MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 4757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015964	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	345428591
2	NC_015964	CTTG	2	8	1403	1410	0 %	50 %	25 %	25 %	345428592
3	NC_015964	ATTT	2	8	1546	1553	25 %	75 %	0 %	0 %	345428592
4	NC_015964	TGTT	2	8	1578	1585	0 %	75 %	25 %	0 %	345428592
5	NC_015964	GATG	2	8	1774	1781	25 %	25 %	50 %	0 %	345428592
6	NC_015964	CTTT	2	8	1913	1920	0 %	75 %	0 %	25 %	345428592
7	NC_015964	GAGC	2	8	1943	1950	25 %	0 %	50 %	25 %	345428592
8	NC_015964	AACC	2	8	2310	2317	50 %	0 %	0 %	50 %	345428592
9	NC_015964	ATTT	2	8	2604	2611	25 %	75 %	0 %	0 %	345428592
10	NC_015964	ACCG	2	8	2615	2622	25 %	0 %	25 %	50 %	345428592
11	NC_015964	GGTT	2	8	3330	3337	0 %	50 %	50 %	0 %	345428593
12	NC_015964	CCAA	2	8	4383	4390	50 %	0 %	0 %	50 %	345428594
13	NC_015964	AATT	2	8	6657	6664	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
14	NC_015964	AATT	2	8	7198	7205	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
15	NC_015964	TCAT	2	8	7519	7526	25 %	50 %	0 %	25 %	345428596
16	NC_015964	AATT	2	8	7669	7676	50 %	50 %	0 %	0 %	345428597
17	NC_015964	AATG	2	8	7838	7845	50 %	25 %	25 %	0 %	345428597
18	NC_015964	TTTA	2	8	9102	9109	25 %	75 %	0 %	0 %	345428598
19	NC_015964	CAAG	2	8	10624	10631	50 %	0 %	25 %	25 %	345428600
20	NC_015964	AAAC	2	8	10997	11004	75 %	0 %	0 %	25 %	345428600
21	NC_015964	TGCA	2	8	11136	11143	25 %	25 %	25 %	25 %	345428600
22	NC_015964	AAAG	2	8	11587	11594	75 %	0 %	25 %	0 %	345428601
23	NC_015964	AAAG	2	8	11808	11815	75 %	0 %	25 %	0 %	345428601
24	NC_015964	CAAA	2	8	11913	11920	75 %	0 %	0 %	25 %	345428601
25	NC_015964	CAAG	2	8	12036	12043	50 %	0 %	25 %	25 %	345428601
26	NC_015964	ATTG	2	8	13097	13104	25 %	50 %	25 %	0 %	345428602
27	NC_015964	TAAC	2	8	13330	13337	50 %	25 %	0 %	25 %	345428602
28	NC_015964	TTAA	2	8	13707	13714	50 %	50 %	0 %	0 %	345428602
29	NC_015964	TTCA	2	8	14189	14196	25 %	50 %	0 %	25 %	345428602
30	NC_015964	TCAT	2	8	14550	14557	25 %	50 %	0 %	25 %	345428602
31	NC_015964	TGGA	2	8	14790	14797	25 %	25 %	50 %	0 %	345428602
32	NC_015964	AATC	2	8	14876	14883	50 %	25 %	0 %	25 %	345428602
33	NC_015964	ACCA	2	8	16622	16629	50 %	0 %	0 %	50 %	345428605
34	NC_015964	CTTG	2	8	16641	16648	0 %	50 %	25 %	25 %	345428605
35	NC_015964	ATTA	2	8	16955	16962	50 %	50 %	0 %	0 %	345428605
36	NC_015964	TTAA	2	8	17412	17419	50 %	50 %	0 %	0 %	345428605
37	NC_015964	CTTT	2	8	17687	17694	0 %	75 %	0 %	25 %	345428606
38	NC_015964	CATT	2	8	18522	18529	25 %	50 %	0 %	25 %	345428607
39	NC_015964	CAAT	2	8	19432	19439	50 %	25 %	0 %	25 %	345428609
40	NC_015964	TTCA	2	8	21171	21178	25 %	50 %	0 %	25 %	345428610
41	NC_015964	CTTG	2	8	21377	21384	0 %	50 %	25 %	25 %	345428610
42	NC_015964	CAAT	2	8	21902	21909	50 %	25 %	0 %	25 %	345428611
43	NC_015964	CACT	2	8	22377	22384	25 %	25 %	0 %	50 %	345428611
44	NC_015964	TTGT	2	8	22531	22538	0 %	75 %	25 %	0 %	345428611
45	NC_015964	CGAA	2	8	22648	22655	50 %	0 %	25 %	25 %	345428611
