MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 39315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015958	TTA	2	6	23	28	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015958	ATA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015958	TAT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015958	AGG	2	6	101	106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015958	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016448
6	NC_015958	CCA	2	6	178	183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016448
7	NC_015958	ACA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016448
8	NC_015958	TGA	2	6	227	232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016448
9	NC_015958	TAT	2	6	235	240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016448
10	NC_015958	TAA	2	6	274	279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016448
11	NC_015958	ACG	2	6	304	309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016448
12	NC_015958	AGA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
13	NC_015958	GAA	3	9	363	371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
14	NC_015958	CCA	2	6	418	423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016448
15	NC_015958	TGC	2	6	494	499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016448
16	NC_015958	GGA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016448
17	NC_015958	GAA	2	6	699	704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
18	NC_015958	GAT	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016448
19	NC_015958	AAG	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
20	NC_015958	ACC	2	6	851	856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016448
21	NC_015958	AGA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
22	NC_015958	CCA	2	6	927	932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016448
23	NC_015958	CGA	2	6	995	1000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016448
24	NC_015958	TAA	2	6	1060	1065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016448
25	NC_015958	TAA	2	6	1145	1150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016448
26	NC_015958	AAG	3	9	1180	1188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
27	NC_015958	AGA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
28	NC_015958	GAA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016448
29	NC_015958	TAC	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016448
30	NC_015958	TAA	2	6	1505	1510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015958	AAT	2	6	1516	1521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015958	TAC	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015958	ACT	2	6	1608	1613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015958	TTA	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015958	ATT	2	6	1707	1712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016449
36	NC_015958	ACT	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016449
37	NC_015958	TTC	2	6	1766	1771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016449
38	NC_015958	AGA	3	9	1863	1871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016449
39	NC_015958	TAA	2	6	2090	2095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016449
40	NC_015958	AGA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016449
41	NC_015958	AGA	2	6	2313	2318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016449
42	NC_015958	AAT	2	6	2524	2529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016449
43	NC_015958	TTA	2	6	2558	2563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016449
44	NC_015958	TCT	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016449
45	NC_015958	TTA	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016449
46	NC_015958	TAA	3	9	2729	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016449
47	NC_015958	GGA	2	6	2889	2894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016450
48	NC_015958	TTA	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016451
49	NC_015958	TAA	2	6	3209	3214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
50	NC_015958	ATT	2	6	3227	3232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016451
51	NC_015958	AAT	2	6	3246	3251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
52	NC_015958	ATA	2	6	3400	3405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
53	NC_015958	AAG	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016451
54	NC_015958	TAA	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
55	NC_015958	AAG	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016451
56	NC_015958	TGA	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016451
57	NC_015958	TAG	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016451
58	NC_015958	AAT	2	6	3600	3605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016451
59	NC_015958	CAG	2	6	3680	3685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016451
60	NC_015958	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016451
61	NC_015958	ACA	2	6	3799	3804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016451
62	NC_015958	ATT	2	6	3835	3840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016451
63	NC_015958	TTC	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016451
64	NC_015958	GAT	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016451
65	NC_015958	TAC	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016451
66	NC_015958	GGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345016452
67	NC_015958	GTA	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016452
68	NC_015958	CTA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016452
69	NC_015958	GAA	3	9	4245	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016452
70	NC_015958	TAT	2	6	4322	4327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016452
71	NC_015958	AAG	2	6	4361	4366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016452
72	NC_015958	TTG	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016453
73	NC_015958	AAG	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
74	NC_015958	ATT	2	6	4479	4484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016453
75	NC_015958	TGA	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016453
76	NC_015958	GGA	2	6	4692	4697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016453
77	NC_015958	AGA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
78	NC_015958	ACA	2	6	4921	4926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016453
79	NC_015958	ATT	2	6	4969	4974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016453
80	NC_015958	GGC	2	6	4989	4994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345016453
81	NC_015958	ACT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016453
82	NC_015958	CAA	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016453
83	NC_015958	AGT	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016453
84	NC_015958	AAG	3	9	5455	5463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
