MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 1955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	TGGG	2	8	487	494	0 %	25 %	75 %	0 %	345006828
2	NC_015955	ACTT	2	8	615	622	25 %	50 %	0 %	25 %	345006828
3	NC_015955	TTAT	2	8	694	701	25 %	75 %	0 %	0 %	345006828
4	NC_015955	CAAC	2	8	1202	1209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015955	AATC	2	8	1507	1514	50 %	25 %	0 %	25 %	345006829
6	NC_015955	ATTT	2	8	2278	2285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015955	TAAT	2	8	2785	2792	50 %	50 %	0 %	0 %	345006830
8	NC_015955	ATTT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	345006830
9	NC_015955	AAAG	2	8	2867	2874	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015955	TCGG	2	8	3019	3026	0 %	25 %	50 %	25 %	345006831
11	NC_015955	TTCC	2	8	3914	3921	0 %	50 %	0 %	50 %	345006832
12	NC_015955	GATG	2	8	4865	4872	25 %	25 %	50 %	0 %	345006833
13	NC_015955	GGGT	2	8	5020	5027	0 %	25 %	75 %	0 %	345006833
14	NC_015955	TGAA	2	8	5169	5176	50 %	25 %	25 %	0 %	345006833
15	NC_015955	CAGT	2	8	5648	5655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015955	GCTG	2	8	7088	7095	0 %	25 %	50 %	25 %	345006835
17	NC_015955	GAAC	2	8	7234	7241	50 %	0 %	25 %	25 %	345006835
18	NC_015955	GGTC	2	8	7857	7864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015955	CGAG	2	8	8325	8332	25 %	0 %	50 %	25 %	345006836
20	NC_015955	CAGA	2	8	8373	8380	50 %	0 %	25 %	25 %	345006836
21	NC_015955	TCAA	2	8	8781	8788	50 %	25 %	0 %	25 %	345006836
22	NC_015955	TTGC	2	8	9565	9572	0 %	50 %	25 %	25 %	345006837
23	NC_015955	CAGG	2	8	10542	10549	25 %	0 %	50 %	25 %	345006838
24	NC_015955	CATC	2	8	10708	10715	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015955	CTAT	2	8	12004	12011	25 %	50 %	0 %	25 %	345006839
26	NC_015955	GAAT	2	8	12608	12615	50 %	25 %	25 %	0 %	345006839
27	NC_015955	CCCG	2	8	13114	13121	0 %	0 %	25 %	75 %	345006840
28	NC_015955	CATC	2	8	13525	13532	25 %	25 %	0 %	50 %	345006840
29	NC_015955	GTTG	2	8	13962	13969	0 %	50 %	50 %	0 %	345006840
30	NC_015955	AAAG	2	8	14570	14577	75 %	0 %	25 %	0 %	345006840
31	NC_015955	ACCA	2	8	14655	14662	50 %	0 %	0 %	50 %	345006840
32	NC_015955	GGAA	2	8	14899	14906	50 %	0 %	50 %	0 %	345006840
33	NC_015955	GTCA	2	8	15102	15109	25 %	25 %	25 %	25 %	345006841
34	NC_015955	TGAA	2	8	15399	15406	50 %	25 %	25 %	0 %	345006841
35	NC_015955	CAAT	2	8	15498	15505	50 %	25 %	0 %	25 %	345006841
36	NC_015955	AACG	2	8	15580	15587	50 %	0 %	25 %	25 %	345006841
37	NC_015955	TCAT	2	8	15785	15792	25 %	50 %	0 %	25 %	345006841
38	NC_015955	GAAG	2	8	16031	16038	50 %	0 %	50 %	0 %	345006841
39	NC_015955	ATTG	2	8	16152	16159	25 %	50 %	25 %	0 %	345006841
40	NC_015955	AGTA	2	8	16318	16325	50 %	25 %	25 %	0 %	345006841
41	NC_015955	TCCA	2	8	16807	16814	25 %	25 %	0 %	50 %	345006841
42	NC_015955	TTCA	2	8	17065	17072	25 %	50 %	0 %	25 %	345006841
43	NC_015955	TTAA	2	8	17206	17213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015955	GAGG	2	8	17828	17835	25 %	0 %	75 %	0 %	345006842
45	NC_015955	GCTG	2	8	18100	18107	0 %	25 %	50 %	25 %	345006842
46	NC_015955	GCCA	2	8	18143	18150	25 %	0 %	25 %	50 %	345006842
47	NC_015955	CACC	2	8	18276	18283	25 %	0 %	0 %	75 %	345006842
