MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	AAATGA	2	12	1137	1148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015955	GCAGAA	2	12	9646	9657	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345006837
3	NC_015955	TGACCT	2	12	14779	14790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006840
4	NC_015955	CGATTC	2	12	16963	16974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006841
5	NC_015955	ATCGAA	2	12	20288	20299	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	345006842
6	NC_015955	TTTGAA	2	12	22295	22306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345006844
7	NC_015955	AGAGAT	2	12	22321	22332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345006844
8	NC_015955	GAAGAT	2	12	27415	27426	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345006845
9	NC_015955	TACCAC	2	12	27590	27601	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345006845
10	NC_015955	CAGACT	2	12	28894	28905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345006846
11	NC_015955	GCTGTC	2	12	36232	36243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015955	GTTGTC	2	12	36540	36551	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345006853
13	NC_015955	CACGAA	2	12	38974	38985	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345006856
14	NC_015955	TGTTGC	2	12	39071	39082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345006856
15	NC_015955	CATACC	2	12	39492	39503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015955	CACCGA	2	12	39834	39845	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345006859
17	NC_015955	AACATC	2	12	41372	41383	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345006860
18	NC_015955	CGGTCT	2	12	43280	43291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006862
19	NC_015955	CGTGGA	2	12	44110	44121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345006863
20	NC_015955	TCGACG	2	12	47490	47501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345006865
21	NC_015955	AGCCGA	2	12	47641	47652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
22	NC_015955	TCGTCC	2	12	48501	48512	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345006865
23	NC_015955	CGTTCT	2	12	48915	48926	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	345006865
24	NC_015955	CGGAAC	2	12	49655	49666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
25	NC_015955	AGCGCT	2	12	54058	54069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345006868
26	NC_015955	TGACGA	2	12	54225	54236	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345006868
27	NC_015955	ACCAGA	2	12	57980	57991	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015955	AGTACG	2	12	59294	59305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345006870
29	NC_015955	GACGTC	2	12	61305	61316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345006874
30	NC_015955	TCGACG	2	12	61701	61712	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345006875
31	NC_015955	CGAAGC	2	12	70399	70410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006887
32	NC_015955	TGATTG	2	12	73931	73942	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	345006891
33	NC_015955	ATCCGT	2	12	76216	76227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006894
34	NC_015955	GGACGA	2	12	76976	76987	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345006895
35	NC_015955	CCCAGT	2	12	79403	79414	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345006896
36	NC_015955	GCTGTC	2	12	80312	80323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015955	GTTGTC	2	12	80620	80631	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345006897
38	NC_015955	ACTGGA	2	12	83016	83027	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345006898
39	NC_015955	GAGAAG	2	12	84935	84946	50 %	0 %	50 %	0 %	345006898
40	NC_015955	ATTCGG	2	12	88196	88207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345006899
41	NC_015955	GCTGTC	2	12	91923	91934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015955	GTTGTC	2	12	92231	92242	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015955	TCAAGA	2	12	93290	93301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	345006903
44	NC_015955	GCGTAT	2	12	95921	95932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345006905
45	NC_015955	ACGTCG	2	12	96370	96381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345006905
46	NC_015955	GTCATC	2	12	96462	96473	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006905
47	NC_015955	TGAACG	2	12	98790	98801	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015955	CAGAAG	2	12	99514	99525	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015955	GCTGTC	2	12	100500	100511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015955	CGTTGT	2	12	100807	100818	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345006907
51	NC_015955	TACTGA	2	12	101785	101796	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345006908
52	NC_015955	GTCAAT	2	12	104291	104302	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345006910
53	NC_015955	GATACG	2	12	110880	110891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345006916
54	NC_015955	TCAGTA	2	12	111134	111145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015955	GCTGTC	2	12	111250	111261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015955	GTTGTC	2	12	111558	111569	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345006917
57	NC_015955	GACGGC	2	12	115368	115379	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345006922
58	NC_015955	GAGTAC	2	12	121833	121844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345006929
59	NC_015955	CGTTCA	2	12	123537	123548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006930
60	NC_015955	CTCACA	2	12	124500	124511	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345006931
61	NC_015955	GAAACA	2	12	125673	125684	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	345006931
62	NC_015955	GTAGCG	2	12	128935	128946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345006936
