Hexa-nucleotide Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 255

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_015955GCAGAA2129646965750 %0 %33.33 %16.67 %345006837
2NC_015955TGACCT212147791479016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006840
3NC_015955CGATTC212169631697416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006841
4NC_015955ATCGAA212202882029950 %16.67 %16.67 %16.67 %345006842
5NC_015955TTTGAA212222952230633.33 %50 %16.67 %0 %345006844
6NC_015955AGAGAT212223212233250 %16.67 %33.33 %0 %345006844
7NC_015955GAAGAT212274152742650 %16.67 %33.33 %0 %345006845
8NC_015955TACCAC212275902760133.33 %16.67 %0 %50 %345006845
9NC_015955CAGACT212288942890533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345006846
10NC_015955GTTGTC21236540365510 %50 %33.33 %16.67 %345006853
11NC_015955CACGAA212389743898550 %0 %16.67 %33.33 %345006856
12NC_015955TGTTGC21239071390820 %50 %33.33 %16.67 %345006856
13NC_015955CACCGA212398343984533.33 %0 %16.67 %50 %345006859
14NC_015955AACATC212413724138350 %16.67 %0 %33.33 %345006860
15NC_015955CGGTCT21243280432910 %33.33 %33.33 %33.33 %345006862
16NC_015955CGTGGA212441104412116.67 %16.67 %50 %16.67 %345006863
17NC_015955TCGACG212474904750116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345006865
18NC_015955AGCCGA212476414765233.33 %0 %33.33 %33.33 %345006865
19NC_015955TCGTCC21248501485120 %33.33 %16.67 %50 %345006865
20NC_015955CGTTCT21248915489260 %50 %16.67 %33.33 %345006865
21NC_015955CGGAAC212496554966633.33 %0 %33.33 %33.33 %345006865
22NC_015955AGCGCT212540585406916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345006868
23NC_015955TGACGA212542255423633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345006868
24NC_015955AGTACG212592945930533.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345006870
25NC_015955GACGTC212613056131616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345006874
26NC_015955TCGACG212617016171216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345006875
27NC_015955CGAAGC212703997041033.33 %0 %33.33 %33.33 %345006887
28NC_015955TGATTG212739317394216.67 %50 %33.33 %0 %345006891
29NC_015955ATCCGT212762167622716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006894
30NC_015955GGACGA212769767698733.33 %0 %50 %16.67 %345006895
31NC_015955CCCAGT212794037941416.67 %16.67 %16.67 %50 %345006896
32NC_015955GTTGTC21280620806310 %50 %33.33 %16.67 %345006897
33NC_015955ACTGGA212830168302733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345006898
34NC_015955GAGAAG212849358494650 %0 %50 %0 %345006898
35NC_015955ATTCGG212881968820716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345006899
36NC_015955TCAAGA212932909330150 %16.67 %16.67 %16.67 %345006903
37NC_015955GCGTAT212959219593216.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345006905
38NC_015955ACGTCG212963709638116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345006905
39NC_015955GTCATC212964629647316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006905
40NC_015955CGTTGT2121008071008180 %50 %33.33 %16.67 %345006907
41NC_015955TACTGA21210178510179633.33 %33.33 %16.67 %16.67 %345006908
42NC_015955GTCAAT21210429110430233.33 %33.33 %16.67 %16.67 %345006910
43NC_015955GATACG21211088011089133.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345006916
44NC_015955GTTGTC2121115581115690 %50 %33.33 %16.67 %345006917
45NC_015955GACGGC21211536811537916.67 %0 %50 %33.33 %345006922
46NC_015955GAGTAC21212183312184433.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345006929
47NC_015955CGTTCA21212353712354816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006930
48NC_015955CTCACA21212450012451133.33 %16.67 %0 %50 %345006931
49NC_015955GAAACA21212567312568466.67 %0 %16.67 %16.67 %345006931
50NC_015955GTAGCG21212893512894616.67 %16.67 %50 %16.67 %345006936