48	NC_015955	CAGA	2	8	18405	18412	50 %	0 %	25 %	25 %	345006842
49	NC_015955	CGAA	2	8	18442	18449	50 %	0 %	25 %	25 %	345006842
50	NC_015955	ACGG	2	8	19340	19347	25 %	0 %	50 %	25 %	345006842
51	NC_015955	CGAA	2	8	19536	19543	50 %	0 %	25 %	25 %	345006842
52	NC_015955	ACAT	2	8	19805	19812	50 %	25 %	0 %	25 %	345006842
53	NC_015955	TTCA	2	8	20146	20153	25 %	50 %	0 %	25 %	345006842
54	NC_015955	GATG	2	8	20563	20570	25 %	25 %	50 %	0 %	345006842
55	NC_015955	GACG	2	8	20833	20840	25 %	0 %	50 %	25 %	345006843
56	NC_015955	AATT	2	8	21087	21094	50 %	50 %	0 %	0 %	345006843
57	NC_015955	ACAA	2	8	21338	21345	75 %	0 %	0 %	25 %	345006844
58	NC_015955	CCGA	2	8	21481	21488	25 %	0 %	25 %	50 %	345006844
59	NC_015955	GAGT	2	8	21954	21961	25 %	25 %	50 %	0 %	345006844
60	NC_015955	TCAG	2	8	22213	22220	25 %	25 %	25 %	25 %	345006844
61	NC_015955	AATT	2	8	22675	22682	50 %	50 %	0 %	0 %	345006844
62	NC_015955	TCTA	2	8	22998	23005	25 %	50 %	0 %	25 %	345006844
63	NC_015955	ACAA	2	8	23046	23053	75 %	0 %	0 %	25 %	345006844
64	NC_015955	AAAG	2	8	23605	23612	75 %	0 %	25 %	0 %	345006844
65	NC_015955	TGAC	2	8	24219	24226	25 %	25 %	25 %	25 %	345006844
66	NC_015955	TCCA	2	8	24608	24615	25 %	25 %	0 %	50 %	345006845
67	NC_015955	CGAC	2	8	24777	24784	25 %	0 %	25 %	50 %	345006845
68	NC_015955	ACGC	2	8	25407	25414	25 %	0 %	25 %	50 %	345006845
69	NC_015955	CTTC	2	8	26025	26032	0 %	50 %	0 %	50 %	345006845
70	NC_015955	GTAC	2	8	26702	26709	25 %	25 %	25 %	25 %	345006845
71	NC_015955	AGCA	2	8	27041	27048	50 %	0 %	25 %	25 %	345006845
72	NC_015955	TCCG	2	8	27059	27066	0 %	25 %	25 %	50 %	345006845
73	NC_015955	ACCC	2	8	27491	27498	25 %	0 %	0 %	75 %	345006845
74	NC_015955	AAGC	2	8	28387	28394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015955	GGGA	2	8	28999	29006	25 %	0 %	75 %	0 %	345006846
76	NC_015955	CGGG	2	8	29232	29239	0 %	0 %	75 %	25 %	345006846
77	NC_015955	CGTT	2	8	29489	29496	0 %	50 %	25 %	25 %	345006846
78	NC_015955	TAAT	2	8	29921	29928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015955	GGTT	2	8	30010	30017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015955	TAAA	2	8	30160	30167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015955	AACA	2	8	30335	30342	75 %	0 %	0 %	25 %	345006847
82	NC_015955	CGAA	2	8	30763	30770	50 %	0 %	25 %	25 %	345006847
83	NC_015955	CAGA	2	8	30780	30787	50 %	0 %	25 %	25 %	345006847
84	NC_015955	CCGA	2	8	30856	30863	25 %	0 %	25 %	50 %	345006847
85	NC_015955	GAAA	2	8	31808	31815	75 %	0 %	25 %	0 %	345006849
86	NC_015955	ATAA	2	8	32057	32064	75 %	25 %	0 %	0 %	345006850
87	NC_015955	ATTG	2	8	32609	32616	25 %	50 %	25 %	0 %	345006850
88	NC_015955	ACCA	2	8	32924	32931	50 %	0 %	0 %	50 %	345006850
89	NC_015955	TTTG	2	8	33023	33030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015955	GAGT	2	8	33426	33433	25 %	25 %	50 %	0 %	345006851
91	NC_015955	GAAA	2	8	33435	33442	75 %	0 %	25 %	0 %	345006851
92	NC_015955	ATGA	2	8	34314	34321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015955	TTCC	2	8	35017	35024	0 %	50 %	0 %	50 %	345006852
94	NC_015955	ACGG	2	8	36213	36220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015955	CACT	2	8	36277	36284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015955	TCGG	2	8	36297	36304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015955	CGCC	2	8	36432	36439	0 %	0 %	25 %	75 %	345006853