46	NC_015964	GAAC	2	8	22778	22785	50 %	0 %	25 %	25 %	345428611
47	NC_015964	AAGC	2	8	23631	23638	50 %	0 %	25 %	25 %	345428611
48	NC_015964	TTTA	2	8	24206	24213	25 %	75 %	0 %	0 %	345428613
49	NC_015964	CACC	2	8	24793	24800	25 %	0 %	0 %	75 %	345428614
50	NC_015964	ACAT	2	8	24989	24996	50 %	25 %	0 %	25 %	345428614
51	NC_015964	ATTA	2	8	25232	25239	50 %	50 %	0 %	0 %	345428615
52	NC_015964	GCCA	2	8	25293	25300	25 %	0 %	25 %	50 %	345428615
53	NC_015964	GATT	2	8	25931	25938	25 %	50 %	25 %	0 %	345428616
54	NC_015964	GCTT	2	8	28099	28106	0 %	50 %	25 %	25 %	345428619
55	NC_015964	TTTG	2	8	28444	28451	0 %	75 %	25 %	0 %	345428619
56	NC_015964	TCAA	2	8	28682	28689	50 %	25 %	0 %	25 %	345428620
57	NC_015964	AAGT	2	8	28726	28733	50 %	25 %	25 %	0 %	345428620
58	NC_015964	TTCT	2	8	29341	29348	0 %	75 %	0 %	25 %	345428620
59	NC_015964	TCAT	2	8	29894	29901	25 %	50 %	0 %	25 %	345428620
60	NC_015964	GGTA	2	8	30850	30857	25 %	25 %	50 %	0 %	345428621
61	NC_015964	ATTT	2	8	31482	31489	25 %	75 %	0 %	0 %	345428622
62	NC_015964	GTTT	2	8	32252	32259	0 %	75 %	25 %	0 %	345428623
63	NC_015964	GCTT	2	8	32444	32451	0 %	50 %	25 %	25 %	345428623
64	NC_015964	TTCT	2	8	34248	34255	0 %	75 %	0 %	25 %	345428625
65	NC_015964	TGAA	2	8	34608	34615	50 %	25 %	25 %	0 %	345428625
66	NC_015964	TTCA	2	8	34769	34776	25 %	50 %	0 %	25 %	345428625
67	NC_015964	ATTT	2	8	35272	35279	25 %	75 %	0 %	0 %	345428626
68	NC_015964	CCAA	2	8	35803	35810	50 %	0 %	0 %	50 %	345428626
69	NC_015964	GAAA	2	8	36014	36021	75 %	0 %	25 %	0 %	345428626
70	NC_015964	CGTT	2	8	36187	36194	0 %	50 %	25 %	25 %	345428627
71	NC_015964	TTAA	2	8	36314	36321	50 %	50 %	0 %	0 %	345428627
72	NC_015964	ACAA	2	8	36504	36511	75 %	0 %	0 %	25 %	345428627
73	NC_015964	CCGC	2	8	36989	36996	0 %	0 %	25 %	75 %	345428627
74	NC_015964	CTTT	2	8	37132	37139	0 %	75 %	0 %	25 %	345428628
75	NC_015964	CCTG	2	8	38051	38058	0 %	25 %	25 %	50 %	345428629
76	NC_015964	TGCA	2	8	38642	38649	25 %	25 %	25 %	25 %	345428629
77	NC_015964	TAAA	2	8	38721	38728	75 %	25 %	0 %	0 %	345428629
78	NC_015964	AATC	2	8	38988	38995	50 %	25 %	0 %	25 %	345428630
79	NC_015964	TCTG	2	8	39079	39086	0 %	50 %	25 %	25 %	345428630
80	NC_015964	TTCC	2	8	39392	39399	0 %	50 %	0 %	50 %	345428630
81	NC_015964	TAAG	2	8	39542	39549	50 %	25 %	25 %	0 %	345428630
82	NC_015964	GTAT	2	8	39900	39907	25 %	50 %	25 %	0 %	345428630
83	NC_015964	CAAC	2	8	40029	40036	50 %	0 %	0 %	50 %	345428630
84	NC_015964	CAAT	2	8	40270	40277	50 %	25 %	0 %	25 %	345428630
85	NC_015964	GACT	2	8	41629	41636	25 %	25 %	25 %	25 %	345428631
86	NC_015964	GATT	2	8	42412	42419	25 %	50 %	25 %	0 %	345428631
87	NC_015964	GATA	2	8	42507	42514	50 %	25 %	25 %	0 %	345428631
88	NC_015964	AATA	2	8	42621	42628	75 %	25 %	0 %	0 %	345428631
89	NC_015964	GAAA	2	8	43435	43442	75 %	0 %	25 %	0 %	345428632
90	NC_015964	TTTC	2	8	43513	43520	0 %	75 %	0 %	25 %	345428632
91	NC_015964	CAAT	2	8	44076	44083	50 %	25 %	0 %	25 %	345428632
92	NC_015964	AAGC	2	8	44091	44098	50 %	0 %	25 %	25 %	345428633