63	NC_015955	ACTCGT	2	12	129744	129755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006936
64	NC_015955	CATTCT	2	12	130197	130208	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	345006936
65	NC_015955	GGAGTT	2	12	133998	134009	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	345006939
66	NC_015955	TCGTCA	2	12	135653	135664	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006939
67	NC_015955	TCCTCA	2	12	136930	136941	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345006941
68	NC_015955	CGCCAT	2	12	138786	138797	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345006942
69	NC_015955	GTCTGA	2	12	144184	144195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015955	CGACAA	2	12	145582	145593	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345006946
71	NC_015955	TCAACC	2	12	151176	151187	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345006950
72	NC_015955	GTTCGT	2	12	153595	153606	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345006952
73	NC_015955	ATATGA	2	12	156614	156625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	345006955
74	NC_015955	GTTTCA	2	12	161065	161076	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015955	CGTACT	2	12	161746	161757	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006961
76	NC_015955	CTTCGA	2	12	170328	170339	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006965
77	NC_015955	CCCGAA	2	12	171168	171179	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345006967
78	NC_015955	CGGGAT	2	12	171669	171680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345006967
79	NC_015955	GAACTC	2	12	172350	172361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345006967
80	NC_015955	GCGTCC	2	12	172533	172544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345006968
81	NC_015955	ACTCGT	2	12	173008	173019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006968
82	NC_015955	CGGCGA	2	12	186126	186137	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345006976
83	NC_015955	CGTCGG	2	12	186267	186278	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345006976
84	NC_015955	TCGTCA	2	12	188867	188878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006982
85	NC_015955	AGTTTC	2	12	189579	189590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015955	GTCACA	2	12	189662	189673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015955	CGAGAC	2	12	189774	189785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006983
88	NC_015955	CGACAA	2	12	193214	193225	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345006989
89	NC_015955	CGACGC	2	12	193960	193971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015955	GCACAG	2	12	197682	197693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006994
91	NC_015955	ACGGAG	2	12	199693	199704	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345006998
92	NC_015955	TTCCCA	2	12	207968	207979	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345007005
93	NC_015955	CAGTCG	2	12	210346	210357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007008
94	NC_015955	ATCGGT	2	12	212299	212310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007010
95	NC_015955	CGACAA	2	12	215746	215757	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007014
96	NC_015955	TGGAAC	2	12	217862	217873	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015955	TAGTGG	2	12	218110	218121	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015955	GGACGA	2	12	219946	219957	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007015
99	NC_015955	GAAGAG	2	12	221301	221312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015955	GCGTTC	2	12	222925	222936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007016
101	NC_015955	ATTCGG	2	12	224860	224871	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007016
102	NC_015955	CGGATG	2	12	230894	230905	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007020
103	NC_015955	GGTTCG	2	12	231161	231172	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345007020
104	NC_015955	GCTGTC	2	12	233917	233928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015955	GTTGTC	2	12	234225	234236	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007024
106	NC_015955	GGTCCT	2	12	235405	235416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015955	GTCGAG	2	12	236959	236970	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007027
108	NC_015955	GAGGTT	2	12	237746	237757	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	345007029
109	NC_015955	GCTGTC	2	12	237888	237899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015955	GTTGTC	2	12	238196	238207	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007030
111	NC_015955	ACACGC	2	12	240757	240768	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345007032
112	NC_015955	TCGGAA	2	12	242428	242439	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007032
113	NC_015955	CTCGAC	2	12	248853	248864	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007036
114	NC_015955	CCGAGT	2	12	251234	251245	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007038
115	NC_015955	TCGACG	2	12	255353	255364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007040
116	NC_015955	CTACAA	2	12	257396	257407	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345007041
117	NC_015955	GACGCC	2	12	261040	261051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007043
118	NC_015955	GCTCCA	2	12	263082	263093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007044
119	NC_015955	CAACCA	2	12	264026	264037	50 %	0 %	0 %	50 %	345007044
120	NC_015955	CCTTCA	2	12	265052	265063	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345007044
121	NC_015955	TCGATA	2	12	268737	268748	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345007046
122	NC_015955	GCAACG	2	12	273146	273157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007052
123	NC_015955	TGGAGA	2	12	279050	279061	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345007056
124	NC_015955	CGAAGC	2	12	279408	279419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007056
