MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 7140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015958	AACT	2	8	31	38	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015958	TTTA	3	12	542	553	25 %	75 %	0 %	0 %	345016448
3	NC_015958	ATGC	2	8	585	592	25 %	25 %	25 %	25 %	345016448
4	NC_015958	AGTT	2	8	667	674	25 %	50 %	25 %	0 %	345016448
5	NC_015958	GAAC	2	8	771	778	50 %	0 %	25 %	25 %	345016448
6	NC_015958	AAAG	2	8	962	969	75 %	0 %	25 %	0 %	345016448
7	NC_015958	GAAG	2	8	2404	2411	50 %	0 %	50 %	0 %	345016449
8	NC_015958	ATTT	2	8	2906	2913	25 %	75 %	0 %	0 %	345016450
9	NC_015958	AATA	2	8	3102	3109	75 %	25 %	0 %	0 %	345016451
10	NC_015958	AGAA	2	8	3997	4004	75 %	0 %	25 %	0 %	345016451
11	NC_015958	TTAT	3	12	4324	4335	25 %	75 %	0 %	0 %	345016452
12	NC_015958	GTAA	2	8	4494	4501	50 %	25 %	25 %	0 %	345016453
13	NC_015958	ATAA	2	8	4623	4630	75 %	25 %	0 %	0 %	345016453
14	NC_015958	TAAT	2	8	4672	4679	50 %	50 %	0 %	0 %	345016453
15	NC_015958	AGGA	2	8	5063	5070	50 %	0 %	50 %	0 %	345016453
16	NC_015958	ATGA	2	8	5532	5539	50 %	25 %	25 %	0 %	345016453
17	NC_015958	CTTA	2	8	6037	6044	25 %	50 %	0 %	25 %	345016453
18	NC_015958	CTTC	2	8	6186	6193	0 %	50 %	0 %	50 %	345016453
19	NC_015958	TTTA	2	8	6211	6218	25 %	75 %	0 %	0 %	345016453
20	NC_015958	GAAG	2	8	6504	6511	50 %	0 %	50 %	0 %	345016453
21	NC_015958	GAGC	2	8	6859	6866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015958	CCAG	2	8	7364	7371	25 %	0 %	25 %	50 %	345016454
23	NC_015958	CTTC	2	8	8113	8120	0 %	50 %	0 %	50 %	345016455
24	NC_015958	AATT	2	8	8925	8932	50 %	50 %	0 %	0 %	345016455
25	NC_015958	TGCA	2	8	10357	10364	25 %	25 %	25 %	25 %	345016457
26	NC_015958	TAAG	2	8	11045	11052	50 %	25 %	25 %	0 %	345016457
27	NC_015958	AATG	2	8	11313	11320	50 %	25 %	25 %	0 %	345016457
28	NC_015958	GAAA	2	8	12885	12892	75 %	0 %	25 %	0 %	345016458
29	NC_015958	ACAA	2	8	13182	13189	75 %	0 %	0 %	25 %	345016458
30	NC_015958	GAAA	2	8	14450	14457	75 %	0 %	25 %	0 %	345016459
31	NC_015958	TACA	2	8	14894	14901	50 %	25 %	0 %	25 %	345016459
32	NC_015958	GTTA	2	8	15783	15790	25 %	50 %	25 %	0 %	345016460
33	NC_015958	AAAG	2	8	16188	16195	75 %	0 %	25 %	0 %	345016461
34	NC_015958	AGCA	2	8	16282	16289	50 %	0 %	25 %	25 %	345016461
35	NC_015958	AAAG	2	8	16299	16306	75 %	0 %	25 %	0 %	345016461
36	NC_015958	GCAC	2	8	18537	18544	25 %	0 %	25 %	50 %	345016463
37	NC_015958	ATTT	2	8	20390	20397	25 %	75 %	0 %	0 %	345016465
38	NC_015958	AAAG	2	8	20518	20525	75 %	0 %	25 %	0 %	345016465
39	NC_015958	TAAG	2	8	20592	20599	50 %	25 %	25 %	0 %	345016465
40	NC_015958	ATGT	2	8	20627	20634	25 %	50 %	25 %	0 %	345016465
41	NC_015958	TAAA	2	8	20934	20941	75 %	25 %	0 %	0 %	345016465
42	NC_015958	AAAG	2	8	22594	22601	75 %	0 %	25 %	0 %	345016466
43	NC_015958	CTAT	2	8	22804	22811	25 %	50 %	0 %	25 %	345016467
44	NC_015958	AGGC	2	8	23133	23140	25 %	0 %	50 %	25 %	345016467
45	NC_015958	GCAT	2	8	23479	23486	25 %	25 %	25 %	25 %	345016467
46	NC_015958	CATT	2	8	23710	23717	25 %	50 %	0 %	25 %	345016467
47	NC_015958	TTTC	2	8	23743	23750	0 %	75 %	0 %	25 %	345016467
48	NC_015958	GAAT	2	8	24034	24041	50 %	25 %	25 %	0 %	345016467
49	NC_015958	GGAA	2	8	24218	24225	50 %	0 %	50 %	0 %	345016467
50	NC_015958	TAAT	2	8	25157	25164	50 %	50 %	0 %	0 %	345016468
