MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar02

Total Repeats: 13

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015959	TGCGA	2	10	265	274	20 %	20 %	40 %	20 %	345133532
2	NC_015959	AGGGA	2	10	3539	3548	40 %	0 %	60 %	0 %	345133537
3	NC_015959	GGACG	2	10	5629	5638	20 %	0 %	60 %	20 %	345133541
4	NC_015959	CGGGC	2	10	6878	6887	0 %	0 %	60 %	40 %	345133542
5	NC_015959	GCGAC	2	10	7708	7717	20 %	0 %	40 %	40 %	345133542
6	NC_015959	CGAGG	2	10	9051	9060	20 %	0 %	60 %	20 %	345133542
7	NC_015959	CGGCG	2	10	11989	11998	0 %	0 %	60 %	40 %	345133545
8	NC_015959	GAGCA	2	10	14511	14520	40 %	0 %	40 %	20 %	345133549
9	NC_015959	CCACG	2	10	15669	15678	20 %	0 %	20 %	60 %	345133550
10	NC_015959	CCGGG	2	10	17643	17652	0 %	0 %	60 %	40 %	345133554
11	NC_015959	TTCGC	2	10	19533	19542	0 %	40 %	20 %	40 %	345133556
12	NC_015959	TGCTC	2	10	19608	19617	0 %	40 %	20 %	40 %	345133556
13	NC_015959	GGCGT	2	10	22682	22691	0 %	20 %	60 %	20 %	345133561

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.