	154508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015964	AACA	2	8	157147	157154	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015964	TAAG	2	8	158990	158997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015964	CATT	2	8	160599	160606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015964	GTTT	2	8	161243	161250	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015964	GAAT	2	8	172939	172946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015964	GTAT	2	8	183386	183393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015964	TAAA	2	8	183427	183434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015964	AACT	2	8	185800	185807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015964	CTTA	2	8	186811	186818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015964	TGAA	2	8	190203	190210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015964	TCAC	2	8	193971	193978	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015964	TTTC	2	8	194464	194471	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015964	TTTA	2	8	198502	198509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015964	GTTC	2	8	200766	200773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015964	ATTA	2	8	202661	202668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015964	TAAT	2	8	202684	202691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015964	TAAA	2	8	217257	217264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015964	TTCC	2	8	218890	218897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015964	TTAC	2	8	225031	225038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015964	AAAT	2	8	225171	225178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015964	CGAA	2	8	226450	226457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015964	GTTC	2	8	237735	237742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015964	ATTT	2	8	241125	241132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015964	ATGA	2	8	241173	241180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015964	ACAA	2	8	241233	241240	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015964	TAAA	2	8	243107	243114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015964	TCTA	2	8	248260	248267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015964	ATTT	2	8	252772	252779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015964	TTTA	2	8	252790	252797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015964	AAAT	2	8	253181	253188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015964	TCAT	2	8	261324	261331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015964	TTGC	2	8	261364	261371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015964	CATA	2	8	264364	264371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015964	ATAA	2	8	284903	284910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015964	AATT	2	8	284955	284962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015964	ATTT	2	8	286475	286482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015964	CTTC	2	8	289491	289498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015964	AAAG	2	8	299087	299094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015964	AATA	2	8	309898	309905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015964	TGAT	2	8	315290	315297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015964	ATTT	2	8	316371	316378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015964	TAAC	2	8	319102	319109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015964	TTAA	2	8	322006	322013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015964	TAGA	2	8	322091	322098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015964	TTGA	2	8	322132	322139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015964	CTAA	2	8	322224	322231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015964	TTAA	2	8	322234	322241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015964	AAGA	2	8	328448	328455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015964	TAAT	2	8	329785	329792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015964	ATAA	2	8	330889	330896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015964	TTTC	2	8	330933	330940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015964	TTGT	2	8	334310	334317	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015964	GAAA	2	8	334345	334352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015964	TGTT	2	8	334931	334938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015964	ACTC	2	8	335068	335075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015964	TTTG	2	8	342014	342021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015964	ACAA	2	8	342115	342122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015964	AATA	2	8	346670	346677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015964	AAAT	2	8	346724	346731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015964	AACA	2	8	348297	348304	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015964	AAAT	2	8	353977	353984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015964	AATA	2	8	354704	354711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015964	ACCG	2	8	355524	355531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015964	TAAA	2	8	356979	356986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015964	TAAA	2	8	357046	357053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015964	GATT	2	8	358176	358183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015964	AAAT	2	8	358389	358396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015964	AAAC	2	8	360071	360078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015964	ATAA	2	8	363108	363115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015964	CTTT	2	8	375178	375185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015964	AATA	2	8	375211	375218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015964	TATT	2	8	379087	379094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015964	TTTA	2	8	384194	384201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015964	TATT	2	8	385542	385549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015964	TGAA	2	8	385553	385560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015964	AATT	2	8	386972	386979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015964	AATT	2	8	388834	388841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015964	GGTT	2	8	394450	394457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015964	ATCA	2	8	396610	396617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015964	ATAA	2	8	403662	403669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015964	CAAT	2	8	403691	403698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015964	CGTG	2	8	403955	403962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015964	GTTT	2	8	404001	404008	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015964	ATTG	2	8	404010	404017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015964	CAAA	2	8	415648	415655	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015964	CACC	2	8	422705	422712	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_015964	AACA	2	8	427281	427288	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015964	AAAC	2	8	427814	427821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015964	ATTC	2	8	428470	428477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015964	CAGG	2	8	434522	434529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015964	GTTT	2	8	434958	434965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015964	CAAT	2	8	435258	435265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015964	TGTC	2	8	435540	435547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015964	GCTT	2	8	435558	435565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015964	GGCA	2	8	436063	436070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015964	CAGC	2	8	436130	436137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015964	CTTT	2	8	436809	436816	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015964	GTAC	2	8	437369	437376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015964	TCGC	2	8	437643	437650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015964	TCAA	2	8	437956	437963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015964	TAAA	2	8	438081	438088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015964	AGGC	2	8	438173	438180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015964	TTTA	2	8	438215	438222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015964	CTCA	2	8	438244	438251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015964	ATCA	2	8	438376	438383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015964	CCCT	2	8	439288	439295	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_015964	TCAA	2	8	440070	440077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015964	GGGT	2	8	448934	448941	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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