MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 9120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015957	CGGCG	2	10	745	754	0 %	0 %	60 %	40 %	345007965
2	NC_015957	CGGGC	2	10	762	771	0 %	0 %	60 %	40 %	345007965
3	NC_015957	CGGGC	2	10	783	792	0 %	0 %	60 %	40 %	345007965
4	NC_015957	CGGGC	2	10	822	831	0 %	0 %	60 %	40 %	345007965
5	NC_015957	TGTGC	2	10	7015	7024	0 %	40 %	40 %	20 %	345007970
6	NC_015957	CCGCG	2	10	7981	7990	0 %	0 %	40 %	60 %	345007970
7	NC_015957	CGGGC	2	10	13370	13379	0 %	0 %	60 %	40 %	345007974
8	NC_015957	CCGGC	2	10	13600	13609	0 %	0 %	40 %	60 %	345007974
9	NC_015957	CGCGG	2	10	13798	13807	0 %	0 %	60 %	40 %	345007974
10	NC_015957	GCCGT	2	10	15499	15508	0 %	20 %	40 %	40 %	345007975
11	NC_015957	CGCGG	2	10	17615	17624	0 %	0 %	60 %	40 %	345007977
12	NC_015957	CCGGA	2	10	17907	17916	20 %	0 %	40 %	40 %	345007977
13	NC_015957	CGGTG	2	10	18434	18443	0 %	20 %	60 %	20 %	345007977
14	NC_015957	CGGCG	2	10	20713	20722	0 %	0 %	60 %	40 %	345007980
15	NC_015957	TGACG	2	10	23724	23733	20 %	20 %	40 %	20 %	345007984
16	NC_015957	GACCG	2	10	24409	24418	20 %	0 %	40 %	40 %	345007985
17	NC_015957	GGCCG	2	10	25067	25076	0 %	0 %	60 %	40 %	345007986
18	NC_015957	GCCCG	2	10	25133	25142	0 %	0 %	40 %	60 %	345007986
19	NC_015957	GCCGG	2	10	25801	25810	0 %	0 %	60 %	40 %	345007986
20	NC_015957	GGCCG	2	10	26578	26587	0 %	0 %	60 %	40 %	345007987
21	NC_015957	TGCCC	2	10	26883	26892	0 %	20 %	20 %	60 %	345007988
22	NC_015957	CAGAT	2	10	32929	32938	40 %	20 %	20 %	20 %	345007991
23	NC_015957	CCCGG	2	10	32946	32955	0 %	0 %	40 %	60 %	345007991
24	NC_015957	GCGCC	3	15	33943	33957	0 %	0 %	40 %	60 %	345007992
25	NC_015957	ATGTG	2	10	39818	39827	20 %	40 %	40 %	0 %	345007998
26	NC_015957	GGCCG	2	10	41983	41992	0 %	0 %	60 %	40 %	345008000
27	NC_015957	CGGCG	2	10	42524	42533	0 %	0 %	60 %	40 %	345008001
28	NC_015957	CCGGC	2	10	42730	42739	0 %	0 %	40 %	60 %	345008001
29	NC_015957	GCCCC	2	10	42980	42989	0 %	0 %	20 %	80 %	345008002
30	NC_015957	GGCGG	2	10	45061	45070	0 %	0 %	80 %	20 %	345008005
31	NC_015957	CGGCG	2	10	45325	45334	0 %	0 %	60 %	40 %	345008005
32	NC_015957	GCGCC	2	10	45544	45553	0 %	0 %	40 %	60 %	345008005
33	NC_015957	GGGCT	2	10	46438	46447	0 %	20 %	60 %	20 %	345008006
34	NC_015957	CGCGG	2	10	46941	46950	0 %	0 %	60 %	40 %	345008006
35	NC_015957	GGGCC	2	10	46953	46962	0 %	0 %	60 %	40 %	345008006
36	NC_015957	TGCGC	2	10	50486	50495	0 %	20 %	40 %	40 %	345008009
37	NC_015957	ACCGC	2	10	51056	51065	20 %	0 %	20 %	60 %	345008009
38	NC_015957	GCCCG	2	10	52529	52538	0 %	0 %	40 %	60 %	345008011
39	NC_015957	CGTGC	2	10	55281	55290	0 %	20 %	40 %	40 %	345008014
