MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 1762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015958	TACGT	2	10	639	648	20 %	40 %	20 %	20 %	345016448
2	NC_015958	GTCAA	2	10	1799	1808	40 %	20 %	20 %	20 %	345016449
3	NC_015958	AATAA	2	10	3328	3337	80 %	20 %	0 %	0 %	345016451
4	NC_015958	GAAAG	2	10	4536	4545	60 %	0 %	40 %	0 %	345016453
5	NC_015958	TGTGA	2	10	5181	5190	20 %	40 %	40 %	0 %	345016453
6	NC_015958	TTTTG	2	10	5702	5711	0 %	80 %	20 %	0 %	345016453
7	NC_015958	AATTG	2	10	6647	6656	40 %	40 %	20 %	0 %	345016453
8	NC_015958	TATAG	2	10	8261	8270	40 %	40 %	20 %	0 %	345016455
9	NC_015958	ATGAA	2	10	11554	11563	60 %	20 %	20 %	0 %	345016458
10	NC_015958	CTATG	2	10	11657	11666	20 %	40 %	20 %	20 %	345016458
11	NC_015958	GGAAT	2	10	12397	12406	40 %	20 %	40 %	0 %	345016458
12	NC_015958	GCTAT	2	10	13504	13513	20 %	40 %	20 %	20 %	345016458
13	NC_015958	ATGAA	2	10	16717	16726	60 %	20 %	20 %	0 %	345016461
14	NC_015958	TTGAA	2	10	18057	18066	40 %	40 %	20 %	0 %	345016462
15	NC_015958	CCTTG	2	10	19309	19318	0 %	40 %	20 %	40 %	345016463
16	NC_015958	TTTGC	2	10	22915	22924	0 %	60 %	20 %	20 %	345016467
17	NC_015958	ACAGG	2	10	23004	23013	40 %	0 %	40 %	20 %	345016467
18	NC_015958	ATAGA	2	10	25610	25619	60 %	20 %	20 %	0 %	345016468
19	NC_015958	GATAG	2	10	26334	26343	40 %	20 %	40 %	0 %	345016470
20	NC_015958	CAAAA	2	10	27473	27482	80 %	0 %	0 %	20 %	345016470
21	NC_015958	AAATA	2	10	28046	28055	80 %	20 %	0 %	0 %	345016471
22	NC_015958	TTATT	2	10	28070	28079	20 %	80 %	0 %	0 %	345016472
23	NC_015958	AAAGC	2	10	29007	29016	60 %	0 %	20 %	20 %	345016472
24	NC_015958	TTCGC	2	10	29291	29300	0 %	40 %	20 %	40 %	345016473
25	NC_015958	TGAAA	2	10	30575	30584	60 %	20 %	20 %	0 %	345016475
26	NC_015958	AAAAG	2	10	33381	33390	80 %	0 %	20 %	0 %	345016477
27	NC_015958	TATGA	2	10	34428	34437	40 %	40 %	20 %	0 %	345016477
28	NC_015958	ATGGT	2	10	40617	40626	20 %	40 %	40 %	0 %	345016485
29	NC_015958	AATAT	2	10	41675	41684	60 %	40 %	0 %	0 %	345016485
30	NC_015958	TCTAA	2	10	43907	43916	40 %	40 %	0 %	20 %	345016487
31	NC_015958	CAAAT	2	10	45198	45207	60 %	20 %	0 %	20 %	345016489
32	NC_015958	ATTGT	2	10	48312	48321	20 %	60 %	20 %	0 %	345016492
33	NC_015958	TTTGG	2	10	49428	49437	0 %	60 %	40 %	0 %	345016493
34	NC_015958	GATGG	2	10	51910	51919	20 %	20 %	60 %	0 %	345016495
35	NC_015958	ATTGT	2	10	56705	56714	20 %	60 %	20 %	0 %	345016497
36	NC_015958	AAAAG	2	10	62043	62052	80 %	0 %	20 %	0 %	345016502
37	NC_015958	TTTAC	2	10	62723	62732	20 %	60 %	0 %	20 %	345016503
38	NC_015958	TTGAT	2	10	63435	63444	20 %	60 %	20 %	0 %	345016504
39	NC_015958	ACAAG	2	10	64020	64029	60 %	0 %	20 %	20 %	345016505
40	NC_015958	ATTCT	2	10	64309	64318	20 %	60 %	0 %	20 %	345016505
41	NC_015958	TAATG	2	10	77111	77120	40 %	40 %	20 %	0 %	345016515
42	NC_015958	AAATT	2	10	77335	77344	60 %	40 %	0 %	0 %	345016515
43	NC_015958	TTTTG	2	10	77386	77395	0 %	80 %	20 %	0 %	345016515
44	NC_015958	GAATA	2	10	78616	78625	60 %	20 %	20 %	0 %	345016515
45	NC_015958	AAAAG	2	10	86189	86198	80 %	0 %	20 %	0 %	345016523