51NC_015955ACTCGT21212974412975516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006936
52NC_015955CATTCT21213019713020816.67 %50 %0 %33.33 %345006936
53NC_015955GGAGTT21213399813400916.67 %33.33 %50 %0 %345006939
54NC_015955TCGTCA21213565313566416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006939
55NC_015955TCCTCA21213693013694116.67 %33.33 %0 %50 %345006941
56NC_015955CGCCAT21213878613879716.67 %16.67 %16.67 %50 %345006942
57NC_015955CGACAA21214558214559350 %0 %16.67 %33.33 %345006946
58NC_015955TCAACC21215117615118733.33 %16.67 %0 %50 %345006950
59NC_015955GTTCGT2121535951536060 %50 %33.33 %16.67 %345006952
60NC_015955ATATGA21215661415662550 %33.33 %16.67 %0 %345006955
61NC_015955CGTACT21216174616175716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006961
62NC_015955CTTCGA21217032817033916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006965
63NC_015955CCCGAA21217116817117933.33 %0 %16.67 %50 %345006967
64NC_015955CGGGAT21217166917168016.67 %16.67 %50 %16.67 %345006967
65NC_015955GAACTC21217235017236133.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345006967
66NC_015955GCGTCC2121725331725440 %16.67 %33.33 %50 %345006968
67NC_015955ACTCGT21217300817301916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006968
68NC_015955CGGCGA21218612618613716.67 %0 %50 %33.33 %345006976
69NC_015955CGTCGG2121862671862780 %16.67 %50 %33.33 %345006976
70NC_015955TCGTCA21218886718887816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345006982
71NC_015955CGAGAC21218977418978533.33 %0 %33.33 %33.33 %345006983
72NC_015955CGACAA21219321419322550 %0 %16.67 %33.33 %345006989
73NC_015955GCACAG21219768219769333.33 %0 %33.33 %33.33 %345006994
74NC_015955ACGGAG21219969319970433.33 %0 %50 %16.67 %345006998
75NC_015955TTCCCA21220796820797916.67 %33.33 %0 %50 %345007005
76NC_015955CAGTCG21221034621035716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007008
77NC_015955ATCGGT21221229921231016.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007010
78NC_015955CGACAA21221574621575750 %0 %16.67 %33.33 %345007014
79NC_015955GGACGA21221994621995733.33 %0 %50 %16.67 %345007015
80NC_015955GCGTTC2122229252229360 %33.33 %33.33 %33.33 %345007016
81NC_015955ATTCGG21222486022487116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007016
82NC_015955CGGATG21223089423090516.67 %16.67 %50 %16.67 %345007020
83NC_015955GGTTCG2122311612311720 %33.33 %50 %16.67 %345007020
84NC_015955GTTGTC2122342252342360 %50 %33.33 %16.67 %345007024
85NC_015955GTCGAG21223695923697016.67 %16.67 %50 %16.67 %345007027
86NC_015955GAGGTT21223774623775716.67 %33.33 %50 %0 %345007029
87NC_015955GTTGTC2122381962382070 %50 %33.33 %16.67 %345007030
88NC_015955ACACGC21224075724076833.33 %0 %16.67 %50 %345007032
89NC_015955TCGGAA21224242824243933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345007032
90NC_015955CTCGAC21224885324886416.67 %16.67 %16.67 %50 %345007036
91NC_015955CCGAGT21225123425124516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007038
92NC_015955TCGACG21225535325536416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007040
93NC_015955CTACAA21225739625740750 %16.67 %0 %33.33 %345007041
94NC_015955GACGCC21226104026105116.67 %0 %33.33 %50 %345007043
95NC_015955GCTCCA21226308226309316.67 %16.67 %16.67 %50 %345007044
96NC_015955CAACCA21226402626403750 %0 %0 %50 %345007044
97NC_015955CCTTCA21226505226506316.67 %33.33 %0 %50 %345007044
98NC_015955TCGATA21226873726874833.33 %33.33 %16.67 %16.67 %345007046
99NC_015955GCAACG21227314627315733.33 %0 %33.33 %33.33 %345007052
100NC_015955TGGAGA21227905027906133.33 %16.67 %50 %0 %345007056
101NC_015955CGAAGC21227940827941933.33 %0 %33.33 %33.33 %345007056
102NC_015955TCGACG21228056328057416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007057
103NC_015955ATCGTC21228074228075316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345007057