85	NC_015958	TGG	2	6	5472	5477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016453
86	NC_015958	ATG	2	6	5503	5508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016453
87	NC_015958	CAG	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016453
88	NC_015958	ATA	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016453
89	NC_015958	TGC	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016453
90	NC_015958	ACA	2	6	5764	5769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016453
91	NC_015958	TCT	2	6	5786	5791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016453
92	NC_015958	ATG	3	9	5793	5801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016453
93	NC_015958	GGA	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016453
94	NC_015958	GAA	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
95	NC_015958	AGA	2	6	5990	5995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
96	NC_015958	TAT	2	6	6083	6088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016453
97	NC_015958	AGG	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016453
98	NC_015958	CAG	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016453
99	NC_015958	AAG	2	6	6369	6374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
100	NC_015958	GAA	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016453
101	NC_015958	GAT	2	6	6435	6440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016453
102	NC_015958	GAC	2	6	6591	6596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016453
103	NC_015958	CAA	2	6	6931	6936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015958	TTG	2	6	6997	7002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016454
105	NC_015958	CTA	2	6	7032	7037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016454
106	NC_015958	GTA	2	6	7098	7103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016454
107	NC_015958	TCT	2	6	7160	7165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016454
108	NC_015958	ATT	2	6	7168	7173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016454
109	NC_015958	ATT	2	6	7184	7189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016454
110	NC_015958	TCC	2	6	7402	7407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345016454
111	NC_015958	ATC	2	6	7477	7482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016454
112	NC_015958	CTC	2	6	7512	7517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345016454
113	NC_015958	TTC	2	6	7546	7551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016454
114	NC_015958	TAA	2	6	7651	7656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016454
115	NC_015958	CCT	2	6	7697	7702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345016455
116	NC_015958	CAT	2	6	7724	7729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016455
117	NC_015958	AAG	2	6	7733	7738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016455
118	NC_015958	TTC	3	9	7764	7772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016455
119	NC_015958	TAT	2	6	7815	7820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016455
120	NC_015958	TCT	2	6	7870	7875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016455
121	NC_015958	TTA	2	6	8011	8016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016455
122	NC_015958	TAT	2	6	8073	8078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016455
123	NC_015958	CAA	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016455
124	NC_015958	CAG	2	6	8183	8188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016455
125	NC_015958	GCT	2	6	8194	8199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016455
126	NC_015958	AGA	2	6	8436	8441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016455
127	NC_015958	TGT	2	6	8459	8464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016455
128	NC_015958	TCA	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016455
129	NC_015958	TGT	2	6	8595	8600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016455
130	NC_015958	TTA	2	6	8645	8650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016455
131	NC_015958	CTA	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016455
132	NC_015958	TCT	2	6	8671	8676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016455
133	NC_015958	TGC	2	6	8747	8752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016455
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257	NC_015958	AGG	2	6	17029	17034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015958	GCT	2	6	17192	17197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016462
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262	NC_015958	TGA	2	6	17446	17451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016462
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293	NC_015958	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016465
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330	NC_015958	TAG	2	6	23809	23814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016467
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334	NC_015958	ACA	2	6	24234	24239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016467
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362	NC_015958	GAC	2	6	26161	26166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016469
363	NC_015958	AGG	2	6	26314	26319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
364	NC_015958	ATT	2	6	26379	26384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016470
365	NC_015958	GCA	2	6	26430	26435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016470
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369	NC_015958	TGG	2	6	26723	26728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016470
370	NC_015958	AGC	2	6	26756	26761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016470
371	NC_015958	CTG	2	6	26794	26799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016470
372	NC_015958	GAT	2	6	26823	26828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016470
373	NC_015958	CAA	2	6	26965	26970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016470
374	NC_015958	GAA	2	6	27000	27005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016470
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376	NC_015958	ATT	2	6	27451	27456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016470
377	NC_015958	GAA	2	6	27562	27567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
378	NC_015958	TAA	2	6	27833	27838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016471
379	NC_015958	GAG	2	6	27839	27844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016471
380	NC_015958	AGG	2	6	28084	28089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016472
381	NC_015958	AAT	2	6	28090	28095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016472
382	NC_015958	TAC	3	9	28120	28128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016472
383	NC_015958	ACC	2	6	28262	28267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016472
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