40	NC_015957	GCTCC	2	10	55394	55403	0 %	20 %	20 %	60 %	345008014
41	NC_015957	GGTGG	2	10	56514	56523	0 %	20 %	80 %	0 %	345008015
42	NC_015957	GCCCG	2	10	57150	57159	0 %	0 %	40 %	60 %	345008015
43	NC_015957	CCGAC	2	10	57480	57489	20 %	0 %	20 %	60 %	345008016
44	NC_015957	CCCCG	2	10	57685	57694	0 %	0 %	20 %	80 %	345008016
45	NC_015957	GCCGC	2	10	57890	57899	0 %	0 %	40 %	60 %	345008016
46	NC_015957	CCACC	2	10	58558	58567	20 %	0 %	0 %	80 %	345008016
47	NC_015957	CCCGC	2	10	58743	58752	0 %	0 %	20 %	80 %	345008016
48	NC_015957	GCCCG	2	10	58858	58867	0 %	0 %	40 %	60 %	345008016
49	NC_015957	CGGCC	2	10	58963	58972	0 %	0 %	40 %	60 %	345008016
50	NC_015957	GCGAC	2	10	59864	59873	20 %	0 %	40 %	40 %	345008017
51	NC_015957	GGGCG	2	10	61078	61087	0 %	0 %	80 %	20 %	345008018
52	NC_015957	GCGGT	2	10	67348	67357	0 %	20 %	60 %	20 %	345008023
53	NC_015957	CCGCG	2	10	68166	68175	0 %	0 %	40 %	60 %	345008024
54	NC_015957	GCCGC	2	10	68860	68869	0 %	0 %	40 %	60 %	345008025
55	NC_015957	CGACC	2	10	68989	68998	20 %	0 %	20 %	60 %	345008025
56	NC_015957	GGCTC	2	10	73728	73737	0 %	20 %	40 %	40 %	345008029
57	NC_015957	GCCCG	2	10	74372	74381	0 %	0 %	40 %	60 %	345008029
58	NC_015957	GCGCC	2	10	75116	75125	0 %	0 %	40 %	60 %	345008030
59	NC_015957	GGCCC	2	10	77943	77952	0 %	0 %	40 %	60 %	345008032
60	NC_015957	GACCG	2	10	79230	79239	20 %	0 %	40 %	40 %	345008033
61	NC_015957	CCGTC	2	10	80133	80142	0 %	20 %	20 %	60 %	345008034
62	NC_015957	CGGCG	2	10	80175	80184	0 %	0 %	60 %	40 %	345008034
63	NC_015957	GCGAG	2	10	80756	80765	20 %	0 %	60 %	20 %	345008034
64	NC_015957	TGCCG	2	10	82993	83002	0 %	20 %	40 %	40 %	345008036
65	NC_015957	GCCCG	2	10	84494	84503	0 %	0 %	40 %	60 %	345008037
66	NC_015957	CGGGC	2	10	86795	86804	0 %	0 %	60 %	40 %	345008039
67	NC_015957	GCAGG	2	10	87609	87618	20 %	0 %	60 %	20 %	345008040
68	NC_015957	CCACG	2	10	88805	88814	20 %	0 %	20 %	60 %	345008041
69	NC_015957	GTCCG	2	10	92853	92862	0 %	20 %	40 %	40 %	345008043
70	NC_015957	GGCGT	2	10	92926	92935	0 %	20 %	60 %	20 %	345008043
71	NC_015957	TCCGG	2	10	92982	92991	0 %	20 %	40 %	40 %	345008043
72	NC_015957	GATCC	2	10	94279	94288	20 %	20 %	20 %	40 %	345008044
73	NC_015957	CCAGC	2	10	94626	94635	20 %	0 %	20 %	60 %	345008045
74	NC_015957	CCTGC	2	10	94818	94827	0 %	20 %	20 %	60 %	345008045
75	NC_015957	GGCCG	2	10	95120	95129	0 %	0 %	60 %	40 %	345008045
76	NC_015957	GGCCG	2	10	95667	95676	0 %	0 %	60 %	40 %	345008046
77	NC_015957	GGAGG	2	10	96280	96289	20 %	0 %	80 %	0 %	345008046
78	NC_015957	GCTCC	2	10	98397	98406	0 %	20 %	20 %	60 %	345008047