93	NC_015964	TTTC	2	8	44424	44431	0 %	75 %	0 %	25 %	345428633
94	NC_015964	GCTG	2	8	44453	44460	0 %	25 %	50 %	25 %	345428633
95	NC_015964	AATT	2	8	44521	44528	50 %	50 %	0 %	0 %	345428633
96	NC_015964	TTAA	2	8	44987	44994	50 %	50 %	0 %	0 %	345428633
97	NC_015964	TAAA	2	8	45030	45037	75 %	25 %	0 %	0 %	345428633
98	NC_015964	GTAA	2	8	45135	45142	50 %	25 %	25 %	0 %	345428634
99	NC_015964	CTTT	2	8	45189	45196	0 %	75 %	0 %	25 %	345428634
100	NC_015964	TAAA	2	8	45629	45636	75 %	25 %	0 %	0 %	345428635
101	NC_015964	TACG	2	8	46683	46690	25 %	25 %	25 %	25 %	345428636
102	NC_015964	ACGT	2	8	46722	46729	25 %	25 %	25 %	25 %	345428636
103	NC_015964	GAAA	2	8	48051	48058	75 %	0 %	25 %	0 %	345428637
104	NC_015964	GCAA	2	8	48198	48205	50 %	0 %	25 %	25 %	345428637
105	NC_015964	CATC	2	8	48382	48389	25 %	25 %	0 %	50 %	345428637
106	NC_015964	AGAA	2	8	48455	48462	75 %	0 %	25 %	0 %	345428638
107	NC_015964	CACG	2	8	48937	48944	25 %	0 %	25 %	50 %	345428638
108	NC_015964	TTGA	2	8	49209	49216	25 %	50 %	25 %	0 %	345428638
109	NC_015964	AATC	2	8	49280	49287	50 %	25 %	0 %	25 %	345428638
110	NC_015964	TTTC	2	8	49790	49797	0 %	75 %	0 %	25 %	345428638
111	NC_015964	AATT	2	8	49851	49858	50 %	50 %	0 %	0 %	345428639
112	NC_015964	GAGC	2	8	49904	49911	25 %	0 %	50 %	25 %	345428639
113	NC_015964	ATTG	2	8	49996	50003	25 %	50 %	25 %	0 %	345428639
114	NC_015964	CCTT	2	8	50239	50246	0 %	50 %	0 %	50 %	345428639
115	NC_015964	ATAA	2	8	50391	50398	75 %	25 %	0 %	0 %	345428639
116	NC_015964	CCAA	2	8	50748	50755	50 %	0 %	0 %	50 %	345428640
117	NC_015964	TGAA	2	8	51067	51074	50 %	25 %	25 %	0 %	345428640
118	NC_015964	CTGT	2	8	51274	51281	0 %	50 %	25 %	25 %	345428640
119	NC_015964	GAAA	2	8	52050	52057	75 %	0 %	25 %	0 %	345428640
120	NC_015964	TTAA	2	8	52314	52321	50 %	50 %	0 %	0 %	345428641
121	NC_015964	TGCG	2	8	52572	52579	0 %	25 %	50 %	25 %	345428642
122	NC_015964	TGCT	2	8	52599	52606	0 %	50 %	25 %	25 %	345428642
123	NC_015964	ATTT	2	8	53521	53528	25 %	75 %	0 %	0 %	345428644
124	NC_015964	AACC	2	8	53602	53609	50 %	0 %	0 %	50 %	345428644
125	NC_015964	TACG	2	8	55028	55035	25 %	25 %	25 %	25 %	345428645
126	NC_015964	GCGT	2	8	55367	55374	0 %	25 %	50 %	25 %	345428645
127	NC_015964	AAAT	2	8	55921	55928	75 %	25 %	0 %	0 %	345428646
128	NC_015964	AATT	2	8	55978	55985	50 %	50 %	0 %	0 %	345428646
129	NC_015964	AGTG	2	8	56195	56202	25 %	25 %	50 %	0 %	345428646
130	NC_015964	AACG	2	8	57158	57165	50 %	0 %	25 %	25 %	345428647
131	NC_015964	AGCC	2	8	57761	57768	25 %	0 %	25 %	50 %	345428647
132	NC_015964	TTAA	2	8	57907	57914	50 %	50 %	0 %	0 %	345428647
133	NC_015964	CACT	2	8	58085	58092	25 %	25 %	0 %	50 %	345428648
134	NC_015964	TTTC	2	8	59988	59995	0 %	75 %	0 %	25 %	345428650
135	NC_015964	TGCT	2	8	60205	60212	0 %	50 %	25 %	25 %	345428650
136	NC_015964	CATC	2	8	60267	60274	25 %	25 %	0 %	50 %	345428650
137	NC_015964	AGTA	2	8	61076	61083	50 %	25 %	25 %	0 %	345428651
138	NC_015964	TAAG	2	8	61204	61211	50 %	25 %	25 %	0 %	345428651
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