46	NC_015958	CTTTA	2	10	86981	86990	20 %	60 %	0 %	20 %	345016524
47	NC_015958	CTTTT	2	10	89405	89414	0 %	80 %	0 %	20 %	345016525
48	NC_015958	AAGTT	2	10	90332	90341	40 %	40 %	20 %	0 %	345016525
49	NC_015958	GAAGA	2	10	91781	91790	60 %	0 %	40 %	0 %	345016525
50	NC_015958	TTAAT	2	10	93935	93944	40 %	60 %	0 %	0 %	345016525
51	NC_015958	AAGAG	2	10	94647	94656	60 %	0 %	40 %	0 %	345016525
52	NC_015958	GAGAA	2	10	95562	95571	60 %	0 %	40 %	0 %	345016526
53	NC_015958	ATTAA	2	10	104715	104724	60 %	40 %	0 %	0 %	345016533
54	NC_015958	AATAC	2	10	106169	106178	60 %	20 %	0 %	20 %	345016535
55	NC_015958	AAAGA	2	10	107031	107040	80 %	0 %	20 %	0 %	345016537
56	NC_015958	AAAAT	2	10	107056	107065	80 %	20 %	0 %	0 %	345016537
57	NC_015958	GATTT	2	10	107788	107797	20 %	60 %	20 %	0 %	345016537
58	NC_015958	AGTTA	2	10	113050	113059	40 %	40 %	20 %	0 %	345016544
59	NC_015958	AAAAT	2	10	114181	114190	80 %	20 %	0 %	0 %	345016547
60	NC_015958	ATTTT	2	10	115444	115453	20 %	80 %	0 %	0 %	345016548
61	NC_015958	AGAGC	2	10	115745	115754	40 %	0 %	40 %	20 %	345016548
62	NC_015958	AAAAG	2	10	117199	117208	80 %	0 %	20 %	0 %	345016550
63	NC_015958	TGTTT	2	10	117507	117516	0 %	80 %	20 %	0 %	345016551
64	NC_015958	AAAAC	2	10	118610	118619	80 %	0 %	0 %	20 %	345016552
65	NC_015958	GATAA	2	10	118680	118689	60 %	20 %	20 %	0 %	345016552
66	NC_015958	ATTTC	2	10	119302	119311	20 %	60 %	0 %	20 %	345016552
67	NC_015958	ATTTA	2	10	119955	119964	40 %	60 %	0 %	0 %	345016553
68	NC_015958	ATTTC	2	10	120077	120086	20 %	60 %	0 %	20 %	345016553
69	NC_015958	ATGCA	2	10	123461	123470	40 %	20 %	20 %	20 %	345016556
70	NC_015958	AAATA	2	10	125188	125197	80 %	20 %	0 %	0 %	345016559
71	NC_015958	AAAAG	2	10	126133	126142	80 %	0 %	20 %	0 %	345016560
72	NC_015958	GTACT	2	10	128298	128307	20 %	40 %	20 %	20 %	345016562
73	NC_015958	GTTTG	2	10	129381	129390	0 %	60 %	40 %	0 %	345016562
74	NC_015958	AAGAA	2	10	131006	131015	80 %	0 %	20 %	0 %	345016564
75	NC_015958	AAAGC	2	10	132351	132360	60 %	0 %	20 %	20 %	345016565
76	NC_015958	AGGAG	2	10	132606	132615	40 %	0 %	60 %	0 %	345016565
77	NC_015958	ATATT	2	10	134669	134678	40 %	60 %	0 %	0 %	345016568
78	NC_015958	TTATT	2	10	135245	135254	20 %	80 %	0 %	0 %	345016568
79	NC_015958	ATTTA	2	10	136038	136047	40 %	60 %	0 %	0 %	345016569
80	NC_015958	CTCTT	2	10	136128	136137	0 %	60 %	0 %	40 %	345016569
81	NC_015958	TATAA	2	10	137416	137425	60 %	40 %	0 %	0 %	345016571
82	NC_015958	TTTGC	2	10	138946	138955	0 %	60 %	20 %	20 %	345016572
83	NC_015958	AAAAT	2	10	139418	139427	80 %	20 %	0 %	0 %	345016573
84	NC_015958	ATTAT	2	10	139964	139973	40 %	60 %	0 %	0 %	345016574
85	NC_015958	AAGAA	2	10	141261	141270	80 %	0 %	20 %	0 %	345016574
86	NC_015958	TTTGG	2	10	145546	145555	0 %	60 %	40 %	0 %	345016579
87	NC_015958	AGAGG	2	10	146118	146127	40 %	0 %	60 %	0 %	345016579
88	NC_015958	CTTTT	2	10	148700	148709	0 %	80 %	0 %	20 %	345016583
89	NC_015958	AATAG	2	10	148729	148738	60 %	20 %	20 %	0 %	345016583
90	NC_015958	CTTCA	2	10	150398	150407	20 %	40 %	0 %	40 %	345016585