79	NC_015957	CCCGG	2	10	101322	101331	0 %	0 %	40 %	60 %	345008049
80	NC_015957	TGGGC	2	10	105025	105034	0 %	20 %	60 %	20 %	345008051
81	NC_015957	TCGGC	2	10	105406	105415	0 %	20 %	40 %	40 %	345008051
82	NC_015957	CGGTG	2	10	106035	106044	0 %	20 %	60 %	20 %	345008052
83	NC_015957	CCGGC	2	10	106601	106610	0 %	0 %	40 %	60 %	345008052
84	NC_015957	ACTCC	2	10	106925	106934	20 %	20 %	0 %	60 %	345008052
85	NC_015957	CGAGC	2	10	107355	107364	20 %	0 %	40 %	40 %	345008052
86	NC_015957	CGGCG	2	10	108370	108379	0 %	0 %	60 %	40 %	345008053
87	NC_015957	CGGCG	2	10	108676	108685	0 %	0 %	60 %	40 %	345008053
88	NC_015957	GCGCT	2	10	109685	109694	0 %	20 %	40 %	40 %	345008054
89	NC_015957	CGCCC	2	10	110479	110488	0 %	0 %	20 %	80 %	345008055
90	NC_015957	CTGGC	2	10	110832	110841	0 %	20 %	40 %	40 %	345008055
91	NC_015957	CGGGG	2	10	111293	111302	0 %	0 %	80 %	20 %	345008055
92	NC_015957	CTGGG	2	10	112602	112611	0 %	20 %	60 %	20 %	345008056
93	NC_015957	TCACC	2	10	113506	113515	20 %	20 %	0 %	60 %	345008057
94	NC_015957	TCGGC	2	10	114073	114082	0 %	20 %	40 %	40 %	345008057
95	NC_015957	TCCGG	2	10	114122	114131	0 %	20 %	40 %	40 %	345008057
96	NC_015957	CGGCG	2	10	115222	115231	0 %	0 %	60 %	40 %	345008059
97	NC_015957	ATCGG	2	10	115467	115476	20 %	20 %	40 %	20 %	345008059
98	NC_015957	CCGGC	2	10	116329	116338	0 %	0 %	40 %	60 %	345008059
99	NC_015957	GGCCG	2	10	117160	117169	0 %	0 %	60 %	40 %	345008059
100	NC_015957	CGCCA	2	10	117581	117590	20 %	0 %	20 %	60 %	345008059
101	NC_015957	GCCGT	2	10	118163	118172	0 %	20 %	40 %	40 %	345008060
102	NC_015957	ACCAC	2	10	118623	118632	40 %	0 %	0 %	60 %	345008060
103	NC_015957	ACCCC	2	10	120217	120226	20 %	0 %	0 %	80 %	345008062
104	NC_015957	GGCCG	2	10	121632	121641	0 %	0 %	60 %	40 %	345008064
105	NC_015957	CCGGT	2	10	122397	122406	0 %	20 %	40 %	40 %	345008064
106	NC_015957	CCCGG	2	10	122444	122453	0 %	0 %	40 %	60 %	345008065
107	NC_015957	GCGCC	2	10	123682	123691	0 %	0 %	40 %	60 %	345008068
108	NC_015957	TCGCT	2	10	124351	124360	0 %	40 %	20 %	40 %	345008068
109	NC_015957	CTGAC	2	10	125538	125547	20 %	20 %	20 %	40 %	345008070
110	NC_015957	GCCCT	2	10	126981	126990	0 %	20 %	20 %	60 %	345008073
111	NC_015957	TCCGC	2	10	127899	127908	0 %	20 %	20 %	60 %	345008074
112	NC_015957	CGACC	2	10	128841	128850	20 %	0 %	20 %	60 %	345008075
113	NC_015957	CGACC	2	10	129444	129453	20 %	0 %	20 %	60 %	345008076
114	NC_015957	CGGCT	2	10	130275	130284	0 %	20 %	40 %	40 %	345008077
115	NC_015957	CCGCG	2	10	131117	131126	0 %	0 %	40 %	60 %	345008078
116	NC_015957	CGGCG	2	10	132727	132736	0 %	0 %	60 %	40 %	345008080
117	NC_015957	CGACG	2	10	133181	133190	20 %	0 %	40 %	40 %	345008081