125	NC_015955	TCGACG	2	12	280563	280574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007057
126	NC_015955	ATCGTC	2	12	280742	280753	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007057
127	NC_015955	TACGAG	2	12	281492	281503	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007057
128	NC_015955	ACGCGA	2	12	283204	283215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007058
129	NC_015955	TCCGAG	2	12	283718	283729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007058
130	NC_015955	CGACGT	2	12	283774	283785	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007058
131	NC_015955	CGACGC	2	12	285408	285419	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007060
132	NC_015955	CATCGA	2	12	285831	285842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007062
133	NC_015955	GGACGA	2	12	292566	292577	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007071
134	NC_015955	CAGTTC	2	12	293548	293559	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007072
135	NC_015955	CGACAA	2	12	298132	298143	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007076
136	NC_015955	TGCACA	2	12	306433	306444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007082
137	NC_015955	ACCACG	2	12	311131	311142	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345007086
138	NC_015955	ATGGAG	2	12	311382	311393	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345007086
139	NC_015955	TCGAGA	2	12	311662	311673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007086
140	NC_015955	CTACTT	2	12	312250	312261	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015955	CCGCGG	2	12	313722	313733	0 %	0 %	50 %	50 %	345007088
142	NC_015955	ATCGAA	2	12	316024	316035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_015955	TCTCGA	2	12	321021	321032	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007094
144	NC_015955	TGCGGG	2	12	324790	324801	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345007098
145	NC_015955	GACGCG	2	12	328233	328244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007101
146	NC_015955	GCCCGA	2	12	329014	329025	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007101
147	NC_015955	CGAACT	2	12	333277	333288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007105
148	NC_015955	CGAAAG	2	12	335104	335115	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345007107
149	NC_015955	AGCGAA	2	12	336001	336012	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345007107
150	NC_015955	TAAGAT	2	12	336619	336630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015955	GAAAGT	2	12	338152	338163	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345007108
152	NC_015955	CAGAAA	2	12	339558	339569	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	345007110
153	NC_015955	TGAGTC	2	12	339940	339951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007110
154	NC_015955	TCGGAG	2	12	341443	341454	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007111
155	NC_015955	GCGAAG	2	12	347969	347980	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007116
156	NC_015955	CGACAA	2	12	354582	354593	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007126
157	NC_015955	CGACAA	2	12	357021	357032	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007129
158	NC_015955	ACTCAA	2	12	360105	360116	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015955	CGTCGC	2	12	362391	362402	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345007137
160	NC_015955	GCTGTC	2	12	365351	365362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_015955	GTTGTC	2	12	365659	365670	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007141
162	NC_015955	GCTGTC	2	12	366911	366922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_015955	GTTGTC	2	12	367219	367230	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007142
164	NC_015955	GCTGTC	2	12	370570	370581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015955	GTTGTC	2	12	370878	370889	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007145
166	NC_015955	TCCGCA	2	12	372962	372973	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007148
167	NC_015955	GTAGCG	2	12	375475	375486	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007152
168	NC_015955	CTGGTA	2	12	379516	379527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007157
169	NC_015955	GACGAG	2	12	380434	380445	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007158
170	NC_015955	GAGGTC	2	12	384333	384344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007159
171	NC_015955	CCTTCA	2	12	386031	386042	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345007160
172	NC_015955	GGGTCG	2	12	386281	386292	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345007160
173	NC_015955	CCAGAG	2	12	387339	387350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007160
174	NC_015955	GGCTCG	2	12	389138	389149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_015955	TCATCT	2	12	390155	390166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_015955	CGACAA	2	12	392699	392710	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007162
177	NC_015955	GATGAG	2	12	401207	401218	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345007171
178	NC_015955	CAGGAT	2	12	401258	401269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007171
179	NC_015955	CCGATC	2	12	401544	401555	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007171
180	NC_015955	GACGAG	2	12	402374	402385	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007173
181	NC_015955	GACCGG	2	12	405927	405938	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007176
182	NC_015955	CGACCT	2	12	406390	406401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007178
183	NC_015955	TCGCCC	2	12	408246	408257	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345007178
184	NC_015955	TGATCG	2	12	410528	410539	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007181
185	NC_015955	ACGCCT	2	12	412617	412628	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007184
