MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 11154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	CGA	2	6	44	49	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006828
2	NC_015955	TCA	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006828
3	NC_015955	ATC	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006828
4	NC_015955	GAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006828
5	NC_015955	TGC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006828
6	NC_015955	TCA	2	6	462	467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006828
7	NC_015955	GTG	2	6	560	565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006828
8	NC_015955	TGA	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006828
9	NC_015955	CAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006828
10	NC_015955	AAT	2	6	922	927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015955	TAC	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015955	ACC	2	6	1087	1092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015955	ATA	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015955	ATA	2	6	1263	1268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015955	GAT	2	6	1311	1316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015955	GAG	2	6	1360	1365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015955	TTC	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006829
18	NC_015955	GAA	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006829
19	NC_015955	AGC	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006829
20	NC_015955	TTA	2	6	1700	1705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006829
21	NC_015955	TAG	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006829
22	NC_015955	TGC	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006829
23	NC_015955	ATA	2	6	1813	1818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006829
24	NC_015955	GAT	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006829
25	NC_015955	CTT	2	6	1853	1858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006829
26	NC_015955	TTG	2	6	1880	1885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006829
27	NC_015955	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006829
28	NC_015955	AAT	2	6	2052	2057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006829
29	NC_015955	TCT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006829
30	NC_015955	ATA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015955	TTA	2	6	2183	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015955	GTA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015955	TTC	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006830
34	NC_015955	AAT	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006830
35	NC_015955	TCA	2	6	2571	2576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006830
36	NC_015955	GCA	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006830
37	NC_015955	TAG	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006830
38	NC_015955	CTT	2	6	2752	2757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006830
39	NC_015955	ATG	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006831
40	NC_015955	TTC	2	6	3031	3036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006831
41	NC_015955	CAG	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006831
42	NC_015955	TCG	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015955	ATA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015955	AGT	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015955	CGA	3	9	3448	3456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
46	NC_015955	CGC	2	6	3547	3552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
47	NC_015955	CAG	2	6	3767	3772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
48	NC_015955	CGC	2	6	3778	3783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
49	NC_015955	ACC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006832
50	NC_015955	CCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
51	NC_015955	GAC	3	9	3986	3994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
52	NC_015955	CCG	2	6	4035	4040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
53	NC_015955	CTG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006832
54	NC_015955	GCC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
55	NC_015955	GAT	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006832
56	NC_015955	GAC	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
57	NC_015955	GTC	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006832
58	NC_015955	CGA	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
59	NC_015955	ACC	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006832
60	NC_015955	TCT	2	6	4257	4262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006832
61	NC_015955	CGA	2	6	4300	4305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
62	NC_015955	GAA	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006832
63	NC_015955	GGA	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006832
64	NC_015955	AGA	2	6	4401	4406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006832
65	NC_015955	CGG	2	6	4457	4462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006832
66	NC_015955	CAG	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
67	NC_015955	TAC	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006832
68	NC_015955	CGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
69	NC_015955	TCT	2	6	4778	4783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006833
70	NC_015955	CAT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006833
71	NC_015955	GCG	2	6	4997	5002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006833
72	NC_015955	CAA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006833
73	NC_015955	GTT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006833
74	NC_015955	GAG	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006833
75	NC_015955	CAA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006833
76	NC_015955	CCG	2	6	5387	5392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006833
77	NC_015955	TTC	2	6	5423	5428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006833
78	NC_015955	AAT	2	6	5494	5499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006833
79	NC_015955	TAT	2	6	5526	5531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015955	ACT	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015955	GGT	2	6	5551	5556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015955	GAC	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015955	TCC	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015955	CAG	2	6	5661	5666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015955	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015955	AGC	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015955	CCA	2	6	5884	5889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006834
88	NC_015955	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006834
89	NC_015955	CGA	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006834
90	NC_015955	TTG	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006835
91	NC_015955	TTA	2	6	6252	6257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006835
92	NC_015955	TAA	2	6	6346	6351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006835
93	NC_015955	CCA	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006835
94	NC_015955	CTC	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006835
95	NC_015955	CAA	2	6	6391	6396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006835
96	NC_015955	CTC	2	6	6449	6454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006835
97	NC_015955	ACA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006835
98	NC_015955	GAA	2	6	6662	6667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006835
99	NC_015955	AGA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006835
100	NC_015955	GCC	2	6	6852	6857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006835
101	NC_015955	TCC	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006835
102	NC_015955	CTA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
103	NC_015955	TCG	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006835
104	NC_015955	GCG	2	6	7125	7130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006835
105	NC_015955	CAC	2	6	7145	7150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006835
106	NC_015955	ATA	2	6	7203	7208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006835
107	NC_015955	CAT	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
108	NC_015955	GCC	2	6	7316	7321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006835
109	NC_015955	TTC	2	6	7349	7354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006835
110	NC_015955	AGA	2	6	7411	7416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006835
111	NC_015955	GTA	2	6	7419	7424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006835
112	NC_015955	ACG	2	6	7467	7472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006835
113	NC_015955	ACG	2	6	7511	7516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006835
114	NC_015955	ACT	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
115	NC_015955	ACT	2	6	7747	7752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
116	NC_015955	GGA	2	6	7810	7815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015955	GAT	2	6	8204	8209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006836
118	NC_015955	ACT	2	6	8279	8284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006836
119	NC_015955	TCA	2	6	8306	8311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006836
120	NC_015955	TAC	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006836
121	NC_015955	CAG	2	6	8489	8494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006836
122	NC_015955	AAG	2	6	8544	8549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006836
123	NC_015955	GAT	2	6	8765	8770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006836
124	NC_015955	AAC	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006836
125	NC_015955	TGT	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006836
126	NC_015955	AGA	2	6	8875	8880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006836
127	NC_015955	GTC	2	6	8892	8897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015955	GCC	2	6	8937	8942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015955	ATC	2	6	8946	8951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015955	ATG	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015955	GAC	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015955	TGG	2	6	9034	9039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015955	TTA	2	6	9094	9099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015955	TGA	2	6	9132	9137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006837
135	NC_015955	GAA	2	6	9184	9189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006837
136	NC_015955	TTG	2	6	9307	9312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006837
137	NC_015955	CAA	2	6	9368	9373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006837
138	NC_015955	GCT	2	6	9385	9390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006837
139	NC_015955	CAA	2	6	9609	9614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006837
140	NC_015955	AAG	2	6	9615	9620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006837
141	NC_015955	GAA	2	6	9694	9699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006837
142	NC_015955	TCA	2	6	9731	9736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006837
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149	NC_015955	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015955	ATT	2	6	10206	10211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015955	TGA	2	6	10224	10229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015955	ATT	2	6	10420	10425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006838
153	NC_015955	CCT	2	6	10514	10519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006838
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254	NC_015955	AGT	2	6	17262	17267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_015955	TAG	2	6	17311	17316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015955	CTC	2	6	17368	17373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_015955	ATC	2	6	17386	17391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_015955	CAC	2	6	17397	17402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006842
259	NC_015955	ACG	3	9	17436	17444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006842
260	NC_015955	GCT	2	6	17477	17482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006842
261	NC_015955	CAG	2	6	17504	17509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006842
262	NC_015955	GAC	2	6	17510	17515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006842
263	NC_015955	ACT	2	6	17593	17598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006842
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272	NC_015955	TGA	2	6	18019	18024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006842
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