118	NC_015957	ACGGC	2	10	133293	133302	20 %	0 %	40 %	40 %	345008081
119	NC_015957	CACCG	2	10	138051	138060	20 %	0 %	20 %	60 %	345008086
120	NC_015957	CCGCC	2	10	139434	139443	0 %	0 %	20 %	80 %	345008088
121	NC_015957	CGGGG	2	10	140066	140075	0 %	0 %	80 %	20 %	345008088
122	NC_015957	TGGCG	2	10	140973	140982	0 %	20 %	60 %	20 %	345008089
123	NC_015957	CGGGC	2	10	141345	141354	0 %	0 %	60 %	40 %	345008089
124	NC_015957	GGCAC	2	10	142240	142249	20 %	0 %	40 %	40 %	345008090
125	NC_015957	ACGCG	2	10	142361	142370	20 %	0 %	40 %	40 %	345008090
126	NC_015957	GCCAT	2	10	142681	142690	20 %	20 %	20 %	40 %	345008090
127	NC_015957	CGGTG	2	10	143711	143720	0 %	20 %	60 %	20 %	345008091
128	NC_015957	GGGCG	2	10	145661	145670	0 %	0 %	80 %	20 %	345008093
129	NC_015957	GCTGG	2	10	145838	145847	0 %	20 %	60 %	20 %	345008093
130	NC_015957	GCACC	2	10	146132	146141	20 %	0 %	20 %	60 %	345008093
131	NC_015957	CCGGC	2	10	148023	148032	0 %	0 %	40 %	60 %	345008096
132	NC_015957	CTGGC	2	10	148286	148295	0 %	20 %	40 %	40 %	345008096
133	NC_015957	CGGGG	2	10	152356	152365	0 %	0 %	80 %	20 %	345008101
134	NC_015957	GCTTC	2	10	152861	152870	0 %	40 %	20 %	40 %	345008101
135	NC_015957	CGGGC	2	10	157878	157887	0 %	0 %	60 %	40 %	345008106
136	NC_015957	CCCCG	2	10	158015	158024	0 %	0 %	20 %	80 %	345008106
137	NC_015957	GAGTC	2	10	158132	158141	20 %	20 %	40 %	20 %	345008106
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143	NC_015957	GCCCG	2	10	165659	165668	0 %	0 %	40 %	60 %	345008114
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150	NC_015957	GCAGC	2	10	178379	178388	20 %	0 %	40 %	40 %	345008128
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156	NC_015957	ATCCG	2	10	185689	185698	20 %	20 %	20 %	40 %	345008133
157	NC_015957	CTGGA	2	10	186597	186606	20 %	20 %	40 %	20 %	345008134
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252	NC_015957	GGCGC	2	10	283856	283865	0 %	0 %	60 %	40 %	345008218
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254	NC_015957	CCGAG	2	10	284904	284913	20 %	0 %	40 %	40 %	345008218
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258	NC_015957	CCCCG	2	10	294645	294654	0 %	0 %	20 %	80 %	345008225
259	NC_015957	GCGCC	2	10	294995	295004	0 %	0 %	40 %	60 %	345008225
260	NC_015957	TCCGG	2	10	295092	295101	0 %	20 %	40 %	40 %	345008225
261	NC_015957	CGAGC	2	10	295211	295220	20 %	0 %	40 %	40 %	345008225
262	NC_015957	GCCGG	2	10	296205	296214	0 %	0 %	60 %	40 %	345008226
263	NC_015957	GCGCG	2	10	296975	296984	0 %	0 %	60 %	40 %	345008226
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