98	NC_015955	GTAC	2	8	36701	36708	25 %	25 %	25 %	25 %	345006853
99	NC_015955	AGCA	2	8	37481	37488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015955	CTAA	2	8	37495	37502	50 %	25 %	0 %	25 %	345006854
101	NC_015955	GTCG	2	8	38154	38161	0 %	25 %	50 %	25 %	345006856
102	NC_015955	TATT	2	8	39439	39446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015955	GTCA	2	8	39522	39529	25 %	25 %	25 %	25 %	345006858
104	NC_015955	AGCC	2	8	39754	39761	25 %	0 %	25 %	50 %	345006858
105	NC_015955	CTCC	2	8	39812	39819	0 %	25 %	0 %	75 %	345006859
106	NC_015955	GGCA	2	8	39872	39879	25 %	0 %	50 %	25 %	345006859
107	NC_015955	GGAC	2	8	40470	40477	25 %	0 %	50 %	25 %	345006860
108	NC_015955	GACC	2	8	40945	40952	25 %	0 %	25 %	50 %	345006860
109	NC_015955	CGGA	2	8	40961	40968	25 %	0 %	50 %	25 %	345006860
110	NC_015955	CGGA	2	8	40985	40992	25 %	0 %	50 %	25 %	345006860
111	NC_015955	CGGA	2	8	41213	41220	25 %	0 %	50 %	25 %	345006860
112	NC_015955	CGTA	2	8	41802	41809	25 %	25 %	25 %	25 %	345006860
113	NC_015955	TCGG	2	8	42887	42894	0 %	25 %	50 %	25 %	345006862
114	NC_015955	CTGC	2	8	43482	43489	0 %	25 %	25 %	50 %	345006862
115	NC_015955	GGGC	2	8	44216	44223	0 %	0 %	75 %	25 %	345006863
116	NC_015955	GCCG	2	8	44678	44685	0 %	0 %	50 %	50 %	345006863
117	NC_015955	CCGC	2	8	44848	44855	0 %	0 %	25 %	75 %	345006863
118	NC_015955	GAAC	2	8	45444	45451	50 %	0 %	25 %	25 %	345006864
119	NC_015955	CGGA	2	8	45756	45763	25 %	0 %	50 %	25 %	345006864
120	NC_015955	CGAG	2	8	46608	46615	25 %	0 %	50 %	25 %	345006864
121	NC_015955	AACG	2	8	47115	47122	50 %	0 %	25 %	25 %	345006864
122	NC_015955	CCAG	2	8	47518	47525	25 %	0 %	25 %	50 %	345006865
123	NC_015955	AGCG	2	8	49440	49447	25 %	0 %	50 %	25 %	345006865
124	NC_015955	TCGA	2	8	49724	49731	25 %	25 %	25 %	25 %	345006865
125	NC_015955	CCGA	2	8	49772	49779	25 %	0 %	25 %	50 %	345006865
126	NC_015955	CGAC	2	8	50097	50104	25 %	0 %	25 %	50 %	345006865
127	NC_015955	GACG	2	8	50236	50243	25 %	0 %	50 %	25 %	345006865
128	NC_015955	GCGG	3	12	50916	50927	0 %	0 %	75 %	25 %	345006865
129	NC_015955	CGCC	2	8	51804	51811	0 %	0 %	25 %	75 %	345006866
130	NC_015955	TCGG	2	8	51879	51886	0 %	25 %	50 %	25 %	345006866
131	NC_015955	CTCA	2	8	52274	52281	25 %	25 %	0 %	50 %	345006867
132	NC_015955	CGGT	2	8	52543	52550	0 %	25 %	50 %	25 %	345006867
133	NC_015955	TTTG	2	8	53449	53456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015955	TCAT	2	8	53695	53702	25 %	50 %	0 %	25 %	345006868
135	NC_015955	CAGT	2	8	53777	53784	25 %	25 %	25 %	25 %	345006868
136	NC_015955	CGGG	2	8	53794	53801	0 %	0 %	75 %	25 %	345006868
137	NC_015955	GAAG	2	8	54021	54028	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
138	NC_015955	AGAT	2	8	54129	54136	50 %	25 %	25 %	0 %	345006868
139	NC_015955	CCAT	2	8	54447	54454	25 %	25 %	0 %	50 %	345006868
140	NC_015955	GGAT	2	8	54987	54994	25 %	25 %	50 %	0 %	345006868
141	NC_015955	TCGA	2	8	55136	55143	25 %	25 %	25 %	25 %	345006868
142	NC_015955	ACCA	2	8	55774	55781	50 %	0 %	0 %	50 %	345006868
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