MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar02

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015959	GCTC	2	8	1052	1059	0 %	25 %	25 %	50 %	345133532
2	NC_015959	CGAA	2	8	1611	1618	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015959	GCAG	2	8	2004	2011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015959	CCGG	2	8	2397	2404	0 %	0 %	50 %	50 %	345133533
5	NC_015959	GGCG	2	8	2555	2562	0 %	0 %	75 %	25 %	345133533
6	NC_015959	CCGA	2	8	2706	2713	25 %	0 %	25 %	50 %	345133533
7	NC_015959	AGAT	2	8	2784	2791	50 %	25 %	25 %	0 %	345133534
8	NC_015959	GGCG	2	8	3046	3053	0 %	0 %	75 %	25 %	345133535
9	NC_015959	CCCG	2	8	3223	3230	0 %	0 %	25 %	75 %	345133536
10	NC_015959	CTGG	2	8	3485	3492	0 %	25 %	50 %	25 %	345133537
11	NC_015959	GATG	2	8	3575	3582	25 %	25 %	50 %	0 %	345133537
12	NC_015959	AAAT	2	8	3597	3604	75 %	25 %	0 %	0 %	345133537
13	NC_015959	GCCC	2	8	4201	4208	0 %	0 %	25 %	75 %	345133538
14	NC_015959	CCGA	2	8	4384	4391	25 %	0 %	25 %	50 %	345133539
15	NC_015959	CGGT	2	8	4474	4481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015959	CGGT	2	8	5410	5417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015959	GTGC	2	8	5436	5443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015959	GCTG	2	8	5557	5564	0 %	25 %	50 %	25 %	345133541
19	NC_015959	CACG	2	8	5759	5766	25 %	0 %	25 %	50 %	345133542
20	NC_015959	GGTG	2	8	5848	5855	0 %	25 %	75 %	0 %	345133542
21	NC_015959	GGAC	4	16	6020	6035	25 %	0 %	50 %	25 %	345133542
22	NC_015959	GCGA	2	8	7348	7355	25 %	0 %	50 %	25 %	345133542
23	NC_015959	TCGC	2	8	7477	7484	0 %	25 %	25 %	50 %	345133542
24	NC_015959	CGGC	2	8	7609	7616	0 %	0 %	50 %	50 %	345133542
25	NC_015959	CGAC	2	8	8305	8312	25 %	0 %	25 %	50 %	345133542
26	NC_015959	GCGA	2	8	8484	8491	25 %	0 %	50 %	25 %	345133542
27	NC_015959	CGGC	2	8	9416	9423	0 %	0 %	50 %	50 %	345133542
28	NC_015959	GCGA	2	8	9703	9710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015959	AACA	2	8	9940	9947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015959	CCTT	2	8	10165	10172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015959	GCTC	2	8	10556	10563	0 %	25 %	25 %	50 %	345133543
32	NC_015959	GTGG	2	8	10660	10667	0 %	25 %	75 %	0 %	345133543
33	NC_015959	GCGA	2	8	10810	10817	25 %	0 %	50 %	25 %	345133543
34	NC_015959	ACGA	2	8	10910	10917	50 %	0 %	25 %	25 %	345133543
35	NC_015959	GGTC	2	8	12461	12468	0 %	25 %	50 %	25 %	345133545
36	NC_015959	GGAC	2	8	12478	12485	25 %	0 %	50 %	25 %	345133546
37	NC_015959	CGCC	2	8	13166	13173	0 %	0 %	25 %	75 %	345133548
38	NC_015959	GGGC	2	8	13181	13188	0 %	0 %	75 %	25 %	345133548
39	NC_015959	ACGA	2	8	13396	13403	50 %	0 %	25 %	25 %	345133548
40	NC_015959	CGCT	2	8	13472	13479	0 %	25 %	25 %	50 %	345133548
41	NC_015959	GCAA	2	8	13628	13635	50 %	0 %	25 %	25 %	345133548
42	NC_015959	GATC	2	8	13638	13645	25 %	25 %	25 %	25 %	345133548
43	NC_015959	ACGC	2	8	14422	14429	25 %	0 %	25 %	50 %	345133549
44	NC_015959	TCTG	2	8	14472	14479	0 %	50 %	25 %	25 %	345133549
45	NC_015959	GTCG	2	8	14591	14598	0 %	25 %	50 %	25 %	345133549
46	NC_015959	GGTG	2	8	14627	14634	0 %	25 %	75 %	0 %	345133549
47	NC_015959	GAAA	2	8	15180	15187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015959	TCGC	2	8	15491	15498	0 %	25 %	25 %	50 %	345133550
49	NC_015959	CTGA	2	8	16048	16055	25 %	25 %	25 %	25 %	345133551
50	NC_015959	ATCC	2	8	16656	16663	25 %	25 %	0 %	50 %	345133552
51	NC_015959	TCGC	2	8	16813	16820	0 %	25 %	25 %	50 %	345133553
52	NC_015959	CCCT	2	8	16941	16948	0 %	25 %	0 %	75 %	345133553
53	NC_015959	CACG	2	8	17093	17100	25 %	0 %	25 %	50 %	345133553
54	NC_015959	GGCG	2	8	17319	17326	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015959	ACGG	2	8	18042	18049	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015959	CACT	2	8	18106	18113	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015959	TCGG	2	8	18126	18133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015959	CGCC	2	8	18261	18268	0 %	0 %	25 %	75 %	345133555
59	NC_015959	GTAC	2	8	18530	18537	25 %	25 %	25 %	25 %	345133555
60	NC_015959	AGCA	2	8	19310	19317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015959	CTAA	2	8	19324	19331	50 %	25 %	0 %	25 %	345133556
62	NC_015959	GATC	2	8	19713	19720	25 %	25 %	25 %	25 %	345133556
63	NC_015959	GATT	2	8	19831	19838	25 %	50 %	25 %	0 %	345133556
64	NC_015959	TGCC	2	8	20011	20018	0 %	25 %	25 %	50 %	345133556
65	NC_015959	GTTC	2	8	20151	20158	0 %	50 %	25 %	25 %	345133556
66	NC_015959	ATCC	2	8	20869	20876	25 %	25 %	0 %	50 %	345133557
67	NC_015959	ACAG	2	8	20926	20933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015959	GGCG	2	8	21563	21570	0 %	0 %	75 %	25 %	345133559
69	NC_015959	CGAC	2	8	21835	21842	25 %	0 %	25 %	50 %	345133559
70	NC_015959	CGGC	2	8	22203	22210	0 %	0 %	50 %	50 %	345133559
71	NC_015959	GGAC	2	8	22252	22259	25 %	0 %	50 %	25 %	345133560
72	NC_015959	GTTC	2	8	22390	22397	0 %	50 %	25 %	25 %	345133560
73	NC_015959	CCCG	2	8	22615	22622	0 %	0 %	25 %	75 %	345133561
74	NC_015959	GCCC	2	8	22830	22837	0 %	0 %	25 %	75 %	345133561
75	NC_015959	GCTC	2	8	23151	23158	0 %	25 %	25 %	50 %	345133562
76	NC_015959	CGCC	2	8	23457	23464	0 %	0 %	25 %	75 %	345133562
77	NC_015959	GCCG	2	8	23508	23515	0 %	0 %	50 %	50 %	345133562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.