51	NC_015958	AGAA	2	8	25321	25328	75 %	0 %	25 %	0 %	345016468
52	NC_015958	ATTG	2	8	25434	25441	25 %	50 %	25 %	0 %	345016468
53	NC_015958	AGCA	2	8	25867	25874	50 %	0 %	25 %	25 %	345016469
54	NC_015958	TGGG	2	8	25941	25948	0 %	25 %	75 %	0 %	345016469
55	NC_015958	GAAA	2	8	26269	26276	75 %	0 %	25 %	0 %	345016469
56	NC_015958	AGGA	2	8	27166	27173	50 %	0 %	50 %	0 %	345016470
57	NC_015958	AGGA	2	8	27196	27203	50 %	0 %	50 %	0 %	345016470
58	NC_015958	GAAA	2	8	27626	27633	75 %	0 %	25 %	0 %	345016471
59	NC_015958	ATTG	2	8	28718	28725	25 %	50 %	25 %	0 %	345016472
60	NC_015958	TTTG	2	8	29496	29503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015958	AAAT	2	8	29687	29694	75 %	25 %	0 %	0 %	345016474
62	NC_015958	GTAT	2	8	29997	30004	25 %	50 %	25 %	0 %	345016474
63	NC_015958	CTTA	2	8	30273	30280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015958	ATAG	2	8	30435	30442	50 %	25 %	25 %	0 %	345016475
65	NC_015958	CAAG	2	8	31431	31438	50 %	0 %	25 %	25 %	345016475
66	NC_015958	AAAT	2	8	31623	31630	75 %	25 %	0 %	0 %	345016475
67	NC_015958	TGAC	2	8	32488	32495	25 %	25 %	25 %	25 %	345016476
68	NC_015958	GTAT	2	8	32919	32926	25 %	50 %	25 %	0 %	345016476
69	NC_015958	TATT	2	8	32945	32952	25 %	75 %	0 %	0 %	345016476
70	NC_015958	TAAT	2	8	33372	33379	50 %	50 %	0 %	0 %	345016477
71	NC_015958	ACAA	2	8	33620	33627	75 %	0 %	0 %	25 %	345016477
72	NC_015958	CAGA	2	8	33972	33979	50 %	0 %	25 %	25 %	345016477
73	NC_015958	ATTT	2	8	33987	33994	25 %	75 %	0 %	0 %	345016477
74	NC_015958	TAGA	2	8	34406	34413	50 %	25 %	25 %	0 %	345016477
75	NC_015958	TGAC	2	8	35416	35423	25 %	25 %	25 %	25 %	345016477
76	NC_015958	TAAA	2	8	35923	35930	75 %	25 %	0 %	0 %	345016477
77	NC_015958	TAAA	2	8	36118	36125	75 %	25 %	0 %	0 %	345016477
78	NC_015958	CTCC	2	8	36276	36283	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_015958	ATAG	2	8	36404	36411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015958	TCTA	2	8	36469	36476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015958	AAGT	2	8	36564	36571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015958	ATTT	2	8	37502	37509	25 %	75 %	0 %	0 %	345016478
83	NC_015958	TTAT	2	8	37935	37942	25 %	75 %	0 %	0 %	345016479
84	NC_015958	TATT	2	8	38586	38593	25 %	75 %	0 %	0 %	345016480
85	NC_015958	AATC	2	8	38727	38734	50 %	25 %	0 %	25 %	345016481
86	NC_015958	TTGT	2	8	38775	38782	0 %	75 %	25 %	0 %	345016481
87	NC_015958	ATTT	2	8	39020	39027	25 %	75 %	0 %	0 %	345016482
88	NC_015958	TATT	2	8	39146	39153	25 %	75 %	0 %	0 %	345016482
89	NC_015958	TATT	2	8	39471	39478	25 %	75 %	0 %	0 %	345016483
90	NC_015958	ACTT	2	8	40051	40058	25 %	50 %	0 %	25 %	345016484
91	NC_015958	TAAA	2	8	40129	40136	75 %	25 %	0 %	0 %	345016484
92	NC_015958	AGAT	2	8	40708	40715	50 %	25 %	25 %	0 %	345016485
93	NC_015958	TTAA	2	8	41156	41163	50 %	50 %	0 %	0 %	345016485
94	NC_015958	TATT	2	8	43032	43039	25 %	75 %	0 %	0 %	345016486
95	NC_015958	ACCA	2	8	43447	43454	50 %	0 %	0 %	50 %	345016486
96	NC_015958	ATAG	2	8	43494	43501	50 %	25 %	25 %	0 %	345016486
97	NC_015958	TTAT	2	8	43608	43615	25 %	75 %	0 %	0 %	345016486
98	NC_015958	TTAT	2	8	43691	43698	25 %	75 %	0 %	0 %	345016487
99	NC_015958	CAGG	2	8	44114	44121	25 %	0 %	50 %	25 %	345016487