91	NC_015958	AAGAA	2	10	150843	150852	80 %	0 %	20 %	0 %	345016585
92	NC_015958	TAAGA	2	10	150945	150954	60 %	20 %	20 %	0 %	345016585
93	NC_015958	GTGTA	2	10	151619	151628	20 %	40 %	40 %	0 %	345016586
94	NC_015958	GTGAA	2	10	152081	152090	40 %	20 %	40 %	0 %	345016586
95	NC_015958	AAGAA	2	10	155444	155453	80 %	0 %	20 %	0 %	345016589
96	NC_015958	ATTTA	2	10	155872	155881	40 %	60 %	0 %	0 %	345016590
97	NC_015958	TAGCG	2	10	156621	156630	20 %	20 %	40 %	20 %	345016592
98	NC_015958	AATAA	2	10	157336	157345	80 %	20 %	0 %	0 %	345016592
99	NC_015958	GGATA	2	10	157576	157585	40 %	20 %	40 %	0 %	345016593
100	NC_015958	GAAAT	2	10	158043	158052	60 %	20 %	20 %	0 %	345016593
101	NC_015958	TTATT	2	10	160318	160327	20 %	80 %	0 %	0 %	345016595
102	NC_015958	GAACA	2	10	165725	165734	60 %	0 %	20 %	20 %	345016601
103	NC_015958	AGGAA	2	10	171174	171183	60 %	0 %	40 %	0 %	345016606
104	NC_015958	CATTA	2	10	180223	180232	40 %	40 %	0 %	20 %	345016610
105	NC_015958	ATGAC	2	10	180513	180522	40 %	20 %	20 %	20 %	345016610
106	NC_015958	TACGG	2	10	180890	180899	20 %	20 %	40 %	20 %	345016611
107	NC_015958	TAACA	2	10	181879	181888	60 %	20 %	0 %	20 %	345016611
108	NC_015958	TCAGT	2	10	184565	184574	20 %	40 %	20 %	20 %	345016612
109	NC_015958	CAAAA	2	10	187179	187188	80 %	0 %	0 %	20 %	345016613
110	NC_015958	TTTAA	2	10	187818	187827	40 %	60 %	0 %	0 %	345016613
111	NC_015958	TAAAA	2	10	189286	189295	80 %	20 %	0 %	0 %	345016615
112	NC_015958	AATCA	2	10	191180	191189	60 %	20 %	0 %	20 %	345016617
113	NC_015958	TTAAT	2	10	194160	194169	40 %	60 %	0 %	0 %	345016621
114	NC_015958	CTTTT	2	10	194235	194244	0 %	80 %	0 %	20 %	345016621
115	NC_015958	TGATT	2	10	197543	197552	20 %	60 %	20 %	0 %	345016626
116	NC_015958	TTAAA	2	10	197628	197637	60 %	40 %	0 %	0 %	345016626
117	NC_015958	ACCTT	2	10	197965	197974	20 %	40 %	0 %	40 %	345016627
118	NC_015958	TAACA	2	10	199249	199258	60 %	20 %	0 %	20 %	345016627
119	NC_015958	TGGCA	2	10	199645	199654	20 %	20 %	40 %	20 %	345016627
120	NC_015958	AAGAG	2	10	202228	202237	60 %	0 %	40 %	0 %	345016629
121	NC_015958	ATTGA	2	10	207577	207586	40 %	40 %	20 %	0 %	345016633
122	NC_015958	CGTTA	2	10	208588	208597	20 %	40 %	20 %	20 %	345016634
123	NC_015958	CCCAA	2	10	208739	208748	40 %	0 %	0 %	60 %	345016634
124	NC_015958	TATTG	2	10	209062	209071	20 %	60 %	20 %	0 %	345016634
125	NC_015958	AAAAT	2	10	209568	209577	80 %	20 %	0 %	0 %	345016634
126	NC_015958	ACTAT	2	10	210088	210097	40 %	40 %	0 %	20 %	345016635
127	NC_015958	GATAT	2	10	211312	211321	40 %	40 %	20 %	0 %	345016637
128	NC_015958	GATAT	2	10	211333	211342	40 %	40 %	20 %	0 %	345016637
129	NC_015958	AATTA	2	10	212457	212466	60 %	40 %	0 %	0 %	345016639
130	NC_015958	ATTAG	2	10	212752	212761	40 %	40 %	20 %	0 %	345016639
131	NC_015958	ACTAT	2	10	216201	216210	40 %	40 %	0 %	20 %	345016642
132	NC_015958	ACAAT	2	10	216795	216804	60 %	20 %	0 %	20 %	345016642
133	NC_015958	AAAGA	2	10	219082	219091	80 %	0 %	20 %	0 %	345016644
134	NC_015958	GAATA	2	10	220983	220992	60 %	20 %	20 %	0 %	345016644
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