104NC_015955TACGAG21228149228150333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345007057
105NC_015955ACGCGA21228320428321533.33 %0 %33.33 %33.33 %345007058
106NC_015955TCCGAG21228371828372916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007058
107NC_015955CGACGT21228377428378516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007058
108NC_015955CGACGC21228540828541916.67 %0 %33.33 %50 %345007060
109NC_015955CATCGA21228583128584233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007062
110NC_015955GGACGA21229256629257733.33 %0 %50 %16.67 %345007071
111NC_015955CAGTTC21229354829355916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345007072
112NC_015955CGACAA21229813229814350 %0 %16.67 %33.33 %345007076
113NC_015955TGCACA21230643330644433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007082
114NC_015955ACCACG21231113131114233.33 %0 %16.67 %50 %345007086
115NC_015955ATGGAG21231138231139333.33 %16.67 %50 %0 %345007086
116NC_015955TCGAGA21231166231167333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345007086
117NC_015955CCGCGG2123137223137330 %0 %50 %50 %345007088
118NC_015955TCTCGA21232102132103216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345007094
119NC_015955TGCGGG2123247903248010 %16.67 %66.67 %16.67 %345007098
120NC_015955GACGCG21232823332824416.67 %0 %50 %33.33 %345007101
121NC_015955GCCCGA21232901432902516.67 %0 %33.33 %50 %345007101
122NC_015955CGAACT21233327733328833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007105
123NC_015955CGAAAG21233510433511550 %0 %33.33 %16.67 %345007107
124NC_015955AGCGAA21233600133601250 %0 %33.33 %16.67 %345007107
125NC_015955GAAAGT21233815233816350 %16.67 %33.33 %0 %345007108
126NC_015955CAGAAA21233955833956966.67 %0 %16.67 %16.67 %345007110
127NC_015955TGAGTC21233994033995116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007110
128NC_015955TCGGAG21234144334145416.67 %16.67 %50 %16.67 %345007111
129NC_015955GCGAAG21234796934798033.33 %0 %50 %16.67 %345007116
130NC_015955CGACAA21235458235459350 %0 %16.67 %33.33 %345007126
131NC_015955CGACAA21235702135703250 %0 %16.67 %33.33 %345007129
132NC_015955CGTCGC2123623913624020 %16.67 %33.33 %50 %345007137
133NC_015955GTTGTC2123656593656700 %50 %33.33 %16.67 %345007141
134NC_015955GTTGTC2123672193672300 %50 %33.33 %16.67 %345007142
135NC_015955GTTGTC2123708783708890 %50 %33.33 %16.67 %345007145
136NC_015955TCCGCA21237296237297316.67 %16.67 %16.67 %50 %345007148
137NC_015955GTAGCG21237547537548616.67 %16.67 %50 %16.67 %345007152
138NC_015955CTGGTA21237951637952716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007157
139NC_015955GACGAG21238043438044533.33 %0 %50 %16.67 %345007158
140NC_015955GAGGTC21238433338434416.67 %16.67 %50 %16.67 %345007159
141NC_015955CCTTCA21238603138604216.67 %33.33 %0 %50 %345007160
142NC_015955GGGTCG2123862813862920 %16.67 %66.67 %16.67 %345007160
143NC_015955CCAGAG21238733938735033.33 %0 %33.33 %33.33 %345007160
144NC_015955CGACAA21239269939271050 %0 %16.67 %33.33 %345007162
145NC_015955GATGAG21240120740121833.33 %16.67 %50 %0 %345007171
146NC_015955CAGGAT21240125840126933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345007171
147NC_015955CCGATC21240154440155516.67 %16.67 %16.67 %50 %345007171
148NC_015955GACGAG21240237440238533.33 %0 %50 %16.67 %345007173
149NC_015955GACCGG21240592740593816.67 %0 %50 %33.33 %345007176
150NC_015955CGACCT21240639040640116.67 %16.67 %16.67 %50 %345007178
151NC_015955TCGCCC2124082464082570 %16.67 %16.67 %66.67 %345007178
152NC_015955TGATCG21241052841053916.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007181
153NC_015955ACGCCT21241261741262816.67 %16.67 %16.67 %50 %345007184
154NC_015955ACGAGG21241281241282333.33 %0 %50 %16.67 %345007184
155NC_015955CGGCTT2124141054141160 %33.33 %33.33 %33.33 %345007186
