MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar02

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015959	GCTC	2	8	1052	1059	0 %	25 %	25 %	50 %	345133532
2	NC_015959	CCGG	2	8	2397	2404	0 %	0 %	50 %	50 %	345133533
3	NC_015959	GGCG	2	8	2555	2562	0 %	0 %	75 %	25 %	345133533
4	NC_015959	CCGA	2	8	2706	2713	25 %	0 %	25 %	50 %	345133533
5	NC_015959	AGAT	2	8	2784	2791	50 %	25 %	25 %	0 %	345133534
6	NC_015959	GGCG	2	8	3046	3053	0 %	0 %	75 %	25 %	345133535
7	NC_015959	CCCG	2	8	3223	3230	0 %	0 %	25 %	75 %	345133536
8	NC_015959	CTGG	2	8	3485	3492	0 %	25 %	50 %	25 %	345133537
9	NC_015959	GATG	2	8	3575	3582	25 %	25 %	50 %	0 %	345133537
10	NC_015959	AAAT	2	8	3597	3604	75 %	25 %	0 %	0 %	345133537
11	NC_015959	GCCC	2	8	4201	4208	0 %	0 %	25 %	75 %	345133538
12	NC_015959	CCGA	2	8	4384	4391	25 %	0 %	25 %	50 %	345133539
13	NC_015959	GCTG	2	8	5557	5564	0 %	25 %	50 %	25 %	345133541
14	NC_015959	CACG	2	8	5759	5766	25 %	0 %	25 %	50 %	345133542
15	NC_015959	GGTG	2	8	5848	5855	0 %	25 %	75 %	0 %	345133542
16	NC_015959	GGAC	4	16	6020	6035	25 %	0 %	50 %	25 %	345133542
17	NC_015959	GCGA	2	8	7348	7355	25 %	0 %	50 %	25 %	345133542
18	NC_015959	TCGC	2	8	7477	7484	0 %	25 %	25 %	50 %	345133542
19	NC_015959	CGGC	2	8	7609	7616	0 %	0 %	50 %	50 %	345133542
20	NC_015959	CGAC	2	8	8305	8312	25 %	0 %	25 %	50 %	345133542
21	NC_015959	GCGA	2	8	8484	8491	25 %	0 %	50 %	25 %	345133542
22	NC_015959	CGGC	2	8	9416	9423	0 %	0 %	50 %	50 %	345133542
23	NC_015959	GCTC	2	8	10556	10563	0 %	25 %	25 %	50 %	345133543
24	NC_015959	GTGG	2	8	10660	10667	0 %	25 %	75 %	0 %	345133543
25	NC_015959	GCGA	2	8	10810	10817	25 %	0 %	50 %	25 %	345133543
26	NC_015959	ACGA	2	8	10910	10917	50 %	0 %	25 %	25 %	345133543
27	NC_015959	GGTC	2	8	12461	12468	0 %	25 %	50 %	25 %	345133545
28	NC_015959	GGAC	2	8	12478	12485	25 %	0 %	50 %	25 %	345133546
29	NC_015959	CGCC	2	8	13166	13173	0 %	0 %	25 %	75 %	345133548
30	NC_015959	GGGC	2	8	13181	13188	0 %	0 %	75 %	25 %	345133548
31	NC_015959	ACGA	2	8	13396	13403	50 %	0 %	25 %	25 %	345133548
32	NC_015959	CGCT	2	8	13472	13479	0 %	25 %	25 %	50 %	345133548
33	NC_015959	GCAA	2	8	13628	13635	50 %	0 %	25 %	25 %	345133548
34	NC_015959	GATC	2	8	13638	13645	25 %	25 %	25 %	25 %	345133548
35	NC_015959	ACGC	2	8	14422	14429	25 %	0 %	25 %	50 %	345133549
36	NC_015959	TCTG	2	8	14472	14479	0 %	50 %	25 %	25 %	345133549
37	NC_015959	GTCG	2	8	14591	14598	0 %	25 %	50 %	25 %	345133549
38	NC_015959	GGTG	2	8	14627	14634	0 %	25 %	75 %	0 %	345133549
39	NC_015959	TCGC	2	8	15491	15498	0 %	25 %	25 %	50 %	345133550
40	NC_015959	CTGA	2	8	16048	16055	25 %	25 %	25 %	25 %	345133551
41	NC_015959	ATCC	2	8	16656	16663	25 %	25 %	0 %	50 %	345133552
42	NC_015959	TCGC	2	8	16813	16820	0 %	25 %	25 %	50 %	345133553
43	NC_015959	CCCT	2	8	16941	16948	0 %	25 %	0 %	75 %	345133553
44	NC_015959	CACG	2	8	17093	17100	25 %	0 %	25 %	50 %	345133553
45	NC_015959	CGCC	2	8	18261	18268	0 %	0 %	25 %	75 %	345133555
46	NC_015959	GTAC	2	8	18530	18537	25 %	25 %	25 %	25 %	345133555
47	NC_015959	CTAA	2	8	19324	19331	50 %	25 %	0 %	25 %	345133556
48	NC_015959	GATC	2	8	19713	19720	25 %	25 %	25 %	25 %	345133556
49	NC_015959	GATT	2	8	19831	19838	25 %	50 %	25 %	0 %	345133556
50	NC_015959	TGCC	2	8	20011	20018	0 %	25 %	25 %	50 %	345133556
51	NC_015959	GTTC	2	8	20151	20158	0 %	50 %	25 %	25 %	345133556
52	NC_015959	ATCC	2	8	20869	20876	25 %	25 %	0 %	50 %	345133557
53	NC_015959	GGCG	2	8	21563	21570	0 %	0 %	75 %	25 %	345133559
54	NC_015959	CGAC	2	8	21835	21842	25 %	0 %	25 %	50 %	345133559
55	NC_015959	CGGC	2	8	22203	22210	0 %	0 %	50 %	50 %	345133559
56	NC_015959	GGAC	2	8	22252	22259	25 %	0 %	50 %	25 %	345133560
57	NC_015959	GTTC	2	8	22390	22397	0 %	50 %	25 %	25 %	345133560
58	NC_015959	CCCG	2	8	22615	22622	0 %	0 %	25 %	75 %	345133561
59	NC_015959	GCCC	2	8	22830	22837	0 %	0 %	25 %	75 %	345133561
60	NC_015959	GCTC	2	8	23151	23158	0 %	25 %	25 %	50 %	345133562
61	NC_015959	CGCC	2	8	23457	23464	0 %	0 %	25 %	75 %	345133562
62	NC_015959	GCCG	2	8	23508	23515	0 %	0 %	50 %	50 %	345133562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.