MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 1006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015958	AGAAAA	2	12	395	406	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	345016448
2	NC_015958	AGAGAT	2	12	2328	2339	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345016449
3	NC_015958	TAGATT	2	12	3776	3787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345016451
4	NC_015958	CAAATA	2	12	9625	9636	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	345016457
5	NC_015958	ACAAGC	2	12	12761	12772	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345016458
6	NC_015958	GAGAAA	2	12	13471	13482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016458
7	NC_015958	TCATGC	2	12	16115	16126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345016461
8	NC_015958	TCTTTG	2	12	31993	32004	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	345016476
9	NC_015958	TGTTTT	2	12	32252	32263	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	345016476
10	NC_015958	TGACAT	2	12	34568	34579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345016477
11	NC_015958	TTTAAT	2	12	40870	40881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016485
12	NC_015958	GTGAGA	2	12	42826	42837	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345016486
13	NC_015958	AATGGC	2	12	43954	43965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345016487
14	NC_015958	AATGGG	2	12	45982	45993	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345016490
15	NC_015958	TTTGGT	2	12	47657	47668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016492
16	NC_015958	TAAAAA	2	12	48241	48252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	345016492
17	NC_015958	TGCAGG	2	12	49754	49765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345016494
18	NC_015958	TAAGAA	2	12	52664	52675	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016495
19	NC_015958	TTTGGT	2	12	56050	56061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016497
20	NC_015958	TAAAAA	2	12	56634	56645	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	345016497
21	NC_015958	AAATAA	2	12	59014	59025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	345016499
22	NC_015958	TTAAAT	2	12	63618	63629	50 %	50 %	0 %	0 %	345016505
23	NC_015958	TGCAAT	2	12	76042	76053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345016513
24	NC_015958	AATAAG	2	12	78731	78742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016515
25	NC_015958	GAAAAA	2	12	79751	79762	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	345016516
26	NC_015958	TAAGTT	2	12	85893	85904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345016522
27	NC_015958	CTTCAA	2	12	86739	86750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016523
28	NC_015958	ATTACA	2	12	89726	89737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	345016525
29	NC_015958	CCTACT	2	12	93724	93735	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345016525
30	NC_015958	TTCAAT	2	12	103414	103425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	345016531
31	NC_015958	AAAATA	2	12	114613	114624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	345016547
32	NC_015958	GAGTTT	2	12	114813	114824	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	345016547
33	NC_015958	TTCCTA	2	12	116700	116711	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	345016550
34	NC_015958	CAAATC	2	12	118944	118955	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345016552
35	NC_015958	CCTCTT	2	12	120002	120013	0 %	50 %	0 %	50 %	345016553
36	NC_015958	TAAATT	2	12	121392	121403	50 %	50 %	0 %	0 %	345016554
37	NC_015958	TTGAAT	2	12	125892	125903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345016560
38	NC_015958	GATAGA	2	12	129880	129891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345016563
39	NC_015958	GTACAT	2	12	131225	131236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345016564
40	NC_015958	AAACTG	2	12	133237	133248	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	345016566
41	NC_015958	ATAAAA	2	12	133835	133846	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	345016566
42	NC_015958	ATCTTT	2	12	135933	135944	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	345016569
43	NC_015958	TTTTGG	2	12	141026	141037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016574
44	NC_015958	GTTAGA	2	12	145983	145994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016579
45	NC_015958	GTAAAA	2	12	146061	146072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016579
46	NC_015958	AGTGTT	2	12	146252	146263	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	345016579
47	NC_015958	TGAAAG	2	12	146800	146811	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345016581
48	NC_015958	TTTTAG	2	12	152464	152475	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	345016587
49	NC_015958	TAGCTA	2	12	153445	153456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345016588
50	NC_015958	TATTTT	2	12	157017	157028	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	345016592
51	NC_015958	CAGAGA	2	12	157752	157763	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345016593
52	NC_015958	GCAGGA	2	12	158701	158712	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345016594
53	NC_015958	AATTGC	2	12	160069	160080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345016595
54	NC_015958	CAGGAC	2	12	162359	162370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016597
55	NC_015958	CAGTGG	2	12	162701	162712	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345016598
56	NC_015958	CTTGTA	2	12	165028	165039	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	345016601
57	NC_015958	AATATG	2	12	166726	166737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	345016603
58	NC_015958	AAGTGG	2	12	166882	166893	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345016603
59	NC_015958	TGAGAA	2	12	167552	167563	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345016604
60	NC_015958	TAAAAG	2	12	167566	167577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016604
61	NC_015958	AAAAAG	2	12	170810	170821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	345016605
62	NC_015958	ATATTG	2	12	176430	176441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345016610
63	NC_015958	GGATGC	2	12	177472	177483	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345016610
64	NC_015958	TGTCTT	2	12	182208	182219	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	345016611
