MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015958	GGAGAA	2	12	24477	24488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015958	CAATTG	2	12	36165	36176	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015958	TTTTAT	2	12	37676	37687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015958	TTAACA	2	12	54215	54226	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015958	AAGCGA	2	12	68379	68390	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015958	TTTTCC	2	12	84219	84230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015958	AAGCGA	2	12	100549	100560	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015958	TTTTAT	2	12	133862	133873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015958	ATAAAA	2	12	141378	141389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015958	ATTATA	2	12	159541	159552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015958	TAAATG	2	12	168992	169003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015958	GGCCAG	2	12	204266	204277	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015958	TAAAAT	2	12	238404	238415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015958	GAAAAA	2	12	239560	239571	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015958	TTTTAT	2	12	243394	243405	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015958	AAATTA	2	12	243701	243712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015958	ATTTTT	2	12	247910	247921	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015958	AAATTA	2	12	248692	248703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015958	ATTTTT	2	12	302515	302526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015958	TTTTTA	2	12	349536	349547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015958	CATAAT	2	12	351452	351463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015958	GAAGTA	2	12	364621	364632	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015958	AATAGC	2	12	366125	366136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015958	AGAGAA	2	12	366687	366698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015958	AAATTA	2	12	368230	368241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015958	TGATTA	2	12	386517	386528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015958	TTTTAT	2	12	387486	387497	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015958	TGCATT	2	12	407986	407997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015958	TAAATT	2	12	444903	444914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015958	ATTTAT	2	12	458265	458276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015958	AAATTC	2	12	472730	472741	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015958	TAAAAA	2	12	483476	483487	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015958	ATACTT	2	12	489445	489456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015958	TAATTT	2	12	502205	502216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015958	AATTGA	2	12	503040	503051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015958	ATAAAA	2	12	505106	505117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015958	ATAGAG	2	12	512885	512896	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015958	ATTAAT	2	12	515961	515972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015958	TTTAAA	2	12	523007	523018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015958	CATTTA	2	12	566916	566927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015958	ATTTTA	2	12	595928	595939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015958	TAAAAT	2	12	629945	629956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015958	TAAGAA	2	12	678018	678029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015958	AAATAA	2	12	680070	680081	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015958	ATAATC	2	12	680111	680122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015958	ATAAAA	2	12	708217	708228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015958	TAATTT	2	12	723954	723965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015958	ATTTTC	2	12	732319	732330	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015958	AAATTT	2	12	767900	767911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015958	GCCTTT	2	12	767958	767969	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015958	TATTGC	2	12	817687	817698	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015958	TTCTAT	2	12	827215	827226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015958	CATTTT	2	12	829610	829621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015958	CAAAAA	2	12	833580	833591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015958	TGCTGA	2	12	838883	838894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015958	TTTAGT	2	12	839862	839873	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015958	TTATAT	2	12	851858	851869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015958	GGAAAA	2	12	853081	853092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015958	CATTTT	2	12	854104	854115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015958	TAAAAT	2	12	863144	863155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015958	TATTTT	2	12	863952	863963	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015958	TTAAAA	2	12	868248	868259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015958	AACTTA	2	12	893463	893474	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015958	TGAAGT	2	12	934353	934364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015958	AGAATA	2	12	950568	950579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015958	AAGGGG	2	12	951236	951247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015958	TTAAAA	2	12	964175	964186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015958	ATGATA	2	12	964199	964210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015958	AGGCGG	2	12	971130	971141	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015958	CCGCCT	2	12	988013	988024	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015958	TTGACT	2	12	1004673	1004684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015958	AAATTA	2	12	1107805	1107816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015958	TAAGAA	2	12	1115695	1115706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015958	AACCCG	2	12	1142443	1142454	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015958	AAGTAA	2	12	1153889	1153900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015958	AATGTA	2	12	1155773	1155784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015958	TATTTT	2	12	1168765	1168776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015958	CATAGA	2	12	1168907	1168918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015958	AATAAA	2	12	1175097	1175108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015958	TAAAAA	2	12	1204673	1204684	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015958	ATATAG	2	12	1211831	1211842	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015958	TTTTTA	2	12	1230336	1230347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015958	TAAATT	2	12	1279098	1279109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015958	ACTTAT	2	12	1285908	1285919	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015958	TTTTTG	2	12	1291962	1291973	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015958	GTGAAA	2	12	1294562	1294573	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015958	AGTTTA	2	12	1304776	1304787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015958	TAAAAT	2	12	1319983	1319994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015958	ATTTAC	2	12	1448528	1448539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015958	TCGCTT	2	12	1476503	1476514	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015958	AACATC	2	12	1498565	1498576	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015958	GAATTA	2	12	1505636	1505647	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015958	CCTCTT	2	12	1511488	1511499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015958	ATATTA	2	12	1549546	1549557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015958	TTTAAC	2	12	1558168	1558179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015958	CTTTTT	2	12	1565925	1565936	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015958	CTTCAA	2	12	1571458	1571469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015958	TTACAG	2	12	1625173	1625184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015958	TTCGGT	2	12	1634902	1634913	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015958	ATCTTT	2	12	1641144	1641155	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015958	ATTTTA	2	12	1658876	1658887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015958	TAAAAA	2	12	1665557	1665568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015958	TAAAAA	2	12	1684840	1684851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015958	TTTTTG	2	12	1712946	1712957	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015958	TGATTA	2	12	1735868	1735879	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015958	ACTTAT	2	12	1749172	1749183	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015958	TAAAAA	2	12	1769244	1769255	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015958	TATACC	2	12	1788783	1788794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015958	AAAAAT	2	12	1803373	1803384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015958	AAAAAT	2	12	1805521	1805532	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015958	CGCTTG	2	12	1810420	1810431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015958	AATTGC	2	12	1819793	1819804	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015958	AGCTTT	2	12	1840467	1840478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015958	TAGTGA	2	12	1853895	1853906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015958	ATTTTT	2	12	1892515	1892526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015958	TTTTGT	2	12	1893974	1893985	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015958	AAAAGC	2	12	1932507	1932518	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015958	CAATAT	2	12	1942927	1942938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015958	CAAAAC	2	12	1975230	1975241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015958	TAAGAG	2	12	1977779	1977790	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015958	ATTTTA	2	12	1985260	1985271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015958	AACATC	2	12	1985591	1985602	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015958	CATGAA	2	12	1987214	1987225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015958	AAAATA	2	12	1997920	1997931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015958	CAGAAA	2	12	1999801	1999812	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015958	TAAAAT	2	12	2051146	2051157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015958	CCCAGC	2	12	2075912	2075923	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015958	TTATTT	2	12	2076786	2076797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015958	CTTGAG	2	12	2117497	2117508	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.