MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar02

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015959	AGTACG	2	12	590	601	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345133532
2	NC_015959	GTGAGG	2	12	821	832	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	345133532
3	NC_015959	ACCCTC	2	12	850	861	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	345133532
4	NC_015959	GCTCAA	2	12	990	1001	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345133532
5	NC_015959	CGCGAG	2	12	2406	2417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345133533
6	NC_015959	AGGACC	2	12	2850	2861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345133534
7	NC_015959	GCTCGG	2	12	3088	3099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345133535
8	NC_015959	GTGAGA	2	12	7243	7254	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345133542
9	NC_015959	ACGCAC	2	12	8182	8193	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345133542
10	NC_015959	CTGAAT	2	12	8727	8738	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345133542
11	NC_015959	TCGACC	2	12	9475	9486	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345133542
12	NC_015959	TCTCGG	2	12	10125	10136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015959	AGTTCG	2	12	10150	10161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015959	CTACGA	2	12	10726	10737	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345133543
15	NC_015959	CAGCCC	2	12	11294	11305	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015959	ATCCAG	2	12	14200	14211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015959	AACCTC	2	12	15804	15815	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345133550
18	NC_015959	CTCGAC	2	12	16591	16602	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345133552
19	NC_015959	GCTGTC	2	12	18061	18072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015959	GTTGTC	2	12	18369	18380	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345133555
21	NC_015959	TCGGCG	2	12	21238	21249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345133558
22	NC_015959	CAGTCG	2	12	21256	21267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345133558
23	NC_015959	ACATCA	2	12	23193	23204	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345133562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.