65	NC_015958	GTTGCA	2	12	184383	184394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345016612
66	NC_015958	TGTAAA	2	12	199234	199245	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	345016627
67	NC_015958	CCATTC	2	12	202366	202377	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345016629
68	NC_015958	ACCAGA	2	12	204640	204651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345016630
69	NC_015958	TTGTAA	2	12	205299	205310	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345016630
70	NC_015958	GTAATG	2	12	207874	207885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016633
71	NC_015958	TATTCC	2	12	209518	209529	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	345016634
72	NC_015958	GAACAA	2	12	210237	210248	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	345016635
73	NC_015958	GGAGTA	2	12	211050	211061	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345016637
74	NC_015958	TAAATT	2	12	211472	211483	50 %	50 %	0 %	0 %	345016637
75	NC_015958	TGTAGC	2	12	214199	214210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345016640
76	NC_015958	TGTTTT	2	12	219686	219697	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	345016644
77	NC_015958	AACCTA	2	12	229061	229072	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345016652
78	NC_015958	TTATTG	2	12	229136	229147	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	345016653
79	NC_015958	TGGAAT	2	12	231644	231655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016655
80	NC_015958	AGTAAG	2	12	233570	233581	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345016656
81	NC_015958	TGGAAT	2	12	241832	241843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016661
82	NC_015958	TAAAGA	2	12	245334	245345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016663
83	NC_015958	TTCCTT	2	12	249698	249709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016667
84	NC_015958	ATGGTA	2	12	251284	251295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016668
85	NC_015958	TTTACA	2	12	251573	251584	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	345016669
86	NC_015958	TACTTC	2	12	254286	254297	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	345016671
87	NC_015958	CTATTT	2	12	254825	254836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	345016671
88	NC_015958	TCAATA	2	12	257721	257732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	345016674
89	NC_015958	ATTCAT	2	12	258763	258774	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	345016676
90	NC_015958	AAAGAT	2	12	259406	259417	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016677
91	NC_015958	TTGCTG	2	12	265669	265680	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345016685
92	NC_015958	TGCAGA	2	12	267019	267030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345016686
93	NC_015958	TCAGGT	2	12	268083	268094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345016687
94	NC_015958	TAGCAA	2	12	268414	268425	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	345016687
95	NC_015958	TGCAAA	2	12	277996	278007	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	345016693
96	NC_015958	ATAAAA	2	12	279773	279784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	345016694
97	NC_015958	GAAAAT	2	12	280765	280776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016694
98	NC_015958	TTAGAT	2	12	281356	281367	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345016694
99	NC_015958	TTTAGA	2	12	285408	285419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345016696
100	NC_015958	TTCTTT	2	12	288888	288899	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	345016699
101	NC_015958	GAAGTA	2	12	290073	290084	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345016701
102	NC_015958	GTTTAT	2	12	297001	297012	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	345016707
103	NC_015958	ATGTAG	2	12	302307	302318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016713
104	NC_015958	ATATAA	2	12	303544	303555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016714
105	NC_015958	ACCAAA	2	12	304214	304225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016714
106	NC_015958	AAAATT	2	12	310579	310590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016719
107	NC_015958	GACCAA	2	12	310705	310716	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345016719
108	NC_015958	TCTACA	2	12	317260	317271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016724
109	NC_015958	CAATTT	2	12	318912	318923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	345016726
110	NC_015958	TTTCTA	2	12	319533	319544	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	345016726
111	NC_015958	ATAGCA	2	12	325788	325799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	345016731
112	NC_015958	AATAGA	2	12	330133	330144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016735
113	NC_015958	TAAAGA	2	12	331146	331157	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016736
114	NC_015958	TTTTAA	2	12	331382	331393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016737
115	NC_015958	AAATAA	2	12	332011	332022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	345016737
116	NC_015958	TACTGC	2	12	332656	332667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345016738
117	NC_015958	CCAAAG	2	12	337595	337606	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345016743
118	NC_015958	GACTTG	2	12	338043	338054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345016743
119	NC_015958	AAGTAA	2	12	339574	339585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	345016745
120	NC_015958	AAAATA	2	12	340839	340850	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	345016746
121	NC_015958	TACTTC	2	12	350571	350582	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	345016753
122	NC_015958	CTATTT	2	12	351110	351121	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	345016753
123	NC_015958	GCAATT	2	12	352360	352371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345016754
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458	NC_015958	GGAATT	2	12	1273720	1273731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345017609
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461	NC_015958	CATGTT	2	12	1277920	1277931	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	345017615
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463	NC_015958	TTTAAA	2	12	1280866	1280877	50 %	50 %	0 %	0 %	345017618
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