156NC_015955CCAGAT21241457741458833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007186
157NC_015955CGGTGA21241576241577316.67 %16.67 %50 %16.67 %345007189
158NC_015955GTTCGA21241869141870216.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007194
159NC_015955CGTGTC2124231944232050 %33.33 %33.33 %33.33 %345007200
160NC_015955GGACGA21243216643217733.33 %0 %50 %16.67 %345007210
161NC_015955CGACAA21243593443594550 %0 %16.67 %33.33 %345007213
162NC_015955ACGCCT21243729643730716.67 %16.67 %16.67 %50 %345007215
163NC_015955CCAGAT21243911243912333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007217
164NC_015955CGATGG21244029244030316.67 %16.67 %50 %16.67 %345007220
165NC_015955GGACTG21244107044108116.67 %16.67 %50 %16.67 %345007220
166NC_015955AACGCA21244211544212650 %0 %16.67 %33.33 %345007223
167NC_015955CGAGGA21244308844309933.33 %0 %50 %16.67 %345007223
168NC_015955GAAAGC21244442944444050 %0 %33.33 %16.67 %345007224
169NC_015955CGACGT21244606744607816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007225
170NC_015955GCCCTC2124470234470340 %16.67 %16.67 %66.67 %345007227
171NC_015955TCGGTA21245080545081616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007229
172NC_015955AGATGA21245089545090650 %16.67 %33.33 %0 %345007230
173NC_015955AGGCCG21245156945158016.67 %0 %50 %33.33 %345007230
174NC_015955TCCAGA21245374945376033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007232
175NC_015955GGCGCG2124560624560730 %0 %66.67 %33.33 %345007234
176NC_015955CAGTCG21246741746742816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007242
177NC_015955CTCACA21246743746744833.33 %16.67 %0 %50 %345007242
178NC_015955CTTAAT21246968946970033.33 %50 %0 %16.67 %345007243
179NC_015955GGCGCG2124781934782040 %0 %66.67 %33.33 %345007251
180NC_015955GAGTAC21247929347930433.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345007252
181NC_015955ACCGGA21248185348186433.33 %0 %33.33 %33.33 %345007256
182NC_015955CCAGTC21248210848211916.67 %16.67 %16.67 %50 %345007256
183NC_015955GACCTC21248675148676216.67 %16.67 %16.67 %50 %345007262
184NC_015955GTCGAC21249254949256016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007266
185NC_015955GTCGAC21249428649429716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007266
186NC_015955GCCGAG21249575649576716.67 %0 %50 %33.33 %345007267
187NC_015955ACGCGA21249715749716833.33 %0 %33.33 %33.33 %345007268
188NC_015955ACCGCG21249721549722616.67 %0 %33.33 %50 %345007268
189NC_015955TCGGAT21249747249748316.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007268
190NC_015955TCTACC21249881449882516.67 %33.33 %0 %50 %345007269
191NC_015955TGGCGA21250012250013316.67 %16.67 %50 %16.67 %345007269
192NC_015955AGCGCC21250823550824616.67 %0 %33.33 %50 %345007275
193NC_015955CGACAA21251643951645050 %0 %16.67 %33.33 %345007280
194NC_015955CGTGAA21251862251863333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345007281
195NC_015955TGATCG21252046352047416.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007282
196NC_015955CGGCAG21252108752109816.67 %0 %50 %33.33 %345007283
197NC_015955CAGATC21252231952233033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007284
198NC_015955CGATGG21252318052319116.67 %16.67 %50 %16.67 %345007286
199NC_015955TTCGAC21253177853178916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345007294
200NC_015955CAAACC21253233053234150 %0 %0 %50 %345007294
201NC_015955ACGTAC21253262453263533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007294
202NC_015955TTCGGG2125377455377560 %33.33 %50 %16.67 %345007303
203NC_015955ATCACG21254710554711633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007311
204NC_015955GTACGA21254968954970033.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345007311
205NC_015955CGTCCA21255406355407416.67 %16.67 %16.67 %50 %345007313