186	NC_015955	ACGAGG	2	12	412812	412823	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007184
187	NC_015955	CGGCTT	2	12	414105	414116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007186
188	NC_015955	CCAGAT	2	12	414577	414588	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007186
189	NC_015955	CGGTGA	2	12	415762	415773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007189
190	NC_015955	GTTCGA	2	12	418691	418702	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007194
191	NC_015955	CGTGTC	2	12	423194	423205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007200
192	NC_015955	GGACGA	2	12	432166	432177	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007210
193	NC_015955	CGACAA	2	12	435934	435945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007213
194	NC_015955	ACGCCT	2	12	437296	437307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007215
195	NC_015955	CCAGAT	2	12	439112	439123	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007217
196	NC_015955	CGATGG	2	12	440292	440303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007220
197	NC_015955	GGACTG	2	12	441070	441081	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007220
198	NC_015955	AACGCA	2	12	442115	442126	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007223
199	NC_015955	CGAGGA	2	12	443088	443099	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007223
200	NC_015955	GAAAGC	2	12	444429	444440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345007224
201	NC_015955	CGACGT	2	12	446067	446078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007225
202	NC_015955	GCCCTC	2	12	447023	447034	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345007227
203	NC_015955	TCGGTA	2	12	450805	450816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007229
204	NC_015955	AGATGA	2	12	450895	450906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345007230
205	NC_015955	AGGCCG	2	12	451569	451580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007230
206	NC_015955	TCCAGA	2	12	453749	453760	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007232
207	NC_015955	GGCGCG	2	12	456062	456073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007234
208	NC_015955	CAGTCG	2	12	467417	467428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007242
209	NC_015955	CTCACA	2	12	467437	467448	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345007242
210	NC_015955	GACACC	2	12	469496	469507	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
211	NC_015955	CTTAAT	2	12	469689	469700	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	345007243
212	NC_015955	GGCGCG	2	12	478193	478204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007251
213	NC_015955	GAGTAC	2	12	479293	479304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007252
214	NC_015955	ACCGGA	2	12	481853	481864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007256
215	NC_015955	CCAGTC	2	12	482108	482119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007256
216	NC_015955	GACCTC	2	12	486751	486762	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007262
217	NC_015955	GGACGC	2	12	487590	487601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
218	NC_015955	GTCGAC	2	12	492549	492560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007266
219	NC_015955	GTCGAC	2	12	494286	494297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007266
220	NC_015955	GCCGAG	2	12	495756	495767	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007267
221	NC_015955	ACGCGA	2	12	497157	497168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007268
222	NC_015955	ACCGCG	2	12	497215	497226	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007268
223	NC_015955	TCGGAT	2	12	497472	497483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007268
224	NC_015955	TCTACC	2	12	498814	498825	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345007269
225	NC_015955	TGGCGA	2	12	500122	500133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007269
226	NC_015955	AGCGCC	2	12	508235	508246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007275
227	NC_015955	CCGTTC	2	12	513146	513157	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
228	NC_015955	GGCTAA	2	12	514381	514392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
229	NC_015955	CGACAA	2	12	516439	516450	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007280
230	NC_015955	CGTGAA	2	12	518622	518633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007281
231	NC_015955	TGATCG	2	12	520463	520474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007282
232	NC_015955	CGGCAG	2	12	521087	521098	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007283
233	NC_015955	CAGATC	2	12	522319	522330	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007284
234	NC_015955	CGATGG	2	12	523180	523191	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007286
235	NC_015955	CCGTGA	2	12	528030	528041	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
236	NC_015955	TCGGTA	2	12	528725	528736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
237	NC_015955	TTGGAG	2	12	528919	528930	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
238	NC_015955	TTCGAC	2	12	531778	531789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007294
239	NC_015955	CAAACC	2	12	532330	532341	50 %	0 %	0 %	50 %	345007294
240	NC_015955	ACGTAC	2	12	532624	532635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007294
241	NC_015955	TTCGGG	2	12	537745	537756	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345007303
242	NC_015955	ATCACG	2	12	547105	547116	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007311
243	NC_015955	GTACGA	2	12	549689	549700	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007311
244	NC_015955	CGTCCA	2	12	554063	554074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007313
245	NC_015955	TAGTCC	2	12	554938	554949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007314