100	NC_015958	ATTT	2	8	44337	44344	25 %	75 %	0 %	0 %	345016487
101	NC_015958	GCAG	2	8	44446	44453	25 %	0 %	50 %	25 %	345016487
102	NC_015958	GAGG	2	8	44992	44999	25 %	0 %	75 %	0 %	345016488
103	NC_015958	AAAG	2	8	45140	45147	75 %	0 %	25 %	0 %	345016489
104	NC_015958	ATTT	2	8	46821	46828	25 %	75 %	0 %	0 %	345016491
105	NC_015958	AACT	2	8	47086	47093	50 %	25 %	0 %	25 %	345016491
106	NC_015958	CATT	2	8	47596	47603	25 %	50 %	0 %	25 %	345016492
107	NC_015958	AAAT	2	8	47707	47714	75 %	25 %	0 %	0 %	345016492
108	NC_015958	GCCT	2	8	48505	48512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015958	TCCA	2	8	48737	48744	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015958	TGAG	2	8	48840	48847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015958	CAAG	2	8	49132	49139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015958	AGGA	2	8	49152	49159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015958	TTGG	2	8	49801	49808	0 %	50 %	50 %	0 %	345016494
114	NC_015958	TTAT	2	8	49817	49824	25 %	75 %	0 %	0 %	345016494
115	NC_015958	TCTT	2	8	50300	50307	0 %	75 %	0 %	25 %	345016494
116	NC_015958	TTAA	2	8	51165	51172	50 %	50 %	0 %	0 %	345016494
117	NC_015958	ATGA	2	8	51206	51213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015958	TGCG	2	8	51253	51260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015958	GAAG	2	8	51359	51366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015958	GATG	2	8	51421	51428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015958	AAGG	2	8	51639	51646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015958	AGAC	2	8	52071	52078	50 %	0 %	25 %	25 %	345016495
123	NC_015958	TAAA	2	8	52106	52113	75 %	25 %	0 %	0 %	345016495
124	NC_015958	CATA	2	8	52196	52203	50 %	25 %	0 %	25 %	345016495
125	NC_015958	TAGA	2	8	52604	52611	50 %	25 %	25 %	0 %	345016495
126	NC_015958	AAAT	2	8	53019	53026	75 %	25 %	0 %	0 %	345016495
127	NC_015958	GTAC	2	8	53110	53117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015958	TACC	2	8	53422	53429	25 %	25 %	0 %	50 %	345016496
129	NC_015958	AAGG	3	12	53676	53687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015958	TTGT	2	8	53983	53990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015958	GCTC	2	8	54661	54668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015958	TCAA	2	8	55042	55049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015958	CATT	2	8	55989	55996	25 %	50 %	0 %	25 %	345016497
134	NC_015958	AAAT	2	8	56100	56107	75 %	25 %	0 %	0 %	345016497
135	NC_015958	TAAA	2	8	56723	56730	75 %	25 %	0 %	0 %	345016497
136	NC_015958	GCAT	2	8	56823	56830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015958	TCAA	2	8	56962	56969	50 %	25 %	0 %	25 %	345016498
138	NC_015958	ATGT	2	8	57066	57073	25 %	50 %	25 %	0 %	345016498
139	NC_015958	TAAG	2	8	57655	57662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015958	GGAA	2	8	57717	57724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015958	CTTA	2	8	57877	57884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015958	AAAT	2	8	57906	57913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015958	GAAA	2	8	58401	58408	75 %	0 %	25 %	0 %	345016499
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