206NC_015955TAGTCC21255493855494916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345007314
207NC_015955GAGGGT21255733355734416.67 %16.67 %66.67 %0 %345007316
208NC_015955GGCCAA21256479456480533.33 %0 %33.33 %33.33 %345007323
209NC_015955CGAACT21256786656787733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007329
210NC_015955ACAACC21256899756900850 %0 %0 %50 %345007331
211NC_015955CGACGT21257027657028716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007333
212NC_015955TGGCAA21257040257041333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345007333
213NC_015955CGCTTG2125822985823090 %33.33 %33.33 %33.33 %345007344
214NC_015955CGAGTT21258322258323316.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007345
215NC_015955TCGAAC21258685558686633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007348
216NC_015955GTCGAG21259199259200316.67 %16.67 %50 %16.67 %345007351
217NC_015955GTCTGG2125924935925040 %33.33 %50 %16.67 %345007351
218NC_015955TAATCG21259455359456433.33 %33.33 %16.67 %16.67 %345007353
219NC_015955CTACGA21259694859695933.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007355
220NC_015955GTTGCT2126014666014770 %50 %33.33 %16.67 %345007361
221NC_015955GCGATG21260203860204916.67 %16.67 %50 %16.67 %345007362
222NC_015955CGATCA21260223160224233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007363
223NC_015955GTTGTC2126049506049610 %50 %33.33 %16.67 %345007366
224NC_015955TCAAGA21260600860601950 %16.67 %16.67 %16.67 %345007367
225NC_015955GCGTAT21260863960865016.67 %33.33 %33.33 %16.67 %345007369
226NC_015955ACGTCG21260908860909916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007369
227NC_015955GTCATC21260918060919116.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345007369
228NC_015955TGAACG21261150861151933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %345007371
229NC_015955CAGAAG21261223361224450 %0 %33.33 %16.67 %345007371
230NC_015955GTTGTC2126135276135380 %50 %33.33 %16.67 %345007372
231NC_015955CATCAC21261491661492733.33 %16.67 %0 %50 %345007373
232NC_015955TACCTC21261746961748016.67 %33.33 %0 %50 %345007375
233NC_015955CGACGG21262023762024816.67 %0 %50 %33.33 %345007376
234NC_015955GACCGA21262185762186833.33 %0 %33.33 %33.33 %345007377
235NC_015955CGGCAC21263529563530616.67 %0 %33.33 %50 %345007386
236NC_015955CCCCGG2126398396398500 %0 %33.33 %66.67 %345007388
237NC_015955CGGCGA31864859164860816.67 %0 %50 %33.33 %345007397
238NC_015955CGTAGC21265016065017116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007399
239NC_015955AACGCG21265201265202333.33 %0 %33.33 %33.33 %345007400
240NC_015955ATCCAG21265727465728533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007405
241NC_015955TGGCAG21265906165907216.67 %16.67 %50 %16.67 %345007408
242NC_015955GTAGCG21266314566315616.67 %16.67 %50 %16.67 %345007415
243NC_015955ATATCG21266777066778133.33 %33.33 %16.67 %16.67 %345007419
244NC_015955CGATCT21266788466789516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345007419
245NC_015955ACGTCG21266956066957116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %345007420
246NC_015955GACCTC21267110467111516.67 %16.67 %16.67 %50 %345007421
247NC_015955TCCTGC2126722826722930 %33.33 %16.67 %50 %345007423
248NC_015955GTAGCG21267455067456116.67 %16.67 %50 %16.67 %345007426
249NC_015955GACATC21267628367629433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %345007427
250NC_015955ACTCGT21268316268317316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %345007433
251NC_015955AAGGGA21268399168400250 %0 %50 %0 %345007434
252NC_015955TCTCCG2126906846906950 %33.33 %16.67 %50 %345007441
253NC_015955CGGTGA21269144769145816.67 %16.67 %50 %16.67 %345007443
254NC_015955GTTGTC2126923176923280 %50 %33.33 %16.67 %345007444
255NC_015955TTGCGG2126982226982330 %33.33 %50 %16.67 %345007449