246	NC_015955	GAGGGT	2	12	557333	557344	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	345007316
247	NC_015955	GGCCAA	2	12	564794	564805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007323
248	NC_015955	ATATCG	2	12	566331	566342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_015955	CGAACT	2	12	567866	567877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007329
250	NC_015955	ACAACC	2	12	568997	569008	50 %	0 %	0 %	50 %	345007331
251	NC_015955	CGACGT	2	12	570276	570287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007333
252	NC_015955	TGGCAA	2	12	570402	570413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007333
253	NC_015955	CGCTTG	2	12	582298	582309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007344
254	NC_015955	CGAGTT	2	12	583222	583233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007345
255	NC_015955	TCGAAC	2	12	586855	586866	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007348
256	NC_015955	GTCGAG	2	12	591992	592003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007351
257	NC_015955	GTCTGG	2	12	592493	592504	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345007351
258	NC_015955	TAATCG	2	12	594553	594564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345007353
259	NC_015955	CTACGA	2	12	596948	596959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007355
260	NC_015955	GTTGCT	2	12	601466	601477	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007361
261	NC_015955	GCGATG	2	12	602038	602049	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007362
262	NC_015955	CGATCA	2	12	602231	602242	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007363
263	NC_015955	GCTGTC	2	12	604642	604653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_015955	GTTGTC	2	12	604950	604961	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007366
265	NC_015955	TCAAGA	2	12	606008	606019	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	345007367
266	NC_015955	GCGTAT	2	12	608639	608650	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007369
267	NC_015955	ACGTCG	2	12	609088	609099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007369
268	NC_015955	GTCATC	2	12	609180	609191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007369
269	NC_015955	TGAACG	2	12	611508	611519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007371
270	NC_015955	CAGAAG	2	12	612233	612244	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345007371
271	NC_015955	GCTGTC	2	12	613219	613230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_015955	GTTGTC	2	12	613527	613538	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007372
273	NC_015955	CATCAC	2	12	614916	614927	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345007373
274	NC_015955	GCTGTC	2	12	615509	615520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_015955	TACCTC	2	12	617469	617480	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345007375
276	NC_015955	CGACGG	2	12	620237	620248	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007376
277	NC_015955	GACCGA	2	12	621857	621868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007377
278	NC_015955	GGGAGA	2	12	630800	630811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_015955	CGGCAC	2	12	635295	635306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007386
280	NC_015955	CGGGGG	2	12	635885	635896	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
281	NC_015955	CGGGGG	2	12	636165	636176	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
282	NC_015955	CGTTCA	2	12	637261	637272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_015955	CCCCGG	2	12	639839	639850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007388
284	NC_015955	GAGCTG	2	12	644681	644692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
285	NC_015955	CCAGCG	2	12	644896	644907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
286	NC_015955	CGGCGA	3	18	648591	648608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007397
287	NC_015955	CGTAGC	2	12	650160	650171	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007399
288	NC_015955	GGCGTC	2	12	650502	650513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_015955	AACGCG	2	12	652012	652023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007400
290	NC_015955	ATCCAG	2	12	657274	657285	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007405
291	NC_015955	TGGCAG	2	12	659061	659072	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007408
292	NC_015955	GTAGCG	2	12	663145	663156	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007415
293	NC_015955	ATATCG	2	12	667770	667781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345007419
294	NC_015955	CGATCT	2	12	667884	667895	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007419
295	NC_015955	ACGTCG	2	12	669560	669571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007420
296	NC_015955	GACCTC	2	12	671104	671115	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007421
297	NC_015955	TCCTGC	2	12	672282	672293	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345007423
298	NC_015955	GTAGCG	2	12	674550	674561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007426
299	NC_015955	GACATC	2	12	676283	676294	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007427
300	NC_015955	ACTCGT	2	12	683162	683173	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007433
301	NC_015955	AAGGGA	2	12	683991	684002	50 %	0 %	50 %	0 %	345007434
302	NC_015955	TCTCCG	2	12	690684	690695	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345007441
303	NC_015955	CGGTGA	2	12	691447	691458	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007443
304	NC_015955	GCTGTC	2	12	692009	692020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_015955	GTTGTC	2	12	692317	692328	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007444
306	NC_015955	TTGCGG	2	12	698222	698233	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345007449
307	NC_015955	GGGGAA	2	12	702499	702510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.